Protein
View in Explore- Genbank accession
- WAQ79264.1 [GenBank]
- Protein name
- tailspike protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MNEMFSQGGKGSTGILTNKQAVARHFGVKQSEVVYFSTGAVLSGYKVIYDKASQRAYSLPADIGSGVTAVSLSPAGVLVHSAGNVDLGALAVERKEYINSPGSFTTGATLTVKNQRLIHNGEYYIWNGAFPKVVPASSTPENSGGVANDAWSKLSPLVKSEEVPYVRMPNAINTNVAANMDLMGRRVIYATDFGVTVDSADNADALWELGQYLSTQVTEPVKVIFPAGTSLVGSQYLTGSTGQGGSYKPSYEQRAWTDASAKGWFSIHMTDANIELEMSNWTLKINDGMRLGAFDPVTGSIAPDVVAETPDYSYMAYQGFLIKLYKAPNVVINGGTSDGNLASAVWGGKFGNTGYQIPCYNMWINQSAGARVYRHKYLNSPVDGLYHQSTGSFSFLDIVPRTVIEDCYWDSCGRNCYSLTGGANIDIINPVITRSGNKAGGIGTHYTGPEAGIDIEAEGGNPYNIRVINPKIVNTGKCAFQTVSVPGTVNDILVVGGVLHSMHSEGAVSNAGNARNIKFVGTTIIGSIIDTGWPAAMGFECYSFIDCELQNRYANDYADEYRLNFKVKEFKGNTITFGIPPTINTNHATINIEDQDATPFGLYAERFKENRLIVYGDASKVTFANGLGGIRNFKNAELYVSADGLTGGTLKITVDTSSAAMNGLSTNTANFNFDVAMDKDVGKNVWYARKVNRVAGVMTAVTDSLQDIGSKDGRFGTMYATKGIILRDVGDSTYKRLRSNNGVLEVVADNT
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 751 AA molecular weight: 80709,62170 Da isoelectric point: 5,89030 aromaticity: 0,09854 hydropathy: -0,17004
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage E20 [NCBI] |
3003230 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WAQ79264.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP745616
[NCBI]
CDS location
range 61169 -> 63424
strand -
strand -
CDS
ATGAACGAAATGTTTTCACAAGGTGGTAAGGGTTCAACTGGAATCTTAACCAACAAACAAGCAGTAGCCCGTCACTTTGGGGTTAAGCAATCTGAGGTTGTTTACTTCTCTACTGGTGCTGTACTAAGCGGTTATAAAGTCATCTATGACAAAGCGTCACAGCGTGCTTACTCCTTACCTGCTGATATTGGTTCAGGTGTTACTGCTGTAAGTCTTAGTCCTGCTGGGGTATTAGTTCACTCTGCTGGTAATGTTGACTTAGGTGCTCTGGCTGTAGAACGTAAGGAGTATATTAACTCTCCCGGTTCATTTACTACTGGGGCTACCCTTACCGTTAAAAACCAAAGACTGATTCATAATGGTGAGTATTATATTTGGAATGGTGCATTCCCTAAAGTTGTCCCGGCATCCTCTACACCAGAAAACTCAGGTGGTGTAGCTAATGATGCCTGGAGTAAGTTAAGCCCATTAGTTAAGTCTGAAGAAGTTCCCTATGTTCGTATGCCTAATGCAATTAATACCAACGTAGCTGCTAACATGGATTTAATGGGTAGACGTGTAATCTATGCTACGGATTTTGGTGTAACTGTTGACTCTGCTGATAACGCAGACGCTCTTTGGGAATTGGGTCAATACTTAAGCACACAGGTAACTGAACCGGTTAAGGTGATATTCCCTGCTGGCACTAGTTTAGTAGGTTCCCAGTATCTCACTGGTTCTACTGGTCAGGGTGGTTCTTATAAACCTTCCTATGAGCAGCGTGCCTGGACAGATGCTTCTGCTAAAGGCTGGTTCTCCATTCATATGACGGATGCTAATATCGAACTGGAGATGAGTAACTGGACACTTAAGATTAATGACGGTATGCGTTTAGGGGCTTTTGATCCTGTTACTGGTTCTATTGCACCGGATGTTGTAGCTGAAACCCCTGATTATAGCTATATGGCTTACCAAGGTTTTCTTATTAAACTGTACAAAGCACCTAACGTCGTAATTAATGGTGGGACCAGTGATGGTAACTTAGCCTCTGCTGTATGGGGGGGTAAGTTTGGTAACACTGGTTATCAGATTCCTTGTTATAACATGTGGATTAACCAGTCAGCAGGTGCTCGTGTTTACCGACATAAATACCTTAATTCGCCTGTAGATGGCTTATATCATCAATCTACCGGTAGCTTCAGTTTCTTGGATATTGTTCCACGCACTGTTATTGAAGACTGTTACTGGGATTCCTGTGGGCGCAACTGCTACTCCCTGACTGGTGGAGCTAACATTGATATCATTAATCCAGTAATTACCCGCTCAGGCAATAAAGCTGGTGGGATTGGTACTCATTATACCGGACCGGAAGCAGGTATTGATATTGAAGCTGAAGGGGGAAACCCTTACAACATTCGTGTTATTAACCCTAAAATTGTTAACACCGGTAAGTGTGCATTCCAGACTGTATCCGTACCGGGGACTGTTAACGATATTCTGGTTGTGGGTGGCGTGCTACATAGTATGCACTCTGAGGGTGCTGTATCCAATGCTGGTAATGCCCGTAATATTAAGTTTGTAGGCACAACCATCATAGGCAGTATTATTGATACTGGCTGGCCTGCTGCTATGGGTTTTGAGTGTTATAGCTTTATTGATTGTGAACTTCAGAACAGATATGCAAATGATTATGCTGATGAGTATCGTTTGAATTTCAAAGTTAAAGAGTTTAAAGGGAATACTATTACATTTGGTATCCCACCCACCATTAACACTAACCATGCAACAATTAATATTGAAGATCAGGACGCTACTCCTTTCGGTCTTTACGCAGAACGATTCAAAGAGAATCGGTTAATTGTTTATGGTGATGCATCTAAAGTTACCTTTGCCAATGGTCTAGGTGGCATTCGTAACTTTAAGAATGCAGAGTTGTACGTTTCTGCTGATGGACTTACTGGAGGTACTCTCAAGATTACTGTTGATACTTCTAGTGCAGCAATGAATGGTTTATCTACCAATACTGCAAACTTTAACTTCGATGTTGCTATGGATAAAGATGTTGGCAAAAATGTCTGGTATGCCCGTAAAGTTAATCGTGTTGCAGGGGTTATGACAGCAGTAACAGATTCCTTGCAGGATATTGGTTCTAAGGATGGACGTTTCGGTACTATGTATGCTACCAAAGGGATTATACTCCGAGATGTGGGGGATAGTACTTACAAACGCCTTCGTTCTAATAACGGAGTACTTGAGGTAGTTGCTGATAACACCTAA
Tertiary structure
PDB ID
059a1bd901732668e5f58ffa4a7a744efb4681acbe05d54c4614b7042be8d0e4
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50