Protein
View in Explore- Genbank accession
- DBB20427.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MLNLPNPNLNLTDKKESKSVLLENIQSALKQDKDFIEQVYLSLDGIYTLLKEFDKLEIFKNLNSQEESAINMMSALKEKVQEYQGYFKELNQVLGDSESNLNQSLNQIDLKIKELERELNNRKTLLQTELNIDFENFKSQNLEKLKTLIEENKQELLKVLSAFKTESLENLENSKNSALNALNSTKSTALSELNTLKQEITQNKQDALSELTQDKQDAINSLNALKSESLENLENSKNSALSALNSTKNSTLSELNTLKQEITQNKQDAINAITHDKQDSLSALNALKVESLENLAQTQSQGLERLEQTKTQALNALESIKTNAETIANNALEIANNNARSLSALEGVNMKFIGVFINGEQKLYVNKTNNFNEIFAFNDLTLKSDTSYYLSFLLPYQVSVSSQYENNMGEFILGLKSDNIVYPILSSFQSAKSTLVFNNTRIDNYFVRVAFKTPANANHLTLGFFARQVNSLWINVNFTGNTDGLGDNYVNHSVFNAFQVRAIAPDYNNNNAYNKSTHCVVYEILD
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 526 AA molecular weight: 59327,63110 Da isoelectric point: 4,98997 aromaticity: 0,07414 hydropathy: -0,49791
Domains
Domains [InterPro]
DC_0415
STR
1–200
STR
1–200
Coil
Unmapped
98–125
Unmapped
98–125
DC_0415
STR
190–258
STR
190–258
1
526
Architecture
STR 1-526
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Bacteriophage sp [NCBI] |
38018 | No lineage information |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
DBB20427.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
BK070059.1
[NCBI]
CDS location
range 23417 -> 24997
strand +
strand +
CDS
GTGTTAAATCTACCTAACCCTAATTTAAACCTAACAGACAAGAAAGAGAGTAAAAGCGTTTTATTAGAAAATATACAAAGTGCTTTAAAGCAAGATAAGGACTTTATAGAACAAGTGTATTTGAGCTTAGATGGGATTTATACGCTTTTAAAAGAGTTTGACAAACTAGAGATTTTTAAAAATCTTAATAGCCAAGAAGAAAGCGCTATTAATATGATGAGCGCTTTAAAAGAAAAAGTGCAAGAATACCAAGGCTATTTTAAAGAGCTTAATCAAGTTTTAGGGGATAGTGAGAGTAATTTAAACCAATCTTTGAATCAAATTGATTTAAAGATTAAAGAGCTAGAGAGAGAACTTAATAATAGAAAGACGCTTTTACAAACAGAGCTAAATATAGACTTTGAAAATTTTAAAAGCCAAAATTTAGAAAAATTAAAAACCCTTATTGAAGAAAACAAACAAGAGCTTTTAAAGGTTTTAAGCGCTTTTAAAACTGAGAGTTTAGAGAATTTAGAAAATAGTAAAAATAGCGCCTTAAACGCACTTAATAGCACTAAATCCACTGCTTTAAGTGAATTAAACACTTTAAAGCAAGAGATTACACAAAATAAGCAAGACGCCTTAAGTGAATTAACACAAGACAAACAAGACGCCATAAATTCCTTAAATGCCTTAAAAAGCGAGAGTTTAGAGAATTTAGAAAATAGTAAAAATAGCGCCTTAAGCGCACTTAATAGCACTAAAAATAGCACTTTAAGTGAATTAAACACTCTAAAGCAAGAGATTACACAAAATAAGCAAGACGCCATAAATGCCATAACACACGACAAGCAAGACTCCTTAAGCGCTTTAAATGCCTTAAAAGTTGAGAGTTTAGAGAATTTAGCACAAACTCAAAGCCAAGGTTTAGAGAGATTAGAACAGACTAAAACTCAAGCATTAAATGCCTTAGAGAGCATAAAAACTAATGCTGAAACTATTGCCAATAACGCCCTAGAAATTGCCAATAACAATGCAAGGAGTTTAAGCGCCTTAGAGGGCGTGAATATGAAATTTATCGGTGTTTTTATCAACGGAGAGCAAAAACTCTATGTTAATAAAACCAATAACTTTAATGAGATTTTTGCCTTTAATGATTTAACTCTAAAGAGTGATACAAGCTACTATCTATCCTTTTTATTGCCTTATCAAGTGAGTGTAAGCTCGCAATATGAAAATAACATGGGCGAGTTTATCTTAGGCTTAAAAAGTGATAACATTGTCTATCCAATTTTAAGCAGTTTTCAAAGCGCAAAAAGCACGCTGGTATTTAATAATACAAGGATAGATAATTACTTTGTAAGAGTCGCTTTTAAAACCCCAGCTAATGCCAATCATCTCACATTAGGCTTTTTTGCTAGACAAGTTAATAGCCTATGGATAAATGTTAATTTCACAGGAAATACCGACGGCTTAGGGGATAATTATGTCAATCATAGCGTGTTTAATGCTTTTCAAGTAAGAGCTATTGCACCAGATTATAATAATAACAATGCTTATAATAAATCCACGCATTGTGTGGTTTATGAAATTTTAGATTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
3389fa235b0061a01cbfae13c79dc8f14dce05322b1a1680b6e71bc0a350ce89
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50