Protein

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Genbank accession
CAL9967335.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,71
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MATKIEVTKLNALDDNLVEGQKVIEIILGPTIGADTADLALAVAQAEAAQAAAELAEDNAKASELAALASEGAAQTAQTLAEVAEGNAKASEIAAQSSEDDAQISEDAAAASEAAALASQNAAAVSAAAALASENAAQSSEDDAQVSEDNAAASEVAAAASAAAALASENAAQSSEDDAQISEDAAAASAAAALASENAAQSSEDDAKVSEDAAAASAAAALTQANRAETEADRSETEADRAQTIADSMTTALVPRGDWDASTGAFPTPTLSPERADFYQISVAGTMTTNKPAGQDDLSVEVGDQLYWNVVIDVWYSIDNTDQVTSVDGKKGVVVIDKYTQAEADARFVNAAGDTMTGALTIEESVMLVGNTAADNYMELAQVYGSSYGFTFQHNNASTMTNLQGSTNQALVLGDVSANVTDVLLGVSLKEGAGAWTKRLELDGAGELYLGSGAAYRTFHENYHPNADTWTTSRTVTLTGDVSGSFAIDGSADVSVSVVVEDDSHVHTDYLSNVATDLSNIMYGNIYASDEKPLIQLVGDDAYFGSHGRVGLQLASSSNPEWKTSTAAYKLFNESYHPNADTWTTARTITLTGDATGSFTMDGSSDESVEVTVVNDSHTHDTRYLKLAGGYMAGEITGPYSWVLNRTFVMIENETPQYLLLCLNAGGNNVNGEFILNRTSGNYQSANLNVVVSSGSSVSPYGTIVSVQSTQDDEEYRLVTVDYAGDSWVAIKYVGNSYPVTDPGLFSGRIQSSKAGSLTAVGAASITNEAPLRDATKFELNGQAIFHQGYHPNADTWTTARTLTFTGDATGSTTLDGSSDKSIAMTVVDDSHNHSYVNGTFEIRHANEQLKLVDTTDGNKWWMLDHQNGDLNFRYNGVSVTPALVIHETGNYVSAPSFSATTYLNLPIENVRTGNQADIRYNPVKGFEGHDGVEWGAIGGGGGVEWEATTGTSVVAETGAGYLVTEAGVTVVLPPTPDQGNTVGVGDYNGLNFEVTINPNGGKIMGLTEDFTFDTKNANIVFSYVDTTVGWILTQGFGESEAPQAIANKVIVTDAVGQSVISIPNNGSQTVDVWYNGLKLLRNDDYIVDEDLDTVTLTDPIDLSDDIVEVYAWNQALVLDTTDLLYHGTQMRKTIEGDGISLTEAIEARAPQPNLLINGDFVINQRQFAISSDVPIDGEFFVDRWFARNAIGGTNLCYSDFRNNTGMYTRMTHTGAAVSAYIGQRIEVMDWRPFVNTTASVEVSHSQDCVMSGVIHLRRVSDDTVLSSVFSNEVIVTPGLKTVVFTMEGLDISMVGSTECYAEFRIIYNNGGSIATPDGQYRFYTAKLESGLLATPFVPDSPQESLAKCQRYFYTTRGRTKSQIFGTATVSSTNDGTFQAGVPIPVPMRINKPALTQFGSFAIYGVSSTSGTKNETVTFTDGGSGAGVGFIDIIIQSNTVPTLLRGAVTLRGLNSSSWFNVDAEL
Physico‐chemical
properties
protein length:1465 AA
molecular weight: 155030,15120 Da
isoelectric point:4,24476
aromaticity:0,07782
hydropathy:-0,16669

Domains

Domains [InterPro]
Coil
39–66
Coil Coil
CAL9967335.1
1 1465
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage D6
[NCBI] 		3105301 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAL9967335.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ195830 [NCBI]
CDS location
range 20301 -> 24698
strand +
CDS
ATGGCAACAAAAATAGAAGTAACCAAGCTTAATGCCTTAGATGACAATCTAGTAGAGGGTCAGAAGGTAATTGAGATCATACTTGGTCCGACTATCGGGGCAGACACAGCAGATCTAGCCCTTGCTGTTGCGCAAGCAGAAGCAGCACAGGCAGCTGCAGAGTTAGCGGAAGATAACGCTAAGGCCTCTGAACTTGCAGCGCTAGCATCAGAAGGTGCGGCACAAACAGCACAAACACTTGCAGAAGTGGCAGAAGGCAATGCTAAGGCATCCGAAATAGCTGCACAGAGCTCAGAAGATGATGCTCAAATATCAGAAGATGCGGCAGCAGCCTCTGAAGCGGCAGCGCTTGCGTCTCAAAACGCAGCAGCAGTATCAGCAGCAGCAGCCCTTGCTTCAGAAAACGCAGCACAAAGCTCAGAAGACGATGCTCAGGTGTCAGAAGACAACGCGGCAGCCTCAGAAGTAGCGGCAGCGGCATCAGCAGCTGCGGCACTTGCGTCAGAAAACGCAGCACAGAGCTCTGAGGATGATGCACAGATCTCCGAGGATGCAGCGGCAGCCTCAGCAGCAGCAGCACTTGCATCTGAGAATGCAGCGCAAAGCTCAGAAGACGATGCTAAAGTATCAGAAGATGCAGCAGCGGCATCCGCAGCGGCAGCACTAACTCAGGCAAACCGCGCAGAGACAGAAGCAGATCGCTCAGAAACAGAAGCGGATCGTGCTCAAACCATCGCAGATTCTATGACAACAGCTCTAGTTCCTCGCGGTGACTGGGATGCATCTACAGGAGCATTCCCTACACCTACACTATCTCCTGAACGAGCAGACTTCTATCAGATCTCCGTAGCAGGTACAATGACAACTAACAAGCCTGCTGGACAGGATGATCTATCAGTTGAAGTAGGTGACCAATTATACTGGAACGTTGTAATCGACGTTTGGTACTCAATAGACAACACAGACCAAGTTACTAGCGTAGATGGTAAGAAAGGTGTTGTTGTAATTGATAAATACACACAGGCTGAAGCAGACGCTCGCTTTGTAAACGCTGCAGGCGATACGATGACTGGCGCTTTAACTATCGAAGAAAGCGTAATGTTAGTGGGAAATACCGCGGCGGATAACTACATGGAACTTGCCCAAGTTTATGGTAGCTCTTACGGGTTTACTTTCCAACATAATAACGCATCCACTATGACTAACTTGCAGGGTTCAACCAACCAAGCACTAGTTCTAGGTGATGTTAGTGCAAATGTTACAGACGTGCTATTGGGGGTGTCCCTAAAAGAAGGTGCGGGTGCATGGACTAAGCGTCTTGAACTCGACGGAGCAGGTGAATTATACCTTGGCTCTGGTGCAGCTTATAGGACTTTTCATGAAAACTACCACCCTAATGCAGATACATGGACTACCAGCCGTACAGTAACTCTTACTGGTGACGTTTCTGGTAGCTTTGCTATTGATGGATCGGCAGATGTCTCAGTCTCCGTTGTTGTTGAGGACGACAGTCACGTCCACACGGATTACTTGAGTAATGTAGCAACCGACCTAAGTAACATTATGTATGGTAACATATATGCCTCCGACGAGAAGCCCCTAATACAACTAGTCGGGGATGACGCATATTTTGGGTCTCACGGCCGAGTAGGATTGCAACTGGCATCCTCGTCAAACCCAGAGTGGAAGACTTCAACAGCCGCCTACAAACTATTTAATGAGTCCTACCACCCTAACGCAGATACTTGGACTACTGCTAGAACAATTACTCTTACTGGTGATGCTACAGGTTCATTTACTATGGACGGTTCCTCTGATGAATCGGTAGAAGTTACAGTCGTTAATGACTCCCATACCCATGATACGCGTTACTTAAAACTAGCTGGTGGGTACATGGCCGGTGAGATTACAGGGCCTTACAGCTGGGTACTAAATCGCACTTTCGTTATGATTGAGAACGAGACTCCTCAGTACCTATTGCTATGTCTCAACGCGGGAGGCAACAATGTGAACGGTGAGTTCATACTGAATAGGACGTCTGGTAATTACCAGTCTGCTAACCTTAATGTTGTAGTCTCTTCTGGTTCTTCTGTATCGCCGTACGGTACTATAGTGTCCGTGCAATCTACCCAAGATGATGAAGAGTACAGGCTAGTAACAGTGGACTATGCAGGCGATAGTTGGGTAGCTATTAAGTACGTAGGCAACTCGTATCCTGTAACAGACCCTGGTCTATTCTCAGGGCGTATACAGTCTTCTAAAGCTGGTTCACTTACTGCTGTAGGTGCCGCGAGCATAACCAATGAAGCACCCCTAAGAGACGCTACTAAGTTCGAGTTAAATGGGCAGGCTATATTCCATCAAGGATACCACCCTAACGCAGATACTTGGACTACTGCTAGAACTCTTACGTTTACAGGCGACGCTACGGGCTCTACTACTTTAGACGGCTCCTCAGACAAGTCTATTGCTATGACAGTGGTAGATGACTCACATAATCACAGCTATGTTAACGGTACATTTGAGATTCGCCACGCTAATGAGCAACTTAAGTTAGTGGATACTACAGATGGTAATAAATGGTGGATGCTAGATCACCAGAATGGTGACCTTAACTTCCGCTATAACGGAGTGTCAGTAACCCCTGCCCTAGTAATACATGAAACAGGTAATTACGTTAGTGCCCCTAGCTTTAGTGCTACAACCTACTTAAACCTACCTATAGAGAATGTCCGTACTGGTAATCAGGCAGATATTCGATACAACCCAGTCAAAGGCTTCGAAGGACACGACGGAGTAGAGTGGGGAGCTATTGGTGGTGGTGGTGGTGTTGAGTGGGAAGCAACCACAGGAACATCTGTAGTTGCAGAAACTGGCGCAGGCTATTTAGTTACAGAAGCCGGAGTTACAGTTGTACTTCCACCAACCCCAGATCAAGGTAATACTGTAGGTGTAGGTGATTACAACGGTCTTAACTTCGAAGTAACTATTAACCCTAACGGTGGTAAGATCATGGGGCTTACTGAAGATTTTACCTTTGATACCAAGAACGCTAACATAGTATTCTCTTACGTAGATACAACGGTTGGTTGGATCCTTACACAAGGTTTTGGTGAATCTGAAGCGCCACAGGCTATTGCTAACAAGGTTATAGTAACAGATGCAGTCGGACAGTCCGTTATCTCTATCCCAAATAATGGATCTCAGACGGTAGATGTATGGTATAATGGTCTTAAACTCCTACGCAACGACGACTACATCGTAGATGAGGACTTAGATACTGTTACGCTAACAGACCCTATAGACTTAAGTGATGATATAGTTGAGGTATACGCTTGGAATCAGGCTCTAGTACTAGATACTACTGATTTACTGTACCACGGTACGCAGATGCGTAAAACAATCGAGGGTGACGGTATTTCTCTTACAGAAGCTATTGAAGCCCGTGCTCCGCAACCAAATCTATTGATTAATGGTGACTTTGTTATCAACCAGCGTCAGTTTGCTATAAGTAGTGATGTTCCAATTGATGGGGAGTTCTTTGTTGACCGTTGGTTCGCTCGTAACGCAATAGGCGGTACTAACCTTTGTTACTCTGATTTCCGTAATAACACAGGTATGTATACTCGTATGACTCACACAGGAGCTGCAGTTAGCGCATACATTGGTCAAAGAATTGAAGTTATGGACTGGCGTCCGTTCGTAAATACAACAGCGTCTGTGGAAGTTAGTCACTCGCAAGATTGTGTCATGAGTGGTGTTATTCATCTTCGTCGGGTTTCTGATGATACTGTCCTTTCTTCTGTATTTAGTAATGAAGTTATCGTTACACCAGGGTTAAAGACAGTAGTGTTTACTATGGAAGGTTTAGACATCTCTATGGTGGGGTCTACAGAATGTTACGCAGAGTTCCGAATCATCTATAACAACGGAGGTAGCATCGCTACACCGGATGGTCAGTATCGTTTCTATACTGCTAAGTTGGAATCTGGTTTATTAGCTACACCATTTGTTCCGGACTCTCCTCAAGAGAGCCTGGCTAAGTGTCAGCGCTACTTCTACACAACTAGGGGCAGAACAAAGTCTCAAATATTCGGAACAGCTACCGTATCCAGTACTAACGATGGCACATTCCAAGCAGGCGTACCGATTCCTGTACCTATGCGAATTAATAAACCAGCACTTACTCAGTTTGGTTCTTTCGCTATTTACGGGGTTTCTTCTACGTCAGGTACTAAGAATGAGACAGTAACCTTTACAGACGGAGGCTCTGGGGCAGGTGTAGGTTTCATTGACATCATAATACAGTCTAATACAGTGCCTACCTTGTTAAGAGGTGCGGTAACGCTTAGGGGACTTAACTCAAGTTCGTGGTTTAATGTAGACGCGGAACTGTAA

Tertiary structure

PDB ID
ddad274f40142029afd6004c9ab66df91f4efa6ede7a1fdd271e3866f059592e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5591
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50