Genbank accession
CAB4161406.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
Seq2Symm
C3 confidence 0,987 truncated
C3 0,987
C1 0,028
C2 0,000
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MEKNELKKIISELINNNDIYFEAAPSNDPNKKVSEMTDGSPMQGTDYIPVVRTVDSVLTNFKVLASTIPGSLDPFDAKVDGIGASPGCYATLTAAITAGANFINWITSSGPENAVINITKNIFIFLHGANYHLFNLAGFNISQNCTLTIVSPSEKNLTNSSVGATFLCNSGSNNFFAGLGKILNYGVTFIQGGAGGLLDPTLSAMIGACQFQPLGTNNKFVNLQTFGSKVKNCFIIGQAIGAEVDNSLVIGNGCEGENIEYYNSTGSTGTHITVQPGGKLSGIKGSGQEGAGGFPLVIDNQGYLERIYTSYPISPVIQNDGGIVANTMFATATGFAALNASIENTGNSPKMQNINFVNADISIDAVALNTTILSCETVGGTYINYATNTQGFANSGGLLPNSVNFLAVANTAARLALTSSQVKNDQMVTQDSDKTAWIAGVSGATVTWYPISSGVPGVNISPFQAKIDGIGTLPNFYLNLGSAYTAGKTYDDTIANVTETADIEMSSTDQIYLLVGQQFTWDLSDYAIKSSGGNDFGLTLADGSATFQYKTAGQPFQDFDNLSSIVITGNGGIIQNNSSTVDSYIYSLGELLADNLRFLLPNISGGGFKTNHYTQLSGIKFTGGGINCENSIISNGGKLSSIGFYGNNWKPNGFLNDIGTDPTIWDTVDYNVDLPMSFYLFGQAINVVKNNFLSSAFLTVVFSSNSTLTNSYVDAAVLTSGITGCKVFGGTLTTLSLASDNTTDVVLVGVTIPNNTVFYGSGKLIGCKFEGGGSLAVGANFTITGCTSGASTTFSIPAGATAIRAGNDNIIGNDYGGSAASIEFYDAEVDGVGTLPHHYATWNDAISVNPKTLLVTANTSLTADITLANDIFIQFKDGAKLNPNNYQIIQNNFVMSLSSNIIGDLNIVAPATQNIPPIQDNSGNKPLLILDNVGIDLSLVTTNSCEIGGTSCVFANNARVLPGNADRCGIAVLSNNNFNGYLINSSIACFSASGTLTNMQRVLYVDTGTTNNNYLQIDGPPASNIIIDVQAESSVNNTAIQSNDGFFIHNAGQIKNLDNLSDCPINVLFTTSVENDPCYFENVNLGNGNIDFNSLSNMTCNNTRLGSWSNFSGSNIKLNNTSLSFLSSLPTLTVGGSNNTINQLNSPNPALGENADYATLTVTGSSINLSDVRVNTLNNNGNNTSLISCSASNWSETGTGRQSAGCQGAIPNSYISLPFNSGGWQFSLSAVENNTVTLVAYAGCNGVLLGIGEKARALTTAGTFGIEINGTPVVGLTAIAPTTTGSYTPSTSANTFVRGNTITITYTGTLAVLDHAISLDVERSS
Physico‐chemical
properties
protein length:1325 AA
molecular weight: 138734,74640 Da
isoelectric point:4,40578
aromaticity:0,08453
hydropathy:0,03283

Tail Spike Domain Segmentation

Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.

CAB4161406.1
1 1325 aa
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 114 114 0,8945
Central domain 115 385 272 0,9859
C-terminal 386 1325 939 0,1993
N-terminal Central domain C-terminal

View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.

Taxonomy

Phage
uncultured Caudovirales phage [NCBI] · taxon 2100421
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
CAB4161406.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796712 [NCBI]
CDS location
range 24976 -> 28953
strand -
CDS
ATGGAAAAAAATGAGTTAAAAAAAATAATTTCAGAATTGATTAACAATAATGATATTTATTTTGAAGCTGCGCCGTCTAATGATCCTAATAAAAAAGTTTCTGAAATGACAGATGGCTCCCCCATGCAGGGAACTGATTATATTCCAGTTGTTAGGACTGTTGATAGCGTCCTTACTAATTTTAAGGTATTAGCGTCAACTATTCCTGGATCTTTAGACCCGTTCGACGCAAAAGTTGACGGAATTGGTGCAAGCCCTGGTTGTTATGCTACGTTAACAGCCGCTATTACAGCAGGCGCAAATTTTATAAACTGGATCACTTCATCCGGGCCTGAGAATGCTGTTATCAATATTACAAAAAATATTTTTATTTTTTTACATGGTGCTAATTACCATCTTTTTAATTTAGCCGGATTTAATATTAGCCAAAACTGTACACTAACTATTGTTAGCCCTTCAGAAAAAAACCTAACAAATTCTTCTGTGGGGGCAACATTTTTATGCAATAGTGGGTCAAATAATTTTTTTGCAGGGTTAGGAAAAATTTTAAATTATGGAGTTACTTTTATACAAGGCGGGGCAGGAGGGTTATTAGATCCCACTTTGAGCGCAATGATTGGTGCTTGTCAATTTCAACCGTTAGGCACAAATAATAAATTTGTTAACTTGCAAACCTTCGGATCAAAAGTCAAAAATTGTTTTATTATTGGCCAAGCTATTGGAGCAGAGGTTGATAATTCGCTAGTAATTGGGAACGGCTGTGAAGGAGAAAATATTGAATATTATAATTCAACAGGCAGCACTGGCACACATATTACGGTACAGCCTGGTGGAAAACTAAGCGGAATAAAAGGTTCTGGGCAAGAAGGCGCGGGAGGCTTCCCACTTGTTATTGATAACCAGGGATACTTGGAAAGAATTTACACAAGTTACCCAATTTCTCCTGTCATTCAAAACGATGGGGGAATTGTAGCTAACACTATGTTTGCCACGGCAACAGGTTTTGCGGCGTTAAATGCATCGATTGAAAATACTGGCAACAGTCCAAAAATGCAAAATATTAATTTTGTTAATGCAGACATATCTATAGATGCCGTAGCACTCAATACAACAATTCTGAGCTGTGAAACTGTAGGGGGCACCTACATTAACTATGCAACAAACACCCAGGGTTTTGCAAACAGCGGAGGATTGTTACCCAATAGTGTTAATTTTTTGGCGGTTGCCAATACGGCTGCCCGATTAGCATTAACTAGTAGTCAGGTTAAAAATGACCAAATGGTGACTCAAGATTCGGATAAAACTGCATGGATAGCTGGAGTTTCGGGGGCAACGGTTACTTGGTATCCAATTTCAAGCGGTGTTCCTGGAGTTAATATTAGTCCATTTCAAGCAAAAATTGACGGGATTGGAACTCTTCCTAATTTTTATTTAAATTTAGGATCAGCTTATACAGCAGGCAAAACATACGATGATACAATTGCTAACGTAACAGAAACCGCCGATATTGAGATGTCATCTACGGATCAAATATATTTATTAGTAGGACAGCAATTTACTTGGGATCTTAGTGATTATGCTATTAAATCTTCTGGCGGGAATGATTTTGGTTTAACTTTGGCTGATGGTTCAGCAACTTTTCAATATAAAACAGCAGGTCAGCCTTTCCAAGATTTTGACAATCTTTCTAGTATTGTTATCACAGGTAATGGCGGAATTATCCAAAATAACAGCTCTACTGTTGATAGCTATATTTATTCATTGGGCGAATTACTTGCGGATAATTTGAGATTTTTGTTACCGAATATTTCCGGAGGTGGTTTTAAAACTAATCATTATACACAATTAAGCGGTATTAAATTTACAGGCGGAGGAATAAATTGTGAAAATTCGATCATATCTAACGGAGGGAAATTATCTAGTATTGGCTTTTATGGAAATAATTGGAAACCCAATGGATTTTTAAATGATATAGGCACTGATCCTACTATATGGGATACTGTTGATTATAATGTTGACCTGCCTATGTCATTTTATTTGTTTGGACAAGCAATTAATGTTGTAAAAAATAATTTTCTTTCTTCTGCATTTTTAACAGTTGTTTTTTCAAGCAATTCAACACTTACAAATTCTTATGTAGATGCTGCTGTTTTAACTTCTGGCATCACAGGATGTAAAGTTTTTGGCGGAACTTTAACAACTTTATCTTTAGCAAGCGATAATACTACTGATGTGGTTCTTGTAGGTGTGACTATCCCTAATAATACTGTTTTTTACGGATCAGGAAAATTAATTGGCTGTAAATTTGAGGGGGGGGGGAGTTTAGCAGTTGGTGCAAACTTTACGATCACGGGCTGTACTTCAGGAGCTTCTACTACTTTTTCCATTCCTGCTGGCGCTACTGCCATTCGTGCGGGTAACGATAATATTATTGGAAATGATTATGGCGGATCAGCAGCTAGCATCGAATTTTATGACGCAGAAGTTGATGGAGTTGGAACACTCCCCCATCATTATGCAACTTGGAACGATGCAATTTCAGTAAACCCAAAAACACTATTGGTTACAGCAAATACGTCACTTACAGCAGATATCACCCTTGCTAACGATATTTTTATACAATTTAAAGATGGTGCAAAATTAAATCCTAATAATTATCAAATCATACAAAATAATTTTGTGATGAGTTTATCGAGTAATATTATTGGGGATTTAAATATAGTCGCACCCGCTACACAAAATATTCCTCCTATTCAAGACAATTCAGGTAACAAACCGCTTTTGATATTAGATAATGTGGGGATTGACTTAAGCCTTGTCACGACGAACAGTTGTGAAATTGGCGGAACATCTTGTGTTTTTGCTAATAATGCTAGAGTTTTGCCGGGAAATGCGGACAGATGTGGAATTGCAGTACTGTCAAACAACAATTTTAATGGATATTTGATTAATTCATCTATTGCGTGTTTTTCAGCCTCGGGAACTCTCACAAATATGCAAAGAGTTTTATATGTTGATACCGGAACAACAAACAACAATTATTTACAAATAGATGGCCCGCCTGCATCAAATATTATAATTGATGTGCAGGCGGAAAGCTCTGTTAATAACACAGCCATACAAAGCAACGATGGATTTTTCATACATAATGCAGGTCAAATAAAAAATCTAGATAATTTGTCAGATTGCCCTATTAACGTTCTTTTTACTACAAGTGTAGAAAATGATCCTTGTTATTTTGAGAATGTAAATCTCGGAAATGGTAACATTGATTTTAATTCTCTCAGCAATATGACATGCAACAATACTCGACTTGGTAGTTGGTCTAACTTTTCTGGAAGCAATATTAAATTAAACAACACTTCTTTATCATTCCTTAGTTCTTTGCCAACATTAACTGTAGGCGGTTCAAATAACACTATAAATCAATTAAATTCGCCAAATCCCGCTTTAGGTGAAAATGCTGATTATGCGACATTAACAGTAACCGGTAGTTCAATAAATTTAAGTGATGTGCGTGTTAATACATTAAACAATAACGGAAACAACACGTCATTAATTTCATGCTCTGCTTCAAATTGGAGCGAAACAGGGACGGGGAGACAGAGCGCTGGGTGTCAAGGTGCAATCCCAAATAGCTATATTTCCCTGCCTTTTAATTCAGGCGGATGGCAATTTTCTTTGTCAGCTGTTGAAAATAATACGGTGACATTAGTCGCGTACGCAGGGTGTAACGGTGTTTTATTGGGAATTGGAGAAAAAGCAAGAGCGCTTACCACTGCGGGTACTTTCGGTATTGAAATTAATGGTACCCCTGTGGTTGGATTAACTGCAATTGCACCAACAACAACAGGCAGCTATACCCCTTCAACAAGCGCGAATACTTTTGTAAGAGGAAACACAATCACTATTACTTACACAGGTACTCTTGCAGTGTTAGATCACGCTATTTCTCTTGATGTTGAAAGGAGTTCTTAA

Genome Context

Tertiary structure

CAB4161406.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 33.6
Oligomeric state monomer