Protein
View in Explore- Genbank accession
- XHB26124.1 [GenBank]
- Protein name
- endopeptidase
- RBP type
-
TFTFTF
- Protein sequence
-
MTTFLDHKDNEFEAQAVVKTTNAVNGERSLSGTIYTNEEVLNKVDKGWKLEFDDEYYKIIYAKPTDTGNKIQVEFDAVHQFFYDFDKSSLHKQLNDGSHTFQAYLNFIFNGSGYTYSLEVVVKSFEKQSFGYKSRLDLFNDIIKSAGVEFFVRGKVVRILQKTGTDLSTIVRKNFNMNEIIIEKKINDFITYQKGFGAWTDQEDHSKGRLEVEYESPLAKEYGRIEGEPVVDERYTNADNLKSVLKQNVDSSYNIAVKIDIEDLTKAGYQYTQPIAGDYIMAINETLGFKEKIRIVSFESEYDVTGQLINHKVICNDIGTIKKQTVAVSQLSSKINNNQEILDNAVFKANQALASADGKNTNYYGTEMPVDDPKGTLRKGDLLFLTVGDTTRMYFWNGAEWIINSFSDDIDFVKKEITNKIIEVNAAMKLADEQLTEKYNAIVAKNVSQDELINQAKNLSDSAKKDATEALTNLISESKKLTDKMSALSKTEVEHYSTTNLQLTQLDGTVKGLQTSYEALLKKDGDITQTLANYKQTIDQNSTSITANKKTVDGTLSSLQTQVTQTANEITTRLSQTNIEALITSKSAVIADNKVKETADSFSREITRVNNTIDNLKIGTVNLLSGTKNWTKNWFNRNNWQSDDDNLTIGNFSLTVLKRKAMWSGISQLYAVKSGENYVFSAYAKSSMDNDVVNLYLLPNGQSPQAKISISFKSITLNTDWQRIVIKFNVTSDGYILPRFERFNENGWLYIAGYQLEHGNVASDYSEAPADQEDKMTVEFNKINDTVNSHSQLIGKQNESLTATIQKVDNIQSTVSNVDGRLSRVTQTADGIVTTVSQLDNNILPGTKNFTGWQIEGAVLEDVTQSSYPFVFKKWISGNKVSPLIEYDVKKNQEYTFTAYIAREQAGNLYFYLYDLWNHHITSATPRETIIRDVNSSVIRFRITFIPNRDGKIRPRFAMLASDQGWFMVGGFMLSKGTADLPWSESKQDIKDNVTAINTIVAQTANSWAIKNLTSNGTVLSQLNLTDGNVKLEGKLIHLSGQSIIDNGIITNAMIKDLTADKITAGTIDANRINVINLDASNITSGRMSADLIRSGVLISQNGAMLTDLNTGQIEFYTDNPAIKRITAGYPNQFVKFATGNVEGKGAAGVTVIGSNRWGSESSNDGGFVGIRAWNGKDIDTLDLVGDSIHLASSAYTNADGWEIITLPNQLSIDARNINHRVTSKVKVGDIWLWKNTSTYVSMKDTINMIIDNLQLLHNNKTTEKGYSYTIPGKI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1275 AA molecular weight: 142455,07710 Da isoelectric point: 5,56507 aromaticity: 0,09020 hydropathy: -0,40549
Domains
Domains [InterPro]
DC_1353
STR
1–727
STR
1–727
G3DSA:3.55.50.40
STR
79–164
STR
79–164
IPR010572
ENZ
83–301
ENZ
83–301
1
1275
Architecture
STR 1-757 | RBD 781-1273 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Streptococcus phage phiGBSVK-C_GBSInt4 [NCBI] |
3345062 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Streptococcus agalactiae [NCBI] |
1311 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XHB26124.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP758848
[NCBI]
CDS location
range 32174 -> 36001
strand +
strand +
CDS
TTGACAACTTTTTTAGATCATAAAGATAATGAGTTTGAAGCTCAAGCTGTTGTTAAAACAACTAATGCAGTTAACGGAGAAAGGTCTTTATCAGGAACAATTTATACTAACGAAGAGGTACTAAACAAGGTCGATAAAGGTTGGAAACTTGAGTTTGATGATGAGTATTACAAGATTATTTATGCTAAACCTACTGATACTGGTAACAAAATTCAAGTTGAATTTGATGCAGTTCATCAATTTTTTTATGATTTTGATAAATCATCACTACATAAGCAATTAAATGATGGTTCACATACTTTCCAAGCATATTTGAACTTTATTTTTAATGGCAGCGGGTATACTTACAGTTTAGAAGTAGTTGTCAAATCTTTCGAAAAGCAATCGTTTGGATATAAATCGCGACTTGATTTATTTAATGACATCATTAAGAGTGCAGGAGTTGAATTTTTTGTTCGTGGCAAGGTTGTTCGAATTCTACAAAAAACAGGAACAGATTTATCAACAATCGTACGTAAAAATTTCAATATGAATGAAATCATAATTGAAAAGAAAATCAATGATTTTATTACATATCAGAAGGGTTTTGGAGCGTGGACTGACCAAGAGGATCATTCCAAAGGAAGGCTCGAAGTAGAATATGAAAGTCCACTTGCAAAGGAATATGGACGAATTGAGGGTGAGCCTGTTGTTGATGAGCGGTACACTAACGCTGACAATTTAAAATCAGTACTAAAACAAAATGTAGATTCGTCTTACAATATCGCTGTAAAAATTGACATTGAAGATCTTACAAAAGCAGGTTATCAGTACACTCAACCTATTGCCGGTGATTATATTATGGCTATCAATGAGACACTAGGATTTAAGGAAAAAATCCGAATAGTATCGTTTGAAAGTGAGTATGATGTAACAGGTCAGCTGATTAACCATAAAGTCATTTGTAACGATATTGGTACAATCAAAAAACAAACTGTAGCTGTTAGCCAATTATCAAGTAAGATTAATAATAACCAAGAAATACTAGATAATGCAGTATTTAAAGCAAATCAAGCACTAGCATCAGCTGATGGTAAAAACACTAACTACTATGGTACGGAGATGCCAGTAGATGATCCAAAAGGCACGCTAAGAAAGGGTGATTTGCTTTTTTTAACTGTTGGCGATACTACCAGAATGTATTTCTGGAATGGTGCTGAATGGATTATCAATTCTTTTAGCGACGATATTGATTTTGTAAAGAAAGAAATTACTAATAAAATCATAGAGGTTAATGCAGCAATGAAACTTGCTGATGAACAGTTAACTGAAAAATATAATGCAATTGTTGCTAAAAATGTTAGCCAAGACGAATTAATTAATCAAGCAAAGAATTTGTCTGATTCTGCCAAAAAAGATGCTACAGAAGCATTGACAAACCTTATTAGTGAATCTAAAAAACTGACGGATAAAATGTCTGCGTTATCTAAAACAGAAGTTGAGCATTATTCAACAACTAATCTGCAACTGACACAACTTGATGGTACAGTCAAAGGATTACAAACTAGCTACGAGGCATTGTTAAAAAAAGATGGAGATATCACTCAAACACTCGCTAATTATAAGCAGACGATTGATCAAAATAGTACAAGTATTACTGCTAACAAAAAGACTGTTGATGGTACGCTTAGCAGTCTACAGACCCAAGTCACACAAACGGCTAATGAAATTACAACGAGATTATCTCAAACAAATATTGAAGCGTTGATTACAAGTAAGTCTGCTGTTATCGCTGATAATAAAGTCAAGGAAACTGCAGATAGTTTTAGCAGAGAAATAACTCGTGTTAATAATACTATTGATAATTTAAAGATAGGTACAGTTAATCTACTATCTGGTACTAAAAATTGGACTAAAAATTGGTTTAATCGTAATAACTGGCAATCTGATGACGATAACTTGACTATTGGTAATTTTAGCTTAACAGTGCTAAAGCGCAAAGCAATGTGGAGTGGTATATCACAATTGTATGCTGTAAAAAGCGGAGAGAATTACGTTTTTAGTGCATACGCTAAATCGAGCATGGATAATGACGTTGTGAATTTATATTTATTACCAAACGGTCAATCGCCGCAAGCAAAGATAAGTATTAGTTTCAAGTCAATCACTCTAAACACGGATTGGCAACGTATCGTTATTAAATTTAATGTAACTTCTGATGGCTATATCTTACCGCGTTTTGAACGTTTTAACGAAAACGGATGGTTGTATATTGCAGGCTATCAGCTAGAACATGGAAACGTTGCAAGTGACTATTCAGAGGCACCAGCCGATCAAGAAGACAAAATGACTGTTGAATTTAATAAAATCAACGATACAGTTAACAGCCATAGTCAATTGATTGGTAAACAGAACGAGAGTCTGACGGCTACAATACAAAAAGTTGATAATATACAATCAACAGTATCTAATGTTGATGGACGTTTGTCACGAGTTACACAAACTGCCGACGGTATAGTCACAACAGTTAGTCAGCTTGATAATAATATTTTACCTGGCACAAAAAATTTTACAGGATGGCAAATAGAAGGTGCAGTACTAGAAGATGTAACACAATCATCTTATCCATTTGTCTTTAAAAAATGGATAAGCGGCAACAAGGTATCGCCCTTAATCGAATATGATGTTAAAAAAAATCAAGAGTACACATTTACTGCATACATTGCTAGAGAACAAGCAGGTAATCTATATTTCTACTTGTACGATCTTTGGAATCATCATATCACAAGTGCAACCCCTCGCGAAACCATTATAAGAGACGTTAATTCTAGTGTAATACGATTTAGAATAACATTTATTCCAAATAGAGACGGTAAAATCAGACCACGGTTCGCAATGTTGGCCAGTGATCAAGGCTGGTTTATGGTTGGTGGTTTTATGTTATCTAAAGGTACCGCTGATCTACCCTGGTCTGAATCCAAGCAAGATATCAAAGATAATGTTACTGCGATTAATACAATAGTCGCACAAACAGCGAACAGTTGGGCTATTAAAAATTTGACTTCTAACGGTACTGTATTGAGTCAGCTTAATTTGACTGATGGTAACGTAAAACTGGAAGGTAAGTTAATACATTTGTCAGGTCAATCTATTATTGATAATGGCATTATTACTAATGCGATGATAAAAGATTTAACTGCAGATAAGATTACAGCAGGAACAATTGATGCTAATCGTATAAATGTCATTAATTTAGATGCTAGTAATATTACCAGTGGAAGAATGTCAGCGGACCTGATACGTAGCGGCGTTTTAATATCGCAAAACGGTGCAATGTTAACCGATCTTAATACAGGACAAATTGAATTTTACACAGATAATCCAGCTATCAAACGTATTACTGCAGGTTATCCTAACCAATTCGTTAAATTTGCAACAGGTAATGTTGAAGGAAAGGGCGCGGCTGGCGTAACGGTTATAGGTTCTAATCGATGGGGAAGTGAATCGTCAAACGACGGTGGCTTCGTTGGTATTCGCGCTTGGAATGGTAAAGACATCGATACTCTTGATTTAGTTGGCGATAGTATTCACTTAGCAAGCTCTGCGTACACTAACGCTGATGGTTGGGAAATCATTACTTTGCCAAATCAGCTATCAATAGATGCACGTAACATAAATCATCGTGTAACGTCTAAGGTAAAAGTAGGAGATATTTGGCTATGGAAAAATACATCAACTTATGTAAGCATGAAAGATACAATTAATATGATTATTGATAACTTGCAGCTACTACACAATAATAAAACCACTGAAAAAGGCTACAGTTATACTATTCCAGGAAAGATTTAG
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
8e381b9fe45115c62ee6a3b79ace4b45843045c52fa03867688d856699eeffbf
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50