Protein

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Genbank accession
YP_009322282.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MVKVIERTYNEIFTPESTSWLLGNVGEWQKLKLKVEVSVDLYCDQENRLKIDYINNSFVLNDGKKWSDYGFDIGQNIQLVYKFKLDTNGDGIYEGPFYQAPNFTIVNIASNVMEVLQPIVIWVLADTIPYNQDSVRIIDCKFIAFVEPEGCRIVYGQISNENSENLSLQSFIDGTTTMFVQPNVKSQSLNINSSMNAVGMQSGMSVRMVSVKRIGLKPGSQNVYQYEFELQYLISSFFENISNFTNNQMPDYLLGDGSLTDNFQILFYPKWNNPNTFIQNDMKKTARLGNTGWFDENYNELENNFVIESLQYFDDNGNPVDAIDYFAPTKVKGIVSGVQNINTNTECGFGFIWVPKFEEDYKNKETPFYQNTFVNTGTTTDGFKVGTFYPLTNVGGGLNSASIDTKNVKFTDIGGGKISFEMIFTPNPNFYLFFDARNDDDRKYVLWLSVADQTLVRNFSDRVSLLVDLNSMIKTVPPAGPYPYIQNAFLEHPFDENAIGVDEYDGFVQDDVLCRLPFQLDPITTEFKKMRFAIEIYNPSTGVKKILEKFDVDMTQFFDDANGVPQFNLNQTRGFKLENGNNKNWLKINREPSLDSGGRFGYLAFYAFKIRYEDWINFPGMPNDFFSSTELNNGFHNDWIHYFNTIGWQMNFYTEIDAVENNELKRYKNKFKFKFKDYDLNQLISTQHRYYRDSDNTLLNVGTDPISGRPLGVIISNEPTRLEIEYEIMDGGTWDIANVYATATIEIDKGAGIMQMRQLSSVWGSENDNPLIPLPGQTKLKIEVDATLKRLTTKCLIDPDLLDDAIRYRITGRVGCFANGGSFEFGKYEARYEDKYE
Physico‐chemical
properties
protein length:837 AA
molecular weight: 96037,77250 Da
isoelectric point:4,69879
aromaticity:0,13859
hydropathy:-0,40442

Taxonomy

Phage
Flavobacterium phage Fpv8 [NCBI] · taxon 1814288
No lineage information
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_009322282.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_031919.1 [NCBI]
CDS location
range 10744 -> 13257
strand +
CDS
ATGGTTAAAGTAATTGAAAGAACGTATAATGAAATTTTTACACCAGAATCAACAAGTTGGTTATTAGGTAATGTTGGAGAATGGCAAAAATTAAAATTAAAAGTTGAAGTAAGTGTTGATTTATATTGTGACCAAGAAAATAGATTAAAAATTGATTATATTAATAATTCATTTGTTTTGAATGACGGAAAAAAATGGTCAGATTATGGATTTGATATTGGTCAAAATATACAATTAGTTTATAAATTTAAACTTGACACTAATGGGGATGGTATTTATGAAGGTCCGTTTTATCAAGCTCCAAATTTTACTATTGTAAATATTGCAAGTAATGTTATGGAGGTTTTACAGCCAATTGTTATTTGGGTGCTTGCCGATACAATACCATATAATCAAGATAGTGTTAGAATTATTGATTGTAAGTTTATTGCATTTGTAGAACCTGAAGGATGTAGAATAGTTTACGGACAAATTTCAAACGAAAATTCTGAAAATTTATCGTTACAATCATTTATCGATGGTACAACTACAATGTTTGTTCAACCAAATGTAAAATCACAATCACTAAATATTAATTCATCAATGAATGCCGTAGGTATGCAATCCGGTATGAGTGTAAGAATGGTAAGTGTTAAGCGTATTGGATTAAAACCGGGATCACAAAATGTTTATCAATACGAATTTGAATTGCAATATTTAATTTCATCATTTTTTGAAAACATTTCAAATTTTACAAATAATCAAATGCCAGATTATTTACTTGGCGATGGCTCGTTGACTGATAATTTTCAAATATTATTTTATCCAAAATGGAACAATCCAAACACGTTTATTCAAAATGATATGAAAAAAACGGCCCGACTTGGAAACACCGGTTGGTTCGATGAAAATTATAATGAACTTGAAAATAATTTTGTTATTGAATCATTACAGTATTTTGATGACAATGGAAATCCGGTTGATGCGATTGATTATTTTGCACCAACAAAAGTGAAAGGGATTGTTTCCGGTGTTCAGAATATTAACACAAATACTGAATGTGGTTTTGGTTTCATTTGGGTTCCAAAATTTGAAGAAGATTATAAAAACAAAGAAACGCCGTTTTATCAAAATACATTTGTGAACACGGGAACAACAACGGACGGTTTCAAAGTCGGGACATTTTATCCATTGACAAATGTTGGCGGCGGTTTAAATAGTGCATCAATCGACACTAAAAATGTAAAATTCACGGATATTGGCGGCGGAAAAATTTCATTTGAAATGATTTTCACACCAAATCCGAATTTTTATTTATTTTTTGATGCACGAAATGATGATGACCGAAAATATGTATTGTGGTTATCGGTTGCGGATCAAACATTGGTTCGTAATTTTTCCGACCGTGTTTCATTATTAGTCGATTTGAATTCTATGATTAAAACGGTTCCGCCGGCGGGTCCATATCCATACATTCAAAACGCATTTTTAGAACATCCATTTGATGAAAATGCAATTGGTGTTGATGAATATGACGGATTTGTTCAAGATGATGTTTTGTGTCGTTTACCATTTCAATTGGACCCAATCACAACCGAATTTAAAAAAATGCGATTTGCGATTGAAATATACAATCCAAGTACCGGCGTGAAAAAAATATTGGAAAAATTTGATGTTGATATGACACAGTTTTTCGATGATGCAAACGGTGTGCCGCAATTCAATTTGAATCAAACAAGAGGTTTCAAATTAGAAAATGGAAACAACAAAAATTGGTTGAAAATAAATCGTGAACCATCACTTGATTCCGGCGGCCGTTTTGGATATTTAGCATTTTACGCATTTAAAATTCGTTATGAAGATTGGATTAACTTTCCGGGAATGCCAAATGATTTTTTCAGTTCAACGGAATTAAATAATGGATTTCACAATGATTGGATTCATTATTTTAACACCATCGGATGGCAAATGAATTTTTACACTGAAATTGATGCGGTTGAAAATAATGAATTGAAACGTTATAAAAATAAATTCAAATTCAAATTCAAAGATTATGATTTGAATCAATTGATTTCAACACAACATCGTTATTATCGTGATTCAGATAATACGTTGTTAAATGTTGGAACGGACCCAATAAGCGGGCGACCACTTGGCGTGATTATTTCAAACGAACCAACACGACTTGAAATTGAATATGAAATTATGGACGGCGGCACGTGGGACATCGCCAATGTTTATGCAACTGCAACAATTGAAATTGACAAAGGCGCTGGAATAATGCAAATGCGACAATTATCATCGGTTTGGGGTTCAGAAAATGACAATCCGTTGATTCCGTTACCAGGTCAAACAAAATTGAAAATTGAAGTTGATGCAACGTTGAAAAGATTAACGACAAAATGTTTGATTGATCCGGATTTATTGGATGATGCAATTCGTTATCGAATCACTGGCCGTGTCGGTTGTTTTGCAAATGGTGGTTCATTTGAGTTCGGAAAATATGAAGCACGTTATGAAGACAAATATGAATAA

Genome Context

Tertiary structure

YP_009322282.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 39.6
Oligomeric state monomer
Download structure

Literature

Title Authors Date PMID Source
Molecular aspects and genomic diversity of bacteriophages-specific to fish pathogen Flavobacterium psychrophilum Castillo,D. and Middelboe,M. 2016-12 — GenBank