Protein

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Genbank accession
YP_009151939.1 [GenBank]
Protein name
neck passage structure protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,42
Seq2Symm
C1 confidence 0,861
C1 0,861
C2 0,114
C3 0,046
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MSKQWVDGELITADKLNEKVSPIDLKTTFFNNDKRNNDYSVISAGNDLYILNDIINKPGVINITGKFVTGTINLYLLRKNGNSFIVVDKETKTITDDGWNDIVTDFYAKGTGDEYIGIIGKVYFAYKGGKGFYNLSSADIKATKFITSNFVADSDFSIFATIENSNLSKVINEKIGNNEFKTGIKDFSKYTAMGASTTYVMNEPLKDGNLRLHIKSATIQNGSVCIVKKDGLKFTILDKKTINFVVGENLVDMNYKAIGDGTEYIATTGSINYENSGGNGLFSLSSGSSVGNINDSFNADDHTNWKTDMGIYVEYKSELSEKYDDLSKKINAVTPNFSLTDFNMPKYSEIVDPVGFVGRWFDKTVNGVRTRTTINQGSELYFKVKNTTTINVNFVLNSDLETPYFAYSIDGSAMKRQLITTSSLPAVTTDEHIVRVVVDGLNEHEDKWKGEKGVSFNNVTVDSGGTVTGVLPKNRKIMFFGDSITEGIRVLSMDANPNGNSATGAWPFIASEQLNSISYRVGFGASGVTTGGSGYVPPLLQNIDNMTASKTTPYYEPDIVVVNIGTNDGKSTSSNFITQFNTALDRLSIKYSGTPIFVILPFNGAKRSEITTCVSDRTNVYLIDTAGWGVSTTDGVHPNQAGGITAGNKTAEYITSILGKNYFI
Physico‐chemical
properties
protein length:664 AA
molecular weight: 72600,53380 Da
isoelectric point:5,44707
aromaticity:0,10392
hydropathy:-0,25949

Taxonomy

Phage
Leuconostoc phage Ln-8 [NCBI] · taxon 1536604
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host
Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides [NCBI] · taxon 33967
Bacteria Firmicutes Bacilli Lactobacillales Leuconostocaceae Leuconostoc

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_009151939.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_027377 [NCBI]
CDS location
range 25142 -> 27136
strand -
CDS
ATGAGCAAACAGTGGGTAGATGGTGAACTAATTACGGCAGATAAGTTAAATGAAAAAGTTTCTCCGATTGATTTAAAAACTACTTTTTTTAATAATGATAAACGAAATAATGATTATTCTGTTATTTCAGCTGGTAATGATTTATATATTTTAAATGATATAATTAACAAGCCGGGTGTAATTAATATCACTGGAAAATTCGTCACTGGTACAATCAATTTATACTTGTTAAGAAAAAACGGAAATAGTTTTATTGTCGTTGATAAAGAAACCAAAACAATAACTGATGATGGGTGGAATGATATTGTCACCGATTTTTATGCAAAGGGAACTGGGGACGAATACATAGGCATTATAGGGAAAGTTTATTTTGCTTATAAGGGTGGTAAGGGATTTTATAATTTGTCGTCGGCAGACATTAAGGCAACTAAATTTATAACTAGTAATTTTGTTGCAGATTCTGATTTTTCTATTTTCGCAACCATTGAAAATTCTAATCTGTCAAAAGTGATTAATGAAAAAATAGGAAACAATGAGTTCAAAACAGGCATAAAAGATTTTTCAAAATATACTGCAATGGGTGCCAGCACAACTTATGTTATGAATGAGCCGCTGAAAGATGGTAACTTGAGGCTCCACATAAAATCGGCAACCATCCAAAATGGGTCAGTATGTATTGTAAAAAAGGATGGTTTAAAGTTCACTATTTTAGATAAAAAAACAATTAATTTTGTTGTTGGAGAAAATTTAGTGGATATGAATTATAAGGCGATAGGAGATGGAACAGAATATATCGCAACAACTGGTAGTATTAATTATGAAAATTCTGGTGGTAACGGATTGTTCTCACTTTCTTCTGGTTCTTCTGTTGGCAATATAAATGATAGTTTTAATGCTGATGACCACACTAATTGGAAAACTGATATGGGTATATATGTTGAGTACAAAAGTGAACTATCGGAAAAGTATGATGATTTGTCAAAAAAGATAAACGCTGTCACGCCTAATTTTTCACTAACTGACTTTAACATGCCAAAGTATTCTGAAATTGTTGACCCAGTCGGCTTTGTGGGGCGCTGGTTTGATAAAACTGTCAATGGTGTTAGAACTAGAACGACCATTAACCAAGGGTCTGAATTATACTTCAAAGTAAAGAATACAACAACAATTAACGTTAATTTTGTTTTGAATAGCGATTTAGAAACGCCCTACTTTGCTTATTCGATTGACGGAAGCGCTATGAAAAGACAGCTAATTACCACATCTTCTCTACCAGCTGTGACGACTGATGAGCATATTGTTCGAGTTGTTGTTGATGGATTAAATGAACATGAAGATAAATGGAAAGGTGAAAAAGGTGTTTCGTTTAATAACGTAACTGTTGACTCAGGTGGAACCGTTACTGGTGTATTGCCTAAAAATCGTAAAATTATGTTCTTTGGTGATAGTATTACGGAAGGCATTCGTGTATTGAGCATGGACGCTAACCCAAATGGAAACAGCGCAACAGGGGCTTGGCCGTTTATTGCAAGTGAACAGTTGAATTCGATTTCCTATCGTGTTGGATTTGGGGCTAGTGGTGTTACAACTGGAGGAAGTGGATATGTTCCACCGCTATTACAGAATATTGACAACATGACTGCGTCAAAAACGACACCTTATTACGAGCCAGATATTGTTGTTGTAAATATTGGCACTAATGATGGAAAATCTACTTCGAGCAATTTCATTACGCAATTCAATACGGCGCTCGACAGATTATCAATAAAATATTCCGGTACGCCTATTTTTGTTATTCTACCTTTTAATGGTGCCAAGCGTTCGGAAATAACCACCTGTGTAAGTGATCGGACAAATGTTTACCTTATTGACACAGCAGGGTGGGGAGTTAGCACAACTGATGGCGTTCACCCTAACCAAGCTGGAGGAATAACGGCTGGTAATAAAACGGCAGAATATATAACTAGCATTTTAGGAAAAAATTATTTTATTTAG

Genome Context

Tertiary structure

YP_009151939.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 81.2
Oligomeric state monomer
Download structure