Protein

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Genbank accession
UDY80640.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,65
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYNNRFWAATDNIPKPAGSFNRIRWKALRTDAVYTTVSSGPYQLKSGEAISVDTSVGNDIEFNLPPSPLDGETVIIQDIGGKPGINQVKINSSNQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQMIFIFNNRLWQMYVADYSREAAIVTPSTAYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISIGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNNSTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDARIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRIATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATRSETVAGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTLVRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNNYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVRVWGNQFSGESDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKTGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGSSVTANGEFISKSSNAFRAINGDYGFFIRNGGSITHFMLTESGDQTGGFNGLRPLSINNASGQVTIGESLIIAKGATISSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGAIPSDNGIIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140531,04860 Da
isoelectric point:5,45270
aromaticity:0,07448
hydropathy:-0,34593

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
UDY80640.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage CT01
[NCBI] 		2890957 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UDY80640.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OK018184 [NCBI]
CDS location
range 149710 -> 153579
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATAATAATCGTTTTTGGGCAGCAACGGATAATATTCCAAAACCTGCTGGAAGTTTTAATAGAATTCGTTGGAAAGCATTGCGTACTGATGCCGTATATACAACCGTATCATCTGGACCGTATCAATTAAAATCCGGAGAAGCAATTTCAGTAGATACATCAGTTGGTAATGACATTGAGTTTAATTTACCACCTTCTCCTCTTGATGGAGAAACCGTAATAATTCAAGATATTGGTGGAAAACCTGGTATAAATCAGGTTAAAATAAATTCTTCAAATCAGAGTATTGTTAATTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTTCTAATGACTCATCCAAAGTCACAAATGATATTCATTTTTAATAATCGTTTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGCGATTGTTACTCCATCGACTGCATATCAAGCACAATCTAATGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCCGCTGCGCCGATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAATTAAATCCACTTTATCATACAATTGTCACGACATATGATGAAACAACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCTATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAAAAATTATGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACAACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCAACCGATATTTCCATTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTACAGGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTTGTACAACAAAACGTTCCAACAGTTGAAAGAGTCGATTCTTTAAATAATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCAAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTAGCAATTACACCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTAAATCAGAACACTACATTCTCTTTTGCTGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGCGTTGCTGAAATTGCCACGCAACAAGAAACTAATACAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACCTTTGTATCTACTGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGCAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCGAAAACTTTAAATGACCGTATAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTGGATAATGTTCTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCGCAGGAAGGCGTTATTAAAGTTGCAACTCGGTCTGAAACTGTAGCTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACCCTGGTAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCTACGCAGGACTTAGAACTATATGAGAAAAATAACTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGCGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTTTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCGCAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACACAGCAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTCGGTGGATCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACAGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGGACGAACCCAGCTCAAACGATGACAGTCAGAGTGTGGGGAAATCAATTCAGCGGTGAATCGGACACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACGTCTAGTCACTTTTATTCTCAGCGCAATAAAACTGGTAATATAACATTTAATATAAACGGTACAGTAACGCCGATAAATGTGAATGCTTCAGGAACATTGAATGCGAATGGCGTTGCAACATTCGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTTATCAGTAAATCATCGAATGCTTTTAGAGCAATAAACGGTGATTATGGATTCTTTATCAGGAATGGTGGCAGCATCACACATTTTATGCTCACTGAATCTGGCGACCAGACCGGTGGATTTAATGGATTACGTCCTTTATCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAGTTCAGGTGGTTTAACTGTCAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACCTCTGATTTATATACTCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAGATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACGCTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACTCCAGAAGCACGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCTTCAGATATAGGAGCGATCCCATCTGATAATGGAATAATAGGTAATCTTACTATTCGCGATTTCTTGCGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAGTGGATTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
9cf4ee8303caff70391012d6d6d033fec85c09661310e3eb54fee81773360da1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2299
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50