Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_009813884.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MDNLDNGLELLSGRLVVLFLTYDLALKASANFPAGTKVKVTNDPNPDLNGEYTWDGTKLVKTTNNTLEKAKEEAEKIVNDKIDNTLTKDKILDLISGEITESDLDQNLRQRIDEIESISPIIDKLKKDVKKSKEEVDEKVFFLNVDYQNLKEEVQNIQLQVDLDFQAIQDRIDQIQAEVDAKWLEVDQIRDDLTKEINDRVAAVREETEQRIEDVRKLNDGLTQEIIDRKDGDQKLYENIENYKVSNDGALANVRDEVKVAVETANASAEKVNTMDARVTVAEDNAGTALENSAAAVNKANAAAGLASATAGRVDNMQADVTKALDDSGKALTNSATAIEQSQVAVDKANSAAESVTILESKLNSKNATYRQDTAPTKDTHPNLTEGDLWINPSANNEQKRWNGTDWVDISDVRVGQNATAISELKTSVKEQDDKITSVSERVDNLQASIGDMATSEALELLKGTVTEQGGKINANTEKLVAIETTVGQNQEANAKALQDLTTRIEKDEDDIKANTSAITALDSTVNASLNAINITADMNLENDLIYYNSSSQNVVKSISESGTTRRVLTIGDNSSDDMAWMYPKAMLPYDPDVMYKVRAKLRRLSGDGAIYLGLVVKNSDKTQFVTSNNILSDNVSSSSYFADGVIPPLNEWVEYEWYIKGRASSSALLPPTYGGLGNPIQMQNATGYITPVFIANYSGLSGVVELAYMVLERAEAYKVISANANALTSLKTDVQKNTDGIQAMGEAITNVEASITNMDIGGQNHWTIWPIEPTQSDADNPYLSVQWLTESQEWIRTTLTKDVNSYHHSFDGLLIDLSYPIVIGELYTLTFEMRASKAIPIAATTINFGTNVTYTDNSLTTDTEWKTYTITFPTKGTLTSKSNQAFGLTLLKGHGWTTNDWYELRRIQMQKGNKATRYQKAQAGLVEGIKANSQAFNGLKATVEQQGEDIKSQGQAITGLKQEIADKASSQALSELKSTVEQQGESIRINTEAITSLKGVVDGKADADALNSLKVTVQEQGETLLTQGQAITSVRATADLALNGKKTLIDLTAFDPNLYYPVFIPVSTTGISEIEISPKLGDFQAPWSTHYSGSYSLGVRWTTRGHGWGAEAIDRVIEKFDYAWCGDQSPAMEINQRGEDSKEYIYLRGGTIYPFVTNQFADTPYLENNPVGVAFDQSKVPQSVNARVGANASAISSLDSKINIVGDKVDVNAQAITGLQAEIKDKASSEALNQLSVTVRDQGQLIDTQGQAITKVESKVDNIAVGGKNLIRDSGTWLGDPLAAATGIQSAYSANRDVMFVWASPNNEGWLTNFFSGEQLADIDPNLNENDDVIFSVDILIETGSTVKGPSIYWKDSMYYAPVALAKGQEFRYNEWYRFYQLRKYVKGGLAFHFSFADMVGTYRFRRPVIEKGNIPTDWTISDGDFATARAVQTLNTKVDNVDNKVNVNAQAITDLRSSLDGKANAQALNELSTIVQEQGETIQSQGKVLTSVEATANRTSSQLGTTVSYMLYTFRNGASSITKTGLYKADGTRLEGIARGLSVYLFAANGDYVGLRFFDTYGDMDNACNNMIAYLSDLPQNSFIAIAGCDNLGPLSWPSGPPKALRDHLRDVWGVAQSSVDKWQYNDIPIVICRKWGPKNSAIDKLYTSSVNGDWYSLGITFIDGIPNDWGGDTSKTNIEANASAISTMNADVIKNRDDIRVNAEAITGLSGRIDGKADAQALSQLQTTVREQGETISSQGQAITQVQASADMALNGKKYVVDLTALDPNLYYPVFIPVSSGSGISEISVSASLDEYRTPWSSHGSGTYSLNVMWRTRGSGWGANSVEREVIRFGYAWCGDQSPVIEINQQGDRSREYIYLRGGTQYPFYVNQYAGQPFTDLGNYGGVPYRTDLMPVSTNQRTYANASAVSTLNAKVDIVDGKATSAAESVTKLQTSSSAATYQLLRGSNRIGEKPVGSNPYPFWSQPIDKPLTAGKTYTLVYEAEFQSGGANSYFRPYFNGTQDISQTNQSFGRQVKVDKAVLWFAETTAIDFYIVGSQPDQNNSYAKVYWACLYEEDQPNPIKVWMPNTRENSAKLEVQGQSIDGLMTKWSVKADVNGYVSGVAMNNNGREANFIIRADTFAIAPPVGSGGGDVPKYGFVYQASAKTLPNGTVIPAGLYVDSLMLGEINAEKINANSLSAISANLGTFTSSNAKGTMTISGTDISVKDTNGVERIFIGL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2223 AA molecular weight: 242858,34640 Da isoelectric point: 4,75745 aromaticity: 0,08007 hydropathy: -0,38794
Domains
Domain architecture
YP_009813884.1
1
2223 aa
STR 798–922 ·
ATT Attachment Domain
STR Structural Domain
RBD Receptor-Binding Domain
CBM Carbohydrate-Binding Module
LEC Lectin-like Domain
ENZ Enzymatic Domain
CHP Intramolecular Chaperone
LNK Linker/Spacer Domain
TAS Tail-Associated Structural
TTP Tail Tubular Protein
UNK Uncharacterized Domain
Unmapped
Proteins with similar domain architecture
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009813884.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048080.1
[NCBI]
CDS location
range 19448 -> 26119
strand +
strand +
CDS
ATGGATAATTTAGACAACGGTTTAGAGTTATTATCAGGTAGATTAGTAGTCTTATTTTTAACTTATGATTTGGCTTTGAAAGCTTCTGCTAATTTTCCAGCTGGAACCAAAGTCAAAGTAACCAATGACCCAAACCCTGATTTAAATGGTGAATATACTTGGGATGGAACAAAGTTAGTAAAAACTACAAATAACACACTTGAGAAGGCTAAAGAGGAAGCTGAAAAGATTGTCAATGATAAAATAGACAATACTTTAACTAAAGATAAGATTTTAGACCTTATCTCTGGTGAAATTACAGAAAGTGACTTAGATCAAAACTTAAGACAACGTATAGATGAGATTGAAAGTATTTCACCGATCATCGATAAGTTGAAGAAAGATGTGAAAAAATCTAAGGAAGAGGTGGATGAGAAAGTTTTCTTCTTAAATGTTGATTATCAGAATTTGAAAGAAGAAGTTCAGAATATCCAACTCCAAGTAGATTTAGATTTCCAAGCGATTCAAGATCGTATTGATCAGATTCAAGCTGAAGTTGACGCTAAATGGCTTGAAGTTGACCAAATTAGAGATGATTTAACAAAAGAAATTAATGATCGTGTTGCTGCTGTCCGTGAGGAAACAGAACAACGTATCGAAGATGTAAGAAAATTAAATGATGGTTTAACTCAAGAGATTATTGATCGTAAAGATGGTGATCAGAAGTTATATGAAAACATCGAAAATTATAAAGTGTCAAATGATGGTGCTCTTGCTAATGTAAGAGATGAAGTTAAGGTTGCTGTTGAGACAGCCAATGCTTCTGCTGAAAAAGTAAATACTATGGATGCCAGAGTTACAGTTGCAGAGGATAATGCTGGGACTGCTTTAGAAAACTCTGCTGCTGCCGTTAATAAGGCCAATGCTGCTGCTGGTTTAGCTAGTGCAACTGCTGGTCGTGTTGACAATATGCAAGCTGATGTAACAAAGGCTCTTGATGATTCAGGTAAAGCTCTTACAAACTCTGCTACAGCTATCGAGCAATCGCAAGTTGCTGTTGATAAAGCTAATTCTGCTGCTGAGTCTGTCACTATACTTGAATCAAAGCTTAACAGCAAGAATGCTACATACAGACAAGATACTGCACCAACAAAAGACACTCATCCAAATTTAACTGAAGGTGATTTATGGATTAACCCTTCAGCTAACAATGAACAAAAACGCTGGAATGGTACTGACTGGGTTGACATTTCAGATGTTCGTGTAGGTCAGAATGCTACAGCTATCTCAGAGTTAAAAACCTCTGTAAAAGAGCAAGATGATAAAATCACTTCTGTTTCTGAGAGAGTTGATAATTTACAAGCAAGTATTGGAGATATGGCTACTTCAGAAGCCCTTGAGTTGTTAAAGGGAACTGTAACCGAACAGGGTGGCAAAATCAATGCCAATACAGAGAAGCTTGTGGCTATTGAGACGACTGTTGGGCAAAACCAAGAAGCGAATGCTAAAGCTCTTCAAGATTTAACAACTCGCATTGAGAAAGATGAAGATGATATTAAGGCAAACACCTCAGCTATCACAGCATTGGATTCAACAGTAAATGCATCATTGAATGCAATCAACATCACAGCTGATATGAACCTTGAAAATGACTTGATATACTACAATAGTTCATCACAAAATGTTGTTAAGTCAATCTCTGAATCAGGTACAACAAGAAGGGTTTTAACTATTGGAGACAATAGTAGTGATGATATGGCTTGGATGTATCCAAAAGCCATGTTACCTTATGATCCAGATGTTATGTACAAGGTAAGAGCTAAGTTAAGACGCTTATCTGGAGATGGTGCTATTTACCTTGGATTAGTTGTTAAGAATAGTGATAAAACCCAATTTGTTACTTCTAACAACATATTATCAGATAATGTTTCTAGTTCATCTTATTTTGCTGATGGAGTCATTCCTCCATTAAATGAGTGGGTTGAATATGAGTGGTATATTAAAGGTAGAGCTTCTTCTAGCGCTCTTCTTCCACCTACATATGGTGGCTTAGGAAACCCTATCCAAATGCAGAACGCTACTGGATACATCACCCCTGTTTTTATTGCTAACTATTCAGGTTTATCTGGTGTTGTTGAACTTGCTTATATGGTATTAGAGAGAGCTGAAGCATACAAAGTTATTTCAGCAAATGCTAATGCGCTGACAAGTCTTAAAACAGATGTCCAGAAAAATACTGATGGCATTCAAGCAATGGGTGAGGCTATCACTAATGTTGAAGCTTCTATCACAAATATGGATATTGGTGGACAAAACCATTGGACTATTTGGCCTATTGAACCAACACAATCTGATGCTGACAATCCTTACCTTTCTGTACAATGGTTAACCGAGAGTCAGGAATGGATTAGGACTACACTCACAAAGGATGTAAATTCTTACCATCACTCTTTTGATGGTTTACTGATTGATCTGAGCTATCCTATCGTTATTGGTGAGTTATATACACTGACATTCGAGATGAGGGCTTCTAAGGCAATCCCTATTGCAGCTACCACAATTAACTTTGGTACTAATGTCACTTATACAGATAATAGCTTAACAACTGATACTGAATGGAAGACATACACAATCACATTCCCAACAAAAGGGACATTGACATCTAAGTCCAATCAAGCATTTGGTTTAACATTGCTTAAAGGTCATGGATGGACTACAAATGATTGGTATGAGTTAAGACGTATCCAAATGCAAAAGGGTAACAAAGCTACTCGATACCAAAAAGCTCAAGCTGGACTGGTTGAAGGAATCAAAGCTAACTCTCAAGCATTTAATGGCTTAAAAGCTACTGTTGAACAGCAAGGTGAAGATATCAAGTCTCAAGGTCAAGCTATCACAGGGCTTAAGCAAGAAATTGCTGACAAAGCAAGTTCTCAAGCACTGTCGGAATTGAAGTCTACTGTTGAACAGCAAGGTGAGAGTATTCGTATTAATACCGAAGCAATTACATCATTAAAAGGTGTAGTTGATGGTAAAGCCGATGCAGATGCCTTGAATAGTTTAAAAGTTACAGTCCAAGAGCAAGGTGAAACACTTTTAACTCAAGGTCAAGCTATAACTTCTGTTAGGGCGACAGCCGATCTTGCACTGAATGGTAAGAAAACTTTAATTGACTTAACAGCATTTGATCCTAATCTTTACTACCCCGTATTTATTCCTGTAAGTACAACAGGTATCTCAGAGATTGAGATTTCCCCAAAACTTGGAGATTTTCAAGCTCCTTGGTCCACACACTACAGTGGCTCATATTCACTTGGTGTTCGATGGACAACTCGTGGACATGGGTGGGGTGCAGAGGCAATTGATAGGGTTATTGAAAAATTTGATTATGCTTGGTGTGGTGATCAGTCTCCAGCAATGGAAATTAACCAACGTGGTGAGGATTCGAAAGAATACATCTACTTACGTGGTGGTACAATTTACCCATTCGTGACAAACCAATTTGCTGATACTCCATATTTAGAGAATAATCCTGTAGGTGTCGCTTTTGATCAAAGTAAAGTCCCACAATCAGTTAATGCTAGGGTAGGTGCAAATGCATCGGCTATTAGTAGTCTTGATTCTAAGATCAATATTGTAGGAGATAAGGTTGATGTTAACGCACAAGCTATCACAGGGTTACAAGCTGAGATAAAGGACAAAGCAAGTTCAGAAGCTCTAAATCAACTATCTGTAACAGTTAGAGATCAAGGTCAATTAATTGATACACAAGGTCAGGCGATTACAAAGGTTGAGTCTAAAGTTGATAATATTGCTGTTGGTGGCAAGAATTTAATCAGGGACTCAGGTACTTGGTTAGGAGACCCATTGGCTGCTGCTACTGGAATCCAATCAGCATATTCTGCTAACCGTGATGTGATGTTTGTATGGGCTTCACCTAATAATGAAGGATGGTTAACTAATTTTTTCAGTGGAGAACAACTTGCAGATATTGACCCTAACTTAAATGAGAACGATGATGTTATCTTCTCTGTAGATATTCTTATCGAAACTGGAAGTACCGTAAAAGGTCCGAGTATCTACTGGAAAGATTCAATGTATTATGCACCTGTAGCTTTAGCTAAAGGCCAAGAGTTTAGGTACAACGAATGGTATAGATTTTACCAGTTACGTAAGTATGTTAAAGGTGGTTTGGCATTCCATTTTAGCTTTGCAGATATGGTTGGTACTTACCGTTTTAGAAGGCCAGTTATTGAAAAAGGTAATATCCCTACTGATTGGACTATTTCTGATGGAGATTTTGCAACAGCGAGGGCTGTACAAACACTTAACACTAAAGTTGATAACGTTGATAACAAAGTCAACGTTAATGCTCAGGCAATTACAGACCTTCGCTCATCTCTTGATGGTAAGGCAAATGCTCAAGCTCTTAATGAGCTTAGTACTATTGTCCAAGAGCAAGGTGAGACAATTCAATCTCAAGGTAAAGTCTTGACATCTGTTGAGGCTACAGCGAATAGGACCTCAAGTCAACTTGGAACTACAGTTTCTTACATGCTATACACATTTAGGAATGGTGCTTCGTCAATTACCAAAACTGGTTTATACAAAGCTGATGGAACACGACTGGAAGGTATTGCTCGTGGCCTTAGCGTGTATTTGTTCGCTGCTAATGGTGATTATGTGGGTTTAAGATTCTTCGATACTTATGGAGATATGGACAATGCATGTAATAATATGATTGCATACTTGTCTGACTTACCTCAGAACTCATTTATTGCAATTGCAGGGTGTGATAACCTTGGTCCATTAAGCTGGCCTTCAGGTCCCCCAAAAGCATTAAGGGATCACCTTAGAGACGTATGGGGTGTTGCACAAAGCTCAGTAGATAAATGGCAATATAATGACATTCCAATAGTTATTTGTCGTAAATGGGGTCCTAAAAACTCCGCTATTGACAAGCTGTACACATCTAGTGTTAATGGAGACTGGTACTCTTTGGGTATTACCTTCATTGATGG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Genome Context
Tertiary structure
YP_009813884.1
ColabFold structure
Source
ColabFold
pLDDT
59.4
Oligomeric state
monomer
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequence of five Acinetobacter baumannii phages from Abidjan, Cote d'Ivoire | Essoh,C., Vernadet,J.-P., Vergnaud,G., Resch,G. and Pourcel,C. | 2019-01-03 | — | GenBank |