Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_013604866.1 [GenBank]
- Protein name
- L-shaped tail fiber protein B
- RBP type
-
TFTFTFTFTF
- Protein sequence
-
MSRNLMPKSGAMAPYVVVNRDAAVAGVFSIDGEAGAVVLTSKYLQISKYNTDKAATDASINSINESIGNINTALGGINTTLNTKAAKGANNDITELNALTKAIKISQGGTGATTLDGAKKALQVERLRQQSNGTFIVSPNEKYSLFIYDSGDFGLIESSTAAVQALKVAFGGTGGTTPKAARKNLNVPVGALAEVIPNGENVLNYIAIAGQSGYYSSGDGVTHIPPVTEGWWTYNFHCHGVDINGAAQYGMLKATGLSGSTWTNVLDGTGNWKGWQEQFNSQSTVPVANGGTGANSIEGAKTKFGINRFSQTALDTRMSSPDAKKIFRIADGVWGAYNLETNQEIPLGIASGGTGANSAAQARRNLELSEWGLLQSISGRYPGGFNIDSIDFNSTLTVPPSPGSNIVGVRPFQQIPGLEDAWFFLETLVHPDPNYRTQRATLFTGAWKSSICTRTMDSGTWGVWQQVHGAFGLIADPIRDRATFKSMGIADGGAGSLVGGTIKGGAFTAWRDRPCGVLVEHEATDAAYAIWKSVKWGVDWVSGMDAVLWAAGGAQLSLYCKGAEYRFDSGGTAAAGQWVSTSDIRMKANLKEIENARDKVKSLVGYTYYKRSTLKEEKDTTYNIEAGVIAQDVQAVLPEAVYKIEPQKEDSMLGVSHAGVNALLVNAFNELNEVVEKQQQEIDELKELVKQLLAK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 695 AA molecular weight: 74109,28770 Da isoelectric point: 5,94822 aromaticity: 0,08489 hydropathy: -0,21540
Domains
Domains [InterPro]
DC_0195
STR
2–695
STR
2–695
cd19958
STR
419–467
STR
419–467
IPR030392
CHP
582–642
CHP
582–642
1
695
Architecture
STR 2-695
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage EscoHU1 [NCBI] |
2881221 | Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Epseptimavirus > Epseptimavirus EscoHU1 |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_013604866.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_133119.1
[NCBI]
CDS location
range 83889 -> 85976
strand -
strand -
CDS
ATGTCACGTAATTTAATGCCAAAAAGTGGGGCTATGGCCCCCTATGTTGTAGTTAATAGAGACGCCGCGGTTGCCGGCGTTTTCTCTATTGACGGAGAAGCTGGTGCTGTTGTGCTAACTTCTAAATATCTACAAATTTCAAAGTATAATACTGATAAAGCTGCTACCGATGCATCTATCAATAGTATTAACGAATCAATTGGTAATATCAACACTGCGTTAGGTGGTATTAATACTACTTTAAATACTAAAGCTGCTAAAGGTGCTAATAACGATATTACAGAATTAAATGCACTTACTAAAGCTATTAAAATTTCTCAAGGTGGTACTGGTGCTACTACATTAGATGGTGCTAAGAAGGCCTTACAAGTTGAACGCCTTCGTCAGCAGAGTAATGGAACTTTTATTGTATCTCCCAATGAGAAATATTCTTTATTTATATATGATAGCGGAGATTTTGGTTTAATTGAGAGTTCTACTGCGGCTGTACAAGCATTAAAAGTTGCATTTGGTGGTACTGGAGGAACTACTCCAAAAGCTGCAAGAAAAAATCTTAATGTTCCAGTTGGCGCCTTAGCTGAAGTAATACCTAATGGGGAGAATGTTCTAAATTATATCGCAATCGCTGGACAAAGTGGATACTACTCTTCTGGAGATGGTGTTACACATATTCCTCCAGTTACTGAAGGATGGTGGACATATAACTTCCATTGCCATGGTGTGGATATTAATGGTGCTGCTCAGTATGGTATGTTAAAAGCCACTGGATTATCTGGAAGTACTTGGACTAACGTTCTGGATGGTACTGGTAATTGGAAAGGTTGGCAAGAGCAATTCAATTCACAGTCTACTGTACCAGTTGCTAATGGTGGTACAGGGGCTAATTCTATAGAAGGGGCTAAAACTAAATTTGGTATTAATAGATTTAGTCAGACTGCCCTAGATACTAGAATGAGTAGTCCTGATGCTAAGAAGATATTTAGAATAGCAGATGGGGTTTGGGGAGCTTACAATCTAGAAACTAATCAGGAAATACCGCTAGGAATAGCTAGTGGAGGTACCGGGGCTAATTCAGCTGCTCAGGCTAGAAGAAATCTAGAATTAAGTGAGTGGGGCTTGCTACAGTCTATATCTGGAAGATATCCAGGAGGTTTTAATATTGACAGTATAGACTTTAATTCAACCTTAACAGTTCCTCCTTCTCCTGGCTCTAATATTGTAGGCGTACGCCCTTTCCAACAAATCCCAGGATTAGAAGATGCTTGGTTCTTTCTAGAAACTTTGGTCCACCCTGATCCAAATTATAGAACTCAAAGGGCTACGTTATTTACAGGTGCTTGGAAAAGTTCTATCTGCACACGTACAATGGATAGTGGTACTTGGGGTGTTTGGCAACAAGTACATGGGGCATTTGGTTTAATAGCTGATCCAATACGGGATCGAGCTACCTTCAAAAGTATGGGTATAGCAGATGGTGGTGCTGGAAGCTTAGTAGGTGGTACTATTAAAGGAGGGGCATTTACTGCTTGGAGAGATAGACCTTGTGGAGTGCTAGTAGAGCATGAAGCTACGGATGCAGCGTACGCTATATGGAAAAGTGTTAAATGGGGTGTGGATTGGGTATCTGGTATGGATGCTGTGCTATGGGCTGCTGGTGGTGCACAGCTTAGCTTATACTGTAAAGGTGCTGAATATCGCTTTGATAGTGGTGGTACTGCTGCTGCAGGTCAATGGGTAAGTACTTCTGACATACGCATGAAAGCCAACCTCAAGGAAATTGAGAATGCTCGCGATAAGGTTAAATCTCTGGTAGGCTATACATATTATAAGAGAAGTACCCTTAAAGAGGAAAAAGATACTACCTATAACATTGAAGCTGGTGTTATAGCCCAGGATGTACAGGCTGTTCTTCCAGAGGCAGTATATAAGATCGAACCACAAAAAGAAGATAGTATGCTCGGCGTATCTCATGCTGGTGTAAACGCTTTGCTAGTTAATGCTTTTAACGAGCTTAACGAAGTGGTTGAGAAGCAGCAGCAAGAAATTGATGAACTCAAGGAATTGGTAAAACAACTTCTTGCTAAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
90b8a047366edd396f6cf787ff2aec1af31ad5c869908f90d2eabd4fc28d8135
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50