Protein

View in Explore
Genbank accession
QBX25960.1 [GenBank]
Protein name
capsid and scaffold protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Seq2Symm
C1 confidence 0,899
C1 0,899
C3 0,488
C7-C9 0,010
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MGTATFSGSYGHNMTLELRAERSGKPNIAGNSSNVHVTGYLHTNGYASMWGVTSDATITINGGSAIEHPAINIGTNSTQKIFDHTYTIGHNNDGTKTVGIKLSVGLNVGGYGSAMVAFDFRLPDIPRASSVSDVTGTLGSAMTININRKVSSFTHTVKYYFGNLSGTIATGAGASVSWTPPLNLATQIPSASSGWGNITVDTYNGSTKIGSATCRLTLNVPESMKPTFTGVTLSDTNTVVSNIITTANTFVEILSNVKVAFSGATGIQGSTITGHRAEMVGENQTVTSDGGVFGLVKKSGEVTIRSSVQDSRGRWSDTKDTTVEFLEYTGPTALFIAERSGSARTTLTVTRTARISPLTVGDKQLNQMTVTFKTRPMGGDTWTTNNGSASGVWTTQSELIASPANLAGTFSGTQSWEVMMTVSDLFTTASYSYPVSTDTVLESKTKDGIGIGKIREHGALDVAGEIYANNKPIQHHQLTDVNGTAIKLNDGTDLNNVTACGFYNGNNLLHAPTGNGANVWMYIHVTKHTYGGWTLQEAIDFNGVVSAFRMQKGGSWDAWQYYAVQNKVANFTAVNQTKVYSKTITMPYTSKATLTRIGNQVQITWLRAISNINRECEYTAMAETIPLGYRPAFEVHMSLNGNVSNSVNAWAVLHLQTDGSIKLTNAFKGNHVWTGTTTYLTTDPFPAE
Physico‐chemical
properties
protein length:688 AA
molecular weight: 73557,28480 Da
isoelectric point:7,75866
aromaticity:0,08430
hydropathy:-0,20538

Taxonomy

Phage
Streptococcus phage Javan284 [NCBI] · taxon 2548093
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host
Streptococcus lutetiensis [NCBI] · taxon 150055
cellular organisms Bacteria Bacillati Bacillota Bacilli Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
QBX25960.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448898 [NCBI]
CDS location
range 33011 -> 35077
strand +
CDS
ATGGGAACAGCAACGTTTAGTGGCTCATATGGTCACAATATGACGCTTGAATTGCGAGCTGAAAGGTCTGGCAAGCCGAATATCGCAGGCAACAGCAGTAACGTACATGTAACTGGCTACTTGCATACAAACGGATATGCAAGTATGTGGGGTGTAACTAGTGACGCAACTATCACAATTAATGGTGGTAGCGCCATCGAGCACCCAGCTATTAATATTGGCACTAATTCAACACAAAAAATCTTTGACCATACGTACACAATTGGTCACAACAACGACGGGACTAAAACTGTTGGTATCAAGCTGTCCGTAGGTCTTAATGTTGGCGGATATGGGTCTGCTATGGTCGCTTTTGATTTTAGGTTACCAGACATACCACGAGCTAGTTCGGTCAGTGACGTGACAGGAACGCTTGGCAGTGCGATGACTATTAACATTAATCGAAAGGTCAGCAGTTTCACACACACCGTCAAATACTATTTTGGTAACTTGTCTGGCACGATTGCAACTGGTGCTGGGGCGTCTGTAAGCTGGACACCGCCGCTTAATCTAGCAACACAAATCCCAAGTGCGTCAAGCGGTTGGGGAAATATTACGGTAGACACTTACAATGGCTCTACTAAAATCGGGTCCGCTACATGTAGGCTAACTCTTAACGTCCCAGAGTCGATGAAACCAACGTTCACAGGTGTGACTTTGTCGGATACAAATACAGTCGTATCAAACATTATCACGACAGCTAACACGTTCGTGGAAATTTTGTCTAATGTCAAAGTTGCCTTTAGTGGTGCTACTGGTATTCAAGGCTCTACTATTACAGGTCACAGAGCCGAAATGGTAGGCGAGAACCAAACAGTCACGTCTGATGGTGGTGTTTTCGGACTAGTCAAAAAATCGGGTGAAGTGACTATCAGGTCGAGCGTGCAAGATAGCCGTGGGCGTTGGTCGGACACTAAAGACACAACGGTCGAGTTCCTAGAATACACTGGTCCTACAGCGCTGTTCATCGCTGAGCGTTCAGGTTCGGCAAGAACCACGTTGACAGTTACCAGGACGGCTAGAATATCACCTTTAACAGTCGGTGATAAGCAACTTAATCAAATGACCGTCACATTCAAAACACGTCCTATGGGCGGTGATACATGGACGACTAACAATGGTTCGGCGTCTGGTGTTTGGACAACTCAGAGCGAACTAATAGCTAGCCCAGCTAACTTAGCTGGTACATTCTCTGGGACACAATCTTGGGAAGTCATGATGACTGTCAGCGACTTGTTTACAACAGCTTCTTACTCTTATCCTGTATCAACGGATACGGTTTTGGAAAGCAAAACTAAAGACGGTATTGGAATCGGTAAAATTCGTGAGCATGGTGCTTTAGACGTGGCTGGTGAGATTTACGCTAATAACAAGCCTATTCAACACCATCAATTGACTGATGTTAATGGTACTGCTATTAAATTGAATGACGGAACTGATTTAAATAATGTTACAGCATGTGGATTTTATAACGGAAATAATCTTTTACATGCACCTACTGGTAATGGTGCAAATGTCTGGATGTATATTCACGTAACTAAGCATACGTATGGTGGGTGGACGCTACAAGAGGCTATTGATTTTAATGGTGTAGTTTCTGCCTTTCGTATGCAAAAAGGTGGTAGTTGGGATGCCTGGCAATACTATGCTGTTCAAAATAAGGTAGCTAACTTCACTGCAGTTAACCAGACTAAAGTGTATAGCAAAACAATAACAATGCCATACACAAGTAAGGCAACACTTACTAGAATTGGTAACCAAGTTCAAATCACATGGCTCAGGGCAATCTCAAACATTAATAGAGAATGTGAATACACAGCGATGGCAGAAACTATTCCACTTGGTTACAGACCTGCTTTTGAAGTACATATGTCTCTAAATGGTAATGTTTCGAACAGTGTTAATGCTTGGGCTGTCTTACACTTGCAAACCGATGGCAGTATAAAACTCACAAATGCTTTCAAAGGTAACCACGTATGGACTGGTACAACCACTTATCTCACCACAGACCCATTCCCTGCTGAATAG

Genome Context

Tertiary structure

QBX25960.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 83.7
Oligomeric state monomer
Download structure