Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAH6635130.1 [GenBank]
- Protein name
- putative tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNAENDARYARLEVLNTFKSRQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQDPSGTNKWYVGFNTSNVLGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDWSNLDDRYFTQTLANQRFAQLAGNNTFNGTNTFNQLSVFKKDGEAIRLQNANAAQPLYIKAIDSTGVNRWYIGNSNEGDNVALENYKTSGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTLAKINAKNTFSQGQIIKADGEGIRLQGVNDTGGLFLQGYTSDGAKKWFMGTNASGNFTIREMVLGTELSLRENYIQFNKNVTITGQVQPSDWTNLDKRYYTGSASNARYMYAGKTGEGDNDAAIAWDAKTGLYNVKTGATSSNLLLQLYQGSESSTPSAQLRFKWANGGMWYRTSRDGDGFEKSWAMVYTTAQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGNHSHSISWIGQNSQHYSGGGGGYIGTGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 777 AA molecular weight: 83332,94030 Da isoelectric point: 8,79840 aromaticity: 0,08752 hydropathy: -0,45766
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_Eco_Tribble [NCBI] |
2898838 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAH6635130.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OX016465
[NCBI]
CDS location
range 41385 -> 43718
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTCCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCGTCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGCTGAGAATGATGCTAGATATGCTAGATTAGAAGTACTAAATACTTTTAAGTCTAGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTGTTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGCCCTTCTCTCTATGTTAGAGGTCAAGACCCATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAATACTTCAAATGTTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAGGTTAAACCTTCAGACTGGTCTAACCTAGATGATAGATACTTTACCCAAACATTGGCTAATCAAAGATTTGCACAGTTGGCTGGTAATAACACTTTTAACGGCACTAATACATTCAACCAACTGAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGCAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAAGCAATTGATAGCACAGGTGTCAACAGATGGTACATTGGTAATAGTAACGAAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTAGTGGCAAGATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGCACTCTTGCAAAAATTAATGCTAAGAATACTTTTTCTCAAGGTCAGATTATTAAGGCTGATGGAGAGGGTATTAGGCTTCAAGGGGTAAATGATACTGGTGGTTTGTTCTTGCAAGGTTATACTTCTGATGGTGCTAAAAAGTGGTTTATGGGTACTAATGCTTCAGGAAACTTTACTATCAGGGAGATGGTGTTAGGTACTGAACTGTCTCTTAGAGAGAACTATATCCAGTTTAATAAGAATGTAACAATCACTGGGCAGGTTCAACCATCAGACTGGACTAACCTAGATAAAAGGTACTATACCGGTTCAGCATCAAACGCCAGATACATGTATGCAGGAAAAACTGGTGAAGGTGATAATGATGCTGCTATTGCTTGGGATGCTAAGACAGGGCTGTATAATGTCAAGACTGGAGCTACATCATCAAATCTTTTACTTCAGTTATATCAGGGGTCTGAGTCATCTACACCGTCTGCGCAGCTAAGATTTAAATGGGCGAATGGTGGTATGTGGTATAGGACATCAAGAGATGGTGATGGCTTTGAGAAAAGTTGGGCTATGGTGTACACAACTGCACAGAAGCCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAATAAAATCTACCCTGTTGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAACGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTTAACAATGGTGTAGGTAGAACAATCAGGATTGCAGCAGCTAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACACACAGTTTTTCTGCTACTACTTCGTCTTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAGCCACTCTATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCACAGCACTATTCCGGTGGTGGTGGTGGTTACATTGGTACAGGGCCGGGTTACACCGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTGAGGACTGCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
6fd66206fdbc7111b602c72f1db4daadb1bddb32324658c4c0e4df37bafe68b5
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50