Protein

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Genbank accession
YP_009879048.1 [GenBank]
Protein name
neck passage structure
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,69
Protein sequence
MSLDNFRNRTILWDTVNKDYPQPIQIMQGDVNARTLLIKIVDNGTEIDLTGHSLKLTYQYTNSSNSGFVMITPKDLAKGEFILAIPTEMTATGVIEANLILLNKDKEQVIVSKNLTFISDSSTVSDLAQEINNNIDDFTKLLLEKMPQVLRSELNDLHAQTDSNKSNIELKANLADMTSLQSAMTELKNEVEAFGISPENLVTIKSLLDAIASNASESEVVELINSVKILTSNISLMSNGDYSPKANQTDLESLQHTVNNQSATISTKANQTDLDNLQATVDKQGVAISTKAEQSELSITNKNVTTAQETAKQAESEAKNAMAKATEAQANSLPLNGNAVSASKLETARKLGVNLQASAFQNFDGTADATNIGVSGVLPISNGGTSTSDGVINTIAYSNSADGTDGFTTVYPNLNLLDGTKDFSGDWINARAWDKNGTYKGLTVVSYNGAYNAGIAKGFTIPSDGIYSFSIIVKVKTGYVGQFIVETYKPTGVPAVTINVTDTGGKFVIQSYTGSFKAGQEIAMYFRFDSGATIKGGLEVAGHKIEHGETPTPYMPSASEVTVADYPKYVGFSNIIKPNKKSSDYKWLPMGLVAIDSATGSLKPAVIGIDYAQAHPVGSVVTNNSNLSSGYSTGKWENIGSAVIGLTTIYYWKRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:656 AA
molecular weight: 70331,95740 Da
isoelectric point:5,00015
aromaticity:0,07012
hydropathy:-0,21768

Taxonomy

Phage
Lactococcus phage LP9903 [NCBI] · taxon 2027259
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_009879048.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_049420 [NCBI]
CDS location
range 6862 -> 8832
strand +
CDS
ATGAGTTTAGATAATTTTAGAAATAGAACGATTTTGTGGGACACAGTCAATAAAGACTACCCTCAGCCAATACAAATAATGCAAGGCGATGTCAATGCTAGAACGTTATTAATTAAAATAGTTGATAACGGAACTGAAATTGATTTAACTGGTCATTCATTAAAACTTACATATCAATACACTAATAGTAGTAATTCTGGTTTTGTTATGATCACTCCTAAGGACTTAGCTAAGGGAGAATTTATTTTGGCAATTCCTACCGAAATGACAGCGACAGGAGTTATTGAAGCGAACTTAATACTTCTCAATAAAGACAAAGAGCAAGTTATTGTCAGTAAGAATCTTACATTTATATCAGACAGTTCTACTGTTTCTGATTTAGCTCAAGAAATAAATAATAATATTGATGATTTTACGAAATTATTATTAGAAAAAATGCCACAAGTACTGCGTAGTGAGTTGAATGATTTACATGCTCAAACTGATTCAAACAAGAGCAATATTGAGCTTAAAGCAAATCTAGCTGATATGACTAGCTTACAAAGTGCAATGACAGAGCTAAAAAATGAAGTAGAAGCATTTGGTATTAGTCCTGAAAATTTAGTTACTATAAAATCGCTATTAGACGCAATTGCAAGCAATGCAAGTGAATCGGAAGTTGTTGAACTAATAAATTCAGTAAAGATTTTAACAAGTAATATTTCTCTTATGAGTAACGGAGATTACTCCCCTAAAGCTAATCAAACAGATTTAGAAAGTTTACAGCATACTGTTAATAACCAATCGGCGACTATTTCAACAAAAGCCAATCAAACGGATTTAGACAACTTACAAGCTACTGTTGATAAACAAGGTGTTGCAATTTCAACAAAAGCTGAACAATCAGAGTTATCAATAACAAATAAAAATGTAACAACTGCTCAAGAAACAGCAAAACAAGCTGAAAGTGAAGCCAAAAATGCAATGGCAAAGGCTACCGAAGCACAAGCGAACAGTTTACCACTTAATGGCAATGCGGTCAGTGCAAGCAAACTGGAAACAGCTAGAAAACTTGGAGTAAATCTCCAAGCCTCAGCGTTTCAAAACTTTGACGGGACTGCTGACGCAACTAATATTGGAGTTTCAGGGGTGCTGCCTATTTCAAACGGTGGTACTTCAACAAGTGACGGAGTTATAAATACAATAGCTTATTCCAACAGCGCAGACGGCACTGACGGTTTCACAACTGTTTATCCTAATTTGAATCTATTAGACGGAACTAAAGATTTTAGTGGGGATTGGATTAATGCACGTGCTTGGGACAAGAATGGTACTTATAAGGGTTTGACTGTGGTGTCATACAATGGAGCTTATAACGCAGGTATAGCTAAAGGTTTTACTATCCCTTCCGACGGTATTTATTCATTTTCTATAATTGTTAAAGTAAAAACTGGTTATGTCGGTCAATTTATTGTTGAAACGTATAAACCAACAGGGGTACCTGCTGTTACAATAAATGTAACCGATACAGGTGGGAAATTTGTAATTCAGTCTTATACAGGTAGTTTTAAAGCAGGTCAAGAGATTGCAATGTATTTTCGGTTTGATAGTGGAGCCACTATTAAAGGTGGTTTAGAGGTCGCAGGGCATAAAATTGAACACGGAGAAACACCAACTCCATACATGCCATCAGCTAGCGAAGTCACGGTTGCAGACTATCCGAAGTATGTAGGGTTTAGTAATATCATTAAACCTAATAAGAAAAGTTCTGATTACAAATGGTTACCAATGGGGTTAGTAGCAATTGATAGTGCTACTGGCTCACTCAAACCTGCGGTTATAGGTATAGATTACGCTCAAGCTCACCCAGTTGGCTCGGTAGTCACAAATAACTCAAATTTGTCATCAGGGTATTCCACAGGAAAATGGGAAAATATCGGTTCAGCAGTAATTGGTTTAACAACAATATATTATTGGAAACGTACTGCATAA

Genome Context

Tertiary structure

YP_009879048.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 69.8
Oligomeric state monomer
Download structure