Protein

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Genbank accession
WPH64131.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
Protein sequence
MEDKDKNLLQISEEMNSIKSKINSLVQDQDSIKNLSEDNKNKINVLNENLDNIDKENDNLIEKLRNLDGSHDIDLDLSNYVTLDTLKTELRKYQKLSIDYIDRLAEGGWDSDIKGNLENLNGRVSANEESISSTMSKVNKYDSTIQYLSTKVEQTAESIKSIATDYTLNEINQSITKLESFREQTARVLQDTVTRADIDTMNNKVTEFESQVSQFADLIEQTVSKSEIDGITIGGKNLLENSLAIKGNWLLYPESLSSTKENALTFGQDNNGKSYFTINTDGIEGEVGTISYNSFPLKYNETYTISFDFRSDTFNRLDHCYFIDPSGNYTTPIAEKYLDIDEEWHRYSFVYKQTLTGRNSTKLLIGVDTDLNQLNGTFDISSVKVERGSVSSDWTPAPEDFDNMLENYNKDINNKIDNIEENAIGLGDTVTEAFKDGIISNAEKIAIEKQKNIIDKDKKEIDQIFNSLYANKMMTNSVKTELKNNYDLFNEKYNILLQDITNTISDGIATKEEVAQFNTNFLRYNEAQSNIKSSIQKAVDNISNGYAVDEASKITVGGMNLVSYENILAIGSATLNKNTYKENGEMNVALTANGQGIKFKLDKVRNRREHVLGFNLEKKTGTLTNVDINIPNASVTSCSVNGNKIGSDSRSITFNDTSSLTFIEVVFIPNDSFTTNTPTEIVINRNGTFPLSVDVEGLKVEEGNKATAWQPSIKDSNARITNMESRISQNEKNIDLSVTKETYNADKSKMEKMGSALSILADGISMSSSSNDKLSSFDIDPNSIKLKSKMVDINDGDVIISNGKATIKEASITNLMSKNIVVQTMLDAMGEVKGGITIKRPDGGYLVYNGMPRFTTAYVRSEPGVQDLMSNGTPRFKNVGNAFMFSDKTTGKYFRRAMTMYGQHETRWLHIGIWYATPQCGIDIKVDSFNDQNGVFFDKTVSIPKDTSTSVTKTKHKEIIVDMGIPAQSIASIAIRARVKPGQKGNAWILNSYVYGRN
Physico‐chemical
properties
protein length:998 AA
molecular weight: 111508,26500 Da
isoelectric point:5,00231
aromaticity:0,07515
hydropathy:-0,54359

Domains

Domains [InterPro]
DC_0899
STR
5–323
DC_0899 DC_1035
Coil
Unmapped
36–70
Coil G3DSA:2.60.120.260 Coil
IPR008979
STR
247–386
IPR008979
DC_1272
STR
269–634
DC_1272
WPH64131.1
1 998
Architecture
STR
RBD
STR 5-634 | RBD 635-995 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage vB_StaM_PB50
[NCBI] 		3093914 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPH64131.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR770614 [NCBI]
CDS location
range 65989 -> 68985
strand +
CDS
ATGGAAGATAAAGATAAAAATCTCTTACAAATAAGTGAAGAGATGAATTCTATTAAGTCTAAGATAAATTCTTTAGTTCAAGATCAAGATAGTATTAAGAATTTATCAGAAGATAATAAGAATAAGATTAATGTACTTAATGAAAATCTGGATAATATTGATAAAGAAAATGATAACTTAATAGAAAAATTAAGAAATTTAGATGGTAGTCATGATATTGATTTAGATCTTTCTAATTATGTTACACTTGATACACTTAAAACAGAATTAAGAAAATATCAAAAATTAAGTATTGACTATATTGATAGATTAGCTGAAGGTGGTTGGGATTCTGATATTAAAGGTAATTTAGAAAACCTTAATGGCAGAGTCTCAGCTAATGAAGAATCAATTTCTTCAACTATGTCTAAAGTTAATAAATATGATTCAACTATTCAATACTTAAGCACTAAGGTTGAACAAACAGCTGAGTCTATTAAGAGTATTGCTACTGATTACACACTTAATGAAATTAATCAAAGTATTACTAAATTAGAATCATTTAGAGAACAAACAGCTAGAGTTTTACAAGATACAGTTACTAGAGCTGATATAGATACTATGAATAATAAAGTAACTGAATTTGAAAGTCAAGTATCTCAGTTTGCAGATTTAATAGAACAGACTGTTTCTAAATCAGAAATTGACGGAATTACTATTGGTGGTAAAAACTTACTAGAAAATTCATTAGCTATTAAAGGTAATTGGTTATTATACCCTGAAAGTTTATCTTCAACTAAAGAGAATGCTTTAACATTTGGTCAAGATAATAACGGTAAGAGTTATTTTACTATTAATACCGATGGAATAGAAGGAGAAGTTGGAACTATAAGCTATAATTCTTTCCCTTTAAAATATAATGAAACTTATACTATTTCATTTGATTTTAGATCAGATACATTTAATAGACTTGATCATTGTTACTTCATTGATCCTTCAGGTAATTATACTACACCTATTGCTGAAAAATATTTAGATATTGATGAAGAATGGCATAGATACTCATTTGTATATAAACAAACTTTAACTGGAAGAAATAGTACAAAATTATTAATTGGTGTAGATACTGATTTAAATCAATTAAATGGTACATTTGATATATCTAGTGTTAAAGTTGAAAGAGGTAGTGTATCATCTGACTGGACTCCTGCTCCAGAAGACTTTGATAATATGTTAGAGAATTATAATAAAGATATCAATAATAAAATAGATAATATTGAAGAAAATGCTATTGGGTTAGGTGATACTGTTACTGAAGCTTTTAAAGATGGTATTATATCTAATGCAGAAAAAATAGCTATTGAAAAGCAAAAGAATATTATTGATAAAGATAAAAAAGAAATAGATCAAATATTTAATTCATTATATGCAAATAAAATGATGACAAATAGTGTTAAAACTGAATTGAAAAATAATTATGATTTATTCAATGAAAAATATAATATATTACTACAAGATATAACTAATACAATTTCAGATGGAATAGCTACTAAAGAAGAAGTAGCTCAATTTAATACAAATTTCTTAAGATATAATGAAGCTCAATCAAATATTAAATCATCTATTCAAAAGGCAGTAGATAATATTTCTAATGGCTATGCAGTTGATGAAGCTAGTAAAATCACTGTAGGTGGAATGAACTTAGTAAGTTATGAAAATATTTTAGCTATAGGATCTGCAACTCTAAATAAGAATACTTATAAAGAGAACGGTGAAATGAATGTAGCTTTAACTGCTAATGGACAAGGTATTAAATTTAAATTAGATAAAGTGAGAAATAGACGTGAACATGTATTAGGTTTTAATTTAGAAAAGAAAACTGGTACACTTACAAATGTTGATATTAATATTCCTAATGCTTCTGTAACTTCTTGTTCTGTTAATGGTAATAAAATTGGAAGTGATTCTAGAAGTATTACATTTAACGATACATCATCATTGACATTTATTGAAGTTGTATTTATACCTAATGACAGTTTCACAACTAATACTCCTACAGAAATCGTTATTAATCGTAATGGCACATTCCCATTATCTGTAGATGTAGAAGGGTTAAAAGTGGAAGAAGGTAATAAAGCTACTGCTTGGCAACCTTCTATTAAAGACAGTAATGCTAGAATTACTAATATGGAAAGTAGAATTAGTCAGAATGAAAAGAATATAGATTTAAGTGTAACTAAAGAAACGTACAATGCAGATAAATCTAAAATGGAAAAAATGGGATCAGCTTTATCTATTTTAGCAGATGGTATTAGTATGTCATCTTCATCTAATGATAAATTGTCTTCTTTTGATATTGATCCTAATAGCATTAAATTAAAATCTAAAATGGTTGATATTAATGATGGCGATGTAATAATTTCTAATGGTAAAGCTACTATTAAAGAAGCTTCTATTACTAATTTAATGTCTAAAAATATAGTTGTCCAAACTATGTTAGATGCAATGGGTGAAGTTAAAGGTGGTATTACTATTAAACGTCCTGATGGAGGTTACTTAGTATATAATGGTATGCCAAGATTTACTACAGCTTATGTGCGTTCTGAACCAGGTGTGCAAGATTTAATGTCTAATGGTACTCCTAGATTTAAGAATGTTGGTAATGCATTTATGTTTAGTGATAAGACTACCGGTAAATACTTCAGACGTGCTATGACAATGTATGGTCAACATGAAACTAGATGGTTGCATATAGGTATTTGGTATGCTACTCCTCAATGTGGTATTGATATTAAAGTAGATTCATTTAATGACCAAAATGGAGTATTCTTTGATAAAACTGTGTCTATACCTAAAGATACGTCAACTAGTGTAACTAAGACAAAACATAAAGAAATTATTGTAGATATGGGTATTCCAGCACAATCTATAGCTTCTATAGCAATTCGTGCAAGAGTTAAACCTGGTCAAAAAGGTAATGCTTGGATTCTTAACTCATATGTTTATGGTAGAAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b1e83d64bbd3c8cf84ee3d2f8b8c25950d0a8ce5ded76368cf916a1a1cc67e88
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6497
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence analysis of a novel Staphylococcus aureus phage vB_StaM_PB50 Li,J. 2012-12-15 — GenBank