Protein
- Genbank accession
- YP_009879048.1 [GenBank]
- Protein name
- neck passage structure
- RBP type
-
TF
- Seq2Symm
-
C3 confidence 0,967
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C3 0,967 C1 0,445 C2 0,000 - Protein sequence
-
MSLDNFRNRTILWDTVNKDYPQPIQIMQGDVNARTLLIKIVDNGTEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMITPKDLAKGEFILAIPTEMTATGVIEANLILLNKDKEQVIVSKNLTFISDSSTVSDLAQEINNNIDDFTKLLLEKMPQVLRSELNDLHAQTDSNKSNIELKANLADMTSLQSAMTELKNEVEAFGISPENLVTIKSLLDAIASNASESEVVELINSVKILTSNISLMSNGDYSPKANQTDLESLQHTVNNQSATISTKANQTDLDNLQATVDKQGVAISTKAEQSELSITNKNVTTAQETAKQAESEAKNAMAKATEAQANSLPLNGNAVSASKLETARKLGVNLQASAFQNFDGTADATNIGVSGVLPISNGGTSTSDGVINTIAYSNSADGTDGFTTVYPNLNLLDGTKDFSGDWINARAWDKNGTYKGLTVVSYNGAYNAGIAKGFTIPSDGIYSFSIIVKVKTGYVGQFIVETYKPTGVPAVTINVTDTGGKFVIQSYTGSFKAGQEIAMYFRFDSGATIKGGLEVAGHKIEHGETPTPYMPSASEVTVADYPKYVGFSNIIKPNKKSSDYKWLPMGLVAIDSATGSLKPAVIGIDYAQAHPVGSVVTNNSNLSSGYSTGKWENIGSAVIGLTTIYYWKRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 656 AA molecular weight: 70331,95740 Da isoelectric point: 5,00015 aromaticity: 0,07012 hydropathy: -0,21768
Taxonomy
Phage
Lactococcus phage LP9903
[NCBI]
· taxon 2027259
Host
No host information
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009879048.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_049420
[NCBI]
CDS location
range 6862 -> 8832
strand +
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAGAAATAGAACGATTTTGTGGGACACAGTCAATAAAGACTACCCTCAGCCAATACAAATAATGCAAGGCGATGTCAATGCTAGAACGTTATTAATTAAAATAGTTGATAACGGAACTGAAATTGATTTAACTGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATACACTAATAGTAGTAATTCTGGTTTTGTTATGATCACTCCTAAGGACTTAGCTAAGGGAGAATTTATTTTGGCAATTCCTACCGAAATGACAGCGACAGGAGTTATTGAAGCGAACTTAATACTTCTCAATAAAGACAAAGAGCAAGTTATTGTCAGTAAGAATCTTACATTTATATCAGACAGTTCTACTGTTTCTGATTTAGCTCAAGAAATAAATAATAATATTGATGATTTTACGAAATTATTATTAGAAAAAATGCCACAAGTACTGCGTAGTGAGTTGAATGATTTACATGCTCAAACTGATTCAAACAAGAGCAATATTGAGCTTAAAGCAAATCTAGCTGATATGACTAGCTTACAAAGTGCAATGACAGAGCTAAAAAATGAAGTAGAAGCATTTGGTATTAGTCCTGAAAATTTAGTTACTATAAAATCGCTATTAGACGCAATTGCAAGCAATGCAAGTGAATCGGAAGTTGTTGAACTAATAAATTCAGTAAAGATTTTAACAAGTAATATTTCTCTTATGAGTAACGGAGATTACTCCCCTAAAGCTAATCAAACAGATTTAGAAAGTTTACAGCATACTGTTAATAACCAATCGGCGACTATTTCAACAAAAGCCAATCAAACGGATTTAGACAACTTACAAGCTACTGTTGATAAACAAGGTGTTGCAATTTCAACAAAAGCTGAACAATCAGAGTTATCAATAACAAATAAAAATGTAACAACTGCTCAAGAAACAGCAAAACAAGCTGAAAGTGAAGCCAAAAATGCAATGGCAAAGGCTACCGAAGCACAAGCGAACAGTTTACCACTTAATGGCAATGCGGTCAGTGCAAGCAAACTGGAAACAGCTAGAAAACTTGGAGTAAATCTCCAAGCCTCAGCGTTTCAAAACTTTGACGGGACTGCTGACGCAACTAATATTGGAGTTTCAGGGGTGCTGCCTATTTCAAACGGTGGTACTTCAACAAGTGACGGAGTTATAAATACAATAGCTTATTCCAACAGCGCAGACGGCACTGACGGTTTCACAACTGTTTATCCTAATTTGAATCTATTAGACGGAACTAAAGATTTTAGTGGGGATTGGATTAATGCACGTGCTTGGGACAAGAATGGTACTTATAAGGGTTTGACTGTGGTGTCATACAATGGAGCTTATAACGCAGGTATAGCTAAAGGTTTTACTATCCCTTCCGACGGTATTTATTCATTTTCTATAATTGTTAAAGTAAAAACTGGTTATGTCGGTCAATTTATTGTTGAAACGTATAAACCAACAGGGGTACCTGCTGTTACAATAAATGTAACCGATACAGGTGGGAAATTTGTAATTCAGTCTTATACAGGTAGTTTTAAAGCAGGTCAAGAGATTGCAATGTATTTTCGGTTTGATAGTGGAGCCACTATTAAAGGTGGTTTAGAGGTCGCAGGGCATAAAATTGAACACGGAGAAACACCAACTCCATACATGCCATCAGCTAGCGAAGTCACGGTTGCAGACTATCCGAAGTATGTAGGGTTTAGTAATATCATTAAACCTAATAAGAAAAGTTCTGATTACAAATGGTTACCAATGGGGTTAGTAGCAATTGATAGTGCTACTGGCTCACTCAAACCTGCGGTTATAGGTATAGATTACGCTCAAGCTCACCCAGTTGGCTCGGTAGTCACAAATAACTCAAATTTGTCATCAGGGTATTCCACAGGAAAATGGGAAAATATCGGTTCAGCAGTAATTGGTTTAACAACAATATATTATTGGAAACGTACTGCATAA
Genome Context
Tertiary structure
YP_009879048.1
ESMFold2 structure
Source
ESMFold2
pLDDT
69.8
Oligomeric state
monomer