Protein

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Genbank accession
XTQ13597.1 [GenBank]
Protein name
colanic acid degradation
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MAVFSNLEGTMMPTFKLGKRGASINFVNDSVAIKDFLGETFLPVKVGTPNDDDSAVNVRYLEDNPNALFGVLPPTNDIGKNNNTYFQVDSEGIVDIFAKTNDVWVKSLYINKNVLSSVNGADYIGLITGGTLQQAQFYITPEEFGAKGDGITDDTAAVNACAVYAKEHQIQIQAGGNYRIRTAVYLNDIQWFGGTITGNGGTMVSVLNSTIQQATLTGCYLKFFGGNGKFYFNKFINITSTAAFLMQGMTESGTIDFCFNEMTQCKYGVLQQGTGEKMTVGRYSYNHIHDIYGDAIELNVVNSHYPDGFVIEGNLIENVDGTNAPIPLSNWGIGIGVAGSGPYDVNADDSQYVKKFVIKNNRLYNVRQCIHVELGKDFKILNNEVYPSTLVSIGTGLTTAGVITYGSVDFIIDGLSGHLLNDPSVTNRMVSINWGVTSGKFAGPPRNFKLCNLHIPESSIIVYTSGSDNWLNTTELSNITCSRIQWRGLPSSSKFNNISTKELDVIGQHLATEGEGGGLYTRSKYTYTNWTNCVVQDDCNISKYSFSRMYVDRIDQSSNNFKVTTAIDGTGHRGPVVIPVVEQYYVPYDVFPGGRYFPAGTIIHKQSGGKFIVTVGGSFFGRYDTIRQTVAGQTYIEALGVSWGDNQYAKAAGTEILITGAGENGEDLKTYITRAVYVVNNAYRIDIADPIVTATAAGALLKAAQPITYITLS
Physico‐chemical
properties
protein length:713 AA
molecular weight: 77647,37120 Da
isoelectric point:5,33499
aromaticity:0,10940
hydropathy:-0,11641

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
132–372
IPR011050
IPR012334
142–535
IPR012334
XTQ13597.1
1 713
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage WPEC3
[NCBI] 		3421660 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XTQ13597.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV611058 [NCBI]
CDS location
range 222210 -> 224351
strand +
CDS
ATGGCAGTTTTTTCCAATTTAGAAGGGACCATGATGCCAACATTCAAGTTGGGTAAACGTGGTGCTTCTATTAATTTTGTAAACGATTCTGTCGCAATCAAAGACTTTTTAGGCGAAACGTTCCTACCTGTTAAGGTGGGAACTCCTAATGACGATGATTCCGCAGTAAACGTTAGGTATCTTGAAGATAACCCAAATGCTTTATTTGGCGTACTTCCACCAACAAATGACATTGGTAAAAATAACAACACTTATTTTCAAGTTGATTCTGAGGGTATTGTTGATATCTTTGCAAAAACAAATGATGTTTGGGTAAAATCATTATACATTAATAAAAATGTCCTTTCCAGTGTTAACGGTGCTGATTATATCGGACTTATTACTGGAGGAACACTTCAACAGGCACAGTTTTACATAACTCCAGAAGAGTTTGGTGCAAAAGGTGATGGTATCACTGATGACACGGCGGCGGTTAACGCATGTGCAGTTTATGCTAAAGAACACCAAATCCAAATTCAAGCTGGTGGTAATTATCGTATCAGAACTGCTGTTTATTTGAATGATATTCAATGGTTTGGCGGTACAATCACTGGTAACGGTGGCACAATGGTATCAGTACTGAATAGTACAATCCAACAAGCAACATTAACAGGATGTTATTTAAAATTCTTTGGTGGTAATGGTAAATTTTATTTTAATAAATTTATTAATATTACAAGTACTGCTGCATTTCTAATGCAAGGTATGACTGAATCAGGTACTATCGACTTCTGCTTTAATGAAATGACACAATGTAAGTACGGTGTTCTTCAGCAAGGCACTGGTGAGAAAATGACCGTTGGGCGTTATTCATACAACCACATCCATGATATATATGGTGATGCAATTGAATTGAACGTAGTCAACTCACATTACCCAGACGGATTTGTAATAGAAGGTAACTTGATTGAAAACGTAGATGGTACAAATGCACCAATTCCTCTTTCAAACTGGGGTATTGGTATCGGTGTTGCAGGTTCTGGTCCTTATGATGTGAATGCTGATGATTCACAATATGTAAAAAAATTCGTTATAAAAAATAACCGCTTGTACAATGTCCGTCAATGTATTCACGTTGAGTTGGGTAAAGACTTTAAAATTCTCAATAATGAAGTTTATCCATCAACGTTGGTATCAATTGGTACTGGTTTGACAACCGCTGGTGTAATTACTTATGGTTCTGTTGATTTTATTATTGATGGCCTATCTGGGCATCTATTAAATGATCCATCAGTAACTAACCGTATGGTTTCTATTAACTGGGGCGTAACATCTGGTAAATTTGCTGGTCCTCCACGAAACTTTAAATTATGTAATCTCCACATTCCTGAGTCGTCTATTATTGTGTATACTTCAGGCTCTGATAATTGGCTAAATACTACTGAACTTTCTAATATTACATGTAGTAGAATTCAATGGCGTGGATTGCCGTCATCTTCCAAGTTTAATAATATCAGTACTAAAGAACTTGATGTTATTGGACAACACCTTGCAACTGAAGGTGAAGGAGGGGGCTTATATACTCGCTCTAAATATACATATACCAACTGGACTAATTGTGTTGTTCAAGATGATTGTAACATATCAAAATATAGTTTCTCAAGAATGTATGTTGACCGTATTGACCAATCATCTAATAACTTTAAAGTAACCACTGCAATTGATGGAACGGGTCATCGTGGACCTGTAGTAATACCTGTAGTTGAACAGTATTACGTGCCTTATGATGTTTTTCCTGGTGGGAGATATTTCCCAGCAGGAACAATTATCCATAAACAATCAGGTGGAAAATTTATTGTTACAGTAGGTGGTTCTTTCTTTGGTCGATATGACACAATTAGACAAACAGTTGCAGGACAAACTTATATCGAAGCATTGGGTGTATCATGGGGTGATAATCAATATGCTAAAGCTGCTGGAACCGAAATCCTAATCACAGGAGCAGGGGAAAATGGCGAAGATTTAAAAACATATATCACTAGAGCAGTTTATGTTGTTAATAATGCGTATCGTATCGATATTGCCGATCCGATTGTTACTGCTACCGCAGCAGGGGCATTATTAAAAGCTGCTCAACCAATAACATATATCACCCTATCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
15d802a9cbeecf24d7e66b1a7424d0b370ea288663e0416a680b80b3691e0c6f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7112
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50