Genbank accession
ALM63737.1 [GenBank]
Protein name
neck passage structure
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,46
Protein sequence
MSLDNFRKRAIVWDTVNKDFPQPIQVMQGDVNARTLSVKIIDNGGEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMIPPENLTKGEFILVIPTEMTKPGVIEANLVLLNEDKEQVIVSKNLTFISDNSTVTDLAQEVNNKIDDFTKLLLENMPQVMRSELNDLHAQTESNTSNIELKANLSDMTSLQSAMTELKNEVEAFGISPENLVTIKSLLDAIASNASESEVVELINSVKVLTSNISLMSNGDYSPKANQTDLESLRSVVNNQSKTISKKAEQAEIIQARGGQSSLDARLDGLDAKDTDLQSQININKTSISNTSSRIDNLIVTAGNGNSGEVNDLRVDINGLTHATAGDAVRGQLTQIRDTLDSAVKSGLAEYSYGGETEYAINFSATTTNKTAPTQAYTNEFVPIQDVVITKFRLDSYTTSTTFSIFILDNTNKLIASYQNLTPIISNNIATLSSPIEVPKGGKIQIAFLNGTMAFQNVGAKNLTEYHPATGEIVASPIKIGLQWFYKTATIQFIDVLNTNVDKVNTEDYLLPKFKEIEGNYGLVGRWFKKNNGSVPTDATNNQGSIIYTKVSGATQVTVSLTPFTTPNNPYFFAYSIDGGAFTRQNMTNGVIALPNNGEHIIQIVLDGLGENDPVGGGKWVGKLGVFLNGITIDAGEIKGILPKNKVGIYIGDSITEGINVLTTGAIGASNSATGSYTWISSKKLNAIPYYVGYGGTSTLGNASFHKAIEAIDYFYNGVKSNIPDVDFIVMAHGYNDNTLINNGTYTLQQYKDAYNGVMDRLKVKYSGRPIFCVVPFGAQAIKPYIQECIANRPYCYLIETNGISVSTTDGVHPNSAGSIVLGNHIADSIKSKLGTSYFID
Physico‐chemical
properties
protein length:862 AA
molecular weight: 93503,03480 Da
isoelectric point:5,03778
aromaticity:0,07657
hydropathy:-0,18411

Taxonomy

Phage
Lactococcus phage 936 group phage Phi114 [NCBI] · taxon 1636557
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
ALM63737.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP793115 [NCBI]
CDS location
range 7301 -> 9889
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAGAAAAAGAGCGATTGTATGGGATACGGTCAATAAAGACTTCCCACAACCAATTCAAGTAATGCAAGGCGACGTCAACGCTAGAACATTGTCAGTTAAAATAATTGATAATGGAGGCGAAATTGATTTGACTGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATATACTAATAGCAGTAATTCAGGCTTTGTTATGATTCCTCCTGAAAACTTAACTAAAGGAGAGTTTATTTTGGTAATTCCTACTGAAATGACAAAACCTGGAGTTATTGAAGCGAACTTGGTTCTTCTCAATGAAGATAAAGAGCAAGTTATCGTCAGTAAGAATTTAACATTTATATCAGATAATTCTACAGTTACAGATTTAGCTCAAGAAGTAAATAATAAGATTGATGATTTTACAAAATTATTATTGGAAAATATGCCACAAGTAATGCGCAGTGAGTTGAATGATTTACATGCTCAAACTGAATCAAATACGAGCAATATTGAGCTTAAGGCGAATTTATCTGATATGACGAGCTTACAAAGTGCAATGACAGAGCTTAAAAATGAAGTAGAAGCATTTGGTATTAGTCCTGAAAATTTAGTTACTATAAAATCGCTATTAGACGCAATCGCAAGTAACGCCAGTGAATCAGAAGTAGTTGAACTAATAAATTCAGTAAAGGTTTTAACAAGTAACATTTCTCTGATGAGTAACGGAGATTACTCCCCTAAGGCTAACCAAACGGATTTAGAAAGTTTACGGTCTGTTGTTAATAATCAATCGAAAACAATTTCAAAAAAAGCAGAACAAGCAGAAATCATCCAAGCAAGAGGCGGTCAGTCGAGTTTAGATGCAAGATTAGATGGACTAGACGCCAAAGATACTGACTTACAAAGTCAAATCAATATAAATAAAACTAGTATTTCTAACACAAGTTCACGAATTGACAATTTAATAGTGACTGCTGGTAATGGCAATTCGGGGGAAGTTAATGATTTACGTGTAGACATCAACGGTCTAACACATGCGACTGCTGGTGATGCAGTAAGAGGTCAACTCACACAGATTCGTGACACATTAGATTCAGCAGTTAAGTCAGGATTGGCTGAATATTCTTATGGTGGCGAAACTGAATATGCAATTAATTTCAGTGCTACGACAACAAATAAGACCGCACCAACGCAAGCATATACTAATGAATTTGTACCAATTCAAGATGTCGTTATTACTAAATTTAGACTTGATTCATATACGACATCAACAACATTTTCAATCTTTATTTTAGATAATACAAATAAATTAATTGCATCTTACCAAAACCTAACACCTATTATTTCAAACAATATCGCAACCTTATCAAGTCCTATTGAAGTACCAAAGGGTGGTAAGATTCAAATCGCTTTTCTTAACGGAACAATGGCATTTCAAAATGTTGGGGCTAAAAATTTAACAGAGTACCATCCGGCAACTGGAGAAATTGTTGCATCACCAATCAAGATTGGCTTACAGTGGTTTTATAAAACTGCGACAATACAATTTATCGACGTCCTAAATACGAATGTTGACAAAGTTAATACTGAAGACTACCTATTGCCGAAATTCAAAGAAATTGAAGGTAATTATGGTTTAGTCGGTCGTTGGTTTAAGAAAAATAACGGCAGTGTGCCAACTGACGCAACTAATAACCAAGGCTCGATTATCTACACTAAGGTTAGTGGAGCAACACAAGTTACAGTATCGCTCACACCATTCACGACACCAAATAACCCATATTTCTTTGCTTACTCAATTGACGGTGGAGCATTTACTCGACAAAATATGACAAATGGTGTTATTGCATTGCCAAACAACGGCGAACACATAATCCAGATTGTACTTGACGGATTAGGTGAAAACGACCCAGTTGGCGGTGGGAAATGGGTCGGTAAATTAGGAGTGTTTTTAAACGGTATTACAATTGACGCTGGGGAAATTAAAGGTATTTTACCTAAAAACAAAGTCGGAATTTACATTGGCGATTCCATTACAGAGGGTATCAACGTTTTGACAACTGGTGCAATTGGTGCGTCAAATAGTGCTACTGGATCATACACTTGGATTTCATCTAAAAAACTAAACGCAATTCCCTACTATGTCGGTTACGGGGGAACTTCAACACTTGGAAATGCGTCATTTCACAAAGCAATTGAAGCAATTGACTATTTCTACAATGGTGTTAAATCGAATATACCTGACGTTGATTTTATCGTTATGGCTCATGGATACAATGATAATACATTGATTAACAATGGTACTTACACTTTGCAACAATATAAAGATGCTTATAATGGTGTCATGGATAGATTAAAAGTTAAATATTCAGGTCGTCCGATTTTCTGTGTTGTCCCATTTGGAGCACAGGCAATTAAACCATACATTCAAGAGTGTATTGCAAACAGACCATATTGCTATTTGATTGAGACCAATGGAATATCAGTGTCGACAACAGACGGTGTACACCCTAATTCAGCTGGTTCAATTGTTCTTGGCAATCATATCGCTGATTCAATCAAATCAAAACTAGGTACAAGCTATTTCATTGATTAG

Genome Context

Tertiary structure

ALM63737.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 74.8
Oligomeric state monomer