Protein
View in Explore- Genbank accession
- WYA77462.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEINIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYSRLAVNNIFRGTQTILSDNEALIVKNNTQGMPLGIRGRDADGTSRWYFGNDNRDSNALVLSNVKTGVSIGILENLVSVNRTFQIAGQVQPSDWSNLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNTFSGLNTFSTSVSVISNSAAIMLKNKSVNESLFILAKDVENNNLWYIGKGAANDTITFHDYKGNTSIDLNSSGATFNKTVKITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSNLAKLNVSNTFTNTQTIIANNEGLIVKNLTQNQGLYIRGVDTANVSRWWLGVGGASSNVVALNNSFSGTQISLEQALVSVNKSLYINGQVQPQDWTNLDARYYVQSSADAKYIWSAVRETVRAEDGGVAWNKPSGIYLETLQGGGSNRLVSHMFVNTGASTPAAQLMFGYRNGGMWYRTARDAHGFEEDWSKVYTEAQKPTPSELGAYTKTETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGHHNHAISWIGQNSTHYSGGGGGRIGTGPGYTDGGGDHTHSVSGTAGSAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 784 AA molecular weight: 84212,03700 Da isoelectric point: 7,84376 aromaticity: 0,08418 hydropathy: -0,36645
Domains
Domains [InterPro]
DC_1566
STR
65–784
STR
65–784
G3DSA:6.20.80.10
STR
157–219
STR
157–219
IPR048388
ATT
159–248
ATT
159–248
IPR051934
Unmapped
388–756
Unmapped
388–756
1
784
Architecture
STR 65-158 | ATT 159-248 | STR 249-276 | ATT 277-363 | STR 364-382 | ATT 383-472 | STR 473-784
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_EcoM_BL [NCBI] |
3135017 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Escherichia coli K-12 [NCBI] |
83333 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WYA77462.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP481222.1
[NCBI]
CDS location
range 52635 -> 54989
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGACACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGTTAGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGCAGCACTATGACGGGTGACTTAGGTATTGTGAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCAACAGGTTCTTCTGAGATTAATATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATCAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGGTACTCAAGATTAGCTGTGAATAACATCTTTAGGGGTACTCAAACCATCCTATCTGATAATGAAGCACTTATTGTTAAGAATAACACACAGGGTATGCCACTAGGTATTCGTGGTCGAGATGCAGATGGAACTAGTAGATGGTATTTTGGCAATGATAATAGAGACTCAAATGCTCTTGTATTGTCGAATGTAAAGACTGGTGTTTCAATTGGTATTCTTGAAAATTTGGTGTCAGTCAACAGAACTTTTCAAATCGCTGGTCAAGTTCAGCCTTCTGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGGTTTGCGCAGTTAGCTGGTAATAACACTTTTAGTGGTTTAAATACATTCAGTACTAGTGTTAGTGTTATCTCTAATTCTGCTGCTATCATGTTAAAAAATAAGTCTGTTAATGAGTCTTTGTTCATCCTAGCAAAAGATGTTGAAAACAATAATCTGTGGTATATTGGTAAAGGTGCTGCAAATGACACTATCACATTTCATGATTACAAGGGCAACACCTCTATTGACTTAAACTCGTCTGGTGCTACATTCAACAAGACTGTAAAAATCACTGGTCAAGTTCAGCCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGCTACTTTGAGCAATCTTGCTAAACTTAATGTGTCTAATACTTTCACAAATACACAGACTATTATTGCTAACAATGAAGGGCTGATTGTTAAGAATTTGACACAAAATCAAGGCTTGTATATTCGTGGCGTTGATACTGCGAATGTATCTAGGTGGTGGTTAGGTGTAGGAGGCGCTAGTTCTAACGTGGTAGCCTTGAATAACAGCTTTTCAGGCACTCAAATTTCTCTAGAGCAAGCATTGGTTAGTGTGAATAAGAGTCTGTATATTAATGGACAGGTACAACCACAAGACTGGACTAACTTAGATGCTAGATACTACGTTCAATCTTCAGCAGATGCGAAGTACATCTGGTCAGCAGTCAGGGAGACAGTAAGAGCGGAAGATGGTGGTGTAGCTTGGAATAAACCTTCAGGAATCTATCTTGAGACGCTTCAGGGTGGTGGGTCAAACCGTTTAGTCTCACACATGTTCGTTAATACGGGAGCATCAACACCTGCTGCACAATTGATGTTTGGTTATAGAAATGGTGGGATGTGGTACAGAACAGCCAGAGACGCACATGGTTTTGAGGAGGATTGGTCTAAGGTTTACACAGAGGCTCAGAAACCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAACAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTCAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGGAACTTGCCTTCACACACTCACAGTTTTTCTGCTACAACTTCATCTTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACTCACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTCACCACAACCACGCTATCTCGTGGATTGGTCAGAACTCTACACACTATTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGAATCGGTACAGGTCCGGGTTACACTGATGGGGGTGGTGACCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCTGGTTCTGCTGGTAACCACGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCCGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
b913e3edc1fcc1d34d5eab98311ceef9d027f57a60f2a9bfe57ee9d6a5f2938b
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Isolation and identification of phages and their application in the control of antibiotic resistant bacteria | Wang,Y.-Z., Xue,B.-N., Jin,M.-K., Hu,S.-L., Fortuna,K., Lavigine,R., Ye,M. and Su,J.-Q. | 2024 | — | GenBank |