Protein

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Genbank accession
AGM46944.1 [GenBank]
Protein name
tail protein Pb4
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,79
Seq2Symm
C3 confidence 0,927 truncated
C3 0,927
C1 0,686
I 0,001
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MSIKTTPNVDVTTTNTDIEKSANDLSVEGSSRVYIEPRSGSVTGSKKEYSIVGDGLYAGINSEEAPQWMIDLIDSVVDQAVAKGLLDYNTLIQNVRDGIDALDVAKNTYVKSINFSSLVDGILGSKLETLNATYDDKYATIVDLDQVAATSEYSLTQRISDLQAEFNDEINSRITTIQLAYTSADQANASSIEALSSRLEDQDKRVAGNSDALSGLQTFVGVTDYNNPNGTGMLSRIDVLERQNDGVILYTTGTYDVMINVEDDQNPDDDKIDATKEPYASWIAVDNANGNENERAAHIGDVYIQYDPESGNYVKSYKFIRTAPDQTAPFSTDPQGYTWSLITDTDVQSTYVAALKASDLADQKRRVFVAQPYAPYDVGDLWVDNSSIPQVVKVSTVNRTNIFNEADWVLADETAKEFIENTYEPEAARVRNQIDGKIEYYFYESYSDIPGASNEEEALASIKSGWNTQEKRDDAHGNIVYFKDSRKAYWYQATIHDWVVVTDTSIYQALQDAAAAKGAADGKVSQFYAWGGPNSPANYVLNPEAPVTEQEVISASKFLYWFKPDDKKLYYKPVNSWVLVPVGSSETGNSYIAEGDLVTVFDPATGDTTTYSFNGATWDVTGPEGIISKSRFFVDLATDVRGPTGLVAQGFSNLEATSEAYADSVGAYVENRFAYDSAIMINGEYYKSGFGLTATGDTAGDGASEDTAFDSEFWVNAKRFVLKNPDYPSIEARFTVTESGIQLGVENTEATRNEPKGPYNSNTTYVRGDIVTFNRSSYLAVMTVKGVTPDDSKPQWQLLAEKGSTPLLFDYEGNDSWPDNTNEAAAKTYDFTSSFAGNALIRVFAYDAEGTANGGVRMKFNDGAELPFYRTRADSTEEWYEFSVNNLVTGENTLKFWATSADGGKIRKIEVAFVGAEGLAGGFTDFLFTRSTGTPQNPGGNITWYTDVTDVPDGAGDLWSIKKEVNAGGSKTTYTDKRIIEAPIIRELVLYSKPTTGSRAAPTGSKYNFKTDTLAVNDNNWSRSVPGLTTNNHKIYVSTALVTGNATQTNVSVNWSTPTIYAQRQDGVSADVYKYVYKDSLTKPSKPTGNSPTGWVTEIPALINNTLYQSIGKQTNGTGNFVWQNPTQITARDGLSALLFEWQGSQSWPVNTTIDNAYEWKFNSAFAGNVFIRINANDAEGGVRIGFNGEEITAISGPDNATRYYEVSSDTLKVGENTISVWASTGDGGSVKDIKVAFVGARGRQGVTGAYTDFLFTRSVSEPKAPDQSGAPTWYTSASASGLKGAGNLWTIKKIVSAGGETTTYEGKRQLEADLVREIVLYSIATSGTVNAPTTHFKYNFATDSLVGSHGHWSTSFPSSLPNGKKVYRTTALATGNITQTNVSLSGKWSTPSVYAYRKDGVNVTVTDNNNGTYTVTGANGSIVVKDGKSPGAPTITNNNDGTFTIRNDEGDTAIISAGRQITAQGSHYNNPSSNSYISITGYDKFNVNSRGHRLIVLDPDNGNIDYNQQYDTYGSGVVSLSNRINGLANGKIVILVSEDACRCSSILREALRGCGSPLDAVWGPERIAHAFIGTKGGPDKSAYEVVTAVVSEYAYTTATYTDNGVLPKGYTPVKGIDYFDGANGTYVSFVYRVSSSAPGKPSGGSFNGTNESVPSGWTDRPTAGINDTEYVSTTRYTATTDSNGNVTWSNNGWSTPALFYRKGESGSSADVYREVFLYRNATSTPGGKPSNTQGFNASTGGASNYSSWTTSPSTPTSKNKTYRINITLKQTNGSGNWKAVDSNWNGPLPFTGVDGENGNPGKDADSYKEIFLYANGASAPSLPGVSGSFYASSGNARDNDGWYATASNPGSNEYTYRTSLTLIQKESKGNWTNSDSSWNTAVRMTGDAGKDGKPGDDGKAGKRGAGIYYVGTSDGVWSDAIANGAVPDDTPVPGDIVNIFKISDPTVGETKKYNGSSWVGYALVINGNLLAKGSIDGEAIQANTRIVSPRIDLIGNNFMKIELASGFGPDNLWYWYGPKILNSSGVPILSSLKKSNAIEWKDTSGNSYFGGTLSAGTLTNAGRTTLLTKNPSVTVGPFTTNGNKKVIAYSYSYSSSGIQAIDPGASAKVSCTIKLQRQIGSGSWQTLQTKTLEEGIERNRVSRGYYVREDLNGSWTYTDNSSSTSDFTYRVVVSNAVRHTENPINSYHKTQVVSFNSSEE
Physico‐chemical
properties
protein length:2201 AA
molecular weight: 237982,83010 Da
isoelectric point:4,84089
aromaticity:0,10541
hydropathy:-0,47701

Taxonomy

Phage
Alteromonas phage vB_AmaP_AD45-P3 [NCBI] · taxon 1300006
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host
Alteromonas macleodii str. 'Balearic Sea AD45' [NCBI] · taxon 1004787
Bacteria Proteobacteria Gammaproteobacteria Alteromonadales Alteromonadaceae Alteromonas

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AGM46944.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF005318 [NCBI]
CDS location
range 5296 -> 11901
strand -
CDS
ATGTCGATTAAAACTACCCCTAACGTAGATGTAACCACTACTAATACAGATATAGAAAAAAGCGCTAACGACCTGTCTGTAGAAGGCTCTAGCAGAGTATACATTGAGCCTCGTAGTGGGTCTGTTACAGGAAGCAAAAAAGAATATTCTATTGTAGGTGACGGCCTTTATGCTGGGATTAACAGCGAAGAAGCGCCTCAATGGATGATCGATCTGATTGACAGTGTTGTCGACCAAGCGGTAGCTAAAGGGCTGCTAGATTACAACACGCTCATCCAAAACGTACGGGACGGTATTGATGCGCTTGACGTAGCAAAAAACACATACGTTAAGTCAATAAACTTCTCCAGTCTTGTAGACGGTATTCTCGGATCTAAACTAGAGACCCTAAACGCTACTTACGATGACAAGTACGCAACTATTGTAGACCTAGATCAAGTAGCAGCTACATCAGAATACTCTTTGACACAGCGCATTAGCGACTTACAGGCAGAGTTTAACGACGAGATTAACAGCCGTATTACTACTATACAGCTAGCGTATACATCTGCAGACCAAGCTAATGCATCAAGTATTGAAGCGTTATCTAGTCGCTTAGAAGACCAAGACAAACGTGTTGCGGGTAACTCAGATGCTCTCAGCGGCTTACAAACTTTTGTAGGAGTTACTGACTATAATAACCCTAACGGTACGGGCATGCTTTCTCGTATCGATGTACTAGAACGTCAGAACGACGGTGTAATACTTTACACTACCGGCACATACGACGTCATGATAAACGTTGAAGACGATCAGAACCCTGACGACGATAAAATAGACGCTACCAAAGAGCCCTACGCTAGCTGGATTGCAGTAGACAACGCTAACGGCAACGAAAACGAACGTGCTGCTCACATCGGTGACGTTTACATTCAATATGACCCTGAATCAGGCAACTACGTTAAGTCTTACAAGTTTATTCGTACAGCTCCTGACCAAACAGCTCCGTTCTCTACCGACCCTCAGGGCTACACATGGTCATTGATAACAGATACTGACGTACAGTCTACTTACGTAGCTGCACTAAAAGCCTCTGATCTAGCAGATCAAAAACGGAGAGTTTTTGTTGCTCAGCCTTATGCGCCTTACGATGTAGGCGACTTGTGGGTAGACAACAGCAGCATACCTCAGGTTGTTAAAGTATCGACAGTCAACAGAACTAATATTTTCAACGAAGCTGACTGGGTTTTAGCTGACGAAACAGCTAAAGAGTTCATCGAGAACACTTATGAGCCAGAAGCTGCGCGTGTTAGAAACCAGATAGACGGTAAAATTGAATACTATTTCTATGAAAGCTATTCAGACATTCCGGGAGCTAGTAACGAAGAAGAGGCACTAGCTTCAATAAAGAGCGGGTGGAACACACAAGAAAAGCGTGATGACGCTCACGGCAACATTGTGTACTTCAAAGACAGCCGTAAGGCTTACTGGTATCAGGCTACTATTCATGACTGGGTAGTAGTGACCGATACTTCTATATACCAAGCGTTGCAAGATGCAGCTGCAGCTAAAGGTGCGGCAGACGGTAAAGTATCCCAGTTTTACGCTTGGGGTGGACCTAACAGCCCTGCTAACTATGTACTTAACCCGGAAGCTCCTGTAACAGAACAAGAAGTTATATCTGCGTCTAAATTTTTGTACTGGTTTAAGCCTGACGATAAAAAGCTTTATTACAAGCCTGTAAATTCGTGGGTACTTGTGCCTGTTGGATCTTCCGAAACAGGTAATAGCTACATCGCCGAAGGCGACTTGGTTACGGTGTTCGATCCTGCTACAGGCGATACTACTACGTATTCTTTTAACGGCGCTACGTGGGACGTTACAGGCCCAGAAGGAATAATCTCTAAAAGCAGATTTTTTGTAGACCTCGCAACTGATGTTAGAGGGCCCACAGGATTAGTAGCTCAAGGCTTTAGTAATCTAGAAGCTACTAGCGAGGCTTATGCTGACAGTGTTGGCGCCTATGTAGAAAATCGTTTTGCGTACGATAGCGCTATTATGATTAATGGTGAGTACTACAAATCTGGTTTTGGTCTTACGGCGACAGGCGACACTGCAGGGGACGGTGCGTCTGAGGATACTGCGTTTGATAGCGAGTTTTGGGTTAATGCTAAACGCTTTGTGCTCAAGAACCCTGATTATCCGTCAATAGAAGCGCGTTTTACTGTCACAGAGTCTGGTATCCAACTTGGGGTCGAAAACACAGAAGCTACCCGTAACGAGCCTAAGGGCCCTTACAACAGCAACACTACTTATGTCCGTGGAGATATTGTAACTTTTAACAGATCTAGTTACCTAGCTGTGATGACAGTTAAAGGTGTTACTCCTGATGACAGCAAACCGCAATGGCAGTTACTAGCTGAAAAAGGTAGTACACCTTTACTGTTTGACTACGAAGGGAACGATTCGTGGCCAGATAACACTAACGAGGCGGCCGCAAAAACTTATGACTTTACGTCTTCTTTTGCAGGAAATGCTTTGATACGTGTGTTTGCTTACGACGCTGAAGGTACTGCTAACGGTGGCGTTCGTATGAAGTTCAATGACGGTGCCGAACTACCATTTTACAGAACTAGAGCAGACAGTACCGAAGAATGGTACGAGTTCAGTGTAAACAACCTAGTTACTGGAGAAAATACCCTTAAGTTTTGGGCTACTAGCGCTGACGGTGGTAAAATCCGAAAAATAGAAGTTGCTTTTGTAGGTGCTGAAGGTTTAGCTGGTGGGTTTACAGACTTTCTGTTTACCCGTAGCACAGGTACACCGCAAAACCCGGGCGGCAACATTACTTGGTATACCGATGTAACAGACGTGCCTGACGGTGCTGGTGACTTGTGGTCTATCAAGAAAGAAGTAAATGCTGGAGGTAGTAAGACTACTTACACCGACAAACGTATTATTGAAGCGCCTATTATCAGAGAGCTGGTGCTGTACAGCAAGCCTACTACAGGAAGTCGTGCAGCTCCGACAGGAAGTAAGTACAACTTCAAAACTGATACACTAGCTGTAAACGATAACAACTGGAGCCGCTCAGTACCAGGCCTGACTACTAACAACCATAAGATTTACGTTAGTACGGCACTAGTTACCGGTAATGCTACACAAACAAATGTGTCTGTTAACTGGAGCACTCCGACTATATATGCGCAGCGTCAAGACGGCGTAAGCGCAGACGTTTACAAGTACGTATACAAAGACAGTTTAACTAAACCTAGCAAGCCTACAGGTAACAGCCCTACCGGCTGGGTTACTGAAATACCTGCGTTAATCAACAATACGCTGTACCAGTCGATAGGCAAGCAGACTAACGGTACTGGTAATTTTGTATGGCAAAACCCTACGCAAATTACAGCCCGAGACGGTCTTAGCGCGCTTTTATTTGAGTGGCAGGGTAGTCAGTCATGGCCTGTAAATACAACAATTGATAATGCTTACGAGTGGAAATTTAACTCTGCATTTGCCGGCAATGTGTTTATTCGTATAAACGCTAATGACGCAGAAGGCGGAGTAAGAATAGGGTTTAACGGCGAAGAGATTACTGCTATATCTGGCCCTGACAATGCAACTAGGTATTACGAAGTAAGCTCTGATACGCTAAAAGTAGGCGAAAATACTATTTCAGTATGGGCGTCTACTGGCGACGGGGGAAGCGTAAAAGATATTAAAGTCGCTTTTGTCGGTGCCCGAGGTCGTCAAGGCGTGACAGGCGCTTATACAGACTTTTTATTTACCCGAAGCGTTTCTGAGCCTAAGGCTCCTGACCAGTCGGGTGCCCCTACTTGGTACACCAGTGCATCAGCTAGTGGTTTAAAGGGTGCGGGTAACCTATGGACTATTAAAAAGATAGTCAGCGCGGGTGGAGAAACTACTACGTACGAAGGGAAAAGACAGCTAGAAGCTGACCTTGTTCGCGAGATAGTTTTGTACAGTATTGCCACCAGCGGCACTGTTAATGCTCCTACTACTCACTTTAAATACAACTTTGCCACAGATAGTCTTGTAGGAAGTCACGGACACTGGTCCACTAGTTTTCCTAGCAGCCTACCTAACGGCAAAAAAGTGTACCGTACAACCGCTTTGGCTACAGGCAACATTACGCAAACTAATGTGTCGTTGTCAGGCAAATGGTCTACGCCTAGCGTGTACGCTTACAGAAAAGACGGCGTAAATGTGACGGTTACTGACAACAATAACGGAACTTATACTGTTACAGGCGCGAACGGTTCGATTGTTGTTAAAGACGGTAAAAGCCCCGGTGCTCCTACTATCACTAATAATAACGATGGTACGTTTACTATTCGTAACGACGAAGGTGATACGGCTATTATTAGCGCAGGTCGACAGATCACTGCCCAAGGAAGTCATTACAATAACCCGTCGTCGAACTCGTATATTAGTATTACTGGGTACGATAAGTTCAACGTGAATAGTCGCGGCCACCGCTTGATTGTACTAGATCCCGATAACGGGAACATAGATTACAACCAACAGTATGACACTTACGGCAGTGGTGTAGTTTCGCTCAGTAACCGTATTAACGGTCTGGCCAACGGTAAGATTGTAATATTAGTAAGTGAAGATGCTTGCCGCTGCAGTTCTATTCTGCGTGAGGCTTTGAGAGGTTGTGGATCCCCACTAGATGCTGTATGGGGCCCTGAAAGAATAGCGCATGCCTTTATCGGAACTAAAGGAGGCCCTGACAAGTCTGCTTATGAAGTTGTGACCGCGGTAGTTAGTGAGTACGCTTATACCACAGCAACGTATACAGATAATGGTGTACTGCCTAAAGGATACACCCCTGTAAAAGGTATAGACTACTTCGACGGCGCCAACGGTACATACGTAAGCTTTGTTTACCGTGTAAGCTCAAGCGCTCCTGGAAAACCTTCTGGCGGCAGCTTCAACGGAACTAACGAAAGTGTACCTTCTGGTTGGACTGACAGACCTACTGCAGGTATCAA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Genome Context

Tertiary structure

No tertiary structures available.