Protein

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UniProt accession
A0A8S5LKA2 [UniProt]
Protein name
Neck appendage protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,72
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MIYTFDKNQNLIGTYDEKEELTVANLNLKINKAATLDLEFPANKENVNNLKSVVFLAVPYPNNKQKLLFLRVMTRTDKEYTIELMAKEFAYQELATSGYIEDKRFNDANAKTLISGAVQGSGYKVSNVNVSGTAQLNFYYEDYLTAVSDVIEALGGEVIFYVTLSGNKISGRYVDYVIAQGTNTSKTFAYGSNLISVERQSDASEVYTAILPRGKGELVSTGEDDAPDGYGRRINIAEILWKKPTNPLDKPVGSLVLEDPNATAAFGQVNGTARLLLKTYDDIEDKSELINAAYRDLMQYNHPATQFTASVANIGDSALGDTIVIMHSDRDMSYRTRIFEIDYDLIEINNTVATFGDNLSKNNTSNMLTSVSRAVNNVKETANFAVASANGIGKDYYGENEPANPKNGDTWFYTSGDGFGIRQYVDGQWVEYVNSKTSEQITQQVETAIANAKEYADNLNVAQTQATNSVASDLAQKADELTKSQQSIASQATSYTDSAVADANAKAVEIGQTTAQNAQKALDDKATTLQQSIDTKVAKTDYDQKTGELTASVNTAQQTADTATQTIGTYKETNDKRVTAAETNIKANSEAIALTVSKTDFDKATGKLSGDISTLQQRADGFEATVTKVNDLSVGGRNILIGSQNYSGTAWNGQANLIQSDFQGLTSSSNDYEWGGPKYSASSLEAQGSITSVDTEYIFSAWFKNTGTSNTDIYFFGENTSRDNDFIATIPAKSGWIRVSTRPFKFTKISGLTGVIKFENAMAVQNGMVKQAGLKLEIGNVATDWTPAPEDIDTQIAQVKITADGVYQTVNDPETGLNTRVSTAEGNISTIKSNVDGMSNTVTQTANGLTQEIADRKTGDSNTLQAGKDFTTSQITSYDTGMQSRLTQVSDGIMAQVSSTNLITDSSFVNATANWTLSGDVSWKINNEIMRKGVRVATFDNGSNNFDRKTSTLTSTPIYTMNLGGTQFYASIDIYAQSFGSSAYMKAEIVQKNSSGTTTKSTSIGGSFDTAMTGWNTYTADITLDPATTQLYLQVTQYGGGKVSIARPYLGSIKLNTGDYIPGASTDNTSTLKLFNNFFAFGIQSNTGEIISGINGDSSGLIITGKKITVSGDTTFIGNNFMDGAIIKNASIGSAQIAKASINDANIISLNVDKLSGNISNFIQSNWNGKYGSTTIDANGMTVDTSGITTKFGSYGMTLNMTGESVGGIGVQGLTGQPSDYQGLAFWLDGNAEYMAWGARNNGATSGNPVLKLSWFRNTSAPSGAYAGFNFDDDVIFNKNINIPGGSTKMAFSTTHIGNYDFAVLGEYRGRSGIAYGLKDSYLVIEGTYYNLSKVIMALSGLGAVKIPSEIRSDGTVAKWFNVTL
Physico‐chemical
properties
protein length:1365 AA
molecular weight: 147027,93210 Da
isoelectric point:4,78672
aromaticity:0,09011
hydropathy:-0,34037

Domains

Domains [InterPro]
IPR007119
30–355
IPR007119
IPR010572
93–357
IPR010572
A0A8S5LKA2
1 1365
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Siphoviridae sp. ctcPV5
[NCBI] 		2827582 Uroviricota > Caudoviricetes >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
DAD70525.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
BK015867 [NCBI]
CDS location
range 25054 -> 29151
strand +
CDS
ATGATCTACACATTCGATAAGAACCAAAACCTAATTGGTACTTACGATGAAAAAGAAGAGCTTACAGTCGCTAATCTTAATTTAAAAATCAATAAGGCTGCAACGCTTGATTTGGAATTTCCAGCGAACAAAGAAAACGTCAACAATTTAAAAAGCGTTGTTTTCTTGGCTGTTCCTTATCCAAACAACAAGCAAAAGTTACTATTTTTGCGAGTTATGACAAGGACTGACAAAGAATATACCATTGAACTGATGGCGAAAGAGTTTGCTTATCAAGAGTTAGCGACAAGCGGCTATATTGAAGACAAGCGATTTAACGACGCAAACGCAAAAACTTTGATTTCAGGTGCCGTTCAAGGTTCTGGTTATAAGGTATCTAACGTAAACGTAAGCGGCACAGCACAACTAAACTTCTACTACGAAGATTATTTGACGGCTGTTTCAGATGTGATTGAAGCACTTGGCGGAGAAGTTATCTTTTACGTAACGCTAAGCGGTAACAAAATAAGTGGTCGTTATGTTGATTACGTTATCGCACAAGGCACAAACACTTCGAAAACTTTTGCTTACGGCAGCAACTTGATTTCAGTTGAGCGGCAAAGCGATGCGTCGGAAGTTTACACAGCTATTTTACCGCGTGGTAAAGGAGAACTTGTCAGCACAGGAGAGGACGATGCACCTGATGGTTACGGTCGGCGAATTAACATTGCGGAAATTCTATGGAAAAAGCCAACTAATCCATTGGACAAACCAGTTGGTTCATTAGTGTTAGAAGATCCAAACGCTACCGCTGCGTTCGGTCAAGTGAACGGAACTGCTCGTCTGTTGCTAAAAACTTATGACGATATTGAAGATAAAAGTGAACTTATCAACGCTGCTTATCGTGATTTAATGCAGTATAACCACCCGGCAACTCAATTTACAGCAAGTGTTGCTAACATTGGCGACAGTGCATTAGGCGATACAATCGTTATCATGCACAGCGATCGAGACATGAGTTACCGAACGCGTATTTTTGAGATTGATTACGACTTAATTGAAATCAACAATACAGTTGCAACGTTTGGCGATAACTTATCGAAAAACAATACAAGCAACATGTTGACTAGCGTTTCACGTGCTGTTAATAACGTTAAAGAAACTGCGAATTTTGCAGTTGCTAGTGCTAATGGAATTGGAAAAGATTACTATGGCGAAAACGAGCCTGCTAATCCTAAAAATGGCGATACATGGTTCTATACATCTGGAGACGGTTTCGGAATACGCCAATACGTAGATGGTCAATGGGTTGAATACGTAAATAGCAAAACGTCAGAGCAAATCACACAACAAGTTGAAACAGCTATTGCTAACGCGAAAGAATATGCAGACAATCTAAATGTCGCACAAACACAAGCAACAAACAGCGTTGCATCAGATTTGGCTCAAAAGGCTGATGAATTGACTAAGAGCCAACAATCAATTGCAAGCCAAGCGACTTCATATACAGATAGCGCTGTGGCTGATGCTAACGCAAAAGCTGTGGAAATTGGTCAAACAACGGCTCAAAACGCTCAAAAAGCATTGGACGATAAGGCTACAACGTTGCAACAGTCAATTGACACCAAAGTAGCAAAGACAGATTATGATCAGAAAACAGGCGAACTGACAGCTAGCGTTAATACAGCACAGCAAACCGCTGACACTGCCACACAAACAATTGGTACGTACAAAGAAACAAACGACAAACGTGTGACTGCTGCTGAAACAAACATTAAGGCTAACTCTGAGGCTATTGCGCTGACAGTAAGTAAAACTGATTTTGATAAAGCAACTGGAAAATTAAGCGGAGACATTAGCACATTACAGCAACGCGCAGATGGTTTTGAGGCCACGGTTACAAAGGTTAATGATTTATCGGTTGGTGGAAGAAATATTTTAATTGGTTCACAAAATTATAGTGGAACAGCTTGGAATGGACAAGCAAATCTTATACAATCAGATTTTCAAGGATTAACTTCTTCATCAAATGATTATGAGTGGGGAGGGCCAAAATATAGCGCGTCATCGTTAGAAGCACAAGGTTCTATTACAAGCGTTGACACTGAATATATATTTTCTGCATGGTTTAAAAACACAGGAACATCCAATACTGATATATATTTCTTTGGAGAAAACACCTCGCGAGATAATGATTTTATAGCTACCATTCCTGCGAAAAGTGGATGGATTAGAGTTTCAACTAGACCGTTTAAGTTCACGAAAATATCTGGACTCACGGGAGTAATTAAATTTGAAAACGCTATGGCTGTTCAAAACGGAATGGTTAAGCAAGCTGGTTTGAAACTAGAAATCGGAAATGTTGCAACCGATTGGACTCCCGCACCGGAAGATATCGATACACAAATAGCGCAGGTGAAAATAACTGCTGACGGAGTTTACCAAACAGTTAACGATCCAGAAACAGGTCTTAACACACGAGTTTCAACCGCCGAAGGTAACATCAGTACAATTAAGAGTAACGTTGATGGTATGAGTAATACGGTCACTCAAACTGCTAATGGACTTACACAAGAAATAGCAGACCGCAAAACTGGCGACAGCAACACGTTACAAGCGGGTAAGGACTTTACAACAAGCCAAATCACCAGCTATGACACTGGAATGCAGAGTCGGCTTACACAAGTCAGTGATGGTATTATGGCACAAGTGTCGTCGACAAACCTCATCACAGATAGTTCGTTTGTCAATGCAACGGCTAACTGGACGCTTTCGGGAGATGTATCTTGGAAAATTAACAACGAAATCATGCGTAAGGGCGTACGAGTAGCGACATTCGATAATGGAAGTAATAACTTTGACCGCAAGACTTCAACACTGACAAGTACGCCAATATACACCATGAACTTGGGCGGGACGCAATTTTACGCAAGTATTGACATCTACGCTCAATCTTTTGGAAGCAGCGCTTATATGAAGGCTGAAATCGTTCAAAAGAACAGCTCTGGCACCACAACAAAATCGACTTCAATCGGCGGTTCGTTTGATACAGCGATGACAGGCTGGAATACTTACACAGCGGATATTACGTTAGATCCAGCTACAACGCAGCTATATCTACAAGTTACGCAGTACGGTGGTGGAAAGGTTTCGATTGCTAGACCATATTTAGGTTCAATCAAACTAAATACTGGTGATTATATTCCTGGAGCAAGTACCGACAACACTTCAACGTTAAAGTTATTTAACAATTTCTTCGCATTTGGTATTCAATCTAATACCGGAGAAATAATTTCCGGAATTAACGGAGACTCGTCTGGTTTGATTATCACAGGTAAAAAGATAACCGTCAGCGGAGATACAACGTTCATCGGCAACAACTTCATGGATGGCGCTATTATCAAGAATGCTTCGATTGGAAGCGCTCAAATTGCCAAAGCTTCAATTAATGACGCCAATATTATAAGTCTTAATGTAGATAAGCTATCTGGTAATATTTCTAACTTTATCCAATCAAATTGGAATGGAAAGTATGGATCTACAACGATTGATGCGAATGGAATGACCGTTGACACAAGCGGAATTACCACTAAGTTCGGTAGTTACGGAATGACACTTAATATGACCGGAGAGTCAGTCGGTGGTATTGGTGTTCAAGGACTTACAGGACAACCTTCTGATTATCAAGGTTTGGCATTCTGGCTTGATGGTAACGCTGAATATATGGCATGGGGAGCACGTAATAATGGTGCTACATCTGGAAACCCAGTACTAAAACTTTCTTGGTTTAGAAATACATCGGCTCCATCTGGTGCTTACGCAGGGTTTAATTTTGATGATGACGTCATTTTCAATAAAAACATCAATATTCCGGGTGGAAGTACAAAAATGGCATTTTCAACCACGCACATTGGAAATTATGATTTTGCAGTACTGGGCGAATACCGAGGTAGGTCTGGTATTGCGTACGGGTTGAAAGACTCATATCTAGTAATTGAAGGCACTTATTACAATTTGTCGAAGGTTATCATGGCCCTTTCTGGATTAGGAGCCGTTAAAATACCGTCAGAAATCCGTTCTGATGGAACCGTAGCCAAATGGTTCAACGTCACTTTATAA

Tertiary structure

PDB ID
046747af16e0a5d97d88884e976af1d296153af593570cd0617bece02a42dbab
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7690
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50