Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_009814411.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Seq2Symm
C3 confidence 0,999 truncated
C3 0,999
C1 0,090
C7-C9 0,001
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MADISIPEGDNPVRYQASLGGNQKYRNMGNVSGQAYLVRGQVTNVYYQKGTLDFNTYGSSVTSGVTDGSGSAPIPVDFWGKNTDGKVFGCYRPVQKGSQILVAYIGGDTSRPIVIGVYPDNEASYELISPVHYNTGDDSTDDVQNDALGERKIYPNQQMMYESGKGDILRSMGGKSFLYISENGSGYLDDINYAYDEISDFYDADANEIEPTMTKAQSWLLVHEDNESDEASDGHRTRFYVNRSGELMVTFANKEDPNNIVVLEASKDSGFKLTKRFDNSNIKEDSEDYVQFGIGNGNNVSIKSVDSGDATSFYLDNGNIKFSTPNKGSITFDGISVNDLLGKVSDAETAANDAGTKADIAASAGAIAQSAASNAASQALAASQAGEDAKSAAVNAQAAGEDAKTQAEDTRNRIIYYSSISNEKDVAIPGKYIIVNTDTYIKNGTIKTAHIGDGAITNAKIANLAVGTAQLEDAAITRAKIGNLAVGTAQIEDAAITDAKVGDLSADHLNAGTIDFSVISGIHINASEIDVGKIVADQIFVNGLGDISKNLGTVTSGKITGTNVNDDINTVQSGVNDLNNPNLMSVIEKQTAAKQFAGLTSQYNVILARAKDDSISTTDLTTAYTNLDNFITPLLKDTTKASKIDRYTYNSLTYAYNTALSNVQAALKDAYNTDISNMYTSVAVASQAASSAAIVASQAATTGDNASHAAEQARIAASQAQIAGDNATSVANNASQAASGAVIAGSTASVNADKAVKVANQAKSAGDNATSVANNASQAASGAVIAGSTAAVIANKASTVANQAKSAGDNATSVANNATSVANSAKSTADSTYAYANSEIAVQSTATAKAQSTADNAFSQAQAVGSRADSEIAVNSMATAKAQSTADNAFSQAQAVGSQASAEISNNSTATAKAQSTADNAFSKAQAVGSQASAEIAVQSNATAKAQSTADNAFSQATTAIDNGKVTSQAVTDLKDGSKLTIAELENGLATKVANSDYASYKEQTASQIGQLVTNGAFSAYQTQTADLIAQKVATSDFSAYQATTAKAIESKVESKDFNTYKTQTADLIDDKVSSSQYSSDKTQTASEIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGDFSTYKTQTADLIASKVANKDFSAYQATTAKSIESKVESNDFNTYKSQTADLINDKVSNSEYASDKTQTASQISQMVSNSAFSAYQTQTASQIAQTVSNSAFSAYQQTTADLIASKVATKDFSAYQATTATAIDSKVESSDFNTYKTQTADLIDDKVSSSEYASDKTQTASEIADRVSNSAFSTYQTQTASQIASKVDNGDFSTYKTQTAGLIAQKVATSDFSAYQATTAKEISSKVESSDFNTYKTQTADVIASKVESKDFQALQTQVDNSAVGTNLLLNTSDYSTNWEWNVNPSIDTTQKPAILHYPSTTITSGASIIAQQNIGSILQSSTTYTASFYAKGSGTFKFFCYPGVAATAISVNGIVVSSTSSDCNTSIPLASNYARYTITFTTLSSISNSKYFLLRQDYNTSYTSYNTVEAYVYGMKLEKGSVATDWCPNPADNATQSQFTQLSGEIDLRVTKGGLVDQINIQAGKTLISSSGQLILSGKSVVLDSVDPVIMKSANIGNMAVGTAQIANGAITNAQIGSLAVDTANIKDAAINSAKIADLAVGTAQIGDGAITNAKIGKLAVGTAQIANGAITDAQIGSLAVGTAQIKDEAVNSAKIAKLAVGTAQIGDGAITNAKIGNLAVGTAQIANAAITDAQVGNVSANKLTAGTIDFNTITGKNINASNITTGTLDTNRLNVNKLSALSADLGDVTTGSLKGVDIVAKTFSTPNGSFTTDENGSVVASNLTIRGVTNLVYNAALLGGVGGSNSSIPGWTMGTMGYFSNFTLHDGVPSIGFNGNTGASTWQQLAQSKLYPLNGLTGQPYSASVWFIDAGSDTTMTYNFTLAFFDSSGNRLPSGNYTGVSVSGTGSAQPWKQLTINGFNSPSTAVYVGLQYWAYNGTGHALFSSPMLTQTAQATGYQPDVGNIINAGEINGTIINGSTFHGGSIISNSNNTAHYYPMTITPDGMYNSTYFDNAVGMQSSVESGGISYKYRSMIADGSGQYLSYDSVVNGQGFQSQSGYTSAKDTTFSNSETISGYVNVTPSSGIYLYGPTQQINFAGRRDNIGSNGITMDAYGNVYSQDNSAWWRIGLNNGSKIVDFGIDKAGQNQIYFYRDINMGNISINRAHSITTKDGQALYINSGSGGRADLNVASLTYTGSVSKSLLSEKKDVKKVDTSYWSQLVNSIDLATYQYKDDDNISNLRLSGIVDDVNEDKQWNLPDIFVARDEDGKLAGIENIVLQNAMLATIQEQQKEIDKLNGHLLELEAKLNG
Physico‐chemical
properties
protein length:2377 AA
molecular weight: 249141,77380 Da
isoelectric point:4,68952
aromaticity:0,07446
hydropathy:-0,28519

Domains

View on InterPro
Domain architecture
YP_009814411.1
1 2377 aa
CHP 2269–2368 ·
ATT Attachment Domain STR Structural Domain RBD Receptor-Binding Domain CBM Carbohydrate-Binding Module LEC Lectin-like Domain ENZ Enzymatic Domain CHP Intramolecular Chaperone LNK Linker/Spacer Domain TAS Tail-Associated Structural TTP Tail Tubular Protein UNK Uncharacterized Domain Unmapped
Proteins with similar domain architecture

Taxonomy

Phage
Lactobacillus phage Bromius [NCBI] · taxon 2315485
Uroviricota Caudoviricetes Herelleviridae Harbinvirus bromius
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_009814411.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048085.1 [NCBI]
CDS location
range 26064 -> 33197
strand +
CDS
ATGGCTGATATTAGTATTCCAGAAGGTGACAACCCTGTACGCTATCAAGCATCATTAGGTGGTAACCAAAAATACCGTAATATGGGGAATGTTTCTGGTCAAGCATACCTTGTCAGAGGACAAGTAACTAATGTTTATTATCAAAAAGGTACTCTAGACTTTAATACGTATGGGTCTAGTGTCACTAGTGGTGTTACTGATGGTTCTGGTAGTGCACCTATTCCAGTTGATTTCTGGGGTAAAAATACAGATGGAAAAGTATTTGGATGTTATCGACCGGTGCAGAAAGGTTCTCAAATACTGGTAGCCTATATTGGTGGTGACACTTCTCGGCCAATTGTAATCGGTGTTTACCCTGATAATGAAGCTTCATACGAGTTAATTTCACCAGTGCATTATAATACGGGTGACGATAGCACAGACGATGTTCAAAATGATGCTTTAGGCGAGAGGAAAATATACCCTAACCAGCAAATGATGTATGAGTCTGGTAAGGGAGACATCCTCAGAAGTATGGGTGGCAAGTCTTTCTTATATATATCTGAAAACGGTAGTGGCTACCTAGATGATATAAACTATGCTTATGATGAAATTAGCGATTTCTATGATGCTGATGCAAACGAAATCGAGCCAACAATGACTAAGGCTCAATCTTGGCTGTTAGTTCATGAAGACAATGAAAGTGATGAAGCATCAGACGGTCACAGAACAAGATTCTATGTTAATCGTTCTGGTGAACTAATGGTTACCTTTGCTAATAAAGAAGACCCCAATAACATTGTTGTTTTAGAAGCTAGCAAAGATTCTGGATTTAAGCTAACAAAGAGATTCGATAATAGCAATATTAAAGAAGACTCAGAAGACTATGTTCAGTTTGGAATAGGGAATGGCAATAATGTTAGTATTAAGAGTGTTGACAGTGGAGATGCTACTTCTTTTTATTTAGATAACGGTAATATTAAGTTTAGCACTCCAAATAAAGGTTCAATAACCTTTGATGGCATATCAGTAAATGACCTATTGGGTAAGGTATCAGATGCAGAAACTGCTGCTAATGATGCTGGTACTAAGGCAGATATTGCAGCTAGTGCAGGTGCAATAGCCCAGTCAGCTGCTAGCAATGCAGCAAGTCAAGCACTAGCAGCAAGCCAGGCAGGGGAAGATGCCAAGAGTGCTGCTGTTAACGCACAAGCCGCTGGAGAAGACGCTAAAACTCAGGCTGAAGATACCCGAAACAGAATAATATATTATTCTTCAATTTCAAACGAAAAAGACGTTGCTATCCCCGGTAAATATATTATAGTTAACACTGACACCTATATTAAAAACGGTACAATTAAAACTGCGCATATAGGTGATGGTGCAATTACTAATGCTAAAATAGCTAACCTAGCTGTTGGTACGGCTCAACTAGAAGACGCCGCTATCACTCGTGCTAAGATTGGTAATCTTGCCGTTGGTACTGCTCAAATTGAAGATGCCGCCATTACTGATGCCAAAGTAGGTGACCTTAGTGCTGACCATTTAAATGCAGGTACTATAGACTTTAGTGTCATTAGTGGTATTCATATTAATGCTAGTGAAATAGATGTTGGAAAAATTGTTGCTGACCAAATTTTCGTTAATGGACTAGGTGACATTTCTAAAAACCTGGGGACAGTTACTAGTGGTAAAATAACTGGTACAAACGTAAATGATGATATTAACACTGTACAATCTGGTGTTAATGATTTAAATAATCCAAACTTAATGAGTGTCATTGAAAAGCAGACAGCGGCCAAACAGTTTGCTGGGTTAACCAGCCAGTACAATGTGATTTTAGCCCGTGCTAAAGATGACAGTATCAGTACAACTGATTTAACCACGGCCTATACTAATCTGGACAACTTTATAACGCCTCTACTAAAAGATACTACTAAGGCTAGTAAAATTGACCGGTACACTTATAATAGCCTCACATATGCTTATAATACGGCTCTAAGCAATGTACAGGCCGCCTTAAAGGACGCCTATAACACAGATATTAGTAACATGTATACTAGTGTTGCAGTAGCTAGTCAAGCCGCTTCTAGTGCCGCTATAGTCGCTTCACAGGCAGCCACAACTGGGGATAATGCTAGTCATGCTGCGGAACAGGCCCGTATAGCAGCTAGCCAAGCTCAAATTGCTGGTGATAACGCAACTAGTGTTGCTAATAATGCTAGCCAAGCGGCTTCTGGTGCCGTAATAGCCGGTAGTACAGCATCAGTAAATGCTGATAAAGCAGTTAAGGTTGCTAACCAAGCTAAAAGTGCTGGTGATAATGCAACTAGTGTTGCTAATAATGCTAGCCAAGCGGCTTCTGGTGCCGTAATAGCTGGTAGTACCGCAGCAGTCATTGCCAACAAAGCAAGTACAGTTGCTAACCAAGCTAAAAGTGCTGGTGATAATGCAACTAGTGTTGCTAATAATGCCACTAGTGTCGCTAATAGTGCTAAGTCGACTGCTGATAGCACCTACGCTTATGCTAACTCTGAAATAGCCGTACAATCAACAGCTACCGCTAAAGCCCAAAGTACAGCTGATAATGCCTTTAGCCAAGCACAAGCAGTTGGTAGCCGTGCTGATTCAGAAATAGCTGTAAATTCAATGGCTACTGCTAAGGCTCAGTCTACAGCTGATAATGCCTTTAGCCAAGCACAAGCAGTTGGTAGTCAAGCTAGTGCTGAAATAAGCAACAACTCTACAGCTACCGCTAAAGCTCAAAGTACAGCTGATAACGCTTTTAGCAAAGCACAAGCAGTTGGTAGCCAAGCTAGTGCTGAAATAGCAGTCCAGTCTAATGCTACTGCAAAAGCCCAAAGTACAGCTGACAACGCCTTTAGTCAAGCGACTACAGCAATAGATAATGGTAAAGTAACTAGTCAAGCAGTAACAGACCTAAAAGATGGTTCCAAGTTAACGATTGCTGAACTAGAAAATGGACTAGCTACAAAGGTTGCTAACTCAGACTATGCTAGTTACAAAGAACAAACTGCTAGTCAGATAGGACAACTAGTTACTAATGGTGCTTTCTCGGCATACCAAACACAGACAGCTGACTTGATAGCCCAAAAGGTTGCTACTAGTGACTTCTCAGCCTACCAAGCTACAACCGCTAAAGCAATTGAGAGCAAGGTTGAATCTAAAGATTTTAACACGTATAAGACACAAACAGCTGACTTGATTGATGACAAAGTCTCTAGTTCACAGTATAGCTCTGACAAGACACAAACAGCTAGTGAGATAGCGGACAGAGTAAGTAATAGTGCTTTTTCAACCTACCAAACACAAACTGCTAGTCAAATTGCTAGCAAGGTTGATAATGGTGACTTTTCAACTTACAAAACGCAGACTGCTGACTTAATTGCTAGCAAAGTAGCTAATAAGGACTTTTCAGCCTATCAAGCTACAACCGCTAAGTCGATTGAGAGCAAGGTTGAATCTAACGACTTTAACACTTATAAGTCACAGACTGCTGACTTGATTAATGACAAGGTTTCTAACTCAGAGTATGCTTCTGATAAAACACAGACCGCCAGTCAAATATCACAGATGGTAAGTAATAGTGCTTTCTCAGCTTATCAAACACAAACAGCTAGTCAAATAGCGCAGACGGTAAGCAATAGTGCTTTCTCAGCATACCAACAAACTACTGCTGACTTGATTGCTAGCAAGGTAGCTACTAAAGACTTTTCAGCTTACCAAGCTACAACCGCCACTGCAATTGATAGTAAGGTTGAATCTAGCGATTTTAACACGTACAAGACACAAACTGCTGACTTAATTGATGACAAGGTTTCTAGTTCAGAGTATGCATCTGACAAAACGCAGACTGCTAGTGAGATAGCGGATAGGGTAAGTAATAGTGCTTTTTCAACCTATCAAACACAGACTGCTAGCCAGATTGCTAGCAAGGTTGATAATGGTGACTTTTCAACCTACAAAACGCAGACAGCTGGATTAATAGCTCAAAAGGTGGCTACTAGTGACTTCTCAGCATACCAAGCGACAACTGCTAAAGAAATATCTAGTAAGGTTGAGTCCAGTGATTTTAATACGTATAAGACACAGACTGCTGACGTGATTGCTAGCAAAGTTGAATCTAAGGATTTTCAAGCATTGCAAACGCAAGTTGATAATAGCGCTGTGGGGACTAACTTGCTACTAAATACGTCTGATTATTCTACTAATTGGGAATGGAATGTAAACCCAAGCATTGATACCACTCAAAAACCTGCTATTCTACACTACCCTAGCACTACTATTACTAGTGGAGCAAGTATCATTGCCCAACAGAATATAGGAAGTATTCTACAGTCTTCAACAACATATACAGCTAGTTTTTATGCTAAAGGGAGCGGTACTTTTAAATTTTTCTGTTATCCGGGTGTCGCAGCAACTGCAATCTCGGTTAATGGTATAGTAGTTTCTTCAACATCGTCAGATTGCAACACATCAATACCCTTGGCTTCTAACTATGCACGGTACACGATTACTTTTACAACTTTATCTAGTATAAGTAATAGTAAGTATTTCTTGTTACGACAAGATTATAACACTAGTTACACAAGTTATAATACGGTTGAAGCTTATGTGTATGGTATGAAACTTGAAAAAGGTAGTGTAGCAACAGATTGGTGTCCTAACCCAGCTGACAATGCTACGCAGTCTCAATTTACGCAGTTAAGCGGTGAGATAGACCTTAGAGTTACCAAGGGTGGCCTAGTCGACCAGATTAATATTCAAGCCGGTAAAACCCTAATCTCATCCAGTGGTCAATTAATATTATCTGGTAAGAGTGTTGTTCTTGATAGTGTTGACCCAGTTATTATGAAGAGCGCAAATATTGGTAATATGGCTGTTGGCACAGCACAGATAGCCAATGGTGCAATTACCAATGCTCAAATTGGCTCATTAGCTGTTGACACAGCCAATATTAAAGATGCCGCTATTAATAGTGCTAAGATTGCTGACCTAGCTGTAGGCACTGCACAAATAGGTGACGGTGCTATCACTAATGCCAAGATAGGTAAATTAGCTGTAGGTACGGCACAGATAGCCAATGGTGCTATCACCGATGCTCAGATAGGGTCATTAGCTGTAGGTACTGCACAGATTAAAGATGAAGCTGTCAATAGTGCTAAAATTGCTAAGCTAGCTGTAGGCACGGCACAAATAGGTGATGGTGCTATCACTAATGCTAAGATTGGTAATCTTGCTGTAGGCACAGCCCAGATAGCCAATGCGGCTATCACTGACGCCCAAGTTGGTAATGTTAGTGCCAATAAATTAACAGCTGGCACGATTGACTTTAATACAATTACTGGTAAAAATATCAACGCATCAAACATCACAACAGGAACACTAGACACTAACCGGTTAAATGTCAACAAACTATCAGCTTTAAGTGCCGATTTAGGTGACGTTACAACCGGCTCACTTAAAGGTGTTGACATTGTTGCTAAAACGTTTAGTACGCCTAATGGCTCATTTACAACCGATGAAAACGGTAGCGTGGTTGCTAGCAATTTAACAATTAGGGGCGTTACAAATTTAGTTTATAATGCGGCATTGCTAGGTGGAGTTGGTGGTAGCAACTCTAGTATCCCCGGTTGGACAATGGGTACAATGGGATACTTCTCAAACTTTACGTTGCATGACGGTGTCCCTTCAATTGGATTTAATGGCAATACAGGTGCTTCCACTTGGCAACAACTTGCACAGTCTAAGCTTTATCCTTTAAACGGACTAACAGGTCAGCCTTATAGTGCCTCGGTATGGTTTATTGACGCTGGTAGTGATACTACGATGACATATAATTTTACCCTAGCGTTCTTTGATTCAAGTGGCAATAGGTTACCATCTGGGAATTATACCGGCGTTTCAGTATCTGGAACAGGAAGTGCTCAACCATGGAAACAATTGACTATTAATGGGTTTAATTCACCAAGCACAGCTGTCTATGTTGGCCTACAATATTGGGCATACAATGGCACTGGTCATGCTCTGTTTAGCTCACCTATGCTAACACAAACTGCTCAAGCAACTGGTTACCAGCCAGATGTAGGTAATATTATTAATGCCGGAGAAATTAATGGTACCATTATTAATGGTTCAACATTCCATGGTGGTAGCATTATTAGCAATTCCAATAACACCGCTCACTATTACCCAATGACTATTACGCCAGACGGAATGTATAACTCGACATACTTTGATAATGCGGTTGGAATGCAATCAAGCGTTGAGTCTGGGGGAATTAGCTATAAATATCGCTCAATGATTGCCGATGGTAGTGGGCAATATTTATCTTATGATTCAGTAGTTAACGGTCAAGGATTTCAGTCACAATCAGGTTATACGTCAGCTAAAGATACAACTTTTTCAAACTCTGAAACAATCTCGGGATATGTTAACGTAACGCCATCCTCAGGAATCTATCTATATGGGCCAACGCAACAAATAAACTTTGCTGGTAGGCGTGATAATATTGGTAGTAACGGGATTACTATGGATGCTTATGGCAACGTATATTCACAAGATAATTCAGCTTGGTGGCGGATTGGTTTAAATAATGGTTCAAAAATTGTAGACTTTGGGATTGACAAGGCTGGCCAAAATCAAATTTATTTTTACCGTGATATAAATATGGGTAATATTAGTATTAATAGGGCTCATTCTATTACCACGAAAGATGGTCAAGCGCTATATATCAACTCAGGTAGCGGTGGAAGAGCCGACTTAAATGTGGCTAGTCTAACCTACACTGGGTCCGTGTCTAAATCACTATTATCTGAGAAGAAGGATGTTAAAAAGGTTGATACTTCCTATTGGTCACAGCTAGTTAATTCAATCGACCTAGCAACCTACCAGTATAAAGATGATGATAATATCAGCAACCTTAGACTATCAGGGATTGTTGATGATGTTAACGAGGACAAACAATGGAATCTACCAGACATCTTTGTTGCTCGTGACGAGGATGGAAAACTAGCCGGTATTGAGAATATCGTACTTCAAAATGCCATGTTAGCAACTATACAGGAACAACAAAAGGAAATTGATAAGCTAAACGGACATTTATTAGAATTGGAGGCAAAATTAAATGGATAA

Genome Context

Tertiary structure

YP_009814411.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 53.2
Oligomeric state monomer
Download structure

Literature

Title Authors Date PMID Source
Lactobacillus phages that infect wine-derived L. plantarum strains Kyrkou,I., Byth Carstens,A., Ellegaard-Jensen,L., Kot,W. and Hestbjerg Hansen,L. 2018-12-03 — GenBank