Protein

View in Explore
Genbank accession
AIT14461.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MYSIKTDLDITGAGTVGKDLLVKGNAVFNNNLTVNGTVTFANATFTAIESSTANITSTLDVGGKATLSGGLGVEGNTTIGSAVVGSDTATINSNATFNGTVSVGSDFTQTAGTTTLQATKVKNLEVAETTAFKGNITADVGTTAAFDKITANTAEITNVSTTDISSTGTATFNDVTISGTLGGEFNLSDLNAVTLNVTGASNQQGAVTFGANVTGINSTATFKDIRIGSNSESQTFRLSFPYTAPGKRPTVILQNEIQSELMSPANLTVLTSASFGNASLSSYGITGNGLNKLDYLTVSGNNTQSPDTPLLEVQKGKTKVADFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINVSGLLGGTFQLDDINAVSLNVTGVTSLVGGVTLGSNITGYNSTASFKAISLGQNSQDAAVKLGFGYTAPGQRPTVILPNEVQSEVVSPSTLNVLKTATFGNASLSTYGITGNGLNKLDYLTITGNETQAPGTPFLQVGGKAILNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVVAAANIKGATLESTGNTTVGAKLTVTGDIAGTTATLSGALSAGSVSSGSITGTTSVSAPTISASTEVTAPTITASGTVSGQTINGTNISATTLTAPTISGNTNFTENVDITGSLTVGSLDLSTTDINAKSITTTAGATIGGDLVVQGSFDLSAADLNVKSLTTSGIVKSNDLVNANVLPVLNSTTITATTVNADDITVTGSANLGTIYSSSSVLVGSTLTVTGETTTASLVTPTISNASGVTISNNTNVTGDLTVTGAVIPGSIDLATTDVNAKSITTTAGATIGGNLTVNGTVDLTTADVTVKSLTSTGAIVSNESTISSVLPKLQSTDATIATLGSTTANITNLNVTGASTVADVTSSGKVKAVSVETPTISNVDGVSISNNTSITGDLTVSGTVTPGAIDLSTTDVSAKSITTTAGANIGGDLVVSGTVDLSGADVSVKSLTSTGIITVSSAEGINVLPKVQSTEVTVSALNATNAVVSGDVSAATASISGAITGGSATLSGVGTALNVTNNATVGGVLTVGSITSAAENVSITKNTAITGNLAVSGTLTAGVIDLSTTDVSVKTLTSLGDATVQGNLTVDGTINLSSANIVGVTLESTGSTTVGTDLILTTGNITGSPSISGNLGVTGTTTLTGATTVSNTLNTAGKLTVNAGGIQVVAGGIQVDSGTITASSANISGSSTLNSATVTTTLGVTGAASMNGGLTASTLDVTGDSTVQKLTVKGVFVPEGGLDLSGADLSVNSVTAATTLSVTGASTLTGGVSTSTVTASGKVTAQELSTGTLDVTTNGTVGGTLGVTGKATVGSLDSGAISATSGTFSTTLDVTGAATFGNNVNITGTLTPGALDLASTDVVANSLSVATTLHSDGNATIGGTLGVTGAVSAPSIALNGEGAALAVTNNATIGGTLGVTGATTLGSLTTSGAVKTGADVIIGTKIGDQPETVQIFPNTYIAGSLRVDGGINADIDVSGQTIEPYAVVAADTISAAGNITSGAELISKSATIGDVGSQNNNLTINGNVVNNGNFTVTGLLNATLNQANSDVAVKSLTATNSVAAGTSITAGTSITATGLLKGNTLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITSGNLTVGGDISATGTATLAATSVTTITTSGAATLASASVTGAATIGGTLTVTGLMTANGSVVLGDAAADTLTVNATSSFKENAVFDKDVTVTGQLTTTNADLTTTTVTTKKYDVIPNQVTSSVIAPTGTWTPDGTSNVYFITLDQDTTLAPITGLIGGGKASSVYIYVKQDATGNRNFTTDGTYAVVDGTLNKTANSVTIYQVIYDGVSPVTDMFIAQRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:1841 AA
molecular weight: 180375,94810 Da
isoelectric point:4,14859
aromaticity:0,02933
hydropathy:0,24264

Domains

Domains [InterPro]
IPR058970
1750–1829
IPR058970
AIT14461.1
1 1841
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage 121Q
[NCBI] 		1555202 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIT14461.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KM507819 [NCBI]
CDS location
range 282619 -> 288144
strand -
CDS
ATGTACTCAATAAAAACTGACTTAGATATTACTGGTGCTGGTACGGTTGGTAAGGATCTTTTAGTCAAAGGAAATGCTGTTTTCAACAATAACCTAACTGTAAATGGTACTGTAACTTTTGCAAATGCAACTTTTACTGCCATTGAATCATCAACTGCCAACATTACATCTACTTTAGATGTAGGTGGCAAAGCAACACTTTCTGGTGGTCTTGGTGTTGAGGGTAATACTACAATCGGTAGTGCAGTTGTCGGGTCTGATACAGCAACAATTAATTCAAACGCTACCTTTAACGGTACTGTATCAGTTGGTTCTGATTTTACACAAACTGCTGGTACAACCACTCTACAAGCAACTAAAGTTAAAAACTTAGAAGTTGCTGAAACAACAGCATTTAAAGGTAATATTACTGCTGATGTTGGGACTACTGCTGCATTTGATAAAATTACTGCTAATACCGCAGAAATTACTAATGTAAGTACAACAGATATTAGTAGTACTGGTACTGCTACATTTAACGATGTGACAATTAGTGGTACACTTGGTGGTGAGTTTAATCTATCTGACTTAAATGCAGTAACATTGAACGTTACTGGTGCATCTAACCAACAAGGTGCAGTAACTTTCGGTGCTAACGTAACTGGTATTAACAGTACTGCTACTTTTAAAGACATTCGTATTGGTTCTAACTCTGAATCACAAACCTTCAGATTAAGCTTCCCTTACACTGCTCCTGGTAAACGCCCAACTGTTATTCTACAAAACGAAATTCAGTCCGAGCTAATGTCACCTGCAAACTTGACAGTATTGACCTCTGCTTCTTTTGGTAATGCGTCATTATCTTCTTATGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAATTAGATTATCTAACAGTTTCTGGTAACAATACACAATCACCAGACACACCACTATTAGAAGTTCAAAAAGGAAAAACTAAAGTTGCTGACTTTGAAGTAACCGGAACTGCAACTATTCCAAATATCGAAAGTACTGGTACTGCTAATTTTAATAACATTAATGTTTCTGGTCTTCTTGGTGGAACGTTCCAACTAGACGATATTAATGCAGTATCTTTGAACGTTACTGGTGTAACTTCATTAGTTGGTGGTGTTACTCTTGGTTCTAATATTACTGGTTATAACAGTACTGCATCCTTTAAAGCTATCAGCTTAGGTCAAAATAGTCAAGATGCGGCAGTGAAACTAGGTTTTGGATATACTGCACCAGGTCAACGCCCAACAGTTATTCTACCTAACGAAGTTCAATCAGAAGTCGTTTCTCCTTCTACATTGAACGTTCTTAAAACAGCAACTTTCGGTAACGCTTCTCTTTCCACTTATGGTATTACTGGTAACGGTCTAAACAAACTAGATTACCTAACTATTACTGGTAACGAAACACAAGCTCCAGGTACACCATTCCTACAAGTTGGTGGTAAAGCAATTCTTAATGATGTTGAATTTACTGGAACAGTAACTGGACTAACTGTTGATGTTAGTGGGCAGGATCTAACACCTAATTCTGTTGTCGCGGCAGCAAATATTAAAGGTGCAACACTTGAAAGTACTGGTAACACTACCGTGGGTGCTAAACTAACTGTTACTGGTGATATTGCTGGTACAACTGCAACTCTTTCTGGTGCATTATCCGCTGGTTCAGTAAGTTCTGGTTCTATTACTGGTACAACTTCTGTATCTGCACCAACAATTAGTGCATCTACTGAAGTAACGGCCCCTACTATCACTGCGAGTGGAACTGTAAGTGGGCAAACAATTAACGGTACTAATATTAGTGCAACAACTCTGACTGCACCAACTATTAGTGGTAATACTAACTTTACAGAAAATGTTGATATTACTGGTAGCTTAACTGTTGGTTCTCTAGACTTGAGCACTACCGATATTAATGCTAAATCAATCACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTGATTTAGTAGTTCAAGGCTCTTTTGATTTATCAGCAGCCGACCTTAATGTTAAATCATTAACTACTTCTGGTATTGTTAAAAGTAATGATCTTGTTAATGCTAACGTACTTCCAGTACTTAATAGTACTACCATAACGGCAACTACTGTTAATGCTGATGATATAACTGTTACCGGATCTGCTAATTTGGGTACAATTTACTCAAGCTCATCTGTTCTAGTTGGGTCAACTTTAACTGTAACTGGTGAAACTACAACTGCATCGTTGGTTACCCCAACCATTTCAAATGCAAGTGGTGTCACTATTTCCAATAATACAAATGTAACTGGTGACCTAACTGTTACTGGTGCAGTTATTCCAGGCTCTATCGATCTAGCAACAACTGATGTTAATGCTAAATCCATTACTACTACTGCTGGTGCAACTATTGGTGGTAACCTAACTGTTAATGGTACAGTAGATCTTACTACGGCTGATGTTACTGTCAAATCTTTAACTAGTACTGGTGCAATTGTTAGTAATGAATCCACAATTAGTAGTGTTCTACCTAAACTTCAAAGTACTGATGCAACTATTGCAACCCTTGGTTCAACAACTGCAAATATTACTAATTTGAATGTTACTGGTGCATCTACCGTAGCTGACGTAACTTCTTCAGGTAAAGTTAAAGCAGTTTCTGTAGAAACCCCAACAATTAGTAACGTTGATGGTGTATCTATTTCCAATAATACATCTATTACTGGTGACCTAACAGTTTCTGGTACAGTAACACCAGGTGCAATTGATTTGAGCACAACTGATGTAAGTGCAAAATCCATTACTACTACCGCTGGAGCAAATATTGGTGGAGATCTTGTTGTTTCTGGTACAGTTGATTTAAGTGGTGCTGATGTATCTGTTAAATCTCTAACAAGTACTGGTATTATTACAGTTAGTAGTGCAGAAGGTATCAACGTTCTACCTAAAGTTCAAAGTACTGAAGTTACAGTGTCTGCTCTAAATGCAACAAATGCAGTAGTTTCTGGTGATGTTTCAGCAGCAACAGCTTCAATCTCAGGTGCAATTACTGGTGGGTCAGCAACACTATCTGGTGTTGGAACTGCTCTAAATGTAACTAATAACGCAACTGTTGGTGGTGTACTTACTGTTGGTTCTATTACTTCAGCGGCAGAAAATGTATCCATTACTAAAAATACCGCGATTACTGGTAATTTAGCAGTATCTGGAACACTAACTGCGGGTGTTATTGATCTTAGCACAACTGATGTGTCTGTGAAGACATTAACTTCTCTAGGTGATGCAACCGTTCAAGGTAACTTAACTGTTGATGGTACTATTAACCTAAGTTCTGCAAACATCGTCGGTGTAACACTAGAAAGTACTGGCTCCACTACCGTAGGTACTGATTTGATACTAACTACTGGTAACATTACAGGTAGTCCATCTATTTCTGGTAACTTAGGTGTAACTGGCACTACAACTTTAACTGGTGCAACAACAGTTTCAAATACATTGAATACTGCTGGTAAACTAACAGTTAATGCTGGTGGAATTCAGGTTGTTGCTGGTGGTATACAAGTTGATTCTGGAACTATTACTGCTTCTAGTGCTAATATTTCTGGTAGCTCAACACTTAATAGTGCTACTGTAACCACTACACTAGGTGTTACTGGTGCAGCAAGTATGAATGGTGGTTTAACTGCTTCTACATTGGATGTAACAGGTGATAGTACAGTACAAAAACTAACTGTTAAGGGTGTATTTGTTCCTGAAGGTGGTTTGGACTTATCCGGTGCTGATCTTAGTGTGAATAGCGTAACTGCGGCAACCACATTAAGTGTTACTGGTGCTAGTACTCTAACTGGTGGTGTTTCCACTTCAACTGTTACTGCATCCGGTAAGGTAACCGCACAAGAACTAAGTACTGGTACATTGGATGTAACCACAAATGGAACTGTTGGTGGAACTTTAGGTGTAACTGGTAAAGCAACTGTTGGATCACTAGATTCAGGTGCAATCTCTGCAACATCTGGTACATTTAGTACTACACTAGATGTGACTGGTGCAGCGACCTTTGGTAATAATGTTAACATTACTGGTACATTAACCCCAGGTGCATTGGATTTAGCTAGTACTGATGTAGTTGCTAACAGTCTTTCTGTAGCTACAACTCTACATTCAGATGGCAACGCAACAATTGGTGGCACATTAGGCGTAACTGGTGCAGTATCTGCTCCATCAATCGCTCTTAATGGTGAAGGTGCTGCGTTAGCAGTTACTAATAACGCAACAATTGGTGGTACATTAGGTGTAACTGGTGCTACAACTTTAGGTTCTCTAACAACCTCTGGTGCAGTTAAAACTGGTGCTGATGTTATTATCGGTACTAAAATTGGCGATCAACCAGAGACAGTTCAGATTTTCCCTAATACTTACATTGCTGGCTCCTTGCGTGTAGATGGTGGTATCAACGCTGATATTGACGTTAGTGGTCAAACAATTGAACCTTATGCAGTTGTTGCGGCGGACACTATTAGTGCAGCGGGTAATATTACTTCTGGTGCAGAGTTGATTTCCAAATCAGCAACTATTGGTGATGTTGGTTCACAAAACAACAACTTAACAATCAATGGTAACGTAGTTAACAACGGTAACTTTACAGTAACTGGTCTACTTAACGCAACACTAAACCAAGCAAACTCTGACGTGGCTGTTAAATCATTAACTGCAACCAACAGTGTTGCTGCTGGTACTAGTATTACCGCAGGTACAAGTATTACTGCAACTGGTCTACTAAAAGGGAACACCCTTGAAGTAACTACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACAATGTCAAGTGGTGCTAACATTACTGGAACCGTTGGAATTACTTCTGGTAACCTAACTGTTGGTGGTGATATTTCTGCAACAGGTACTGCAACCCTAGCAGCAACTTCAGTAACTACCATTACTACTTCTGGTGCAGCAACACTTGCTAGTGCATCTGTTACTGGAGCAGCAACAATCGGTGGTACTTTAACTGTTACTGGTTTAATGACTGCAAATGGTAGTGTTGTTTTAGGTGACGCTGCTGCTGATACATTAACTGTCAATGCAACATCTTCTTTCAAAGAAAATGCAGTATTTGATAAAGATGTAACTGTAACTGGTCAATTAACAACTACTAATGCTGACCTAACTACTACAACAGTAACTACTAAAAAATATGATGTTATTCCTAATCAAGTAACTTCTTCTGTTATCGCACCAACTGGTACTTGGACCCCAGACGGTACTAGCAACGTATACTTTATCACTCTAGATCAAGATACCACTCTAGCACCAATCACTGGTCTAATCGGTGGTGGTAAAGCATCTTCAGTATACATTTATGTGAAACAAGATGCAACAGGTAATAGAAACTTTACTACTGATGGTACTTATGCGGTTGTTGATGGCACACTGAACAAAACTGCAAACTCTGTAACTATCTACCAAGTCATTTATGACGGTGTGAGTCCAGTAACAGATATGTTTATTGCACAACGTACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
dfe2ffdaeda48d8ada6dbc37e02023c54476cbf0f52c17c5ffd23d229edbb924
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5171
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50