Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_009202979.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein proximal subunit
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDINAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTIVIKDIGGRVGYNEIKLQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWEAANEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETEWVLNDVLTFNGNISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETDAGIDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTTPATARDTVGTNVYNNNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQSASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQQETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLTGIARIATQVEFDAGTLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTHSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGSWDSQATNFAPIFSEINSTVDASYHPIVKQRLGQGTFSLGTLNDGSGDFKIHHISSASGALKSSYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGITTSNGVSTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYRNEDGSFGDEVLGTSGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1350 AA molecular weight: 146196,96680 Da isoelectric point: 5,63822 aromaticity: 0,08074 hydropathy: -0,32430
Domains
Domain architecture
YP_009202979.1
1
1350 aa
ATT 1144–1177 · ATT 1237–1298 ·
ATT Attachment Domain
STR Structural Domain
RBD Receptor-Binding Domain
CBM Carbohydrate-Binding Module
LEC Lectin-like Domain
ENZ Enzymatic Domain
CHP Intramolecular Chaperone
LNK Linker/Spacer Domain
TAS Tail-Associated Structural
TTP Tail Tubular Protein
UNK Uncharacterized Domain
Unmapped
Proteins with similar domain architecture
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009202979.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_028847
[NCBI]
CDS location
range 151401 -> 155453
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCCGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCAATGCTCCAGCAGGAACCTTTGTACCTGGTTATTGGACTGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCATCTCCTACACGCCAGCTGGCTTCCGGTGAATATATTGCTGTGGATTCTGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCGAACCCTACTGATGGTGATACCATCGTAATCAAGGATATTGGTGGCCGTGTAGGTTATAATGAAATTAAGCTCCAGTCTAGTTCTGCTCCAGGTGGTGGTAATCAGAAAATTGTCCGTTTCGGTAACCAGTTCACTGAGACCTTAATTACGAAGCCTTTTTCCTATAATATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCAGCTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACCGCCCAGTTCCAATCACAAGCGGGTGATAACGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGTGATATTATTAAAACCGTTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCACTTAATCGTTGAAACATTTGATGCGTCATCTTCATTAGGTAAGCCTGGCCAGCATAGCATGGAATTCCGTACTTCAGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGCGACCGACAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGACGATGTTGAACTCTTGGCTAACGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACGACACCCCAGACAATTAATATCACATTACCTACCGGTGTGGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACAGTAAATATTAAGGCTGCCGTAGGAGATAAGATTGCTTCATCCGTCCAGTTGCTTCAATTCCCTAAACGTTCAGAATATCCACCAGAAACCGAATGGGTATTGAATGACGTACTGACCTTTAATGGCAATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCCCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTGGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTTTAGGTGTTATTGCCCTTGCGTCCCAGACTCAAGCAAACGTTGACCATGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTTGCAATTACTCCACAGACTTTAGCTAATCGTGTAGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACCCGCCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTGATGCTGGTATAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCGCGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCACTCCTGCGACTGCTAGGGACACCGTAGGTACTAACGTTTATAATAATAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTTGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACGGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGCCAATCGGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCGGAAACATTACATGCTCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTACGTTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCAACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGACAAAACCATCATCACTCCTTTGAAATTACACTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAAGGTATTATTCGTGTTGCAACCAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTTTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAGACCGAAACTACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAATTAACCGAAGGTGCTTTAACCCATTCAGGAAATAAAGTTACTGGTTCTGGTGTTAAATTCAACTCAGGTACAGGCCTTTATGAGAACGATGATACTGTTCTGAACGCAGCGAACTATCCTAAAACGGGTTATGCGGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGAGACGTCGATCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACCCTGACCAAACAATTGAACCTGGCAGCTCCTCTAGTGTCTTCTAGTACTGCTAATATTACCGGCAATACTATTTTAGGTTCTCTGGAAGTAACCGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGACCCCAGTCTGGCGCAGGTTCTTGGGATTCTCAGGCAACTAATTTTGCACCTATTTTCTCTGAGATAAATTCTACTGTTGATGCTAGTTATCACCCTATTGTTAAGCAACGATTAGGGCAGGGTACTTTCTCTTTAGGTACTTTAAATGACGGTTCCGGCGATTTTAAAATCCATCATATTAGCAGTGCTTCTGGTGCTTTAAAATCTTCCTACTGGACCTTTAATACGACCGGTGATTTTGCTGTTAATAGTGGTTCTATTAGTATTTCTAAGAATGCTAATATCACAGGTATAACCACTTCTAACGGTGTTTCTACAACCACACTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCGTTGCAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCCACCGGACAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGTTCTGTTGGTGTTAAACCTACATTAGCATCCCAGGCCCCTACTGCAGAAACAGTTGGCTTCTGGTCTGTTGATATCAATGATTCGGCCACATTTAACCTGTTCCCTGGTTATTGGACGATGAAAACGAAACGCCAGGTTAATATCGATACGGTCCAAACTAAACCTGCCGGTGTTTCTGATGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTGACAGAAACAGGTGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATCGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAAGTTCTCGGTACGTCAGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACCCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAGGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGACTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACGGCAGATAACCCTCCTTCTGCGGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCCACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA
Genome Context
Tertiary structure
YP_009202979.1
ESMFold structure
Source
ESMFold
pLDDT
53.2
Oligomeric state
monomer
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Isolation and characterization of a T4-like phage QL01 with wide host range against APEC | Xu,J., Chen,M. and Zhang,W. | 2015-12-23 | — | GenBank |