Protein

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Genbank accession
YP_009813884.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,77
Protein sequence
MDNLDNGLELLSGRLVVLFLTYDLALKASANFPAGTKVKVTNDPNPDLNGEYTWDGTKLVKTTNNTLEKAKEEAEKIVNDKIDNTLTKDKILDLISGEITESDLDQNLRQRIDEIESISPIIDKLKKDVKKSKEEVDEKVFFLNVDYQNLKEEVQNIQLQVDLDFQAIQDRIDQIQAEVDAKWLEVDQIRDDLTKEINDRVAAVREETEQRIEDVRKLNDGLTQEIIDRKDGDQKLYENIENYKVSNDGALANVRDEVKVAVETANASAEKVNTMDARVTVAEDNAGTALENSAAAVNKANAAAGLASATAGRVDNMQADVTKALDDSGKALTNSATAIEQSQVAVDKANSAAESVTILESKLNSKNATYRQDTAPTKDTHPNLTEGDLWINPSANNEQKRWNGTDWVDISDVRVGQNATAISELKTSVKEQDDKITSVSERVDNLQASIGDMATSEALELLKGTVTEQGGKINANTEKLVAIETTVGQNQEANAKALQDLTTRIEKDEDDIKANTSAITALDSTVNASLNAINITADMNLENDLIYYNSSSQNVVKSISESGTTRRVLTIGDNSSDDMAWMYPKAMLPYDPDVMYKVRAKLRRLSGDGAIYLGLVVKNSDKTQFVTSNNILSDNVSSSSYFADGVIPPLNEWVEYEWYIKGRASSSALLPPTYGGLGNPIQMQNATGYITPVFIANYSGLSGVVELAYMVLERAEAYKVISANANALTSLKTDVQKNTDGIQAMGEAITNVEASITNMDIGGQNHWTIWPIEPTQSDADNPYLSVQWLTESQEWIRTTLTKDVNSYHHSFDGLLIDLSYPIVIGELYTLTFEMRASKAIPIAATTINFGTNVTYTDNSLTTDTEWKTYTITFPTKGTLTSKSNQAFGLTLLKGHGWTTNDWYELRRIQMQKGNKATRYQKAQAGLVEGIKANSQAFNGLKATVEQQGEDIKSQGQAITGLKQEIADKASSQALSELKSTVEQQGESIRINTEAITSLKGVVDGKADADALNSLKVTVQEQGETLLTQGQAITSVRATADLALNGKKTLIDLTAFDPNLYYPVFIPVSTTGISEIEISPKLGDFQAPWSTHYSGSYSLGVRWTTRGHGWGAEAIDRVIEKFDYAWCGDQSPAMEINQRGEDSKEYIYLRGGTIYPFVTNQFADTPYLENNPVGVAFDQSKVPQSVNARVGANASAISSLDSKINIVGDKVDVNAQAITGLQAEIKDKASSEALNQLSVTVRDQGQLIDTQGQAITKVESKVDNIAVGGKNLIRDSGTWLGDPLAAATGIQSAYSANRDVMFVWASPNNEGWLTNFFSGEQLADIDPNLNENDDVIFSVDILIETGSTVKGPSIYWKDSMYYAPVALAKGQEFRYNEWYRFYQLRKYVKGGLAFHFSFADMVGTYRFRRPVIEKGNIPTDWTISDGDFATARAVQTLNTKVDNVDNKVNVNAQAITDLRSSLDGKANAQALNELSTIVQEQGETIQSQGKVLTSVEATANRTSSQLGTTVSYMLYTFRNGASSITKTGLYKADGTRLEGIARGLSVYLFAANGDYVGLRFFDTYGDMDNACNNMIAYLSDLPQNSFIAIAGCDNLGPLSWPSGPPKALRDHLRDVWGVAQSSVDKWQYNDIPIVICRKWGPKNSAIDKLYTSSVNGDWYSLGITFIDGIPNDWGGDTSKTNIEANASAISTMNADVIKNRDDIRVNAEAITGLSGRIDGKADAQALSQLQTTVREQGETISSQGQAITQVQASADMALNGKKYVVDLTALDPNLYYPVFIPVSSGSGISEISVSASLDEYRTPWSSHGSGTYSLNVMWRTRGSGWGANSVEREVIRFGYAWCGDQSPVIEINQQGDRSREYIYLRGGTQYPFYVNQYAGQPFTDLGNYGGVPYRTDLMPVSTNQRTYANASAVSTLNAKVDIVDGKATSAAESVTKLQTSSSAATYQLLRGSNRIGEKPVGSNPYPFWSQPIDKPLTAGKTYTLVYEAEFQSGGANSYFRPYFNGTQDISQTNQSFGRQVKVDKAVLWFAETTAIDFYIVGSQPDQNNSYAKVYWACLYEEDQPNPIKVWMPNTRENSAKLEVQGQSIDGLMTKWSVKADVNGYVSGVAMNNNGREANFIIRADTFAIAPPVGSGGGDVPKYGFVYQASAKTLPNGTVIPAGLYVDSLMLGEINAEKINANSLSAISANLGTFTSSNAKGTMTISGTDISVKDTNGVERIFIGL
Physico‐chemical
properties
protein length:2223 AA
molecular weight: 242858,34640 Da
isoelectric point:4,75745
aromaticity:0,08007
hydropathy:-0,38794

Domains

Domains [InterPro]
DC_0308
STR
21–954
DC_0308 DC_0338 DC_1169 DC_0793
Coil
Unmapped
60–84
Coil Coil Coil Coil IPR008979 DC_0793 DC_0793
G3DSA:2.60.120.260
STR
800–922
G3DSA:2.60.120.260
YP_009813884.1
1 2223
Architecture
STR
STR
RBD
STR
STR 21-954 | STR 963-1161 | RBD 1169-1219 | STR 1220-2215 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage vB_AbaM_B09_Aci05
[NCBI] 		2315458 Uroviricota > Caudoviricetes > Saclayvirus >
Host Acinetobacter baumannii
[NCBI] 		470 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009813884.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048080.1 [NCBI]
CDS location
range 19448 -> 26119
strand +
CDS
ATGGATAATTTAGACAACGGTTTAGAGTTATTATCAGGTAGATTAGTAGTCTTATTTTTAACTTATGATTTGGCTTTGAAAGCTTCTGCTAATTTTCCAGCTGGAACCAAAGTCAAAGTAACCAATGACCCAAACCCTGATTTAAATGGTGAATATACTTGGGATGGAACAAAGTTAGTAAAAACTACAAATAACACACTTGAGAAGGCTAAAGAGGAAGCTGAAAAGATTGTCAATGATAAAATAGACAATACTTTAACTAAAGATAAGATTTTAGACCTTATCTCTGGTGAAATTACAGAAAGTGACTTAGATCAAAACTTAAGACAACGTATAGATGAGATTGAAAGTATTTCACCGATCATCGATAAGTTGAAGAAAGATGTGAAAAAATCTAAGGAAGAGGTGGATGAGAAAGTTTTCTTCTTAAATGTTGATTATCAGAATTTGAAAGAAGAAGTTCAGAATATCCAACTCCAAGTAGATTTAGATTTCCAAGCGATTCAAGATCGTATTGATCAGATTCAAGCTGAAGTTGACGCTAAATGGCTTGAAGTTGACCAAATTAGAGATGATTTAACAAAAGAAATTAATGATCGTGTTGCTGCTGTCCGTGAGGAAACAGAACAACGTATCGAAGATGTAAGAAAATTAAATGATGGTTTAACTCAAGAGATTATTGATCGTAAAGATGGTGATCAGAAGTTATATGAAAACATCGAAAATTATAAAGTGTCAAATGATGGTGCTCTTGCTAATGTAAGAGATGAAGTTAAGGTTGCTGTTGAGACAGCCAATGCTTCTGCTGAAAAAGTAAATACTATGGATGCCAGAGTTACAGTTGCAGAGGATAATGCTGGGACTGCTTTAGAAAACTCTGCTGCTGCCGTTAATAAGGCCAATGCTGCTGCTGGTTTAGCTAGTGCAACTGCTGGTCGTGTTGACAATATGCAAGCTGATGTAACAAAGGCTCTTGATGATTCAGGTAAAGCTCTTACAAACTCTGCTACAGCTATCGAGCAATCGCAAGTTGCTGTTGATAAAGCTAATTCTGCTGCTGAGTCTGTCACTATACTTGAATCAAAGCTTAACAGCAAGAATGCTACATACAGACAAGATACTGCACCAACAAAAGACACTCATCCAAATTTAACTGAAGGTGATTTATGGATTAACCCTTCAGCTAACAATGAACAAAAACGCTGGAATGGTACTGACTGGGTTGACATTTCAGATGTTCGTGTAGGTCAGAATGCTACAGCTATCTCAGAGTTAAAAACCTCTGTAAAAGAGCAAGATGATAAAATCACTTCTGTTTCTGAGAGAGTTGATAATTTACAAGCAAGTATTGGAGATATGGCTACTTCAGAAGCCCTTGAGTTGTTAAAGGGAACTGTAACCGAACAGGGTGGCAAAATCAATGCCAATACAGAGAAGCTTGTGGCTATTGAGACGACTGTTGGGCAAAACCAAGAAGCGAATGCTAAAGCTCTTCAAGATTTAACAACTCGCATTGAGAAAGATGAAGATGATATTAAGGCAAACACCTCAGCTATCACAGCATTGGATTCAACAGTAAATGCATCATTGAATGCAATCAACATCACAGCTGATATGAACCTTGAAAATGACTTGATATACTACAATAGTTCATCACAAAATGTTGTTAAGTCAATCTCTGAATCAGGTACAACAAGAAGGGTTTTAACTATTGGAGACAATAGTAGTGATGATATGGCTTGGATGTATCCAAAAGCCATGTTACCTTATGATCCAGATGTTATGTACAAGGTAAGAGCTAAGTTAAGACGCTTATCTGGAGATGGTGCTATTTACCTTGGATTAGTTGTTAAGAATAGTGATAAAACCCAATTTGTTACTTCTAACAACATATTATCAGATAATGTTTCTAGTTCATCTTATTTTGCTGATGGAGTCATTCCTCCATTAAATGAGTGGGTTGAATATGAGTGGTATATTAAAGGTAGAGCTTCTTCTAGCGCTCTTCTTCCACCTACATATGGTGGCTTAGGAAACCCTATCCAAATGCAGAACGCTACTGGATACATCACCCCTGTTTTTATTGCTAACTATTCAGGTTTATCTGGTGTTGTTGAACTTGCTTATATGGTATTAGAGAGAGCTGAAGCATACAAAGTTATTTCAGCAAATGCTAATGCGCTGACAAGTCTTAAAACAGATGTCCAGAAAAATACTGATGGCATTCAAGCAATGGGTGAGGCTATCACTAATGTTGAAGCTTCTATCACAAATATGGATATTGGTGGACAAAACCATTGGACTATTTGGCCTATTGAACCAACACAATCTGATGCTGACAATCCTTACCTTTCTGTACAATGGTTAACCGAGAGTCAGGAATGGATTAGGACTACACTCACAAAGGATGTAAATTCTTACCATCACTCTTTTGATGGTTTACTGATTGATCTGAGCTATCCTATCGTTATTGGTGAGTTATATACACTGACATTCGAGATGAGGGCTTCTAAGGCAATCCCTATTGCAGCTACCACAATTAACTTTGGTACTAATGTCACTTATACAGATAATAGCTTAACAACTGATACTGAATGGAAGACATACACAATCACATTCCCAACAAAAGGGACATTGACATCTAAGTCCAATCAAGCATTTGGTTTAACATTGCTTAAAGGTCATGGATGGACTACAAATGATTGGTATGAGTTAAGACGTATCCAAATGCAAAAGGGTAACAAAGCTACTCGATACCAAAAAGCTCAAGCTGGACTGGTTGAAGGAATCAAAGCTAACTCTCAAGCATTTAATGGCTTAAAAGCTACTGTTGAACAGCAAGGTGAAGATATCAAGTCTCAAGGTCAAGCTATCACAGGGCTTAAGCAAGAAATTGCTGACAAAGCAAGTTCTCAAGCACTGTCGGAATTGAAGTCTACTGTTGAACAGCAAGGTGAGAGTATTCGTATTAATACCGAAGCAATTACATCATTAAAAGGTGTAGTTGATGGTAAAGCCGATGCAGATGCCTTGAATAGTTTAAAAGTTACAGTCCAAGAGCAAGGTGAAACACTTTTAACTCAAGGTCAAGCTATAACTTCTGTTAGGGCGACAGCCGATCTTGCACTGAATGGTAAGAAAACTTTAATTGACTTAACAGCATTTGATCCTAATCTTTACTACCCCGTATTTATTCCTGTAAGTACAACAGGTATCTCAGAGATTGAGATTTCCCCAAAACTTGGAGATTTTCAAGCTCCTTGGTCCACACACTACAGTGGCTCATATTCACTTGGTGTTCGATGGACAACTCGTGGACATGGGTGGGGTGCAGAGGCAATTGATAGGGTTATTGAAAAATTTGATTATGCTTGGTGTGGTGATCAGTCTCCAGCAATGGAAATTAACCAACGTGGTGAGGATTCGAAAGAATACATCTACTTACGTGGTGGTACAATTTACCCATTCGTGACAAACCAATTTGCTGATACTCCATATTTAGAGAATAATCCTGTAGGTGTCGCTTTTGATCAAAGTAAAGTCCCACAATCAGTTAATGCTAGGGTAGGTGCAAATGCATCGGCTATTAGTAGTCTTGATTCTAAGATCAATATTGTAGGAGATAAGGTTGATGTTAACGCACAAGCTATCACAGGGTTACAAGCTGAGATAAAGGACAAAGCAAGTTCAGAAGCTCTAAATCAACTATCTGTAACAGTTAGAGATCAAGGTCAATTAATTGATACACAAGGTCAGGCGATTACAAAGGTTGAGTCTAAAGTTGATAATATTGCTGTTGGTGGCAAGAATTTAATCAGGGACTCAGGTACTTGGTTAGGAGACCCATTGGCTGCTGCTACTGGAATCCAATCAGCATATTCTGCTAACCGTGATGTGATGTTTGTATGGGCTTCACCTAATAATGAAGGATGGTTAACTAATTTTTTCAGTGGAGAACAACTTGCAGATATTGACCCTAACTTAAATGAGAACGATGATGTTATCTTCTCTGTAGATATTCTTATCGAAACTGGAAGTACCGTAAAAGGTCCGAGTATCTACTGGAAAGATTCAATGTATTATGCACCTGTAGCTTTAGCTAAAGGCCAAGAGTTTAGGTACAACGAATGGTATAGATTTTACCAGTTACGTAAGTATGTTAAAGGTGGTTTGGCATTCCATTTTAGCTTTGCAGATATGGTTGGTACTTACCGTTTTAGAAGGCCAGTTATTGAAAAAGGTAATATCCCTACTGATTGGACTATTTCTGATGGAGATTTTGCAACAGCGAGGGCTGTACAAACACTTAACACTAAAGTTGATAACGTTGATAACAAAGTCAACGTTAATGCTCAGGCAATTACAGACCTTCGCTCATCTCTTGATGGTAAGGCAAATGCTCAAGCTCTTAATGAGCTTAGTACTATTGTCCAAGAGCAAGGTGAGACAATTCAATCTCAAGGTAAAGTCTTGACATCTGTTGAGGCTACAGCGAATAGGACCTCAAGTCAACTTGGAACTACAGTTTCTTACATGCTATACACATTTAGGAATGGTGCTTCGTCAATTACCAAAACTGGTTTATACAAAGCTGATGGAACACGACTGGAAGGTATTGCTCGTGGCCTTAGCGTGTATTTGTTCGCTGCTAATGGTGATTATGTGGGTTTAAGATTCTTCGATACTTATGGAGATATGGACAATGCATGTAATAATATGATTGCATACTTGTCTGACTTACCTCAGAACTCATTTATTGCAATTGCAGGGTGTGATAACCTTGGTCCATTAAGCTGGCCTTCAGGTCCCCCAAAAGCATTAAGGGATCACCTTAGAGACGTATGGGGTGTTGCACAAAGCTCAGTAGATAAATGGCAATATAATGACATTCCAATAGTTATTTGTCGTAAATGGGGTCCTAAAAACTCCGCTATTGACAAGCTGTACACATCTAGTGTTAATGGAGACTGGTACTCTTTGGGTATTACCTTCATTGATGG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f97a0029b51589b5458c36337356cc9d217606056b02465ff193adc5154181dc
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5939
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of five Acinetobacter baumannii phages from Abidjan, Cote d'Ivoire Essoh,C., Vernadet,J.-P., Vergnaud,G., Resch,G. and Pourcel,C. 2019-01-03 — GenBank