Protein
- Genbank accession
- CAB4161406.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSPTSPTSP
- Seq2Symm
-
C3 confidence 0,987 truncated
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C3 0,987 C1 0,028 C2 0,000 - Protein sequence
-
MEKNELKKIISELINNNDIYFEAAPSNDPNKKVSEMTDGSPMQGTDYIPVVRTVDSVLTNFKVLASTIPGSLDPFDAKVDGIGASPGCYATLTAAITAGANFINWITSSGPENAVINITKNIFIFLHGANYHLFNLAGFNISQNCTLTIVSPSEKNLTNSSVGATFLCNSGSNNFFAGLGKILNYGVTFIQGGAGGLLDPTLSAMIGACQFQPLGTNNKFVNLQTFGSKVKNCFIIGQAIGAEVDNSLVIGNGCEGENIEYYNSTGSTGTHITVQPGGKLSGIKGSGQEGAGGFPLVIDNQGYLERIYTSYPISPVIQNDGGIVANTMFATATGFAALNASIENTGNSPKMQNINFVNADISIDAVALNTTILSCETVGGTYINYATNTQGFANSGGLLPNSVNFLAVANTAARLALTSSQVKNDQMVTQDSDKTAWIAGVSGATVTWYPISSGVPGVNISPFQAKIDGIGTLPNFYLNLGSAYTAGKTYDDTIANVTETADIEMSSTDQIYLLVGQQFTWDLSDYAIKSSGGNDFGLTLADGSATFQYKTAGQPFQDFDNLSSIVITGNGGIIQNNSSTVDSYIYSLGELLADNLRFLLPNISGGGFKTNHYTQLSGIKFTGGGINCENSIISNGGKLSSIGFYGNNWKPNGFLNDIGTDPTIWDTVDYNVDLPMSFYLFGQAINVVKNNFLSSAFLTVVFSSNSTLTNSYVDAAVLTSGITGCKVFGGTLTTLSLASDNTTDVVLVGVTIPNNTVFYGSGKLIGCKFEGGGSLAVGANFTITGCTSGASTTFSIPAGATAIRAGNDNIIGNDYGGSAASIEFYDAEVDGVGTLPHHYATWNDAISVNPKTLLVTANTSLTADITLANDIFIQFKDGAKLNPNNYQIIQNNFVMSLSSNIIGDLNIVAPATQNIPPIQDNSGNKPLLILDNVGIDLSLVTTNSCEIGGTSCVFANNARVLPGNADRCGIAVLSNNNFNGYLINSSIACFSASGTLTNMQRVLYVDTGTTNNNYLQIDGPPASNIIIDVQAESSVNNTAIQSNDGFFIHNAGQIKNLDNLSDCPINVLFTTSVENDPCYFENVNLGNGNIDFNSLSNMTCNNTRLGSWSNFSGSNIKLNNTSLSFLSSLPTLTVGGSNNTINQLNSPNPALGENADYATLTVTGSSINLSDVRVNTLNNNGNNTSLISCSASNWSETGTGRQSAGCQGAIPNSYISLPFNSGGWQFSLSAVENNTVTLVAYAGCNGVLLGIGEKARALTTAGTFGIEINGTPVVGLTAIAPTTTGSYTPSTSANTFVRGNTITITYTGTLAVLDHAISLDVERSS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1325 AA molecular weight: 138734,74640 Da isoelectric point: 4,40578 aromaticity: 0,08453 hydropathy: 0,03283
Tail Spike Domain Segmentation
Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.
Domain layout
CAB4161406.1
1
1325 aa
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 114 | 114 | 0,8945 |
| Central domain | 115 | 385 | 272 | 0,9859 |
| C-terminal | 386 | 1325 | 939 | 0,1993 |
N-terminal
Central domain
C-terminal
View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.
Taxonomy
Phage
uncultured Caudovirales phage
[NCBI]
· taxon 2100421
Host
No host information
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4161406.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796712
[NCBI]
CDS location
range 24976 -> 28953
strand -
strand -
CDS
ATGGAAAAAAATGAGTTAAAAAAAATAATTTCAGAATTGATTAACAATAATGATATTTATTTTGAAGCTGCGCCGTCTAATGATCCTAATAAAAAAGTTTCTGAAATGACAGATGGCTCCCCCATGCAGGGAACTGATTATATTCCAGTTGTTAGGACTGTTGATAGCGTCCTTACTAATTTTAAGGTATTAGCGTCAACTATTCCTGGATCTTTAGACCCGTTCGACGCAAAAGTTGACGGAATTGGTGCAAGCCCTGGTTGTTATGCTACGTTAACAGCCGCTATTACAGCAGGCGCAAATTTTATAAACTGGATCACTTCATCCGGGCCTGAGAATGCTGTTATCAATATTACAAAAAATATTTTTATTTTTTTACATGGTGCTAATTACCATCTTTTTAATTTAGCCGGATTTAATATTAGCCAAAACTGTACACTAACTATTGTTAGCCCTTCAGAAAAAAACCTAACAAATTCTTCTGTGGGGGCAACATTTTTATGCAATAGTGGGTCAAATAATTTTTTTGCAGGGTTAGGAAAAATTTTAAATTATGGAGTTACTTTTATACAAGGCGGGGCAGGAGGGTTATTAGATCCCACTTTGAGCGCAATGATTGGTGCTTGTCAATTTCAACCGTTAGGCACAAATAATAAATTTGTTAACTTGCAAACCTTCGGATCAAAAGTCAAAAATTGTTTTATTATTGGCCAAGCTATTGGAGCAGAGGTTGATAATTCGCTAGTAATTGGGAACGGCTGTGAAGGAGAAAATATTGAATATTATAATTCAACAGGCAGCACTGGCACACATATTACGGTACAGCCTGGTGGAAAACTAAGCGGAATAAAAGGTTCTGGGCAAGAAGGCGCGGGAGGCTTCCCACTTGTTATTGATAACCAGGGATACTTGGAAAGAATTTACACAAGTTACCCAATTTCTCCTGTCATTCAAAACGATGGGGGAATTGTAGCTAACACTATGTTTGCCACGGCAACAGGTTTTGCGGCGTTAAATGCATCGATTGAAAATACTGGCAACAGTCCAAAAATGCAAAATATTAATTTTGTTAATGCAGACATATCTATAGATGCCGTAGCACTCAATACAACAATTCTGAGCTGTGAAACTGTAGGGGGCACCTACATTAACTATGCAACAAACACCCAGGGTTTTGCAAACAGCGGAGGATTGTTACCCAATAGTGTTAATTTTTTGGCGGTTGCCAATACGGCTGCCCGATTAGCATTAACTAGTAGTCAGGTTAAAAATGACCAAATGGTGACTCAAGATTCGGATAAAACTGCATGGATAGCTGGAGTTTCGGGGGCAACGGTTACTTGGTATCCAATTTCAAGCGGTGTTCCTGGAGTTAATATTAGTCCATTTCAAGCAAAAATTGACGGGATTGGAACTCTTCCTAATTTTTATTTAAATTTAGGATCAGCTTATACAGCAGGCAAAACATACGATGATACAATTGCTAACGTAACAGAAACCGCCGATATTGAGATGTCATCTACGGATCAAATATATTTATTAGTAGGACAGCAATTTACTTGGGATCTTAGTGATTATGCTATTAAATCTTCTGGCGGGAATGATTTTGGTTTAACTTTGGCTGATGGTTCAGCAACTTTTCAATATAAAACAGCAGGTCAGCCTTTCCAAGATTTTGACAATCTTTCTAGTATTGTTATCACAGGTAATGGCGGAATTATCCAAAATAACAGCTCTACTGTTGATAGCTATATTTATTCATTGGGCGAATTACTTGCGGATAATTTGAGATTTTTGTTACCGAATATTTCCGGAGGTGGTTTTAAAACTAATCATTATACACAATTAAGCGGTATTAAATTTACAGGCGGAGGAATAAATTGTGAAAATTCGATCATATCTAACGGAGGGAAATTATCTAGTATTGGCTTTTATGGAAATAATTGGAAACCCAATGGATTTTTAAATGATATAGGCACTGATCCTACTATATGGGATACTGTTGATTATAATGTTGACCTGCCTATGTCATTTTATTTGTTTGGACAAGCAATTAATGTTGTAAAAAATAATTTTCTTTCTTCTGCATTTTTAACAGTTGTTTTTTCAAGCAATTCAACACTTACAAATTCTTATGTAGATGCTGCTGTTTTAACTTCTGGCATCACAGGATGTAAAGTTTTTGGCGGAACTTTAACAACTTTATCTTTAGCAAGCGATAATACTACTGATGTGGTTCTTGTAGGTGTGACTATCCCTAATAATACTGTTTTTTACGGATCAGGAAAATTAATTGGCTGTAAATTTGAGGGGGGGGGGAGTTTAGCAGTTGGTGCAAACTTTACGATCACGGGCTGTACTTCAGGAGCTTCTACTACTTTTTCCATTCCTGCTGGCGCTACTGCCATTCGTGCGGGTAACGATAATATTATTGGAAATGATTATGGCGGATCAGCAGCTAGCATCGAATTTTATGACGCAGAAGTTGATGGAGTTGGAACACTCCCCCATCATTATGCAACTTGGAACGATGCAATTTCAGTAAACCCAAAAACACTATTGGTTACAGCAAATACGTCACTTACAGCAGATATCACCCTTGCTAACGATATTTTTATACAATTTAAAGATGGTGCAAAATTAAATCCTAATAATTATCAAATCATACAAAATAATTTTGTGATGAGTTTATCGAGTAATATTATTGGGGATTTAAATATAGTCGCACCCGCTACACAAAATATTCCTCCTATTCAAGACAATTCAGGTAACAAACCGCTTTTGATATTAGATAATGTGGGGATTGACTTAAGCCTTGTCACGACGAACAGTTGTGAAATTGGCGGAACATCTTGTGTTTTTGCTAATAATGCTAGAGTTTTGCCGGGAAATGCGGACAGATGTGGAATTGCAGTACTGTCAAACAACAATTTTAATGGATATTTGATTAATTCATCTATTGCGTGTTTTTCAGCCTCGGGAACTCTCACAAATATGCAAAGAGTTTTATATGTTGATACCGGAACAACAAACAACAATTATTTACAAATAGATGGCCCGCCTGCATCAAATATTATAATTGATGTGCAGGCGGAAAGCTCTGTTAATAACACAGCCATACAAAGCAACGATGGATTTTTCATACATAATGCAGGTCAAATAAAAAATCTAGATAATTTGTCAGATTGCCCTATTAACGTTCTTTTTACTACAAGTGTAGAAAATGATCCTTGTTATTTTGAGAATGTAAATCTCGGAAATGGTAACATTGATTTTAATTCTCTCAGCAATATGACATGCAACAATACTCGACTTGGTAGTTGGTCTAACTTTTCTGGAAGCAATATTAAATTAAACAACACTTCTTTATCATTCCTTAGTTCTTTGCCAACATTAACTGTAGGCGGTTCAAATAACACTATAAATCAATTAAATTCGCCAAATCCCGCTTTAGGTGAAAATGCTGATTATGCGACATTAACAGTAACCGGTAGTTCAATAAATTTAAGTGATGTGCGTGTTAATACATTAAACAATAACGGAAACAACACGTCATTAATTTCATGCTCTGCTTCAAATTGGAGCGAAACAGGGACGGGGAGACAGAGCGCTGGGTGTCAAGGTGCAATCCCAAATAGCTATATTTCCCTGCCTTTTAATTCAGGCGGATGGCAATTTTCTTTGTCAGCTGTTGAAAATAATACGGTGACATTAGTCGCGTACGCAGGGTGTAACGGTGTTTTATTGGGAATTGGAGAAAAAGCAAGAGCGCTTACCACTGCGGGTACTTTCGGTATTGAAATTAATGGTACCCCTGTGGTTGGATTAACTGCAATTGCACCAACAACAACAGGCAGCTATACCCCTTCAACAAGCGCGAATACTTTTGTAAGAGGAAACACAATCACTATTACTTACACAGGTACTCTTGCAGTGTTAGATCACGCTATTTCTCTTGATGTTGAAAGGAGTTCTTAA
Genome Context
Tertiary structure
CAB4161406.1
ColabFold structure
Source
ColabFold
pLDDT
33.6
Oligomeric state
monomer