Protein

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Genbank accession
ALO80258.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MPKTKIKKRHLELPLLPEDSGVDSSFILDAIDGEIGTSWKERDSALEVKNKLESIVTESDKLDASAIKNLPSSDVVSVNGETGVVVLNADDIDDSSTGNKFVDSTEKSKLANIPSDQTALNDDIELRVSINDAKISYPGDQDISGIGVNSSRIDSLDQDKITQDAAIAANTAKISYPGDQDISGIGVNASAITALDNNKLEAGDFKTINNESIVGSGNISISGGSGGDEYNNIYRDSTDSGLVGNVDGTNTSFTVSNGSYNPATLNVFVEGQLFTAGHGITETSPGTGVFTFENAPRVGTNLYVTYQVGNLTTDILDGSIIESKLSSDVITKFGNVPNGYISPRTYGAIMDGVTDDRTAFMSTLSAANTLGKRIYIDSDMFLDVEELATKSIFIPDNIWIEGRDKDVNIIYNNKYSPAFVIALSDNITFKNFTFLYDQTIDATVTSNESVQNAANITQYKNYLTNEKGITFTSSNPIWRGPTLYMSTLLIAGGKYITIDNVKFKARGENAPNFIPWAIKFKEEHSKNITVTNDVEAETTIPQHITFKDVVLDGTIMGVQGIVRNFNCDGLKSYRYSDMQSLDGSNVGGVGYWMAPPHLFYINSDNALVYNPGEVKLTNTIDYGEYVGTPNVRPTISGYCNSLKMVTANDNNLVDGYITYRRDGFADFGDLTNVTIKNVYAECKSDIFDSTFKFTPLRFVGDIDGCVFENIEIRDISDVAHVYPVYFATGNNTIYNNMHLFVNGLDVGGVGFFGISGSNNKILNSSLNIKNHTSTSEFIGVIYHNSTARSTGSNNYYNVLVNGWRKFGSNVGALKSRTLFAAIENPNNNYAKLTDTNNNWVSEQINEMERNTWTRSEIVDITANTEQALTLDIPSGYAVKKIETLIIEAFDAGTTVSIGTLSGSANNLIPSMSTSVGNRTTVDINEEYNSTAYRQIFVRTSTGTFNSLGEFKITLTLTRTVTN
Physico‐chemical
properties
protein length:962 AA
molecular weight: 104832,04730 Da
isoelectric point:4,63354
aromaticity:0,09044
hydropathy:-0,26819

Domains

Domains [InterPro]
IPR012334
331–593
IPR012334
IPR011050
336–557
IPR011050
ALO80258.1
1 962
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cellulophaga phage phi4:1_18
[NCBI] 		1747285 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ALO80258.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT962246 [NCBI]
CDS location
range 64976 -> 67864
strand -
CDS
ATGCCTAAAACTAAAATTAAAAAAAGACATTTAGAATTACCTTTACTTCCAGAAGACTCAGGAGTAGATTCTTCTTTTATACTGGATGCTATTGATGGAGAGATAGGTACCAGTTGGAAAGAAAGAGACTCGGCTTTAGAGGTAAAGAACAAACTAGAGTCTATAGTAACTGAGTCTGACAAGCTAGATGCCTCAGCAATAAAAAACTTACCTTCAAGTGATGTAGTGTCTGTTAATGGAGAAACTGGAGTTGTAGTTTTAAATGCAGATGATATTGACGATTCTAGTACAGGAAACAAGTTTGTAGATTCAACTGAAAAAAGTAAGCTAGCAAATATTCCTAGTGATCAAACTGCATTAAATGATGACATAGAATTAAGAGTATCTATAAATGATGCAAAAATATCTTATCCAGGTGACCAAGATATCTCAGGAATTGGGGTTAACTCAAGCAGAATAGACTCTTTAGATCAAGATAAAATAACACAAGATGCTGCCATAGCAGCAAACACAGCAAAAATATCTTATCCAGGTGACCAAGATATCTCAGGAATAGGAGTTAATGCTTCTGCTATTACAGCTTTAGATAATAATAAGTTAGAAGCTGGAGACTTTAAAACTATAAATAATGAATCTATAGTAGGCTCTGGAAATATAAGTATTTCAGGAGGAAGTGGAGGAGATGAGTATAATAATATTTATAGAGATTCCACTGATTCAGGGTTAGTAGGAAATGTAGATGGTACTAACACTTCTTTCACAGTATCTAATGGTTCATACAACCCTGCAACTTTAAACGTATTTGTTGAAGGTCAACTGTTCACAGCAGGTCATGGTATAACTGAAACTTCTCCTGGAACTGGAGTTTTTACATTTGAAAATGCACCTAGGGTAGGGACTAATTTATACGTAACATACCAAGTAGGTAATTTAACTACTGATATTTTAGATGGTTCTATTATTGAAAGTAAATTATCGTCTGACGTAATAACTAAATTTGGAAATGTTCCAAATGGTTATATTTCTCCTCGTACATATGGTGCAATAATGGATGGTGTAACAGATGACAGAACAGCTTTTATGTCTACGTTATCTGCTGCAAATACCTTGGGTAAACGTATTTACATTGATTCCGATATGTTTTTAGATGTAGAAGAGTTAGCAACTAAGAGTATATTCATACCAGATAATATTTGGATTGAAGGTAGAGATAAAGATGTTAATATAATATACAACAATAAATATTCTCCTGCATTTGTAATAGCATTGTCTGATAATATTACATTTAAGAATTTTACATTTTTATATGATCAAACAATTGATGCAACAGTAACATCTAATGAATCTGTACAGAATGCTGCAAATATAACTCAATACAAGAATTATTTAACTAATGAAAAAGGAATAACATTTACATCAAGTAATCCTATATGGAGAGGACCGACTTTGTATATGTCTACACTACTTATTGCAGGTGGTAAATACATAACAATAGATAATGTAAAGTTTAAAGCTAGAGGTGAGAATGCTCCTAATTTTATTCCTTGGGCTATTAAATTCAAAGAGGAACACTCTAAAAATATAACAGTTACTAATGATGTAGAAGCAGAAACAACAATACCTCAACACATAACATTTAAAGATGTTGTTTTAGATGGTACAATAATGGGTGTCCAAGGTATTGTAAGGAACTTTAATTGTGATGGATTAAAATCTTATCGTTATTCTGATATGCAGAGTTTAGACGGTAGTAATGTAGGGGGTGTAGGTTATTGGATGGCACCACCACACTTATTTTATATAAATTCAGATAATGCTTTAGTTTATAATCCAGGAGAAGTTAAACTAACTAATACTATTGATTATGGTGAGTATGTAGGAACACCTAATGTTAGACCTACAATTAGTGGTTATTGTAACTCTTTAAAAATGGTAACTGCAAATGATAATAATTTAGTTGATGGTTATATCACTTACAGAAGAGATGGTTTCGCTGATTTTGGAGACTTAACAAATGTTACAATAAAGAATGTTTATGCAGAATGTAAAAGTGATATTTTTGATTCAACATTTAAGTTCACACCTCTTAGATTTGTAGGTGATATAGATGGTTGTGTATTTGAAAATATAGAGATTAGAGATATTTCAGATGTTGCCCATGTGTATCCTGTATATTTTGCTACTGGGAACAACACTATTTATAATAATATGCATCTATTTGTTAATGGTTTGGACGTTGGAGGTGTAGGCTTTTTCGGAATCTCAGGAAGCAATAACAAAATATTAAACTCTAGTTTAAACATTAAAAATCATACATCTACTTCTGAATTTATTGGGGTAATTTATCATAATTCTACAGCAAGATCAACAGGGTCAAATAATTATTATAATGTTTTAGTTAATGGTTGGAGAAAGTTTGGTAGTAATGTAGGGGCATTGAAAAGTAGAACTTTATTTGCTGCAATAGAGAATCCTAATAATAACTATGCAAAACTTACGGACACAAACAACAATTGGGTTTCTGAGCAGATAAATGAAATGGAGAGGAATACATGGACTAGGAGTGAAATAGTAGACATAACAGCAAATACAGAACAAGCTCTAACCTTAGACATTCCTTCAGGTTATGCCGTTAAAAAAATAGAGACCTTAATCATAGAAGCTTTTGACGCAGGGACTACGGTTTCTATAGGCACTTTATCAGGTTCTGCAAATAATTTAATACCTTCTATGTCAACAAGTGTAGGCAATAGAACAACTGTTGATATTAATGAAGAGTACAATAGTACAGCGTACAGACAAATATTTGTAAGAACAAGTACTGGAACATTTAATTCTTTAGGGGAATTTAAAATTACATTAACATTGACTAGAACGGTTACAAACTAA

Tertiary structure

PDB ID
6c1e2e99c793f672a71a89cbb654c9ad47f9152d9e7e80c107be484960175c77
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6479
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Large-scale maps of variable infection efficiencies in aquatic Bacteriodetes phage-host model systems Holmfeldt,K., Solonenko,N., Howard-Varona,C., Moreno,M., Malmstrom,R.R., Blow,M.J. and Sullivan,M.B. 2016-06-27 — GenBank