Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A127KLS5 [UniProt]
- Protein name
- Baseplate wedge initiator
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MNINKVSSAVPTQLPGFITSEYELFSKFVEYYYKSQEKTGLGQNILNNFLEYLDIDQLDVGILDGSTILVEDITAEDATISVESVEEFLSENGTILIGDEVIFYEKSISSPNVALSPGISYEQVKLKQIELQSPLSSFDGITQGFSLLSQDRPVSPPSANHLLVQVYGEYLVPGVDFTVSGNTITFTQAPRTALTSDSADQTSIKFYSGFLENTIFSLDDISPSFGDGVSKFRITRDGSAFVPEIDEYVIAYYDNQLLIPKTDYVFDKNLLIFRTFVPLKGRRLDLFYVDAPIPSFGSGSSAYARVNNNGEVSSIVIKDVGSGYRFANPPAITIDSENGEGAAAVALINGVKNLQLLSGGIGYSDTNPPIVNIESPTQDGSQVASITATVVNGSVSELTLVNSGSGYTSVPRITFQQPGGAVVASPTIVNGSISGTITVTSGGVGYSTSPEIYIDEPTGENGIKASLRANLNPQGEVVSVSVLNPGQGYETVPRIKIIEPVGAQVLETQVDSDGRVVNIEILDGGSGYNDVPSVYIIDDRVSNTGQYLGGSGAKAAASIFNGRITDINITEFGSGYSQEFPPKVVIQSPPQATASVDIGINEITGFEVLESGTGYSKAQFIGCARAASGITGYTEDGNVIFSKNTTAAAATENTTVQCLDAVFVKRILDKYTEQFLPDVPRLDYKQIDVRTAIKNIKSFYSTKGTTFSIEYLFKLLYGETVNVSYPKDQIIKPSAATWSINTILRATLVSGDPRNIQDALITQDADIADINVKDASALVENYIAIETANTTIYELVLSEETIQGNFVVPYKTKLGEPLNETTGIITVDSTIGWPERNGEFVLGGQEVVQYKEKSLNQFIECTRGATGTIGGVGNSRPWDSATEVTSNFRVYLNKGTSQEVVMNIVGIVDAQQTSLTDTGSYYLPGDKLTVAKLGGTGEQPLLTTWLYNVKKLVEVESITFGGINDRFATVTCSNNHGLLVGDEVTVYGANPILYNGTFTVTSRDSDIVFQYQLPQTALVEPQGNILVSVNLNKGKSTDEAINNSISVYTTNIQNSFFNDNFVYVASTGIPNYNVGPFLGSALLPGNQRKLNRFPQSPVTISTKNIINPGPIGTWINGVSIWSYKSTNTKTFGPIVDVSIVNAGSDYDAASPPNITISSTAGGSGATAEVVVNGSVTDIQVEEGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGSVSNILITNGGTGYTSQPTITVVGGGGQGATATASVRGPIKQVNLLTQGTSYTVNPDVEISSGEGAVAQAIVNNGRIISIAIISAGNGYTTAPEVQIQGEGFGAKARAIIDREGENAGKVTGVEILNRGIGYTQGTTVINLTSVGQDAKFVANVFEWTYNLQESATFDQSQGSVFEGFNTQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLAINTDGSIREQETQLEHSPIIGWAFDGTPIYGPYGYEDPTDQSSSIVRVSSSYKLKSNLVFNEITNPNPYREEGSLLSVDPAGTFIEDYEYSFALGDLDQYNGRFCKTPQYPNGRYCYFVTIDNTENGNPIFPYILGPSFNSVVDSWNLVDSSIQQNIPRGVVRFRDPYQNVDIDVERIPNASTNSLTLENGDLLLFDVEDENRDGVISQDEIDDPDEVLEEPPLQIFDYFPKVRTESKVDIEVETISRFENASITDFVIENAGQNYQVDDKLIFDNSGTGGSGASARVSRINGENIVSYGYEYLSGQNYGIIQTQVPHNLVEGDTVFVNYEENIEETNKTFVVRQFKGIEEIEINQTGSGYNEDIPPTIIIDGDGESAELNAVVDSVGAIKTVNILNSGNGYTENPRVILSHPQVFKKADYFVTKIDNEEYVKVNDTFVNSNKESYICGKTLDELGNTVAFVAKLSAGGVKEWEKSLELTSGQNYSEFQKVYVDGNTIWVVGINKPNSVILDTYNPDIIVAKYTQSNDGLSATLVFQKAYAGISGGTRSDNITKIIPFSDDKVIISGYTDTNSANPYDGFIAVLDSVGTFSIKRKISSTNLSEKVVDVLLDSNGTLFFVMETATSKNAADINFVLGKATVNISSISISWVKEIKNIAYSFLNTSFTIDEFDEIYVASTLQLKSDDATRDSFWVGKFNTDGDSIWNYRYLAPGRDINLVQNTELDIFNQLNVAFTRTNNTNDKKTVDTVKINYKGDIVNHVTTDFTDDNVEGITAHAMTVDVSGDVYVFGQTSWNRNEAIYTFDSDLSDVTEHHTLSTIGLSGSTVRENSILKIYGFQTGQSTIWENSAAKIAGTSLGNALSEDFTVDFLIYKDDANGYAETLVSAQQTLFAIGDATDATGGLWLYYVTDGSANDGRIELVVANNSSTISGSTPASGTNSNLFANDTWQLISLKKEGNNFKVYVNGIEQISGNVSNTTLGSKDIHIGNIPGFAGAGGFIENNQGQFFLDSFKIRNRAVAVTAPSDFGDPLALPAASALALNYVWTDTDWFDQQHARYDYIDYTGFGFKVDKNADADRLGTFDSNTTTNYGFTRTSVPAVTGSALTITSTGYALGEAGLQALDYNDATTTMSEGTVTLTYNRDIWSSRTSTVPSPGSQKLRVTANVRDRYYFKTFNVVKIDNIQELTINQNFVFTVGTKLVLNNGLSFVNSGYITSVDYQNNKVFVAINNNAWDNDIDVYELSTEQFNEQDTYGVVGPVPNDVNEIIQTFAEVDNTTPGTFDIDLANYDAPEEVGGTNNLDEYAKFKTYSELDYSIRIDEVGGSSPYSVGSVVTLDSGDFSWNSAYSTLQIINLTGVLKITLVTRLQKILQVTAVSNSDTVYVISDTLHYLRTGEQLYIDGNPSQTVGLTVYDEYDGSFPVNEIISPVEFTYKLPQTAVTLPSTNPSSVTVFVKSPTLKMYYGHQYLFDLSHSSLVGGNLSFSRDPVYKLEYSFNSIERIGTPGVTGQGLPTPSVKLKVTRDVITNISYYFDPSRTGADSPIISESYLDVTFSPYVGTFTITSTSGGTITRGDDVFRFLLLNQPEDSATIANAKYSTSSKKAVGSIGQIRIVNPGGFYTQLPIIDSIQSTRNIERVEIEDPGTEYAVGVYNGVPISGNGEGGIVSITVADGTDDEGGLIPGQIQKVVVTSPGKGYTTAFIDIESINGILGAGLTGSGAILNVVIPPFGTGASLFSLGDEIGKIKNLKNNNFGFDYPHDYTLRPEITFPINAQLTATSILDSIAVTNPGSGYTQAPAVVITGGGGTGAIAEATIKNGRLNTIEVKDPGSGYSSQPTVELKSSFNYVINLDLGLLQFAFPHGIQNGSEVTLNVIDTGDGAAFPLAAGAIGRLNGTQTYYAIAGAENSLEDDQLKIALTAANAELGDAINYVNAGTGRQQVLTSSFGGSAEANVITSTFLEGELVYQGDGLDVATATGYVSTNSGWQVGPRILKLVDYTGTFIQGEKITGVISKSSGIISTLNIARGVLEVGSITKTTGQFIDDVGKPSEIVQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSIGEWKDILVRNVHPASFKVFGELSISDYTTIPNKTTDFELTKSVELANEAIVPNIQNFTLVEPIYSEFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRVDDISNLFDGVRTAFPLTVNNGDPVIANANQLMVILNGVVQTPEVAFEIQSDSIVFSEPPKPPASVKYVNVTIDPIATADVVFTSISGIFPNIGNTLTGTASGAKLTVTKVVGNTISGFFTVGTQFSSNELVLGNTTGFSALFSTQTAVVNNGLFVFGETITNLEGNTAVVEDVNLERGSETPLAKLRYGIGVSTTSIEVISYDSTNDEPENPAAGTFELNENYQVGSEIIEVTGITVNPNSTTLTVLRGQLGTSVSGIQQDTPFYGTDITITNDLTLSKTTGTYQSTPGLYDIILDDVIVAAQSGVVARITSTTPYRDPTTNAVVEQVEISEGSSFFALLFDRLSSVTYPNVVLDDIAQSQIAVVDFTDNVTDFNTKFPENELVTNYILPYDNESGDFEDDEFIRNYKIEYGNASGDFLSSEDLAIRKLSLTKPVGSGFFALNQVLRTRDTKAEVIGYNQARKIVYVGKIGRCLSTGKDVHEFTFAGDAQLSTTQKKFGTTSLYLDGTGDYLTESSSSDYAIGTAPYTLEMWIRPDVASITGTATLFDMRVGATEVAMRLYIENAQPRFNVNGVDIISSSTNVAEDIWYHIAVVRNTTGANNTKMYLNGAEVGTGTDASTYVAKPVSIGADYANANLYAGYIDELRLSNLARYTTAFTPRNGIFQGDINTKLLVHFDGVDAQTYTEDWSGSQDFTFGELFNNNAILATTNANGGAVVAGFTGNSQRYLDAANLLEANKNFIAKEVVYLTKQQYPSLVIPGGDVNCEDDIRDVVQQICEDLRNGSNSHMWDAAAIYVDRTVPAAVTLNHIETEVEETIWAYNKVGDMIPYIVNNVLWSVSGSHDVTQFTDTTITDSNNTVYAQFTPTAATYDSATGDMVLTIGAHSLTTNDQIRIDAGSIVFSCDSDDNATQHAYPRTDDPFYNKVIAIDAVDATTITVNVGESPEDAQFVHTFVSASSNAVSLLNYTTSDCADVVSTADNLLNILVDTLDQANQVTPVDHLGGVTRVEPEYKYLGATVDGFYEIPFSADYTDDVNDILYSNRIDSSDMNRFYDAAGLIRSNRTAIVDKASYDLIQRYPDLALDMPRNEDGSGDGTDRCKVDLGLILDAIAKDIEKGGNRETVTAAKFYIGTSNRLLHIRLQVWQSVYAHERLGYYAKQAITGDLDTTNTDALIIGDWGITNDPGNCANVQSAIDTLITNLNDTIAPTGSDYATAADRLYFNRTYIAQEAVGRLDAEFTYTLNNITYNAFSYPDGSVGRDTCIRDLKSYILPSIISDLQTGGNNSTIEAIEFYLTANLQLNHIEEQLSATIYAIEQLRDLGLLAIQNLLYNSGTAVSPPQYASTYATTAAYRDGLSMTNVQAVMARYGELVDIAVSILSPAGKPGRFASQQMLFNKNYYREEIRLTVENQFGPNSWEYNDFVD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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 6405 AA molecular weight: 691148,31670 Da isoelectric point: 4,32422 aromaticity: 0,09711 hydropathy: -0,14279
Domains
Domains [InterPro]
DC_0042
ATT
1–437
ATT
1–437
IPR023366
STR
956–1028
STR
956–1028
DC_1338
ATT
1412–2683
ATT
1412–2683
PF13385
LEC
4084–4230
LEC
4084–4230
IPR006558
LEC
4103–4238
LEC
4103–4238
1
6405
Architecture
ATT 1-437 | STR 458-1233 | ATT 1234-3194 | STR 3195-3988 | STR 4053-4602 | RBD 4603-4928 | STR 5126-5276 | RBD 5572-6405
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cyanophage S-RIM50 [NCBI] |
687803 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Neptunevirus > Neptunevirus srim50 |
| Host |
Synechococcus sp. [NCBI] |
1131 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AMO42876.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU594605
[NCBI]
CDS location
range 53676 -> 72893
strand +
strand +
CDS
ATGAATATTAATAAGGTCTCTTCTGCAGTTCCTACTCAACTTCCAGGCTTTATTACGTCGGAGTATGAACTGTTTTCAAAGTTCGTCGAATATTACTACAAGTCCCAAGAAAAAACAGGACTGGGACAGAATATCCTTAACAATTTTTTAGAGTATCTTGATATTGACCAACTGGATGTTGGTATCTTGGATGGTTCTACCATCTTGGTTGAAGATATTACCGCAGAAGATGCTACAATTTCAGTTGAAAGTGTTGAAGAGTTTTTATCTGAAAATGGCACTATTTTAATTGGAGATGAAGTAATTTTTTATGAGAAGAGTATTTCTTCTCCAAACGTTGCTCTTAGCCCAGGTATTTCCTATGAGCAAGTAAAATTAAAGCAAATTGAATTACAAAGTCCATTATCCAGTTTTGATGGAATTACACAAGGATTTTCATTACTAAGTCAAGATAGACCTGTCTCCCCTCCATCGGCAAATCATTTACTTGTTCAAGTATATGGTGAATACTTAGTACCAGGAGTAGATTTTACAGTTTCTGGGAACACGATTACCTTTACTCAAGCACCAAGAACAGCATTAACTTCTGATAGTGCAGACCAAACTAGTATCAAATTTTATAGTGGATTTTTAGAGAATACTATTTTCTCCCTTGATGACATTTCTCCTTCTTTTGGCGATGGAGTAAGCAAATTTAGAATTACTCGTGATGGAAGTGCATTTGTTCCAGAAATTGATGAGTATGTTATTGCATATTATGACAATCAACTTTTAATTCCAAAAACTGATTACGTATTTGATAAAAATCTTCTTATTTTTAGAACTTTTGTACCATTAAAGGGTAGAAGATTAGACCTTTTTTATGTCGATGCTCCTATCCCTTCATTTGGGTCAGGTTCTTCTGCTTATGCTAGAGTTAATAATAACGGTGAAGTATCGTCTATTGTCATCAAAGATGTTGGTTCTGGATATAGATTTGCAAATCCACCAGCAATTACAATTGATTCTGAAAATGGTGAAGGCGCAGCTGCAGTTGCATTGATTAATGGAGTTAAAAATTTACAACTTCTTTCTGGAGGAATTGGGTATAGCGACACAAATCCACCTATTGTAAACATTGAGTCTCCTACTCAAGATGGTTCCCAAGTAGCATCTATTACAGCTACAGTTGTTAATGGTAGTGTCTCGGAGTTGACGCTTGTTAACTCTGGTAGTGGATATACTTCTGTACCTAGAATTACATTCCAACAACCAGGTGGTGCTGTTGTTGCATCCCCAACAATTGTTAATGGTTCTATCTCTGGTACGATTACTGTCACTTCTGGTGGAGTTGGATATAGCACATCTCCAGAAATTTATATTGATGAACCTACTGGGGAAAATGGAATTAAAGCAAGTCTCCGAGCTAATCTAAACCCTCAAGGAGAAGTTGTATCTGTTAGTGTTTTAAATCCTGGTCAAGGATATGAAACAGTACCAAGAATTAAAATTATTGAACCAGTAGGTGCTCAAGTATTAGAGACTCAAGTTGATAGTGATGGTAGGGTAGTTAATATTGAAATCCTTGACGGTGGTAGTGGATATAATGATGTTCCTTCCGTTTATATCATCGACGATAGAGTTAGTAATACAGGACAATATCTTGGTGGTTCTGGTGCCAAAGCGGCAGCATCCATTTTTAATGGTAGAATTACAGATATTAATATTACTGAGTTTGGTTCTGGGTATAGTCAAGAATTCCCACCCAAAGTTGTTATTCAATCTCCTCCCCAAGCAACTGCTTCGGTAGATATTGGTATTAACGAAATTACTGGTTTTGAAGTTTTAGAATCTGGAACTGGTTATTCTAAAGCGCAATTTATTGGTTGTGCTAGAGCAGCAAGTGGTATTACTGGATACACTGAAGATGGCAATGTAATCTTTAGTAAAAATACAACCGCTGCAGCTGCCACAGAAAATACCACCGTACAGTGTTTAGATGCCGTATTTGTCAAAAGAATTCTTGACAAATATACTGAACAGTTTTTACCAGATGTTCCTAGACTCGATTATAAGCAAATTGATGTAAGAACTGCTATTAAAAATATTAAGAGTTTTTACTCTACAAAGGGAACTACTTTTAGTATTGAGTACTTGTTTAAGTTACTATACGGCGAAACCGTCAATGTTTCTTATCCAAAAGACCAAATTATTAAGCCTTCTGCTGCTACTTGGTCTATCAACACTATTTTACGTGCAACTTTAGTAAGTGGCGACCCACGAAATATTCAAGATGCACTTATTACTCAAGATGCAGATATTGCTGATATTAATGTTAAAGATGCTAGTGCATTAGTAGAAAACTATATTGCAATTGAAACTGCAAATACAACAATTTATGAATTAGTTCTTTCCGAAGAAACTATCCAAGGAAATTTTGTTGTTCCATATAAAACAAAATTAGGTGAACCTCTTAATGAGACAACTGGCATTATTACAGTTGATTCCACTATTGGTTGGCCAGAAAGAAACGGTGAATTTGTTCTTGGTGGGCAAGAAGTAGTTCAATACAAGGAAAAGTCATTGAACCAGTTCATTGAGTGTACTAGAGGCGCTACTGGAACTATTGGTGGTGTTGGTAATTCTAGACCTTGGGATTCTGCTACTGAGGTAACATCCAATTTTAGAGTTTATTTAAACAAAGGAACTTCTCAGGAAGTTGTCATGAATATTGTTGGTATCGTTGATGCTCAACAAACTAGTCTGACGGATACTGGGTCATATTACCTTCCTGGAGATAAACTAACAGTTGCTAAACTTGGAGGAACTGGAGAGCAACCATTATTAACTACTTGGTTGTATAACGTTAAAAAACTGGTTGAAGTTGAAAGTATTACTTTTGGCGGAATTAACGACAGATTTGCAACCGTAACATGCTCAAATAACCATGGATTACTTGTTGGTGATGAAGTTACTGTTTATGGTGCTAACCCAATTTTGTATAATGGAACTTTTACAGTAACATCTAGAGATAGTGATATAGTTTTCCAATATCAATTACCTCAAACTGCCCTGGTTGAACCTCAAGGTAATATTTTGGTATCTGTTAACCTTAATAAAGGTAAGTCTACAGATGAAGCAATTAATAACAGTATTTCTGTATATACAACAAATATTCAAAACTCGTTCTTTAACGATAACTTTGTCTATGTTGCTTCTACTGGTATTCCCAACTATAACGTTGGACCTTTCCTTGGTTCTGCACTTCTTCCAGGTAACCAGAGAAAATTAAACAGATTCCCACAATCTCCAGTAACAATTTCTACAAAGAATATAATTAATCCTGGTCCTATTGGCACTTGGATTAATGGTGTTTCTATTTGGTCTTACAAGTCTACAAATACAAAAACATTTGGACCTATTGTAGATGTTTCTATTGTAAACGCTGGTTCGGATTATGATGCAGCATCGCCACCAAATATAACCATTTCTAGCACTGCTGGTGGTAGTGGAGCTACTGCTGAAGTCGTTGTAAATGGTTCTGTAACAGACATTCAGGTCGAAGAAGGAGGTTCTGGGTATACTTCATCTCCACTGGTTTCTATCGTCGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCTGCGACTGCAATTATTACCAAGGGTAGTGTATCTAATATTTTGATTACCAATGGAGGTACTGGATATACGTCTCAACCAACTATTACCGTTGTTGGTGGCGGTGGTCAGGGTGCAACGGCAACTGCGAGTGTTCGTGGTCCTATCAAACAGGTTAATTTATTAACACAAGGAACTTCTTACACTGTAAATCCAGATGTAGAAATTAGTTCTGGTGAAGGTGCTGTTGCCCAAGCAATTGTTAATAATGGACGTATTATTTCCATCGCTATTATTTCTGCAGGTAATGGTTATACAACTGCACCAGAGGTACAAATTCAAGGTGAAGGTTTTGGTGCAAAAGCAAGAGCAATCATCGATAGAGAAGGGGAAAATGCTGGAAAGGTAACAGGTGTTGAAATTTTAAACAGGGGTATTGGGTATACTCAAGGGACCACTGTTATTAATTTGACTTCTGTTGGACAAGATGCTAAATTTGTTGCGAATGTATTTGAGTGGACTTATAATTTACAAGAGTCTGCTACATTTGACCAGTCTCAAGGTTCCGTATTTGAAGGATTTAACACCCAATATGGTGGTGAATACGCTCACCTGTCCAACCCACAGAGACTTCGTTATATCTTAGGCGATAATCTTGCCATCAATACAGATGGTTCTATTAGAGAGCAAGAGACCCAGTTAGAGCACTCTCCTATCATTGGATGGGCATTTGATGGAACTCCCATCTATGGACCATATGGTTATGAAGATCCAACTGACCAATCTTCTAGTATTGTTAGAGTTTCTAGTTCGTACAAATTAAAGAGCAATTTGGTCTTTAATGAAATAACAAATCCAAATCCATATCGTGAAGAAGGTTCTTTACTGTCTGTAGACCCAGCAGGAACATTTATTGAAGACTATGAGTATTCTTTTGCTTTAGGAGACCTTGACCAGTATAATGGGCGTTTTTGTAAGACACCACAGTATCCTAATGGAAGATACTGCTATTTTGTAACTATTGATAATACCGAGAATGGAAATCCTATATTCCCATATATTCTGGGTCCAAGTTTTAACTCTGTAGTTGATTCTTGGAACCTTGTTGATTCGTCAATTCAGCAAAATATTCCTCGTGGTGTTGTTCGTTTCCGTGACCCATATCAAAATGTAGATATTGATGTTGAAAGAATTCCTAATGCATCTACAAATTCACTAACTTTAGAAAATGGCGATTTACTCTTATTTGATGTAGAAGATGAAAATAGAGATGGTGTAATCAGTCAGGATGAAATTGATGACCCTGATGAAGTTTTAGAAGAACCACCACTTCAGATTTTTGACTACTTCCCTAAAGTAAGAACTGAATCTAAAGTTGATATTGAAGTAGAAACTATTAGTAGGTTTGAGAA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