Protein

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UniProt accession
A0A8S5NCX5 [UniProt]
Protein name
Pectate lyase
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MDFDKIKQNILNSSETSTSESENIAGSELHEEFEINNFLPEFEPLKISGKNLAQQYVSAFNTGMNIYQCLNYLQGYVYTLVTAMNETIEAWNTVVPLLEQATKEWTDEEFDYKWSILKPQVIELVTNLTIETFNKAWEDLKPVVIKLAQDTTDAEFKKQWDILKPQVITLVEETTTNKFNEEWEKLKPTIIQLSTNTTIEQFNRSWTELKPQVIELAQTTTNTKFDEKWTELRPQLIELAQTTTSDKFHEKWTELQPTLTETVNNLAKTQTTTTFNAEWTKLKPQIIELSQTTTSTKFDEKWTELQPTLNTTVENLVNTNLEAFKSTLWQEVTKNESFPFLLPENFGAVGDGQTDDHTAFNLCFAKASETNKNVLLSTKTYLIGRILRATGGFSIIGLNTNIVVNDNDFLTQTQNITFKNIFFLNKAPSNNVRFLIYKARDTYFDNCEFIDIGSIYGELLENTIKTQLLNNCRLLNTSIYNKKQGVTPSENKVYVVNNTLLLNTNNICHSFWCDKSGSKIYFNNCSFNSEFTKFNVTMFPTVDDMIFNNCSFNVKNTLGLIGLLTVGTDTYIGFNKCNINAKSIVNNSLNNYLYLNIKDSVINVDKIMDNSQECSLWLENNQMDIKPIINSGTGKVNLVEIQQKYSNTTQNVFPWIGEIPSTCVNNVIINNNDGAYYVTTENEDKTIIKLDYYTSLLANYTPNAPYYEVQILLPSLDLTGYELNLSSMNCNLFALKNDSYELIDYVHLYLDDTTVSTIINEQGEFEHTEITLKLLQAYAKLKTDTAVAGIMNIDTSFTFIFEKTS
Physico‐chemical
properties
protein length:805 AA
molecular weight: 92105,69060 Da
isoelectric point:4,67537
aromaticity:0,10807
hydropathy:-0,33193

Domains

Domains [InterPro]
IPR012334
342–532
IPR012334
IPR011050
344–605
IPR011050
A0A8S5NCX5
1 805
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Podoviridae sp. ctTZV6
[NCBI] 		2826556 Uroviricota > Caudoviricetes >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
DAD92080.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
BK015127 [NCBI]
CDS location
range 8936 -> 11353
strand +
CDS
ATGGATTTTGATAAAATAAAACAAAATATTTTAAATTCAAGTGAAACATCTACAAGTGAAAGCGAAAATATAGCTGGTTCAGAACTCCATGAAGAATTTGAGATCAATAACTTTTTACCCGAATTCGAACCTTTAAAGATAAGTGGGAAAAATTTAGCACAACAATATGTTAGTGCGTTTAATACAGGTATGAATATTTACCAATGTTTAAATTACTTACAAGGTTATGTTTATACATTGGTAACGGCAATGAATGAAACAATTGAAGCATGGAACACAGTCGTGCCACTATTAGAACAAGCCACAAAAGAATGGACTGACGAAGAGTTTGACTATAAATGGTCAATTCTAAAACCACAAGTTATTGAGCTTGTGACAAACTTAACAATTGAAACATTCAATAAGGCATGGGAAGACTTAAAACCGGTTGTTATTAAATTGGCACAGGATACAACAGACGCCGAATTTAAAAAACAATGGGATATTTTAAAACCGCAAGTTATTACACTGGTGGAAGAAACAACAACAAATAAATTTAATGAGGAATGGGAAAAATTAAAACCGACTATTATACAATTATCAACAAATACAACAATTGAACAATTTAATAGATCATGGACCGAATTAAAACCACAGGTTATTGAGTTAGCTCAAACTACAACTAACACTAAGTTCGACGAGAAATGGACGGAATTACGTCCACAATTAATTGAACTAGCACAAACGACAACGAGTGATAAGTTTCACGAAAAATGGACAGAATTACAGCCGACGTTAACAGAAACTGTTAATAATTTAGCTAAAACACAAACAACTACTACATTTAATGCAGAATGGACTAAGTTAAAACCACAAATTATTGAACTTTCACAAACAACAACTAGCACGAAATTCGACGAAAAATGGACGGAATTACAACCAACATTAAACACAACCGTTGAAAATCTAGTTAATACAAATTTAGAAGCATTTAAAAGTACATTGTGGCAAGAGGTCACTAAGAATGAAAGTTTTCCATTTCTACTACCCGAGAATTTTGGTGCTGTGGGAGATGGTCAAACGGATGATCATACAGCTTTTAATTTATGCTTTGCGAAAGCAAGCGAAACAAATAAAAATGTTTTATTAAGTACTAAAACATATTTAATTGGTAGAATTTTACGTGCTACCGGTGGTTTTAGTATTATAGGATTAAACACTAACATTGTTGTAAATGATAATGATTTTTTAACTCAAACACAAAATATTACTTTTAAAAATATATTTTTTCTTAATAAAGCACCTTCAAATAACGTTAGATTTTTAATTTATAAAGCACGTGATACTTATTTCGATAACTGTGAATTTATTGATATAGGTTCTATTTATGGTGAATTATTAGAAAATACTATAAAAACACAATTATTAAATAACTGTAGGTTATTAAACACATCTATTTATAATAAAAAACAAGGTGTTACACCATCAGAAAATAAAGTTTATGTAGTAAACAACACACTTCTTCTTAATACTAATAATATATGTCACTCTTTTTGGTGTGATAAAAGTGGAAGTAAAATTTATTTTAATAATTGTAGTTTTAATTCAGAGTTTACTAAATTTAATGTTACCATGTTCCCAACAGTTGACGATATGATATTTAATAATTGTAGTTTTAATGTTAAAAATACATTAGGTTTAATTGGCTTGTTAACAGTTGGTACGGATACTTATATTGGTTTTAATAAGTGTAATATTAATGCAAAGTCAATTGTTAATAATAGTTTAAATAACTATTTATATTTAAATATTAAAGATAGTGTTATTAATGTTGATAAAATAATGGATAATAGTCAAGAATGTAGTTTATGGTTAGAAAACAATCAAATGGATATTAAACCTATTATTAATAGTGGCACAGGTAAAGTAAATTTAGTTGAGATTCAACAAAAGTATAGTAATACCACTCAAAATGTTTTTCCATGGATCGGTGAAATACCATCCACTTGTGTAAACAATGTTATAATAAATAACAATGACGGTGCATATTATGTAACTACAGAAAATGAAGATAAAACAATTATTAAATTGGATTATTATACTAGTTTATTGGCTAATTACACACCAAATGCACCTTATTATGAAGTTCAAATATTATTACCTAGTTTAGATTTAACAGGGTATGAACTTAATTTATCATCTATGAATTGTAATTTATTCGCGCTAAAAAATGATAGTTATGAATTAATTGACTATGTGCATTTATATTTAGATGACACTACTGTATCGACTATTATTAATGAACAGGGAGAATTTGAGCACACAGAAATCACATTAAAACTTTTACAGGCCTATGCTAAACTTAAAACAGATACAGCAGTAGCCGGTATAATGAATATTGACACAAGTTTTACATTTATTTTTGAAAAAACTAGCTAA

Gene Ontology

Description Category Evidence (source)
GO:0044423 virion component Cellular Component IEA:UniProtKB-KW (UniProt)
GO:0016829 lyase activity Molecular Function IEA:UniProtKB-KW (UniProt)
GO:0051701 biological process involved in interaction with host Biological Process IEA:UniProtKB-ARBA (UniProt)
GO:0019058 viral life cycle Biological Process IEA:UniProtKB-ARBA (UniProt)

Tertiary structure

PDB ID
77023265d852d2d5c30ad9ba33b6c6fb13c15666f609d6bcfe58f048148a16da
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6933
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50