Protein
- Genbank accession
- ALM63737.1 [GenBank]
- Protein name
- neck passage structure
- RBP type
-
TF
- Seq2Symm
-
C1 confidence 0,773
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C1 0,773 C3 0,658 C2 0,000 - Protein sequence
-
MSLDNFRKRAIVWDTVNKDFPQPIQVMQGDVNARTLSVKIIDNGGEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMIPPENLTKGEFILVIPTEMTKPGVIEANLVLLNEDKEQVIVSKNLTFISDNSTVTDLAQEVNNKIDDFTKLLLENMPQVMRSELNDLHAQTESNTSNIELKANLSDMTSLQSAMTELKNEVEAFGISPENLVTIKSLLDAIASNASESEVVELINSVKVLTSNISLMSNGDYSPKANQTDLESLRSVVNNQSKTISKKAEQAEIIQARGGQSSLDARLDGLDAKDTDLQSQININKTSISNTSSRIDNLIVTAGNGNSGEVNDLRVDINGLTHATAGDAVRGQLTQIRDTLDSAVKSGLAEYSYGGETEYAINFSATTTNKTAPTQAYTNEFVPIQDVVITKFRLDSYTTSTTFSIFILDNTNKLIASYQNLTPIISNNIATLSSPIEVPKGGKIQIAFLNGTMAFQNVGAKNLTEYHPATGEIVASPIKIGLQWFYKTATIQFIDVLNTNVDKVNTEDYLLPKFKEIEGNYGLVGRWFKKNNGSVPTDATNNQGSIIYTKVSGATQVTVSLTPFTTPNNPYFFAYSIDGGAFTRQNMTNGVIALPNNGEHIIQIVLDGLGENDPVGGGKWVGKLGVFLNGITIDAGEIKGILPKNKVGIYIGDSITEGINVLTTGAIGASNSATGSYTWISSKKLNAIPYYVGYGGTSTLGNASFHKAIEAIDYFYNGVKSNIPDVDFIVMAHGYNDNTLINNGTYTLQQYKDAYNGVMDRLKVKYSGRPIFCVVPFGAQAIKPYIQECIANRPYCYLIETNGISVSTTDGVHPNSAGSIVLGNHIADSIKSKLGTSYFID
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 862 AA molecular weight: 93503,03480 Da isoelectric point: 5,03778 aromaticity: 0,07657 hydropathy: -0,18411
Taxonomy
Phage
Lactococcus phage 936 group phage Phi114
[NCBI]
· taxon 1636557
Host
No host information
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ALM63737.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP793115
[NCBI]
CDS location
range 7301 -> 9889
strand +
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAGAAAAAGAGCGATTGTATGGGATACGGTCAATAAAGACTTCCCACAACCAATTCAAGTAATGCAAGGCGACGTCAACGCTAGAACATTGTCAGTTAAAATAATTGATAATGGAGGCGAAATTGATTTGACTGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATATACTAATAGCAGTAATTCAGGCTTTGTTATGATTCCTCCTGAAAACTTAACTAAAGGAGAGTTTATTTTGGTAATTCCTACTGAAATGACAAAACCTGGAGTTATTGAAGCGAACTTGGTTCTTCTCAATGAAGATAAAGAGCAAGTTATCGTCAGTAAGAATTTAACATTTATATCAGATAATTCTACAGTTACAGATTTAGCTCAAGAAGTAAATAATAAGATTGATGATTTTACAAAATTATTATTGGAAAATATGCCACAAGTAATGCGCAGTGAGTTGAATGATTTACATGCTCAAACTGAATCAAATACGAGCAATATTGAGCTTAAGGCGAATTTATCTGATATGACGAGCTTACAAAGTGCAATGACAGAGCTTAAAAATGAAGTAGAAGCATTTGGTATTAGTCCTGAAAATTTAGTTACTATAAAATCGCTATTAGACGCAATCGCAAGTAACGCCAGTGAATCAGAAGTAGTTGAACTAATAAATTCAGTAAAGGTTTTAACAAGTAACATTTCTCTGATGAGTAACGGAGATTACTCCCCTAAGGCTAACCAAACGGATTTAGAAAGTTTACGGTCTGTTGTTAATAATCAATCGAAAACAATTTCAAAAAAAGCAGAACAAGCAGAAATCATCCAAGCAAGAGGCGGTCAGTCGAGTTTAGATGCAAGATTAGATGGACTAGACGCCAAAGATACTGACTTACAAAGTCAAATCAATATAAATAAAACTAGTATTTCTAACACAAGTTCACGAATTGACAATTTAATAGTGACTGCTGGTAATGGCAATTCGGGGGAAGTTAATGATTTACGTGTAGACATCAACGGTCTAACACATGCGACTGCTGGTGATGCAGTAAGAGGTCAACTCACACAGATTCGTGACACATTAGATTCAGCAGTTAAGTCAGGATTGGCTGAATATTCTTATGGTGGCGAAACTGAATATGCAATTAATTTCAGTGCTACGACAACAAATAAGACCGCACCAACGCAAGCATATACTAATGAATTTGTACCAATTCAAGATGTCGTTATTACTAAATTTAGACTTGATTCATATACGACATCAACAACATTTTCAATCTTTATTTTAGATAATACAAATAAATTAATTGCATCTTACCAAAACCTAACACCTATTATTTCAAACAATATCGCAACCTTATCAAGTCCTATTGAAGTACCAAAGGGTGGTAAGATTCAAATCGCTTTTCTTAACGGAACAATGGCATTTCAAAATGTTGGGGCTAAAAATTTAACAGAGTACCATCCGGCAACTGGAGAAATTGTTGCATCACCAATCAAGATTGGCTTACAGTGGTTTTATAAAACTGCGACAATACAATTTATCGACGTCCTAAATACGAATGTTGACAAAGTTAATACTGAAGACTACCTATTGCCGAAATTCAAAGAAATTGAAGGTAATTATGGTTTAGTCGGTCGTTGGTTTAAGAAAAATAACGGCAGTGTGCCAACTGACGCAACTAATAACCAAGGCTCGATTATCTACACTAAGGTTAGTGGAGCAACACAAGTTACAGTATCGCTCACACCATTCACGACACCAAATAACCCATATTTCTTTGCTTACTCAATTGACGGTGGAGCATTTACTCGACAAAATATGACAAATGGTGTTATTGCATTGCCAAACAACGGCGAACACATAATCCAGATTGTACTTGACGGATTAGGTGAAAACGACCCAGTTGGCGGTGGGAAATGGGTCGGTAAATTAGGAGTGTTTTTAAACGGTATTACAATTGACGCTGGGGAAATTAAAGGTATTTTACCTAAAAACAAAGTCGGAATTTACATTGGCGATTCCATTACAGAGGGTATCAACGTTTTGACAACTGGTGCAATTGGTGCGTCAAATAGTGCTACTGGATCATACACTTGGATTTCATCTAAAAAACTAAACGCAATTCCCTACTATGTCGGTTACGGGGGAACTTCAACACTTGGAAATGCGTCATTTCACAAAGCAATTGAAGCAATTGACTATTTCTACAATGGTGTTAAATCGAATATACCTGACGTTGATTTTATCGTTATGGCTCATGGATACAATGATAATACATTGATTAACAATGGTACTTACACTTTGCAACAATATAAAGATGCTTATAATGGTGTCATGGATAGATTAAAAGTTAAATATTCAGGTCGTCCGATTTTCTGTGTTGTCCCATTTGGAGCACAGGCAATTAAACCATACATTCAAGAGTGTATTGCAAACAGACCATATTGCTATTTGATTGAGACCAATGGAATATCAGTGTCGACAACAGACGGTGTACACCCTAATTCAGCTGGTTCAATTGTTCTTGGCAATCATATCGCTGATTCAATCAAATCAAAACTAGGTACAAGCTATTTCATTGATTAG
Genome Context
Tertiary structure
ALM63737.1
ESMFold2 structure
Source
ESMFold2
pLDDT
74.8
Oligomeric state
monomer