Protein

View in Explore
Genbank accession
QPX73301.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MIKNMITGSKGGSSKPHTPVEMEDNLISINRIRILLAVSDGEVDPDFSLKDLYFDDVPVMNHDGSLNFQNVKAEFRPGTQTQDYIQGFTDTASEITVARDLTAATPYIISVTNKNLSAIRIKILMPRGFTQEDNGDLTGVRVEYAVDMAIDGAEYNEVLHDVIEGKTMSGYDRSRRIDLPAFNERVLLRVRRLTDSTSARVTDLIKMQSYAEVVDAKFRYPLTGLVYVEFDSELFPNALPNISIKKKWKIINVPSNYDPISRTYSGSWDGTWKKAWSNNPAFVLYDLITNQRYGLDQRELGIALDKWSIYECAQYCDQMVPDGKGGTEPRYLCDVVIQSQVEAYQLVRDICSIFRGMSFWNGESLSIVIDKPRDASYIFTNDNVVNGDFSYTFASEKSMYTQCNVTFDDEQNMYQQDVEGVFETEAALRFGYNSTSITAIGCTRRSEANRRGRWILKTNVKSTTVNFATGLEGMIPTIGDVIVVSDNFWSSALTLNLSGRVMEVSGLQVFTPFKVDARAGDRILVNKPDGKPVGRTIARVSDDGKTLTLNTTFGFDVQPDTIFAIERTDIAQQRYVVTGITKGDGDEEFTYNITAVEYDPNKYDEIDYGVNIDDRPTSIVQPDILPAPQNVKIESYSRVVQGASVETMHVSWDKVEYASLYEMQWRKDNGNWNNTPRTANKETEVEGIYAGNYHVRVRSVAANGSASGWSAIVSAGLTGKVGEPEKPINLTASDNEVFGIRVKWGMPEGSGDTAYIELHQAPNGADGHPIVDEATLLTLIPFPQYEYWHSILPAGHVVWYKARAVDKIGNVSDWTDFVRGMASDDTSIITDHIKVDIENSDGYKWLQENAIKANDKIHSTAESVIENALANDKDVRRMRVENGKRKAEFLQSLKLIADETEARVTQVTQMSAQFDEKLTAQNSELREVIANSTETISQRIDQLTATFESEIDGVKQDIKAQITDVNQAITNEAEARASADRALSTQIGDTQSAVNQKLDSWVNADSVGAMYGVKLGLRYNGQEYSAGMALSLVGDGSGVKSQFLFDAGRFAIINNQQSGGFTLPFVVENNQVFINSLLVKNGSIGNAQIADQINSNNWSSGAAGWMINKNGYAEFNQITVRGTVYANAGSFTGNVYATDGWFRGAVYAEKIEGDVAKAVVLGFNGSVHIPAVNYNRHLVIPYVGIHGYTYSGGVWGGGTVWVDSTYGGRLANVQATAMHGGSSGYVLLPAGNATTLSYGGNLNHANAVPILTVLLFKA
Physico‐chemical
properties
protein length:1258 AA
molecular weight: 138813,56160 Da
isoelectric point:4,96394
aromaticity:0,09380
hydropathy:-0,30405

Domains

Domains [InterPro]
IPR053171
3–875
IPR053171 IPR015406
IPR055385
92–216
IPR055385 IPR032876 IPR036116
IPR013783
626–719
IPR013783
IPR003961
626–715
IPR003961
QPX73301.1
1 1258
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Citrobacter phage vB_CfrD_Supreme284
[NCBI] 		2777349 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPX73301.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW021750 [NCBI]
CDS location
range 16296 -> 20072
strand +
CDS
ATGATCAAAAATATGATAACTGGCAGTAAGGGCGGTTCTTCAAAGCCTCATACACCTGTTGAAATGGAAGATAACCTAATTTCAATTAACAGGATCAGAATTCTTTTAGCTGTTTCTGATGGTGAAGTTGATCCAGACTTTTCATTGAAAGATTTATATTTTGATGACGTTCCGGTTATGAATCATGATGGTTCACTAAACTTTCAGAATGTTAAGGCAGAATTCAGACCAGGGACGCAAACGCAGGATTATATTCAGGGGTTTACTGATACAGCCAGCGAAATTACAGTTGCTCGCGATCTGACAGCCGCAACGCCTTATATTATTTCCGTGACTAATAAAAACCTTTCCGCGATCCGTATTAAAATTTTAATGCCGCGAGGGTTTACGCAGGAGGATAACGGAGATTTAACAGGCGTTCGCGTTGAATATGCAGTTGATATGGCTATTGATGGCGCTGAATATAACGAGGTTTTGCATGATGTGATCGAAGGTAAAACAATGAGCGGTTACGACAGAAGCCGCAGAATTGATTTACCTGCTTTCAATGAGCGTGTTTTATTGCGCGTTCGTCGCCTGACAGACAGCACGTCAGCGAGAGTTACCGATCTGATTAAAATGCAAAGCTATGCGGAAGTTGTAGACGCTAAATTTCGTTACCCATTGACTGGTTTAGTATATGTTGAGTTTGACAGCGAATTATTCCCTAATGCGTTGCCGAATATCAGCATTAAGAAAAAATGGAAAATCATTAATGTTCCGTCAAATTATGATCCTATTTCCCGCACTTATTCAGGGTCATGGGATGGAACATGGAAAAAGGCATGGAGTAATAACCCTGCTTTTGTTCTGTATGATTTGATTACCAATCAGCGTTACGGACTCGATCAAAGAGAATTAGGCATCGCGCTTGATAAATGGAGCATTTACGAATGTGCGCAGTATTGCGATCAGATGGTTCCAGACGGTAAAGGCGGAACAGAGCCGCGCTATCTTTGCGACGTTGTGATCCAGAGCCAGGTAGAAGCGTATCAGCTTGTGCGTGATATTTGTTCAATCTTCCGTGGAATGAGCTTTTGGAATGGTGAGAGCCTTTCAATCGTGATCGATAAGCCTCGCGATGCGTCATACATCTTTACTAATGACAACGTGGTTAACGGCGATTTCAGCTACACGTTTGCCAGCGAGAAAAGCATGTACACGCAATGCAACGTGACTTTCGACGACGAACAAAACATGTATCAACAGGACGTTGAGGGTGTTTTTGAAACAGAGGCAGCGTTACGTTTTGGATATAACAGTACGTCAATAACTGCCATTGGATGCACTCGACGCAGTGAGGCTAATCGCCGTGGTCGCTGGATTCTAAAAACCAACGTTAAGAGCACAACAGTTAACTTTGCTACTGGCCTGGAAGGTATGATCCCAACAATAGGTGATGTTATTGTTGTATCTGATAACTTCTGGTCAAGTGCTCTAACGCTGAATCTATCAGGTCGCGTGATGGAGGTTAGCGGGTTGCAGGTGTTCACGCCGTTTAAGGTTGACGCAAGAGCAGGTGATCGCATTCTGGTAAATAAGCCAGATGGTAAGCCAGTTGGTCGAACCATTGCGCGTGTAAGTGATGACGGCAAAACGCTAACGCTAAACACGACATTTGGCTTTGACGTTCAGCCGGATACCATTTTTGCAATTGAGCGAACAGATATTGCACAGCAACGATATGTTGTAACCGGAATCACTAAGGGTGACGGTGATGAAGAATTTACCTACAACATAACGGCTGTTGAATACGATCCTAACAAATACGATGAAATTGATTATGGCGTAAACATTGATGACCGTCCGACTTCAATCGTGCAGCCTGACATTTTGCCAGCACCGCAAAACGTCAAGATCGAATCTTATTCGCGAGTTGTTCAGGGTGCGAGCGTGGAAACAATGCACGTTTCATGGGATAAGGTTGAATATGCAAGCCTTTATGAAATGCAGTGGAGAAAAGACAATGGCAACTGGAACAACACGCCGCGCACAGCCAACAAGGAAACGGAAGTTGAAGGTATTTACGCAGGAAACTATCACGTAAGGGTTAGATCTGTTGCAGCTAATGGTTCAGCGTCTGGATGGTCAGCAATTGTTAGCGCCGGATTAACTGGCAAAGTTGGCGAGCCAGAAAAGCCGATTAACCTTACAGCGTCTGACAATGAGGTTTTCGGCATTCGCGTAAAATGGGGTATGCCGGAGGGTTCTGGTGATACAGCTTACATAGAGTTGCATCAAGCGCCGAACGGTGCTGATGGTCATCCTATTGTTGATGAAGCAACGCTATTAACGCTGATACCGTTCCCGCAATATGAGTATTGGCATTCAATACTGCCAGCGGGTCATGTTGTCTGGTACAAGGCAAGGGCAGTTGACAAAATCGGGAATGTGTCTGATTGGACTGACTTTGTGCGCGGCATGGCTTCCGACGATACGAGCATTATCACGGATCATATTAAGGTCGATATTGAAAATTCTGATGGATATAAGTGGTTACAGGAAAACGCAATAAAGGCCAATGATAAGATCCACAGCACAGCGGAATCAGTGATTGAAAACGCATTAGCGAATGATAAAGATGTGCGACGTATGCGAGTTGAAAACGGCAAGCGTAAAGCGGAGTTCTTGCAATCGCTGAAACTCATTGCAGACGAAACAGAAGCAAGGGTAACGCAGGTCACTCAAATGAGTGCGCAATTTGACGAGAAATTAACGGCTCAAAATAGCGAATTGAGAGAGGTAATTGCTAACAGCACTGAAACCATTAGCCAAAGGATTGATCAGCTTACAGCTACGTTTGAGAGCGAAATTGATGGTGTTAAGCAGGATATCAAAGCACAGATAACTGATGTTAACCAAGCAATCACCAATGAAGCGGAAGCGCGAGCGTCAGCGGATAGGGCGTTATCAACTCAAATTGGTGATACCCAATCAGCGGTTAACCAGAAACTTGATTCTTGGGTTAATGCCGATAGCGTAGGCGCGATGTACGGCGTTAAGTTGGGGTTACGTTACAACGGGCAGGAATATAGCGCGGGTATGGCTCTTTCCCTTGTTGGTGACGGATCAGGAGTTAAATCACAATTCCTGTTTGATGCTGGACGATTTGCGATCATAAACAACCAACAGAGCGGAGGTTTTACACTACCGTTTGTTGTTGAGAATAATCAGGTGTTTATCAACAGCTTACTTGTGAAAAATGGCTCTATTGGTAACGCTCAGATTGCGGATCAGATTAACTCTAACAACTGGAGCAGCGGCGCGGCTGGATGGATGATTAATAAGAATGGTTATGCTGAATTTAACCAGATAACGGTAAGGGGTACAGTGTACGCAAACGCCGGATCATTCACTGGTAACGTTTACGCTACTGATGGTTGGTTTAGGGGTGCTGTTTACGCTGAAAAAATCGAGGGCGACGTTGCAAAGGCTGTTGTGCTTGGGTTTAACGGATCGGTTCACATTCCGGCAGTAAACTACAACAGACACCTTGTGATCCCTTATGTTGGTATTCACGGGTACACATATTCAGGTGGTGTATGGGGCGGCGGTACTGTTTGGGTTGATTCAACATATGGCGGTCGCCTTGCTAACGTTCAGGCAACTGCAATGCATGGCGGATCAAGTGGTTATGTTCTGTTGCCAGCAGGTAACGCAACTACGCTTTCATATGGTGGAAATCTAAACCACGCAAACGCAGTACCGATCTTAACAGTTCTGCTATTCAAAGCATAA

Tertiary structure

PDB ID
4eedeb8ed3fe041e39ce546b25d32cd3923bbcc70888db4decfce26a9a97ef9e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2209
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50