Protein

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Genbank accession
AUN43387.1 [GenBank]
Protein name
capsid and scaffold protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Seq2Symm
C1 confidence 0,926
C1 0,926
C3 0,736
C2 0,000
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MAEFWSNNDRGYRIRLWVDQVSQDKVANTSQVRFQLALLNTTTTFVQYQCSAYIDFEGQRLNWSGSPSVLGWYQTIPLIDQTVTINHDSEGKKTFSFSAQFNGAGGWSPRTLTISGNSFTLTDIPRLSSVSVDAGTIGSPVTININRQSSSFKHTVRYAWANKSGTIASNVDTSTAWTIPLNFANDIPNSETGTGTIYVDTYSEGTMIGTKSATLIASVPASMKPTFEGVSLSDSNTAAQNVVQNANTFIQIMSNIKVSFNGASGSYGSNITGYHAEIVGKNQTTNVNGGTLGIMNYNGTVTVRASVSDSRGRWSDPRDVSVTVLEYFAPSLSFSVVRTGSTSSTLEIIRNARIAPLNINGIQKNTMKLTFKVSPYGKDDYTTDTGPASGEWLSISSLVNSPANLAGEYAANKSWQVLAVLEDKFTSTSFKAQVPVESVALSYDQAGLGVGKIREFGALDVAGDIYANNSQIQQYQLTGNNGEPKWFDGKPNVTNANYLDQPGQYYLDPSAPGNPNGQWGYLFHYSNYGKNADGIKEAIQTFWGNNGQLFFRHHRWSFIIDDWEPWKEFTRNDHPNLINTGWQPAGYEGSFYKRVGDVLTVRYDFTGNGNTITFATIPKEIFTAPQSYMYVIADWSTDGSYNTHAQINSGASFISAINTKNGWAYAGQLTIML
Physico‐chemical
properties
protein length:673 AA
molecular weight: 73737,68930 Da
isoelectric point:5,82483
aromaticity:0,11887
hydropathy:-0,34651

Taxonomy

Phage
Streptococcus phage vB_SthS_VA214 [NCBI] · taxon 2069608
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host
Streptococcus thermophilus [NCBI] · taxon 1308
cellular organisms Bacteria Bacillati Bacillota Bacilli Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AUN43387.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MG708274 [NCBI]
CDS location
range 16515 -> 18536
strand -
CDS
TTGGCAGAATTTTGGAGTAATAATGATAGAGGCTATAGGATAAGGTTGTGGGTTGACCAGGTTAGCCAAGACAAAGTAGCTAATACCAGTCAGGTCAGATTTCAACTAGCACTGCTAAATACGACTACGACTTTTGTTCAATATCAATGTAGTGCTTATATCGATTTTGAAGGTCAAAGATTGAATTGGTCTGGTTCACCTAGTGTATTAGGGTGGTATCAAACAATTCCATTGATAGATCAAACAGTTACTATTAATCACGATTCCGAAGGAAAAAAAACTTTCTCTTTTTCAGCGCAGTTTAATGGGGCTGGTGGCTGGAGCCCTCGTACATTAACAATCAGTGGTAACTCATTTACACTAACCGACATACCACGGTTAAGCTCTGTAAGCGTTGATGCTGGTACTATTGGTAGCCCAGTCACTATTAACATCAACCGACAAAGCTCTAGTTTTAAGCACACAGTACGTTATGCTTGGGCAAATAAGTCAGGGACTATTGCAAGTAATGTAGACACATCTACAGCATGGACTATCCCACTTAACTTTGCTAATGACATCCCAAACTCGGAAACAGGTACAGGAACAATCTACGTAGATACCTACTCAGAAGGAACCATGATAGGGACAAAGTCAGCTACGCTAATAGCAAGTGTGCCAGCTAGCATGAAACCAACTTTCGAAGGAGTTTCTTTGTCAGACTCTAACACAGCCGCTCAGAACGTGGTACAAAACGCTAACACATTCATCCAGATTATGTCTAACATCAAGGTATCCTTCAATGGTGCAAGTGGGTCTTATGGCTCAAATATCACGGGTTACCATGCTGAGATAGTCGGTAAGAACCAGACTACCAACGTCAACGGTGGCACGCTGGGTATCATGAACTACAACGGAACCGTTACAGTCAGAGCAAGTGTATCTGATAGCCGTGGTCGTTGGTCTGATCCTAGAGATGTCTCTGTCACAGTGCTTGAGTATTTCGCCCCATCGCTTAGTTTTAGTGTCGTCAGAACTGGATCAACATCTAGTACACTAGAAATTATAAGGAATGCACGGATAGCACCTTTGAATATTAATGGTATTCAAAAAAACACCATGAAATTAACTTTCAAGGTGTCTCCTTATGGCAAAGATGATTACACAACAGACACTGGTCCTGCCTCTGGTGAATGGTTAAGCATTTCAAGTCTTGTCAATTCACCTGCTAATTTAGCTGGTGAATATGCAGCTAATAAATCGTGGCAAGTCTTGGCAGTATTAGAAGACAAATTCACATCCACGAGCTTTAAGGCACAAGTTCCTGTTGAAAGTGTTGCGCTGTCCTATGACCAGGCTGGTCTTGGGGTTGGTAAAATACGCGAGTTTGGCGCTCTTGATGTTGCTGGCGACATCTATGCAAACAACAGTCAGATTCAGCAATATCAGCTAACTGGAAATAACGGAGAGCCGAAGTGGTTTGATGGCAAACCTAACGTAACAAATGCTAACTATCTTGACCAGCCTGGTCAATATTACCTTGACCCATCGGCTCCAGGAAACCCAAACGGTCAGTGGGGCTATTTATTTCACTACAGCAATTACGGTAAGAATGCAGATGGTATTAAAGAAGCTATTCAGACTTTCTGGGGAAATAATGGTCAGCTATTTTTCAGACATCACAGATGGTCTTTTATAATCGATGACTGGGAACCGTGGAAGGAATTCACTAGGAACGACCACCCAAATCTAATTAACACAGGATGGCAACCCGCAGGATATGAGGGTAGCTTTTATAAGCGCGTCGGAGATGTTCTGACGGTTAGATATGATTTTACTGGTAATGGAAACACTATTACCTTTGCAACAATACCGAAAGAAATTTTCACAGCCCCACAATCATACATGTACGTAATAGCTGATTGGAGCACTGACGGAAGTTACAATACTCACGCCCAAATAAATAGTGGAGCTAGCTTTATTTCCGCAATTAATACTAAAAATGGATGGGCCTATGCTGGTCAACTCACAATAATGCTATAA

Genome Context

Tertiary structure

AUN43387.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 79.9
Oligomeric state monomer
Download structure