Protein

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Genbank accession
QOV07748.1 [GenBank]
Protein name
tailspike protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MNILRSFTETVVTTPTDTFPISFEYDEKYDAVHVFLDDVAVEDLGYTVSQVNAVTLKVEPAIPEGTVRIERETDIDRMKYIFDAGALFIDQNVDADFKQIVHAQQEVRDGFIKLRGDVLPLVHGLQEALQQAQEASEAAQEASEAAQEAADTASANLQGTVYSVKAVSDLDSLEKYSDRIVFVRDNSTFYQYSASTNMWFVRDAHAVSPEMVGGDIIVAAELAKQLKLPLFTGPATYQVSTEFKVPEGTLWVSMYSKVQQTGNALNSSSASVIAPESNVVIKGRLTLDMGAPTVGWGEKCHCRIDSFNNITPKVSGFTADELVLEGGYNNCNGVTMAGGASKVRIRKIEVGDSAVIGRVFMAHWGNFTQHKYDSSLKKYTHVSGYLPTTHPHDCIIDEIHTGDLTCTTSDWSAIALVSAGYDIEIKKITGNILDSTISGKGHFIATAGDLAFAYATPEQRAYGMRGLVVGSINGTSYASSIVTLYDALYATADDLTNVPTPPAREDYYANIVLNVTSVDVTGRAVAIGNNDAIISRLGPTGSMTIDTMTTRKFYRSLNIVNGTYNISVGDLTCYDSKVNPVVVNGTGTDPKFYPTGVYINNLTLVRYGVTSSNTVYRSGVSLNNYHSVNIGTIKVLEHGNAYSVVDIANGGGTGLLTVDTIHMLDSTYPSTFLVNNVLPTSKYITIGEVSSVKTLTQYVSGGVVKLTRGKQSKYVCAILPSGLSVQNGDEVFTPSNYATYLCTSAGVVGSTAKLEIVSGGYTVFSQAGYTVPADSTVLVTSGRNFSNAYIGATQLKAVYSSYVEGLVYHIVMTSDEKFSIYATNITTNSISAPAGSWKVFV
Physico‐chemical
properties
protein length:841 AA
molecular weight: 90608,74080 Da
isoelectric point:5,12332
aromaticity:0,09156
hydropathy:-0,01546

Domains

Domains [InterPro]
Coil
122–152
Coil
QOV07748.1
1 841
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter virus fBenAci001
[NCBI] 		2781368 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QOV07748.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW056501 [NCBI]
CDS location
range 33964 -> 36489
strand +
CDS
ATGAATATACTACGCTCATTTACAGAGACAGTGGTGACTACACCTACAGATACTTTCCCTATCAGTTTTGAATATGATGAGAAATATGATGCTGTACATGTCTTTCTTGATGACGTAGCAGTTGAAGACTTGGGGTACACTGTATCCCAAGTTAATGCTGTTACTCTAAAAGTTGAACCTGCTATTCCAGAAGGTACAGTTCGTATTGAACGCGAAACAGATATTGATAGGATGAAGTATATCTTTGATGCTGGTGCGTTGTTCATTGATCAGAATGTGGATGCAGATTTTAAACAAATCGTACACGCACAACAAGAGGTACGCGACGGTTTTATTAAATTACGTGGTGACGTACTACCCTTAGTACATGGCTTACAAGAAGCTTTGCAACAAGCTCAAGAAGCTAGTGAAGCTGCACAAGAAGCTAGTGAAGCTGCCCAAGAGGCTGCTGATACAGCGAGTGCTAACTTACAAGGTACAGTGTACAGTGTTAAAGCTGTATCTGATTTAGATAGTTTAGAAAAATATAGTGATCGGATTGTATTTGTACGCGATAACAGTACATTTTACCAATATAGTGCCAGTACTAATATGTGGTTTGTGCGGGATGCTCATGCAGTTAGTCCAGAGATGGTAGGTGGTGACATCATTGTAGCTGCTGAGCTAGCTAAACAGTTAAAATTACCATTGTTTACAGGTCCAGCAACTTATCAAGTCTCTACAGAATTTAAAGTACCCGAAGGCACTTTATGGGTGAGTATGTACTCTAAGGTGCAGCAAACAGGTAATGCATTAAATAGCAGTAGTGCGTCTGTTATTGCCCCTGAATCTAATGTGGTTATTAAGGGTAGATTAACATTGGATATGGGTGCACCTACTGTAGGTTGGGGTGAGAAATGTCATTGTCGTATTGATAGTTTTAACAATATCACACCGAAGGTTAGTGGTTTTACCGCTGATGAACTTGTCCTAGAGGGTGGTTATAATAACTGCAACGGTGTAACTATGGCAGGTGGTGCATCTAAAGTTCGGATTAGGAAAATTGAGGTTGGTGATAGTGCTGTTATTGGTAGGGTGTTTATGGCTCATTGGGGTAATTTCACCCAACATAAGTACGATTCTAGTCTTAAAAAATATACGCATGTATCTGGCTACCTTCCTACCACCCACCCACATGATTGTATTATCGACGAGATACATACAGGTGATCTAACTTGTACTACTTCTGATTGGAGTGCTATTGCATTAGTCTCGGCTGGTTATGACATCGAAATCAAGAAGATAACGGGTAATATATTAGATAGCACTATTTCGGGTAAAGGTCACTTTATTGCTACGGCTGGTGATCTGGCTTTTGCATATGCAACACCTGAACAACGTGCTTATGGTATGCGTGGTTTGGTTGTAGGTTCTATTAACGGTACTAGTTATGCGTCATCTATTGTTACACTATATGATGCGCTATATGCCACAGCAGATGATCTAACTAACGTACCTACACCACCTGCGCGTGAGGATTACTACGCTAATATTGTACTAAATGTAACTAGTGTGGATGTAACTGGACGTGCAGTTGCTATAGGTAATAATGATGCGATTATTAGTAGGTTAGGACCTACGGGTTCTATGACTATTGATACAATGACAACTCGTAAATTTTACCGATCACTGAATATTGTGAATGGTACATATAACATTAGTGTGGGTGATTTAACATGTTACGATAGTAAAGTTAATCCTGTTGTAGTTAATGGTACTGGTACAGACCCTAAATTTTACCCAACAGGGGTGTATATTAATAACTTAACTTTAGTTCGGTATGGTGTAACTAGTTCTAATACAGTATATCGATCTGGTGTATCCTTAAATAATTATCATAGTGTAAATATTGGCACTATTAAGGTATTAGAGCATGGTAACGCTTATTCAGTTGTAGATATTGCTAATGGTGGTGGTACTGGTTTACTAACTGTAGATACTATCCATATGCTTGACAGCACTTACCCTAGTACATTCTTGGTTAATAACGTACTACCTACATCTAAGTATATAACTATTGGCGAAGTATCTAGTGTTAAAACCCTAACTCAATATGTATCTGGTGGGGTTGTTAAACTTACTAGAGGTAAACAGTCTAAGTATGTGTGTGCAATCTTACCTAGTGGGTTGAGCGTTCAAAATGGAGATGAGGTATTTACACCATCTAACTACGCGACCTACTTATGTACGTCGGCTGGTGTTGTAGGTAGTACTGCTAAACTAGAAATAGTATCTGGAGGTTATACAGTGTTCAGCCAAGCGGGTTATACTGTACCTGCTGATAGCACAGTACTTGTAACGAGTGGTCGTAATTTTTCAAATGCATACATAGGTGCTACACAGTTGAAGGCAGTTTATAGTAGTTACGTTGAAGGTTTGGTGTATCATATAGTTATGACATCTGATGAGAAGTTCAGTATATATGCTACAAATATTACGACCAACTCAATTTCAGCACCTGCTGGAAGTTGGAAAGTTTTTGTATAG

Tertiary structure

PDB ID
950badee117d4c1b166c8cdc493560dc310454a783a317b12fea5b84e73e73db
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2473
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The isolation of lytic bacteriophages infecting Acinetobacter baumannii from Beninese wastewater Kolsi,A., Haukka,K., Dougnon,V., Kantele,A., Skurnik,M. and Kiljunen,S. 2023-08-13 — GenBank