Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_009844292.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MAKQKGDIRRQASLGTELKRNINNNNSTSDLVLARVSKVDYENNSIEYIVQTNGMNNSSGAISNGGARLPVSFGGKNGYGNPYGSVNTIRVNDIVLIGFVGGKKNSPIVISKYLSDEDAYMLSDYSGDQYMAPNDEDMYDKTNSYRDLYPDLTYSYHNGNGYYEHTFSGNSFLVMDDYDIKGNFVDYPVGEVDASTYYSLRGNKYKDGTNFDTLNYLAPNIFFKHQGSYLLDDNGEEKLDHHQTNVSISPQGTTRLTTFHDDDKWLSLFSIDGDNGEISLTRENDNSINIGDTSDSNATFTIDKDNNLILSSGNTKMTLSDGHHIIASDLDTDSDKIDLYQSALNNKNSISGINNSINSINNNMSSSSSSLSTVNDQVNMSASSISQTNAIASSIYGNATTSVNMFSLASSIANTEIDSNTGFYKENNGSLSTPKMAAIRNFNYILTAYSVTSPITIKIAFYDLNKNFINEKEVTGNSGDISVTAISPDNAVYISASVSSNAFKVKLEQADKVTSWSPSIVDLYTNNNTVLELLSAAKIAQADTNAKMSTVTSNNYLNSLLQYNNDSQILASDKDSLANSWDLFKADYKVVVSYATKYSVDLTTANSYYTPLENSIEKDILVDRTSNSPAGAYTSNIKGLQSALDKVIPNIISSALNSVITAQNTLATNTSSYRNLLLGTTTNISATGDQKLYSLSNGASQISGSTILSFTFNTTDVNSNFSINEVILNNDGSINKEVVLIDNLPNNMTNNVVSSFIQPIVPTLNQKADIYIRFSSYRQPVQISNMIMATSNNTKVTWVAAPEDISSTTTDKLATFKITDDQITSAVFDHLLEQSDVFTQTAEKAQIAVTQGDVSAGLSIEAGKMVWFGKEIDILGDIVDNNKITGAQFVDTSWSSTTGNFSITNTGVTTGMSLNSSTITNTTFNLSASGEIIGNYSIADSTTSNIPIKSSGKSIEDNSGIKSSGSKQSYINGSWSGYDDSLNLSSSVSNKEVSNISPSYLEYKILNTSGNNLMDTKVSSDGVYLSDISNSIKYTSKGISANKTLSIESPAISSKGIYNNTSSASANLTIDDSGIIHRVSSSEKYKKNISPIDDIIDKGKALLTITPKKWQDKNNDKDTQVGLIAEDLEKVGLSDFLFYKDGKPEGIQYDRLFILLMPLIKNILEENNG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1169 AA molecular weight: 126975,39400 Da isoelectric point: 4,67219 aromaticity: 0,08041 hydropathy: -0,38050
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Lactobacillus phage SAC12B [NCBI] |
2510941 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009844292.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048754.1
[NCBI]
CDS location
range 84829 -> 88338
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAAGCAAAAGGGGGATATCCGTAGACAAGCCTCTTTAGGAACAGAATTAAAAAGAAATATAAACAATAATAATTCAACTTCTGATCTAGTATTAGCTAGAGTTTCTAAGGTAGACTATGAGAATAATAGTATTGAATATATTGTACAAACAAATGGTATGAATAACAGCTCGGGAGCTATATCCAATGGAGGCGCCAGACTTCCTGTTTCCTTTGGTGGTAAAAATGGCTATGGAAATCCTTATGGATCAGTTAATACGATTAGGGTTAATGATATTGTCTTAATTGGCTTTGTTGGGGGTAAAAAGAATTCCCCTATTGTAATAAGCAAATATTTGTCTGACGAAGATGCCTATATGCTATCCGATTATTCAGGGGACCAATATATGGCTCCTAATGATGAAGATATGTATGATAAAACTAATTCATATAGAGATTTATATCCTGATTTAACTTACTCCTATCATAATGGTAATGGATATTATGAGCATACTTTTAGTGGAAATAGCTTCCTAGTAATGGATGATTATGATATTAAGGGCAATTTTGTAGACTATCCAGTAGGCGAGGTTGATGCTTCTACTTACTACTCATTACGGGGAAATAAATATAAAGATGGAACAAACTTTGACACTTTAAATTATCTAGCTCCAAACATATTTTTTAAACATCAAGGAAGCTATCTATTAGATGATAACGGAGAAGAAAAACTAGATCATCATCAAACAAATGTTTCTATATCACCCCAAGGAACGACTAGACTAACTACTTTTCATGATGATGATAAATGGCTATCGTTGTTTTCTATAGATGGAGATAATGGGGAAATAAGTCTTACTAGAGAAAATGATAACTCTATCAATATTGGGGATACTTCTGATAGTAATGCCACATTTACAATTGATAAAGACAATAATTTAATATTATCATCAGGTAATACAAAAATGACGCTTTCTGACGGTCATCATATTATTGCTAGCGACTTAGATACTGATTCAGATAAAATAGATCTTTATCAATCGGCTTTAAATAACAAGAATTCAATATCTGGTATAAACAATAGTATAAACTCTATTAATAATAATATGTCTTCTAGTTCCAGCTCATTATCTACTGTGAATGACCAAGTGAATATGTCAGCATCTTCTATTTCTCAAACAAATGCTATAGCTAGTTCAATTTACGGGAATGCAACTACTTCTGTAAATATGTTTTCTTTAGCAAGTTCTATTGCGAATACTGAAATAGATAGTAATACTGGATTCTACAAGGAAAATAATGGTAGCTTATCAACTCCCAAAATGGCGGCAATAAGAAACTTTAATTATATATTAACGGCTTACTCTGTTACTAGTCCAATTACTATAAAGATAGCCTTTTATGACTTAAATAAAAACTTTATAAATGAAAAAGAAGTTACAGGTAATTCAGGAGATATCTCTGTAACCGCGATTTCACCAGATAATGCTGTATATATTTCTGCAAGTGTAAGTAGTAACGCCTTTAAAGTAAAATTAGAGCAAGCAGATAAGGTTACTAGTTGGTCTCCATCAATTGTCGATTTATATACAAATAATAATACGGTATTAGAACTATTAAGTGCGGCTAAAATAGCACAAGCAGATACTAATGCCAAAATGTCTACGGTAACTAGCAACAATTATTTAAATAGTCTATTACAGTATAATAATGATTCACAAATATTAGCCAGTGATAAAGATTCTTTAGCTAATTCTTGGGACTTATTCAAAGCAGATTATAAAGTAGTAGTATCCTATGCTACTAAATACTCAGTAGACTTAACAACTGCCAATAGCTACTATACCCCTTTGGAAAATTCTATTGAAAAAGATATTCTGGTTGATAGAACGTCTAATAGCCCAGCAGGAGCTTATACAAGCAATATTAAAGGCCTTCAATCTGCACTTGATAAAGTTATACCTAATATAATTTCATCAGCCCTGAATAGTGTCATAACAGCTCAGAATACGCTTGCTACAAATACTAGCAGTTATAGAAATCTATTACTAGGAACCACTACAAATATTTCTGCAACTGGAGATCAGAAATTATACTCCTTATCAAACGGAGCTAGTCAAATATCTGGAAGTACTATACTATCTTTTACTTTTAATACTACTGATGTTAATAGCAATTTTTCTATTAATGAGGTTATTCTAAACAATGATGGATCTATTAATAAAGAAGTTGTTTTAATTGATAATCTTCCAAACAATATGACTAATAATGTTGTTTCTAGCTTTATACAGCCTATTGTGCCTACTTTAAATCAAAAGGCGGACATTTATATAAGGTTCTCTTCTTATAGGCAACCTGTTCAAATTTCTAATATGATTATGGCAACATCAAATAATACTAAAGTAACATGGGTTGCGGCTCCTGAAGATATTTCTAGCACTACTACAGACAAACTAGCTACCTTTAAAATTACCGATGACCAAATTACTAGCGCTGTATTTGACCATCTTCTAGAACAGTCTGATGTATTTACACAAACGGCTGAAAAGGCTCAAATCGCCGTCACCCAAGGAGATGTTTCTGCGGGATTATCAATTGAAGCAGGTAAGATGGTTTGGTTTGGTAAAGAAATAGATATTTTGGGAGATATTGTTGATAACAATAAAATAACAGGAGCTCAATTTGTAGATACTTCTTGGTCTTCTACTACTGGAAACTTTAGTATTACTAATACTGGGGTAACTACTGGCATGTCGTTAAATAGTTCAACAATAACTAACACAACTTTTAACTTATCTGCATCTGGGGAAATAATTGGCAACTATAGCATAGCAGATAGTACTACTTCTAATATTCCTATTAAGTCTTCCGGTAAGTCAATAGAAGATAACTCTGGTATTAAATCTTCTGGCAGTAAACAATCATATATTAATGGATCATGGTCTGGATATGATGATAGTTTAAACTTATCAAGTTCCGTTAGCAACAAGGAAGTATCCAATATTTCTCCTAGCTATTTAGAATATAAAATACTAAATACCTCGGGCAACAATTTGATGGATACCAAAGTATCTAGTGATGGTGTATATTTAAGTGATATTAGTAATTCTATTAAATATACCAGTAAAGGGATATCTGCAAATAAGACATTATCAATAGAGTCTCCTGCTATTTCTAGCAAGGGAATATATAATAATACTTCTAGTGCTTCTGCAAACTTAACTATAGATGATTCTGGAATAATTCATAGAGTATCATCTTCTGAAAAGTATAAAAAGAATATTTCACCAATTGATGATATAATAGATAAAGGTAAAGCACTATTAACTATTACACCTAAGAAATGGCAAGATAAAAATAATGATAAAGATACCCAAGTAGGATTGATTGCCGAGGACTTAGAAAAAGTAGGATTATCTGATTTCTTATTTTATAAAGATGGTAAACCCGAAGGAATTCAATATGACCGACTATTCATTCTTTTAATGCCATTAATCAAAAATATTTTGGAGGAAAACAATGGATAA
Tertiary structure
PDB ID
3ab48bcadb73fe466ec652dfacd44f208855467a8c90edbd2dce39be818695fc
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50