Protein
View in Explore- Genbank accession
- WNO25371.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MSNTLPLLDNISIYEGDDATLTFSCLSDITGYKVELSVELGNDSPYTILKAVGYVNTTDPTKYVISIRRSDTTGKGRTEPYPYSIKLTSPTGSVCTDRYGTLTIIPNAGGDGDSSSTSGDYRDIIETDGLTDNAILKWDASTKMLKASGVTSEEQGDLTTATNSVNIGVHDVGSAGRNIAITNRVDKRTFNPIFQEVGIDDANTTTAYQREHEAMSELEVNTVTPPNNYVVLTNPTWNFSTAFNETVFGIQLHPVTNMVDVIYTIKENGVPIYTANIGNFRSANPPSFAFFETPFSLYANKAYTVSLTCKDGSDAMFYGNLVGKPHYTVKLRKFDFKELASKDYVDSKRVTPTMASHFVGIFDDLQGLHDAVPTPTQGLQAIVINPSEYYYHYVGSAWAQLAPVGSFHPTYLGAYDTVQDLQTANPSPTKDALAIVGVDTKAFYFYDVLSWKMVTHTDIPALDRRVSDVETKSTDNANRINTAEGHLQTLQADATSQDNKISALEVGQKTLQSNIDQKLDGLHIEDTSGNAFDDVVGLTFEGATVADDGSDHIHVTVAPKITVANGQAPDSTSESGNALIFDGSTITVDPHDANVIHVDIPTSTNNGISVGDGATASRQVHRLLFNGHEVHGSGDTAEVHLEFVHFKTLTERDTWSTRYGTHLDYDVIALVDADENGFVQFYKFNATTKAWMEYNAQGVVMSDSGGAIPKNIKTVVFGPGFAIQQAGSEEDAALVTYTPTGDTHTHEAALSVGQAWGDYHQVTKVDTIDTRYPLEVHTGKQNPNDPEEGTAVLVIKPDAFEPMQAPSFLANTSDIRSIKAGKDTVIFCDNPITPYGMFFSVDNKLEGLRVQDDISGDDPNLGGQLTELLGSVEFETKAPSKGNIKLWFMYHQNGAYIPTGYVTGTDGNPLIVEKTFNTGDDLKMVIAGAYYAKGQETITLHVEHSFSGEQLTMVPEKTMLCVNQFEQGASSSLARIEFMRRLGTQITPVIYKFTKPFVRLSDTVLNLNKPESAVGAGEGEEFLAQFGINNLTTCKASIANGVISISDNNLDILDFYMDYLVDNTRTSMMRGKEFKVSVRCSSIDTAYNLSLFAWTGKADEMTKIYNGRNNDALTLNDGWKEVKKTFIAEQPNGSDGNYDLTVTIPEEASNLAFVIYPTAAQNPINFTISEFSIEPANEFSGYTELESYSLHEVHLRESDDFIEFGQNSEGFASLRYTLNYKPIQGLPLPVGIPLKGNAPFTLDPSKNTVAGSSAKGGEGALKATKDGQVSLSCDYLLWNEKDTDSVVTLWWELETIDGTTSKITGSEIEFTVPKSSTTHGILKTQPAFVFEVEAGQWFYLRGSANKPDGAYLQSTKLTDYMVRPVIDFKELLGSYDDSDLVSIGLDKKLVVDRRVHTFTNNTSQNIVISGLNIPSDVTLASVTAEKDLPNGFTSIETVQHAYNPTTSELTVHVGSVNSGKIFLEFWG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1467 AA molecular weight: 160227,31260 Da isoelectric point: 4,70891 aromaticity: 0,09339 hydropathy: -0,28971
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Vibrio phage vB_VpaP-MS02 [NCBI] |
3075130 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNO25371.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR102882.1
[NCBI]
CDS location
range 40665 -> 45068
strand +
strand +
CDS
ATGTCTAACACATTGCCTTTATTAGATAATATCTCTATCTATGAAGGGGATGACGCTACCCTAACGTTTTCCTGCTTATCAGACATCACTGGATATAAAGTAGAGCTGAGTGTAGAGTTGGGTAATGACTCTCCTTACACAATTTTAAAAGCGGTTGGTTATGTAAATACTACTGACCCTACTAAATACGTTATTTCTATTAGACGTTCAGATACTACCGGTAAAGGTAGAACTGAACCTTACCCTTATTCTATTAAACTAACTTCACCTACTGGTTCAGTATGTACAGATAGATATGGTACTTTGACTATCATCCCTAATGCAGGTGGTGATGGGGATTCATCTAGTACATCTGGTGATTATAGAGACATTATTGAAACTGATGGTCTAACTGACAATGCTATCCTTAAGTGGGATGCATCAACCAAAATGCTTAAAGCGTCGGGTGTAACTTCTGAAGAACAGGGTGACCTTACTACTGCAACTAACTCAGTAAACATCGGTGTTCATGATGTTGGTTCTGCCGGTAGAAATATCGCTATTACTAACAGAGTAGATAAGAGAACCTTTAATCCTATCTTCCAAGAAGTTGGTATTGATGATGCAAATACAACTACAGCATATCAACGTGAACATGAAGCAATGTCTGAGTTGGAAGTTAATACAGTAACTCCTCCAAATAATTATGTTGTTCTAACCAATCCAACTTGGAATTTTAGCACTGCATTTAATGAGACAGTATTTGGGATTCAATTGCATCCAGTAACCAATATGGTAGATGTGATTTACACTATTAAAGAAAATGGTGTGCCTATCTATACAGCAAATATTGGTAACTTTAGAAGTGCTAATCCTCCTAGTTTTGCATTCTTTGAAACCCCGTTCTCTTTATATGCTAATAAAGCTTATACAGTTAGCCTTACTTGTAAGGATGGTTCAGATGCAATGTTCTACGGAAATCTTGTAGGTAAACCACACTATACAGTTAAACTTAGAAAGTTTGATTTTAAAGAATTAGCTAGTAAGGATTATGTAGATAGTAAAAGAGTTACCCCTACAATGGCTTCACATTTTGTAGGTATCTTTGATGATTTACAGGGATTACACGATGCAGTTCCTACCCCTACTCAGGGATTACAGGCAATTGTTATTAATCCTAGTGAGTACTACTACCATTACGTTGGTTCAGCATGGGCACAGCTTGCACCTGTAGGCTCATTCCACCCTACTTACCTAGGTGCTTACGATACTGTTCAAGATTTACAAACAGCTAATCCTTCACCTACTAAAGATGCACTAGCTATTGTAGGTGTAGATACCAAAGCATTTTACTTCTACGATGTTCTATCATGGAAGATGGTAACTCATACCGATATTCCTGCACTAGATAGAAGAGTATCGGATGTTGAAACTAAATCTACTGATAATGCTAATCGTATTAATACCGCAGAAGGTCATTTACAAACTTTACAGGCTGATGCTACTTCTCAGGATAATAAGATTTCAGCATTAGAAGTTGGACAGAAAACCTTACAATCCAATATTGACCAAAAGCTTGATGGGCTACATATCGAAGATACTTCTGGTAATGCTTTTGATGATGTCGTTGGTTTAACTTTTGAAGGTGCAACTGTAGCTGATGACGGTTCAGACCATATCCATGTAACGGTAGCTCCTAAAATTACTGTAGCTAATGGTCAAGCCCCTGATAGCACATCTGAATCAGGTAACGCGCTAATCTTTGATGGTTCTACCATTACAGTAGACCCACATGATGCTAATGTAATCCATGTAGATATTCCTACATCTACTAATAATGGTATTTCTGTAGGTGATGGTGCTACAGCTAGTAGACAGGTACATAGACTACTGTTTAATGGGCACGAGGTTCATGGTTCAGGGGATACAGCAGAAGTTCATTTAGAATTTGTGCATTTTAAAACCTTAACTGAAAGGGATACTTGGTCTACTAGATATGGTACTCACCTAGATTATGATGTAATCGCTTTAGTAGATGCCGATGAAAATGGTTTTGTACAGTTTTATAAATTTAATGCAACCACTAAAGCGTGGATGGAATACAACGCTCAAGGTGTAGTTATGTCTGATTCAGGCGGTGCTATTCCTAAAAATATTAAGACAGTTGTGTTTGGTCCCGGCTTTGCTATTCAACAAGCAGGAAGTGAAGAAGATGCTGCATTAGTTACATATACCCCTACAGGTGATACTCATACACATGAAGCTGCTTTAAGTGTGGGACAAGCTTGGGGTGATTATCACCAAGTAACTAAAGTGGATACTATTGATACCAGATACCCTTTAGAAGTTCATACAGGTAAGCAAAATCCTAATGACCCTGAAGAAGGTACAGCGGTATTAGTAATTAAGCCTGATGCATTTGAACCAATGCAGGCTCCGAGTTTCTTAGCTAATACTTCAGATATCCGCTCTATTAAGGCAGGTAAAGATACTGTTATCTTTTGTGACAACCCAATCACACCTTATGGAATGTTCTTTTCTGTAGATAACAAGTTAGAAGGTTTAAGAGTACAGGACGATATCTCAGGTGATGACCCTAACTTAGGGGGCCAACTTACTGAACTGCTTGGTTCAGTTGAGTTTGAAACTAAAGCGCCAAGCAAAGGTAATATTAAACTTTGGTTCATGTACCACCAGAATGGTGCATATATCCCTACAGGTTATGTAACCGGTACAGATGGTAATCCTTTAATTGTAGAGAAGACTTTTAATACCGGTGATGATTTAAAAATGGTCATTGCAGGAGCTTACTACGCTAAAGGACAAGAAACCATTACTTTACACGTTGAACATTCATTTTCCGGTGAACAGTTAACTATGGTTCCTGAGAAGACAATGTTATGTGTAAACCAATTTGAGCAAGGGGCTAGTTCATCTTTAGCGCGTATTGAGTTTATGCGTAGATTAGGTACTCAGATTACCCCTGTTATCTACAAGTTTACTAAACCTTTTGTAAGATTAAGTGATACTGTTCTTAACCTTAATAAGCCTGAATCTGCTGTAGGAGCTGGAGAGGGTGAAGAGTTCTTAGCACAATTTGGTATTAATAACCTAACTACGTGTAAAGCTAGTATTGCTAATGGTGTAATTAGTATCTCAGATAACAATTTAGATATTCTAGACTTCTATATGGATTACCTAGTGGATAACACTAGAACGTCTATGATGAGGGGTAAAGAGTTTAAAGTATCTGTTAGATGTAGCTCCATTGATACCGCATACAATCTATCTCTATTTGCTTGGACAGGTAAAGCAGACGAGATGACTAAGATTTATAATGGTAGAAATAATGACGCTCTTACTTTAAATGACGGTTGGAAAGAAGTTAAGAAAACATTTATTGCTGAACAACCTAATGGTAGTGATGGTAATTATGATTTAACTGTAACCATTCCAGAAGAAGCATCTAATTTAGCTTTTGTTATTTATCCTACTGCTGCACAGAATCCTATTAACTTCACTATTAGCGAGTTCTCTATTGAACCCGCTAATGAGTTTAGTGGTTATACAGAATTGGAGAGCTACAGCTTACATGAAGTGCATTTGAGAGAATCTGATGACTTTATTGAGTTTGGGCAGAATTCTGAAGGATTTGCGAGTTTAAGATACACCTTAAACTACAAACCAATCCAAGGTTTACCATTACCTGTAGGCATCCCTTTGAAAGGTAATGCTCCCTTTACCCTAGACCCATCTAAAAATACTGTTGCTGGTTCTAGTGCTAAAGGTGGTGAGGGTGCTTTAAAAGCAACTAAAGATGGTCAAGTGTCTCTATCATGTGATTACCTTCTTTGGAACGAAAAGGATACAGACTCTGTTGTAACTCTATGGTGGGAGCTTGAAACTATTGACGGCACTACCTCAAAAATTACTGGAAGTGAAATTGAGTTTACAGTTCCTAAGAGTTCAACAACTCACGGTATTCTAAAGACCCAACCAGCATTTGTATTTGAAGTGGAGGCAGGACAATGGTTCTACCTACGAGGCTCAGCTAACAAACCTGACGGCGCTTACCTACAATCAACTAAACTTACTGATTACATGGTTCGCCCTGTAATTGACTTTAAAGAACTATTGGGTAGTTATGATGATTCCGATTTAGTATCTATTGGTTTAGATAAGAAGTTGGTGGTTGACCGTAGAGTACATACTTTCACTAATAATACTTCCCAGAATATTGTTATTTCTGGTTTGAATATTCCTAGTGATGTAACATTGGCAAGCGTTACTGCTGAGAAGGATTTACCTAATGGGTTTACTTCTATTGAGACAGTACAACACGCTTATAATCCAACTACTTCCGAATTGACAGTTCATGTTGGCTCAGTCAATTCAGGTAAAATCTTTTTAGAGTTTTGGGGATAA
Tertiary structure
PDB ID
fbb0aff8fa96d181f86c6880b6a521a1df6c18273a55905f04cf00d78c763932
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50