Genbank accession
WPH64131.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,61
Protein sequence
MEDKDKNLLQISEEMNSIKSKINSLVQDQDSIKNLSEDNKNKINVLNENLDNIDKENDNLIEKLRNLDGSHDIDLDLSNYVTLDTLKTELRKYQKLSIDYIDRLAEGGWDSDIKGNLENLNGRVSANEESISSTMSKVNKYDSTIQYLSTKVEQTAESIKSIATDYTLNEINQSITKLESFREQTARVLQDTVTRADIDTMNNKVTEFESQVSQFADLIEQTVSKSEIDGITIGGKNLLENSLAIKGNWLLYPESLSSTKENALTFGQDNNGKSYFTINTDGIEGEVGTISYNSFPLKYNETYTISFDFRSDTFNRLDHCYFIDPSGNYTTPIAEKYLDIDEEWHRYSFVYKQTLTGRNSTKLLIGVDTDLNQLNGTFDISSVKVERGSVSSDWTPAPEDFDNMLENYNKDINNKIDNIEENAIGLGDTVTEAFKDGIISNAEKIAIEKQKNIIDKDKKEIDQIFNSLYANKMMTNSVKTELKNNYDLFNEKYNILLQDITNTISDGIATKEEVAQFNTNFLRYNEAQSNIKSSIQKAVDNISNGYAVDEASKITVGGMNLVSYENILAIGSATLNKNTYKENGEMNVALTANGQGIKFKLDKVRNRREHVLGFNLEKKTGTLTNVDINIPNASVTSCSVNGNKIGSDSRSITFNDTSSLTFIEVVFIPNDSFTTNTPTEIVINRNGTFPLSVDVEGLKVEEGNKATAWQPSIKDSNARITNMESRISQNEKNIDLSVTKETYNADKSKMEKMGSALSILADGISMSSSSNDKLSSFDIDPNSIKLKSKMVDINDGDVIISNGKATIKEASITNLMSKNIVVQTMLDAMGEVKGGITIKRPDGGYLVYNGMPRFTTAYVRSEPGVQDLMSNGTPRFKNVGNAFMFSDKTTGKYFRRAMTMYGQHETRWLHIGIWYATPQCGIDIKVDSFNDQNGVFFDKTVSIPKDTSTSVTKTKHKEIIVDMGIPAQSIASIAIRARVKPGQKGNAWILNSYVYGRN
Physico‐chemical
properties
protein length:998 AA
molecular weight: 111508,26500 Da
isoelectric point:5,00231
aromaticity:0,07515
hydropathy:-0,54359

Domains

View on InterPro
WPH64131.1
1 998 aa
STR 236–388 ·

ATT Attachment Domain STR Structural Domain RBD Receptor-Binding Domain CBM Carbohydrate-Binding Module LEC Lectin-like Domain ENZ Enzymatic Domain CHP Intramolecular Chaperone LNK Linker/Spacer Domain TAS Tail-Associated Structural TTP Tail Tubular Protein UNK Uncharacterized Domain Unmapped

Taxonomy

Phage
Staphylococcus phage vB_StaM_PB50 [NCBI] · taxon 3093914
Host

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
WPH64131.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR770614 [NCBI]
CDS location
range 65989 -> 68985
strand +
CDS
ATGGAAGATAAAGATAAAAATCTCTTACAAATAAGTGAAGAGATGAATTCTATTAAGTCTAAGATAAATTCTTTAGTTCAAGATCAAGATAGTATTAAGAATTTATCAGAAGATAATAAGAATAAGATTAATGTACTTAATGAAAATCTGGATAATATTGATAAAGAAAATGATAACTTAATAGAAAAATTAAGAAATTTAGATGGTAGTCATGATATTGATTTAGATCTTTCTAATTATGTTACACTTGATACACTTAAAACAGAATTAAGAAAATATCAAAAATTAAGTATTGACTATATTGATAGATTAGCTGAAGGTGGTTGGGATTCTGATATTAAAGGTAATTTAGAAAACCTTAATGGCAGAGTCTCAGCTAATGAAGAATCAATTTCTTCAACTATGTCTAAAGTTAATAAATATGATTCAACTATTCAATACTTAAGCACTAAGGTTGAACAAACAGCTGAGTCTATTAAGAGTATTGCTACTGATTACACACTTAATGAAATTAATCAAAGTATTACTAAATTAGAATCATTTAGAGAACAAACAGCTAGAGTTTTACAAGATACAGTTACTAGAGCTGATATAGATACTATGAATAATAAAGTAACTGAATTTGAAAGTCAAGTATCTCAGTTTGCAGATTTAATAGAACAGACTGTTTCTAAATCAGAAATTGACGGAATTACTATTGGTGGTAAAAACTTACTAGAAAATTCATTAGCTATTAAAGGTAATTGGTTATTATACCCTGAAAGTTTATCTTCAACTAAAGAGAATGCTTTAACATTTGGTCAAGATAATAACGGTAAGAGTTATTTTACTATTAATACCGATGGAATAGAAGGAGAAGTTGGAACTATAAGCTATAATTCTTTCCCTTTAAAATATAATGAAACTTATACTATTTCATTTGATTTTAGATCAGATACATTTAATAGACTTGATCATTGTTACTTCATTGATCCTTCAGGTAATTATACTACACCTATTGCTGAAAAATATTTAGATATTGATGAAGAATGGCATAGATACTCATTTGTATATAAACAAACTTTAACTGGAAGAAATAGTACAAAATTATTAATTGGTGTAGATACTGATTTAAATCAATTAAATGGTACATTTGATATATCTAGTGTTAAAGTTGAAAGAGGTAGTGTATCATCTGACTGGACTCCTGCTCCAGAAGACTTTGATAATATGTTAGAGAATTATAATAAAGATATCAATAATAAAATAGATAATATTGAAGAAAATGCTATTGGGTTAGGTGATACTGTTACTGAAGCTTTTAAAGATGGTATTATATCTAATGCAGAAAAAATAGCTATTGAAAAGCAAAAGAATATTATTGATAAAGATAAAAAAGAAATAGATCAAATATTTAATTCATTATATGCAAATAAAATGATGACAAATAGTGTTAAAACTGAATTGAAAAATAATTATGATTTATTCAATGAAAAATATAATATATTACTACAAGATATAACTAATACAATTTCAGATGGAATAGCTACTAAAGAAGAAGTAGCTCAATTTAATACAAATTTCTTAAGATATAATGAAGCTCAATCAAATATTAAATCATCTATTCAAAAGGCAGTAGATAATATTTCTAATGGCTATGCAGTTGATGAAGCTAGTAAAATCACTGTAGGTGGAATGAACTTAGTAAGTTATGAAAATATTTTAGCTATAGGATCTGCAACTCTAAATAAGAATACTTATAAAGAGAACGGTGAAATGAATGTAGCTTTAACTGCTAATGGACAAGGTATTAAATTTAAATTAGATAAAGTGAGAAATAGACGTGAACATGTATTAGGTTTTAATTTAGAAAAGAAAACTGGTACACTTACAAATGTTGATATTAATATTCCTAATGCTTCTGTAACTTCTTGTTCTGTTAATGGTAATAAAATTGGAAGTGATTCTAGAAGTATTACATTTAACGATACATCATCATTGACATTTATTGAAGTTGTATTTATACCTAATGACAGTTTCACAACTAATACTCCTACAGAAATCGTTATTAATCGTAATGGCACATTCCCATTATCTGTAGATGTAGAAGGGTTAAAAGTGGAAGAAGGTAATAAAGCTACTGCTTGGCAACCTTCTATTAAAGACAGTAATGCTAGAATTACTAATATGGAAAGTAGAATTAGTCAGAATGAAAAGAATATAGATTTAAGTGTAACTAAAGAAACGTACAATGCAGATAAATCTAAAATGGAAAAAATGGGATCAGCTTTATCTATTTTAGCAGATGGTATTAGTATGTCATCTTCATCTAATGATAAATTGTCTTCTTTTGATATTGATCCTAATAGCATTAAATTAAAATCTAAAATGGTTGATATTAATGATGGCGATGTAATAATTTCTAATGGTAAAGCTACTATTAAAGAAGCTTCTATTACTAATTTAATGTCTAAAAATATAGTTGTCCAAACTATGTTAGATGCAATGGGTGAAGTTAAAGGTGGTATTACTATTAAACGTCCTGATGGAGGTTACTTAGTATATAATGGTATGCCAAGATTTACTACAGCTTATGTGCGTTCTGAACCAGGTGTGCAAGATTTAATGTCTAATGGTACTCCTAGATTTAAGAATGTTGGTAATGCATTTATGTTTAGTGATAAGACTACCGGTAAATACTTCAGACGTGCTATGACAATGTATGGTCAACATGAAACTAGATGGTTGCATATAGGTATTTGGTATGCTACTCCTCAATGTGGTATTGATATTAAAGTAGATTCATTTAATGACCAAAATGGAGTATTCTTTGATAAAACTGTGTCTATACCTAAAGATACGTCAACTAGTGTAACTAAGACAAAACATAAAGAAATTATTGTAGATATGGGTATTCCAGCACAATCTATAGCTTCTATAGCAATTCGTGCAAGAGTTAAACCTGGTCAAAAAGGTAATGCTTGGATTCTTAACTCATATGTTTATGGTAGAAACTAA

Genome Context

Tertiary structure

WPH64131.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 65.0
Oligomeric state monomer

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence analysis of a novel Staphylococcus aureus phage vB_StaM_PB50 Li,J. 2012-12-15 GenBank