Protein

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Genbank accession
QPB08156.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADRFPLIVNAVSKKIEELVAGDNLELTSNGIIIGGDTGSGKYLTSDGTQVLWGSPGDVFLNQSQTLTNKTLESCALSGTLNSITNLPNSSLINSGITINGSTVALGGSITTPDNNTTYTISAQDSISASQKIIRITGSDTSTDDVVITAGTNMNIARSGDEIILSSTYIDTNTVTRLQAYSGGALQDGDITIRGAGSTIVTQDTQTKTLFITSTDDDTITRLRATAGQVYNSGDFTFLAGGATSVVQGVDGNGDPTITYSSTNTVTRLKGGGSGTFTSGDVTITGGTNVTVSQAGSTVTVASVDTNDVTKIAANSESLAFGDFRLLASGATNISTSVNNGVKEITISSVNTDTGAAATASGGVQKSGNDFRLKNNANFTGNTVLKWDSGNSQLANSIILDDGSTITIGGDLVVEGTQTTLNTTTLVVEDNIIELRKGPSITASDGGIQVNLTTDSNENVVTYRQLQWYNAGGYWRSFDGSVSNRFVTENETQVLTNKTLTSPTLTAPILGAATASSINGLQIATTASATLDIASAKTLDVNRDLVLTSDNNSASITVNFRNGGNVAYTSDTLATFASTTSTQLRGLITDTTGLDRLVFQTNPTILTGITTTSPGFTLLNSGATAITAFGAAASIDMGAAGGTFTINQNLVVNEDLTVGSGIADTITINGILNSENADILIRGSATDPMRVGRGIGEVSTNTALGVRAINSVSSGSQNTAIGFESLFTTNTGAANTAIGNRALRANGIGSNNIAIGRDALLVNLSGDKNIAIGNNAMESMSTGSANVCIGHYAGYGITGTGNVLIGPADDENSTNATYVPPNIGGSRQLVIGSGTEAWIRGDANFNLTLPNNLTVDGDATISGNLVVNGDVTSINSNVIQVDDKEIELASVVATTFSAVTVDNTSTITSITINTADAGLIPGMEVNSTTGGISVPAGTTIVSISGNTATLSAAVTGSGTAIFTSPGATDLTADQGGIRVRGTTDKRIFYDHSRTDKYWVMTENLELNFGKKLVIGNQLMLNSTTLGSTIVNSSLTSVGTLTGLDVDGAITLGGVITEKTFNNFSTTLTPSANVLTLNLSAANTILGTPATTAINEWAFTNAGLSNGQSKTVTLILSSNTAATYGDACSVDGNAVTNGVQWSGGSPPIATSNTDILTFVIVRDNAGVVQVFGQGNTDFS
Physico‐chemical
properties
protein length:1178 AA
molecular weight: 120449,34620 Da
isoelectric point:4,30887
aromaticity:0,04669
hydropathy:0,01791

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-H9-1
[NCBI] 		2783674 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPB08156.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW117966 [NCBI]
CDS location
range 74175 -> 77711
strand -
CDS
ATGGCAGATCGTTTCCCATTAATTGTTAATGCCGTCTCCAAGAAAATTGAAGAACTTGTAGCAGGTGACAATCTAGAGTTGACATCCAATGGTATTATCATTGGCGGAGATACTGGATCAGGAAAATATTTGACCAGTGATGGAACACAGGTATTGTGGGGATCTCCTGGAGATGTCTTTTTAAATCAAAGTCAAACCCTAACAAATAAGACTTTGGAATCTTGTGCCCTGTCTGGCACGTTGAATAGCATTACAAACCTTCCAAATTCGTCTCTTATTAATAGTGGTATTACCATAAATGGATCTACTGTTGCTCTGGGTGGAAGCATAACAACTCCAGACAATAATACAACTTATACTATTTCAGCTCAAGATAGTATTAGTGCTTCTCAAAAAATCATTCGTATTACTGGCAGCGATACTTCTACAGACGATGTTGTTATTACTGCTGGAACAAACATGAACATTGCCAGAAGTGGCGATGAAATTATTTTATCTTCGACTTATATTGATACGAATACTGTAACAAGACTCCAAGCATATAGTGGAGGTGCTTTACAAGACGGGGACATTACGATAAGAGGTGCTGGATCTACTATTGTTACACAAGATACTCAAACAAAAACTCTCTTCATTACATCTACAGATGATGATACGATTACCAGATTGAGAGCAACGGCAGGACAAGTTTATAACTCTGGTGATTTTACTTTCCTTGCGGGCGGTGCAACCAGTGTTGTGCAAGGAGTAGATGGCAATGGAGATCCAACAATTACTTACAGTTCTACTAATACTGTAACTAGATTAAAAGGTGGTGGTTCTGGAACATTTACCTCAGGTGATGTAACAATCACTGGAGGAACTAATGTAACAGTATCTCAGGCAGGATCTACTGTTACTGTTGCTTCCGTAGATACTAATGATGTAACAAAAATTGCTGCTAATTCTGAAAGTCTTGCCTTCGGTGACTTTAGATTGCTAGCATCTGGAGCTACAAATATCTCTACATCAGTCAATAATGGTGTAAAAGAAATTACTATTAGCTCTGTCAACACTGATACTGGTGCCGCAGCAACTGCTTCTGGTGGTGTTCAAAAATCTGGTAATGATTTTAGATTAAAAAACAACGCAAACTTTACTGGAAACACTGTTCTCAAATGGGATAGTGGAAACTCTCAGCTAGCAAATAGTATTATTTTAGATGATGGATCTACGATAACTATTGGTGGAGATTTGGTTGTCGAGGGAACACAGACCACTCTGAACACAACCACTCTTGTAGTGGAAGATAATATTATTGAACTTAGAAAAGGACCAAGTATCACTGCTTCCGATGGTGGTATTCAAGTCAACTTAACAACTGATTCAAATGAAAATGTTGTAACTTACAGACAACTTCAATGGTATAATGCTGGTGGATATTGGAGATCTTTTGATGGTTCTGTTTCTAATAGATTTGTAACGGAGAATGAAACTCAAGTTCTTACAAACAAAACTCTTACGTCTCCAACATTAACAGCTCCAATTCTTGGTGCTGCCACAGCATCATCTATTAATGGATTGCAAATTGCAACCACTGCTTCGGCAACTCTTGACATTGCTTCTGCCAAAACATTAGATGTCAATAGAGATCTTGTTTTAACTTCTGATAATAACTCTGCATCTATCACAGTTAACTTTAGGAATGGCGGTAACGTAGCATATACATCAGACACACTTGCTACGTTTGCATCTACAACATCCACTCAGTTGAGAGGTTTGATTACTGACACGACTGGTCTTGATCGTCTTGTATTCCAAACCAACCCAACTATACTTACTGGAATTACTACTACTTCACCTGGATTTACGCTGTTAAATTCTGGTGCCACTGCTATTACAGCATTTGGAGCAGCTGCTTCTATTGATATGGGTGCTGCTGGTGGTACGTTTACCATCAATCAGAATCTAGTTGTTAATGAAGATCTAACAGTGGGTTCTGGTATTGCTGATACTATTACTATCAACGGTATTCTTAACTCTGAGAACGCTGATATTTTAATTCGTGGTAGTGCTACCGATCCAATGAGAGTTGGACGTGGTATTGGTGAAGTTAGTACAAACACTGCCTTGGGTGTGAGAGCAATTAATTCTGTATCCTCTGGTTCTCAGAATACAGCGATTGGTTTTGAATCTTTATTTACCACAAATACTGGTGCTGCTAACACTGCAATTGGTAATAGAGCACTGAGAGCAAATGGTATTGGATCTAACAACATTGCTATTGGTCGTGATGCTCTACTGGTAAATCTTTCTGGTGATAAGAACATCGCTATTGGTAACAATGCGATGGAAAGCATGAGCACAGGTAGTGCCAACGTTTGTATTGGTCACTATGCTGGTTACGGTATCACTGGTACTGGTAACGTTCTCATCGGTCCTGCTGATGATGAGAACTCAACTAACGCAACTTATGTACCACCTAACATTGGTGGCAGCAGACAGTTAGTTATTGGTTCTGGTACTGAAGCATGGATTCGTGGTGACGCTAACTTCAATCTTACATTACCTAATAACCTGACAGTAGATGGTGATGCTACTATCTCTGGTAATTTAGTTGTTAATGGAGATGTCACATCAATTAACTCTAACGTCATTCAAGTAGATGATAAAGAGATTGAACTTGCCTCTGTTGTAGCTACAACATTCTCCGCTGTAACCGTCGATAATACTTCTACAATTACTAGTATTACTATTAATACAGCTGATGCAGGTTTGATTCCTGGAATGGAGGTCAACTCCACAACAGGTGGTATTAGTGTTCCTGCAGGAACAACTATTGTGAGTATTAGTGGAAATACTGCTACTCTCTCAGCTGCTGTTACAGGAAGTGGAACTGCAATCTTCACTTCTCCTGGTGCAACGGATCTGACAGCAGATCAAGGTGGCATTCGTGTCAGGGGAACTACAGACAAGCGAATTTTCTACGATCACTCCAGAACTGATAAGTATTGGGTGATGACTGAGAACCTTGAACTCAACTTCGGTAAGAAGCTAGTTATTGGTAACCAGTTGATGCTCAACAGCACCACCCTTGGTTCTACAATTGTCAATTCTTCACTAACATCTGTTGGTACACTGACTGGACTAGATGTTGATGGTGCTATCACTCTTGGTGGTGTGATTACTGAAAAGACATTCAATAATTTCAGTACGACTCTTACTCCATCTGCTAACGTTCTAACTCTAAACCTTTCTGCTGCCAACACAATTCTTGGAACACCAGCAACAACAGCAATCAATGAGTGGGCATTTACTAATGCTGGTCTAAGCAATGGTCAGTCCAAGACAGTAACTCTCATTCTATCTTCTAACACTGCTGCTACATATGGTGACGCTTGTAGTGTTGATGGCAACGCAGTTACTAATGGTGTTCAGTGGTCTGGAGGTTCGCCACCAATTGCCACATCAAACACAGACATTCTCACGTTTGTTATCGTCCGAGATAATGCGGGTGTCGTTCAGGTATTCGGACAAGGCAACACAGACTTCAGCTGA

Tertiary structure

PDB ID
16db87b44a4a21e1c307e1bd273685169a9780329652a8f6ea1d6afed454eeb8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2491
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Isolation and Genome Sequence of a Novel Cyanophage S-H9-1 from the Yellow Sea, China Jiang,T. 2019-04-04 — GenBank