Genbank accession
AIX20155.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,96
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,64
Protein sequence
MANQNFRVKKGIEVGLGATFLYADDSGVGINSASPRSNLDVRGRSQTEELLVDNYAEVQGPSTFVGLGTFGGDLYVGNDLYVKGNLSFTSFESETGNVTGVLTTRDFNVTGLSTFAGDATFQSDVNISGASSITGNLVVSGASTLTGIVTTGDDLYVGGSLYVFNDIFYDEITGRNLSISGIATLRQLEIQQDLEVAGLSTFVGLVSFRDAVGTNLTVYNLSANTGNFVEINVDGGGGGGGGTGIDSTSVNTEFLNVTGVATFNNGIATNFSAEFIDAGVTTTTDLHFTNGYGVNLNMSGITTVGILTVYENIYDSRNQVGYGDSLLVTQGGKLVWTRPDIAGIATSFQPGSTFYVSENGSNTNDGRSPEKAWGSIAYAVSQIGDTSHDILEVTAGEYTETFPITVPKGLTISGAGQRATIVRPSQATETNDGFLLNDRSTIHNITVTGFYKPQGSINYAFKFSVGAAITSRSPYVDKVTVINKGTQTSASDPYGYGSADSYPTTAPGGAGVLVDGSVVATNSLEAAILLNEVTLFTAGNQGIKITNGGRVEWLNGFIYFASEALVGLSDKTTGLAGAGKARLTLENASGGLVGGNTVQYYDSDGTTVLASGTIDGTIDGTSGAYTTLTTGGTGTFAIAGSRKAKAASFVDTASLSTTQAKFGNASLDVTGQSTDCINVDPSSDFGFGTGDFTAEFWLYRTSATAGATILDMRDAADTDSALSIRENTSDVIEVLVGNSVVLTSSTSAIGNAAWYHIAVARLGSTMELFINGAQEASASNSSDLGLSQSLTFGADYANANGTIAFLDELRIEKGAAKYTNPFTPSTVPLEGDRGTAILLHFDGSNGATEAPDDIQIFQDIRISGGNTADRLSLADYSQFGAELRSSGCAVEYGNKGVVGDGAGVALRLIGINFSFVGALGDLTNDPNLAVQANEVTETNNAEVSFTSIDQGGDFRVGESFYVNQETGDVSFNNTTTDLTSLSSLTITDGTNNSLITPTSGRFGNVQISGQQVASVSGDLDLVTAGGGEVNIYGNTNVVGILTAQVVEINAIQKGDTSIALDDTGTDGTIRFNTDGSEAGRFTKDNDLAVTHNFRVGGIGTIPNLVSTTATITTLNVENLVSSGSTSGGGGTGIGSTAINSPNLNISGQANFNNVNVSGVATVPDLTVTNSFTNTGYSTITGDAEVGGNLWLKGDLNVIGSQNVSEFFATNMEISGIATFGTVKVNSNVHCDDTVFVGGAVTITGPITAVDIFATGIGTIPVADVGHADVDSINVTGVSTIAQVDIGKITVGDLTVSGFATVTDGLEVIGPVSFGGSITQLPLPTGQGGVWFDNSVVGVGTLLATNASISGLLGVGNSLGVAGDAYIDGNIIGSGGTISNYNEIITPLLTATDIDAATLDVSGNVTIDGNVDLGDTSADFVRINGRVSTSFIPSTDSATDLGSNGLRWKELFVDKLTLTDDAAIGGDLSVGGSVSADYVDTTELNVSGVATFAQISIGGGGGGISTNGVIINNVTVTDQSTLNNLIVSGVSTFVGVSTFKGDVYIDGNLIIDGDNSQDLISGTNLLVSGIATIGTLGVTTNLTVGGDVLVSGAMTAGSYNGDGSQLDNLPAASITTSITPTTRVNGDTLQTGDLWYDSSELRQYTYYDDGGSVQWVPSAPEPTIPDFTYAGNTGIGTLSLGDDTFSVVGDGTNVVTTASGVTTTVTISLSDSVAIAGSMTAGSFLGENLNVSGVSTFVGVTTFRGDVFIEGNLIIDGDESQDLVSGTNLIITGIATIGTLGVTTTTTNTLTVLDTFTLDNPVNSIGISSDLGGAGAAHTALASQLAIKQYIDANNSDQNLNFTGDTGSGSIGLGTEFLEVRGTAQQVTTIGVGNSVVIGLPNTVRVPQRLYVGGGAFTQVMDANSASGVVFANKIVTINKGLTLSSSDLTGVRNLVQTGIATLGTVNFSGVTTTVGNAFVGNDLSVLGTVNANDFNSTSDATRKEDVVEIEDALAKVLDLRGVTFNWKNGEGSSAGVLAQEVQMVLPEIVKGDVGNMSVQYNGIIALLVQAVKELSSEVEELKRTKSDKRRKKS
Physico‐chemical
properties
protein length:2073 AA
molecular weight: 212426,19320 Da
isoelectric point:4,10425
aromaticity:0,06850
hydropathy:0,08032

Domains

View on InterPro
AIX20155.1
1 2073 aa
STR 352–813 · CHP 1978–2065 ·

ATT Attachment Domain STR Structural Domain RBD Receptor-Binding Domain CBM Carbohydrate-Binding Module LEC Lectin-like Domain ENZ Enzymatic Domain CHP Intramolecular Chaperone LNK Linker/Spacer Domain TAS Tail-Associated Structural TTP Tail Tubular Protein UNK Uncharacterized Domain Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.

AIX20155.1
1 2073 aa
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 406 406 0,9037
Central domain 407 741 336 0,9033
C-terminal 742 2073 1331 0,0684
N-terminal Central domain C-terminal

View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.

Taxonomy

Phage
Synechococcus phage ACG-2014f_Syn7803C7 [NCBI] · taxon 2790345
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AIX20155.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019052 [NCBI]
CDS location
range 198030 -> 204251
strand +
CDS
GTGGCGAATCAGAATTTTCGTGTCAAAAAAGGTATAGAAGTTGGCTTAGGTGCCACTTTTCTATACGCAGACGACAGTGGAGTTGGCATTAATAGTGCTAGCCCACGATCAAACCTAGACGTTCGAGGTAGATCCCAAACAGAGGAACTACTGGTAGACAACTATGCAGAGGTGCAAGGACCCTCTACATTCGTTGGACTAGGTACCTTTGGGGGTGATCTATATGTTGGGAATGATCTATATGTAAAGGGCAACCTATCATTCACCAGTTTTGAATCTGAGACTGGTAATGTAACAGGTGTTCTTACCACAAGAGACTTTAATGTAACCGGATTATCTACGTTTGCGGGAGACGCCACCTTCCAAAGTGACGTAAATATCTCTGGTGCTTCTTCAATTACTGGAAACTTAGTAGTTTCTGGTGCCTCTACGCTCACAGGTATCGTCACAACTGGCGATGACCTCTATGTGGGTGGTAGTTTATATGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATTACTGGTAGAAACCTCAGTATCTCTGGTATTGCCACACTCAGACAGTTAGAAATCCAACAGGACCTAGAAGTTGCAGGTCTCTCCACATTTGTTGGTTTAGTATCGTTCAGAGATGCAGTAGGTACAAACCTAACAGTTTATAATCTTTCCGCCAATACTGGTAACTTCGTAGAGATTAACGTCGATGGTGGAGGAGGAGGCGGTGGCGGTACTGGTATCGATAGTACCTCCGTCAATACCGAGTTCTTAAACGTCACTGGTGTTGCAACATTTAACAATGGTATTGCCACCAACTTCAGTGCAGAGTTTATTGACGCTGGTGTAACCACAACTACCGACCTCCACTTCACTAATGGTTACGGTGTCAATCTCAATATGAGTGGCATCACAACTGTTGGTATTCTAACAGTCTATGAGAATATCTATGACTCTAGAAACCAAGTTGGATATGGTGACTCACTACTAGTCACACAGGGTGGGAAACTAGTATGGACTAGACCTGATATTGCAGGTATTGCCACTTCATTCCAACCAGGTTCTACCTTCTATGTAAGTGAGAATGGTAGTAATACCAATGATGGTAGAAGTCCAGAGAAAGCATGGGGCTCTATTGCATATGCCGTATCACAGATTGGAGATACTTCTCACGATATTCTAGAGGTTACTGCTGGTGAATACACAGAAACCTTCCCTATCACAGTCCCTAAAGGTCTAACCATTTCTGGTGCTGGACAAAGGGCAACCATTGTTAGACCGTCACAGGCAACAGAAACCAATGATGGTTTCCTACTAAACGATAGATCCACTATCCATAACATCACAGTTACTGGATTCTACAAACCACAAGGTTCTATCAACTACGCCTTCAAGTTTAGTGTTGGAGCAGCAATCACCAGTAGAAGTCCTTATGTTGATAAGGTCACGGTCATCAACAAAGGTACTCAGACAAGTGCCAGTGACCCATATGGTTATGGTTCAGCTGACTCCTACCCAACCACAGCACCTGGTGGTGCTGGTGTTTTAGTTGATGGTAGTGTAGTTGCAACCAACTCACTAGAAGCAGCAATTCTCCTCAATGAGGTTACACTATTCACTGCTGGCAACCAAGGTATTAAGATTACCAATGGTGGTAGAGTAGAGTGGTTGAATGGTTTCATCTACTTCGCTTCTGAAGCACTTGTAGGTCTTAGTGATAAGACTACTGGTTTAGCGGGTGCTGGTAAGGCAAGACTAACCCTAGAGAACGCCTCTGGTGGATTGGTTGGTGGTAATACCGTTCAATACTATGATAGTGATGGAACCACAGTTCTTGCTTCTGGTACTATTGATGGTACTATTGACGGCACCAGTGGTGCATACACGACCCTGACTACTGGTGGTACTGGTACCTTCGCTATTGCAGGAAGTCGTAAGGCGAAAGCTGCCTCATTCGTTGATACAGCCTCTCTATCTACAACACAAGCCAAATTCGGGAATGCTTCACTAGATGTAACTGGTCAGTCTACTGATTGTATCAATGTTGATCCAAGCAGTGACTTCGGTTTCGGTACTGGTGACTTTACAGCTGAATTCTGGTTGTATAGAACATCAGCTACTGCTGGTGCTACTATTCTCGATATGAGAGATGCAGCTGATACTGATTCAGCTCTATCTATTAGAGAGAACACTAGTGATGTTATTGAAGTTCTTGTCGGCAACTCTGTTGTTCTAACTTCATCCACAAGTGCTATTGGTAATGCCGCTTGGTATCACATTGCTGTTGCCCGTTTGGGTAGCACAATGGAACTATTCATTAATGGTGCCCAGGAAGCTTCAGCATCCAATTCATCTGACTTAGGTCTAAGCCAGTCACTCACCTTTGGTGCTGACTATGCTAACGCCAATGGTACTATTGCGTTCTTAGATGAACTCCGTATCGAGAAGGGTGCTGCTAAGTACACGAATCCGTTTACTCCTTCCACTGTACCCCTTGAGGGTGACCGTGGTACAGCTATCCTACTCCACTTTGATGGATCAAATGGAGCAACTGAAGCTCCTGATGATATTCAGATATTCCAGGATATCCGTATCAGTGGTGGTAACACAGCTGATAGACTATCACTTGCTGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGAGTTGCGTTCCTCTGGTTGTGCTGTTGAGTATGGTAACAAAGGTGTCGTCGGAGACGGTGCTGGTGTTGCTCTAAGACTCATCGGTATTAACTTCAGTTTCGTAGGTGCCCTAGGTGATCTAACTAACGATCCAAACCTAGCCGTTCAGGCTAATGAAGTTACAGAAACCAACAATGCTGAGGTATCTTTCACCAGTATTGATCAAGGTGGTGACTTCCGTGTTGGTGAATCCTTCTATGTTAACCAGGAAACTGGTGATGTATCATTCAACAACACAACAACTGATCTAACCTCACTATCTAGTCTAACCATCACTGATGGTACTAACAACTCACTTATCACTCCTACCTCTGGTAGATTTGGTAATGTTCAGATCTCTGGACAGCAAGTTGCTTCTGTATCTGGTGACCTAGACCTAGTAACCGCTGGTGGTGGTGAAGTTAACATCTACGGTAATACTAACGTTGTTGGTATTCTAACCGCACAGGTTGTTGAGATCAACGCTATCCAGAAGGGTGATACTTCTATCGCTCTAGATGATACCGGTACTGATGGTACTATCCGGTTTAACACCGATGGTTCTGAGGCAGGTAGATTCACTAAGGATAACGACCTTGCAGTAACACACAACTTCCGCGTTGGTGGAATTGGTACTATTCCAAACTTGGTAAGTACTACTGCAACCATCACAACTCTAAATGTTGAGAACCTTGTCAGTAGTGGTAGCACTAGTGGCGGTGGCGGAACTGGTATCGGTTCTACCGCTATCAATTCACCTAACCTTAATATTTCTGGTCAGGCAAACTTCAACAACGTCAACGTTTCTGGTGTTGCCACGGTTCCTGATCTAACTGTAACCAACTCCTTTACTAATACTGGTTATTCAACCATCACTGGTGACGCCGAAGTTGGTGGAAATCTATGGTTGAAGGGTGACCTCAATGTTATCGGTTCCCAGAATGTTAGCGAGTTCTTCGCTACCAATATGGAGATCTCTGGTATCGCTACCTTCGGTACCGTAAAGGTCAACAGTAATGTCCATTGTGACGATACTGTATTTGTTGGCGGTGCTGTAACAATCACTGGTCCAATCACAGCAGTGGATATCTTTGCCACTGGTATTGGAACCATTCCTGTAGCAGATGTTGGACATGCTGATGTTGATTCTATCAACGTCACTGGCGTATCTACCATTGCTCAGGTTGACATTGGTAAGATTACCGTAGGTGATCTAACCGTATCTGGATTTGCAACTGTCACTGACGGACTTGAAGTTATCGGTCCTGTCTCATTTGGTGGTTCTATCACACAACTACCTCTACCAACTGGTCAAGGTGGTGTTTGGTTTGACAACTCTGTTGTGGGTGTCGGCACACTACTCGCCACTAATGCATCAATTAGCGGACTCCTCGGAGTTGGTAATTCATTGGGTGTTGCTGGTGATGCCTACATCGATGGAAACATCATTGGTTCTGGTGGTACTATCTCTAATTACAACGAGATTATTACACCTCTCCTAACCGCAACTGATATCGATGCAGCTACACTCGATGTTAGTGGTAACGTAACCATTGATGGAAACGTAGACCTTGGTGACACATCTGCCGACTTCGTTAGAATCAACGGTAGAGTAAGTACTTCCTTTATTCCTTCTACTGATAGTGCAACTGACTTAGGTAGCAATGGTCTCAGGTGGAAAGAACTCTTCGTTGATAAACTCACCCTCACAGATGATGCTGCTATTGGTGGTGATCTATCTGTTGGTGGTAGTGTATCTGCCGATTATGTAGATACTACTGAACTCAATGTCAGTGGTGTTGCAACCTTCGCTCAGATTTCAATTGGTGGCGGCGGCGGTGGTATTAGTACCAACGGCGTTATTATTAACAATGTTACTGTTACTGACCAGAGTACTCTTAACAACCTCATTGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGTGTTTCTACCTTCAAGGGTGATGTCTATATCGATGGTAACCTAATCATTGATGGTGATAACAGTCAGGATCTAATCAGTGGTACTAACCTACTCGTCAGTGGTATTGCTACCATCGGCACACTAGGTGTAACTACAAACTTAACTGTTGGTGGTGATGTACTTGTCAGTGGTGCTATGACCGCTGGTTCATACAATGGTGATGGTTCTCAGTTAGATAATCTACCTGCAGCATCAATCACAACCTCCATAACACCTACAACTAGGGTGAATGGTGATACACTACAGACTGGTGATCTATGGTATGACTCTTCTGAGTTACGCCAGTATACTTACTATGATGATGGTGGATCCGTTCAGTGGGTACCTTCAGCCCCAGAACCTACTATTCCTGATTTTACCTACGCAGGTAACACAGGTATTGGTACTCTATCCTTAGGGGATGATACTTTCTCTGTTGTTGGTGATGGTACAAACGTAGTCACTACTGCAAGTGGTGTAACTACTACCGTAACCATTTCACTATCCGATAGTGTGGCAATCGCCGGTTCTATGACCGCTGGTAGCTTCCTTGGTGAGAACCTCAATGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGCGTTACAACCTTCAGAGGTGATGTCTTCATCGAAGGTAACCTAATCATTGATGGTGATGAGAGTCAGGATCTAGTCAGTGGTACTAACCTAATTATTACTGGTATTGCTACCATTGGTACATTAGGAGTAACTACTACTACTACCAATACTCTCACCGTACTCGATACCTTCACTCTAGATAACCCAGTCAATTCTATCGGAATTAGTTCTGATCTAGGTGGTGCCGGTGCTGCTCACACAGCTCTTGCTTCCCAGTTAGCAATCAAACAATACATTGATGCTAATAACTCAGATCAAAACCTAAACTTCACTGGTGATACTGGTTCTGGCTCGATTGGTCTTGGTACTGAATTCCTAGAGGTTCGTGGTACAGCACAACAGGTTACAACCATTGGTGTTGGTAACAGTGTTGTTATTGGACTACCTAACACAGTAAGAGTACCACAGAGACTATATGTTGGTGGTGGTGCCTTTACTCAGGTTATGGATGCCAACTCCGCTTCTGGTGTGGTATTTGCCAATAAGATTGTTACGATCAACAAAGGTCTAACCCTCAGTAGTAGTGACCTAACCGGAGTTCGTAACCTAGTTCAGACTGGTATTGCAACTCTTGGTACAGTTAACTTCTCTGGTGTAACAACCACTGTAGGTAACGCATTCGTTGGTAATGACTTAAGTGTCTTAGGCACAGTCAACGCTAATGACTTTAACTCTACTTCTGACGCTACTAGAAAAGAAGACGTAGTTGAGATTGAAGATGCACTCGCTAAGGTCCTAGACCTACGTGGTGTAACATTCAACTGGAAGAATGGTGAAGGATCATCTGCTGGTGTTCTTGCACAAGAAGTTCAGATGGTTCTACCTGAGATTGTTAAGGGTGATGTAGGCAATATGTCCGTTCAGTATAACGGTATTATAGCACTTCTCGTCCAAGCAGTCAAGGAACTCTCTTCTGAAGTTGAAGAACTCAAGAGAACCAAGAGTGACAAGAGAAGGAAGAAATCCTGA

Genome Context

Tertiary structure

AIX20155.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 62.3
Oligomeric state monomer

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 GenBank