Protein

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Genbank accession
YP_009814411.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MADISIPEGDNPVRYQASLGGNQKYRNMGNVSGQAYLVRGQVTNVYYQKGTLDFNTYGSSVTSGVTDGSGSAPIPVDFWGKNTDGKVFGCYRPVQKGSQILVAYIGGDTSRPIVIGVYPDNEASYELISPVHYNTGDDSTDDVQNDALGERKIYPNQQMMYESGKGDILRSMGGKSFLYISENGSGYLDDINYAYDEISDFYDADANEIEPTMTKAQSWLLVHEDNESDEASDGHRTRFYVNRSGELMVTFANKEDPNNIVVLEASKDSGFKLTKRFDNSNIKEDSEDYVQFGIGNGNNVSIKSVDSGDATSFYLDNGNIKFSTPNKGSITFDGISVNDLLGKVSDAETAANDAGTKADIAASAGAIAQSAASNAASQALAASQAGEDAKSAAVNAQAAGEDAKTQAEDTRNRIIYYSSISNEKDVAIPGKYIIVNTDTYIKNGTIKTAHIGDGAITNAKIANLAVGTAQLEDAAITRAKIGNLAVGTAQIEDAAITDAKVGDLSADHLNAGTIDFSVISGIHINASEIDVGKIVADQIFVNGLGDISKNLGTVTSGKITGTNVNDDINTVQSGVNDLNNPNLMSVIEKQTAAKQFAGLTSQYNVILARAKDDSISTTDLTTAYTNLDNFITPLLKDTTKASKIDRYTYNSLTYAYNTALSNVQAALKDAYNTDISNMYTSVAVASQAASSAAIVASQAATTGDNASHAAEQARIAASQAQIAGDNATSVANNASQAASGAVIAGSTASVNADKAVKVANQAKSAGDNATSVANNASQAASGAVIAGSTAAVIANKASTVANQAKSAGDNATSVANNATSVANSAKSTADSTYAYANSEIAVQSTATAKAQSTADNAFSQAQAVGSRADSEIAVNSMATAKAQSTADNAFSQAQAVGSQASAEISNNSTATAKAQSTADNAFSKAQAVGSQASAEIAVQSNATAKAQSTADNAFSQATTAIDNGKVTSQAVTDLKDGSKLTIAELENGLATKVANSDYASYKEQTASQIGQLVTNGAFSAYQTQTADLIAQKVATSDFSAYQATTAKAIESKVESKDFNTYKTQTADLIDDKVSSSQYSSDKTQTASEIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGDFSTYKTQTADLIASKVANKDFSAYQATTAKSIESKVESNDFNTYKSQTADLINDKVSNSEYASDKTQTASQISQMVSNSAFSAYQTQTASQIAQTVSNSAFSAYQQTTADLIASKVATKDFSAYQATTATAIDSKVESSDFNTYKTQTADLIDDKVSSSEYASDKTQTASEIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGDFSTYKTQTAGLIAQKVATSDFSAYQATTAKEISSKVESSDFNTYKTQTADVIASKVESKDFQALQTQVDNSAVGTNLLLNTSDYSTNWEWNVNPSIDTTQKPAILHYPSTTITSGASIIAQQNIGSILQSSTTYTASFYAKGSGTFKFFCYPGVAATAISVNGIVVSSTSSDCNTSIPLASNYARYTITFTTLSSISNSKYFLLRQDYNTSYTSYNTVEAYVYGMKLEKGSVATDWCPNPADNATQSQFTQLSGEIDLRVTKGGLVDQINIQAGKTLISSSGQLILSGKSVVLDSVDPVIMKSANIGNMAVGTAQIANGAITNAQIGSLAVDTANIKDAAINSAKIADLAVGTAQIGDGAITNAKIGKLAVGTAQIANGAITDAQIGSLAVGTAQIKDEAVNSAKIAKLAVGTAQIGDGAITNAKIGNLAVGTAQIANAAITDAQVGNVSANKLTAGTIDFNTITGKNINASNITTGTLDTNRLNVNKLSALSADLGDVTTGSLKGVDIVAKTFSTPNGSFTTDENGSVVASNLTIRGVTNLVYNAALLGGVGGSNSSIPGWTMGTMGYFSNFTLHDGVPSIGFNGNTGASTWQQLAQSKLYPLNGLTGQPYSASVWFIDAGSDTTMTYNFTLAFFDSSGNRLPSGNYTGVSVSGTGSAQPWKQLTINGFNSPSTAVYVGLQYWAYNGTGHALFSSPMLTQTAQATGYQPDVGNIINAGEINGTIINGSTFHGGSIISNSNNTAHYYPMTITPDGMYNSTYFDNAVGMQSSVESGGISYKYRSMIADGSGQYLSYDSVVNGQGFQSQSGYTSAKDTTFSNSETISGYVNVTPSSGIYLYGPTQQINFAGRRDNIGSNGITMDAYGNVYSQDNSAWWRIGLNNGSKIVDFGIDKAGQNQIYFYRDINMGNISINRAHSITTKDGQALYINSGSGGRADLNVASLTYTGSVSKSLLSEKKDVKKVDTSYWSQLVNSIDLATYQYKDDDNISNLRLSGIVDDVNEDKQWNLPDIFVARDEDGKLAGIENIVLQNAMLATIQEQQKEIDKLNGHLLELEAKLNG
Physico‐chemical
properties
protein length:2377 AA
molecular weight: 249141,77380 Da
isoelectric point:4,68952
aromaticity:0,07446
hydropathy:-0,28519

Domains

View on InterPro
Domain architecture
YP_009814411.1
1 2377 aa
CHP 2269–2368 ·
ATT Attachment Domain STR Structural Domain RBD Receptor-Binding Domain CBM Carbohydrate-Binding Module LEC Lectin-like Domain ENZ Enzymatic Domain CHP Intramolecular Chaperone LNK Linker/Spacer Domain TAS Tail-Associated Structural TTP Tail Tubular Protein UNK Uncharacterized Domain Unmapped
Proteins with similar domain architecture

Taxonomy

Phage
Lactobacillus phage Bromius [NCBI] · taxon 2315485
Uroviricota Caudoviricetes Herelleviridae Harbinvirus bromius
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_009814411.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048085.1 [NCBI]
CDS location
range 26064 -> 33197
strand +
CDS
ATGGCTGATATTAGTATTCCAGAAGGTGACAACCCTGTACGCTATCAAGCATCATTAGGTGGTAACCAAAAATACCGTAATATGGGGAATGTTTCTGGTCAAGCATACCTTGTCAGAGGACAAGTAACTAATGTTTATTATCAAAAAGGTACTCTAGACTTTAATACGTATGGGTCTAGTGTCACTAGTGGTGTTACTGATGGTTCTGGTAGTGCACCTATTCCAGTTGATTTCTGGGGTAAAAATACAGATGGAAAAGTATTTGGATGTTATCGACCGGTGCAGAAAGGTTCTCAAATACTGGTAGCCTATATTGGTGGTGACACTTCTCGGCCAATTGTAATCGGTGTTTACCCTGATAATGAAGCTTCATACGAGTTAATTTCACCAGTGCATTATAATACGGGTGACGATAGCACAGACGATGTTCAAAATGATGCTTTAGGCGAGAGGAAAATATACCCTAACCAGCAAATGATGTATGAGTCTGGTAAGGGAGACATCCTCAGAAGTATGGGTGGCAAGTCTTTCTTATATATATCTGAAAACGGTAGTGGCTACCTAGATGATATAAACTATGCTTATGATGAAATTAGCGATTTCTATGATGCTGATGCAAACGAAATCGAGCCAACAATGACTAAGGCTCAATCTTGGCTGTTAGTTCATGAAGACAATGAAAGTGATGAAGCATCAGACGGTCACAGAACAAGATTCTATGTTAATCGTTCTGGTGAACTAATGGTTACCTTTGCTAATAAAGAAGACCCCAATAACATTGTTGTTTTAGAAGCTAGCAAAGATTCTGGATTTAAGCTAACAAAGAGATTCGATAATAGCAATATTAAAGAAGACTCAGAAGACTATGTTCAGTTTGGAATAGGGAATGGCAATAATGTTAGTATTAAGAGTGTTGACAGTGGAGATGCTACTTCTTTTTATTTAGATAACGGTAATATTAAGTTTAGCACTCCAAATAAAGGTTCAATAACCTTTGATGGCATATCAGTAAATGACCTATTGGGTAAGGTATCAGATGCAGAAACTGCTGCTAATGATGCTGGTACTAAGGCAGATATTGCAGCTAGTGCAGGTGCAATAGCCCAGTCAGCTGCTAGCAATGCAGCAAGTCAAGCACTAGCAGCAAGCCAGGCAGGGGAAGATGCCAAGAGTGCTGCTGTTAACGCACAAGCCGCTGGAGAAGACGCTAAAACTCAGGCTGAAGATACCCGAAACAGAATAATATATTATTCTTCAATTTCAAACGAAAAAGACGTTGCTATCCCCGGTAAATATATTATAGTTAACACTGACACCTATATTAAAAACGGTACAATTAAAACTGCGCATATAGGTGATGGTGCAATTACTAATGCTAAAATAGCTAACCTAGCTGTTGGTACGGCTCAACTAGAAGACGCCGCTATCACTCGTGCTAAGATTGGTAATCTTGCCGTTGGTACTGCTCAAATTGAAGATGCCGCCATTACTGATGCCAAAGTAGGTGACCTTAGTGCTGACCATTTAAATGCAGGTACTATAGACTTTAGTGTCATTAGTGGTATTCATATTAATGCTAGTGAAATAGATGTTGGAAAAATTGTTGCTGACCAAATTTTCGTTAATGGACTAGGTGACATTTCTAAAAACCTGGGGACAGTTACTAGTGGTAAAATAACTGGTACAAACGTAAATGATGATATTAACACTGTACAATCTGGTGTTAATGATTTAAATAATCCAAACTTAATGAGTGTCATTGAAAAGCAGACAGCGGCCAAACAGTTTGCTGGGTTAACCAGCCAGTACAATGTGATTTTAGCCCGTGCTAAAGATGACAGTATCAGTACAACTGATTTAACCACGGCCTATACTAATCTGGACAACTTTATAACGCCTCTACTAAAAGATACTACTAAGGCTAGTAAAATTGACCGGTACACTTATAATAGCCTCACATATGCTTATAATACGGCTCTAAGCAATGTACAGGCCGCCTTAAAGGACGCCTATAACACAGATATTAGTAACATGTATACTAGTGTTGCAGTAGCTAGTCAAGCCGCTTCTAGTGCCGCTATAGTCGCTTCACAGGCAGCCACAACTGGGGATAATGCTAGTCATGCTGCGGAACAGGCCCGTATAGCAGCTAGCCAAGCTCAAATTGCTGGTGATAACGCAACTAGTGTTGCTAATAATGCTAGCCAAGCGGCTTCTGGTGCCGTAATAGCCGGTAGTACAGCATCAGTAAATGCTGATAAAGCAGTTAAGGTTGCTAACCAAGCTAAAAGTGCTGGTGATAATGCAACTAGTGTTGCTAATAATGCTAGCCAAGCGGCTTCTGGTGCCGTAATAGCTGGTAGTACCGCAGCAGTCATTGCCAACAAAGCAAGTACAGTTGCTAACCAAGCTAAAAGTGCTGGTGATAATGCAACTAGTGTTGCTAATAATGCCACTAGTGTCGCTAATAGTGCTAAGTCGACTGCTGATAGCACCTACGCTTATGCTAACTCTGAAATAGCCGTACAATCAACAGCTACCGCTAAAGCCCAAAGTACAGCTGATAATGCCTTTAGCCAAGCACAAGCAGTTGGTAGCCGTGCTGATTCAGAAATAGCTGTAAATTCAATGGCTACTGCTAAGGCTCAGTCTACAGCTGATAATGCCTTTAGCCAAGCACAAGCAGTTGGTAGTCAAGCTAGTGCTGAAATAAGCAACAACTCTACAGCTACCGCTAAAGCTCAAAGTACAGCTGATAACGCTTTTAGCAAAGCACAAGCAGTTGGTAGCCAAGCTAGTGCTGAAATAGCAGTCCAGTCTAATGCTACTGCAAAAGCCCAAAGTACAGCTGACAACGCCTTTAGTCAAGCGACTACAGCAATAGATAATGGTAAAGTAACTAGTCAAGCAGTAACAGACCTAAAAGATGGTTCCAAGTTAACGATTGCTGAACTAGAAAATGGACTAGCTACAAAGGTTGCTAACTCAGACTATGCTAGTTACAAAGAACAAACTGCTAGTCAGATAGGACAACTAGTTACTAATGGTGCTTTCTCGGCATACCAAACACAGACAGCTGACTTGATAGCCCAAAAGGTTGCTACTAGTGACTTCTCAGCCTACCAAGCTACAACCGCTAAAGCAATTGAGAGCAAGGTTGAATCTAAAGATTTTAACACGTATAAGACACAAACAGCTGACTTGATTGATGACAAAGTCTCTAGTTCACAGTATAGCTCTGACAAGACACAAACAGCTAGTGAGATAGCGGACAGAGTAAGTAATAGTGCTTTTTCAACCTACCAAACACAAACTGCTAGTCAAATTGCTAGCAAGGTTGATAATGGTGACTTTTCAACTTACAAAACGCAGACTGCTGACTTAATTGCTAGCAAAGTAGCTAATAAGGACTTTTCAGCCTATCAAGCTACAACCGCTAAGTCGATTGAGAGCAAGGTTGAATCTAACGACTTTAACACTTATAAGTCACAGACTGCTGACTTGATTAATGACAAGGTTTCTAACTCAGAGTATGCTTCTGATAAAACACAGACCGCCAGTCAAATATCACAGATGGTAAGTAATAGTGCTTTCTCAGCTTATCAAACACAAACAGCTAGTCAAATAGCGCAGACGGTAAGCAATAGTGCTTTCTCAGCATACCAACAAACTACTGCTGACTTGATTGCTAGCAAGGTAGCTACTAAAGACTTTTCAGCTTACCAAGCTACAACCGCCACTGCAATTGATAGTAAGGTTGAATCTAGCGATTTTAACACGTACAAGACACAAACTGCTGACTTAATTGATGACAAGGTTTCTAGTTCAGAGTATGCATCTGACAAAACGCAGACTGCTAGTGAGATAGCGGATAGGGTAAGTAATAGTGCTTTTTCAACCTATCAAACACAGACTGCTAGCCAGATTGCTAGCAAGGTTGATAATGGTGACTTTTCAACCTACAAAACGCAGACAGCTGGATTAATAGCTCAAAAGGTGGCTACTAGTGACTTCTCAGCATACCAAGCGACAACTGCTAAAGAAATATCTAGTAAGGTTGAGTCCAGTGATTTTAATACGTATAAGACACAGACTGCTGACGTGATTGCTAGCAAAGTTGAATCTAAGGATTTTCAAGCATTGCAAACGCAAGTTGATAATAGCGCTGTGGGGACTAACTTGCTACTAAATACGTCTGATTATTCTACTAATTGGGAATGGAATGTAAACCCAAGCATTGATACCACTCAAAAACCTGCTATTCTACACTACCCTAGCACTACTATTACTAGTGGAGCAAGTATCATTGCCCAACAGAATATAGGAAGTATTCTACAGTCTTCAACAACATATACAGCTAGTTTTTATGCTAAAGGGAGCGGTACTTTTAAATTTTTCTGTTATCCGGGTGTCGCAGCAACTGCAATCTCGGTTAATGGTATAGTAGTTTCTTCAACATCGTCAGATTGCAACACATCAATACCCTTGGCTTCTAACTATGCACGGTACACGATTACTTTTACAACTTTATCTAGTATAAGTAATAGTAAGTATTTCTTGTTACGACAAGATTATAACACTAGTTACACAAGTTATAATACGGTTGAAGCTTATGTGTATGGTATGAAACTTGAAAAAGGTAGTGTAGCAACAGATTGGTGTCCTAACCCAGCTGACAATGCTACGCAGTCTCAATTTACGCAGTTAAGCGGTGAGATAGACCTTAGAGTTACCAAGGGTGGCCTAGTCGACCAGATTAATATTCAAGCCGGTAAAACCCTAATCTCATCCAGTGGTCAATTAATATTATCTGGTAAGAGTGTTGTTCTTGATAGTGTTGACCCAGTTATTATGAAGAGCGCAAATATTGGTAATATGGCTGTTGGCACAGCACAGATAGCCAATGGTGCAATTACCAATGCTCAAATTGGCTCATTAGCTGTTGACACAGCCAATATTAAAGATGCCGCTATTAATAGTGCTAAGATTGCTGACCTAGC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Genome Context

Tertiary structure

YP_009814411.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 54.2
Oligomeric state monomer
Download structure

Literature

Title Authors Date PMID Source
Lactobacillus phages that infect wine-derived L. plantarum strains Kyrkou,I., Byth Carstens,A., Ellegaard-Jensen,L., Kot,W. and Hestbjerg Hansen,L. 2018-12-03 — GenBank