Protein

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Genbank accession
AJA73002.1 [GenBank]
Protein name
host specificity protein J
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MGLFSRKRKNHTPKEAPETGRSKQIVNIVELLCEGEIEGLVDGFKSIYLDGTQIQNDDGSYNFNNVSGQLNVGTQDQNVLDGYDSSQNEVSVGVEVKKKSGAIVRTVTDERISRLRLTLGVRSLFHQNNQGDTNTTNVDLKITIGTRQYSHSFNGKYSSQYLESVVFDNLPPVPFNISVERVTKDSNSQRLQNGTIWSSYTEIIDTEFTYPNSAVAGISFDSEYFNNIPTRNYLIKAKKVKVPSNYDPVKRTYTGFWDGTFKIAWTNNPAWEIYDLAPILSKMLGVEISFDKWALYDVARYCDQLVPDGMGGMEPRFTCNVWLTEVKTAYDLLNDFCSVFRAIPIWTGTEVSVIIDRPRDPVWTYTNANVVGGFERSYSARKSRHNAVQVTYSDKTNGYESAIEYVSDDEEIKKHGLNLSQVTAFGCTSRGQAYRTGKWILETEKREKETITFTVGREGLMHLPGDIIRVADSHYAGTEIGGRVLAINGRKVTLDREISIDNASYFTYINGEATHSSIKIQSVNGKEITLDSNPTGLEVYGVWSLSTQQITSGLYRSISIVENADGTNTITALQHEPQKEAIVDNAAHFVETARTLYKAPQINAVEVSTGYDGKLYISSDISSGDGKLTYDIKITKDGNLYQFKKGLADPNIELSDLPNGDYSVIIYGKNAKGQIVTEKTQTFTIDRPPAPTGVVVTGGLGQITLEWDWVNEVTQTEIFAAETDNFALAKKIAKVTARTYAHTVRGNKVVRYYWLRHTRGINVGPFYQQQGVRGESAVDLDARLTELNTQLSRNIVDEIFDVAAPARGLELVKTVANLNDKRTKLASSQVYNQADGKLYTWNGTAYSATVAAEDVTGKLSKSKIDTSLISQLTGADNTANLARRLAETAQSNINQEITNRQDAVTAEANNRTKAIQAESANLTKKIQAEATARGAAVTQLQNVDAQQSQLISAVTAKADNALSGLEAEKTARANADKAESQAREALTARMSDAESNIATIQRTVATNAQSISEVSQNLNAKIDNINIGGRNLLRDSEFNAYNKWGNPQIDFTENANRRTIKVTSTGTNGPVGIVSSNRHSTSYFQQGETYTLSLFARGSKALDYLYLMRQDGNNVRLPVINVASETEFNHYKLTFKAPFTTQQGYVLIGFRQTSTEQFVEFHSVKLEKGNVATDWTPAPEDVDSAVSAVSADLTSYKQTQAATDSAQAQQLNQLSVNLTKAETNFNAKITEEKKARVDADKANAERLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASLAQSSLQAVWKADTQSAIGELAVGGRNLLLKSNATNLINFVRSSQDVLDNTDFKTPVVRINCIQDSWFGRKTAITSGKLLAGKYTLSFKYRTNATINNTFIGYGGNQRRRLITSNVVGNETWQTCKLTFETTEDYPDIFIIIGGYGKADVSYIEFAELKLEKGAIATDWTPAPEDVESSVSAVSAKVDSVQQTLANADSALSSRIDTVNASVGSNSSKITQVSNAVASVDGKLSATHTIKTETIAGGRKAIAGIAFGATADNRNAESSVIVMADKFEVVKNAQDGTPVRLFGVVENKVAINGNLIATGSISGDHINANSVRTAVLTAGAIKTEHLAAGQISADKLAIGLGGNLLVNPIFATPDLSIAPFGWNYWRGEVGDRLNIDTRNIFNRNEQDNYGLKNGGLPNELVFSMRYSTTEETSDTGRIGWLSQDINVVPNKKYIASVWLACHRGQAKLVIENIEKPGGAYLGWIGDSEVITGYSANQGEFKNMKRVKVVFTAPTSGCIRFALRLDNIQGKANPFLFARRPMLEEASDNVTDITQPSPWQNAGVTAIHGGSIATNTVTAQQIAANTITANQIAVGTIAARNMAVDSIEARHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGAITAGSININNRFKVSNAGVVEMRANSGNVGMVMNNDSIIVYDEQGRVRVKMGKL
Physico‐chemical
properties
protein length:1954 AA
molecular weight: 213272,75760 Da
isoelectric point:6,34064
aromaticity:0,07574
hydropathy:-0,34806

Domains

Domains [InterPro]
DC_0129
STR
8–1033
DC_0129 G3DSA:2.60.120.260 IPR015406 G3DSA:2.60.120.260
IPR053171
Unmapped
9–1011
IPR053171 G3DSA:2.60.120.260 DC_0515
IPR055385
ATT
87–206
IPR055385 IPR032876 DC_1441 DC_0595
Coil
Unmapped
983–1003
Coil IPR008979
AJA73002.1
1 1954
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR
RBD
STR
STR 8-86 | ATT 87-206 | STR 207-324 | ATT 325-487 | STR 488-1291 | STR 1346-1469 | RBD 1470-1604 | STR 1605-1949 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Mannheimia phage vB_MhS_587AP2
[NCBI] 		1572745 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Mannheimia haemolytica
[NCBI] 		75985 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pasteurellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AJA73002.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP137435 [NCBI]
CDS location
range 17474 -> 23338
strand +
CDS
ATGGGATTATTTAGTCGTAAGAGAAAAAATCATACTCCTAAAGAAGCACCGGAAACCGGTCGCTCTAAACAGATTGTAAATATTGTGGAATTGCTGTGCGAGGGCGAAATCGAGGGCTTGGTTGATGGCTTTAAATCGATTTACTTAGACGGCACGCAGATCCAAAACGATGACGGCAGCTATAACTTTAATAATGTGAGTGGTCAGTTAAATGTCGGTACGCAAGACCAAAATGTGTTAGACGGTTACGACAGCTCACAAAATGAAGTGAGTGTGGGTGTAGAAGTCAAGAAAAAAAGCGGTGCAATCGTCCGCACCGTTACTGATGAACGCATCAGCCGTTTGCGTTTAACGTTGGGCGTGCGGTCACTATTCCATCAAAATAATCAAGGCGATACCAATACCACCAATGTTGATTTAAAAATCACGATTGGCACACGGCAATATTCGCATAGCTTTAACGGCAAATACAGCTCGCAATACCTTGAATCTGTGGTGTTTGATAACCTGCCTCCTGTACCGTTTAATATCTCGGTTGAACGTGTAACAAAGGATAGCAATTCTCAACGACTACAAAACGGTACAATTTGGAGCAGCTATACCGAAATTATCGACACCGAATTTACTTACCCTAATTCAGCGGTTGCCGGTATCAGTTTTGATTCGGAGTATTTTAATAATATCCCGACCCGAAACTACCTAATTAAAGCGAAAAAAGTCAAAGTGCCAAGCAATTATGATCCAGTTAAACGCACTTACACCGGCTTTTGGGACGGCACATTTAAAATTGCGTGGACGAACAACCCTGCTTGGGAAATTTACGATTTAGCTCCGATTTTAAGCAAAATGCTTGGGGTTGAAATCAGTTTTGACAAATGGGCGTTGTATGATGTTGCTCGCTATTGCGATCAACTTGTGCCGGACGGTATGGGTGGAATGGAGCCTCGTTTCACCTGTAACGTATGGCTCACGGAAGTTAAAACTGCCTATGACTTGTTGAATGATTTCTGCTCGGTATTCCGTGCGATTCCGATTTGGACCGGAACAGAAGTATCGGTCATTATCGACCGTCCGCGTGATCCGGTTTGGACTTACACAAATGCTAATGTAGTTGGTGGATTTGAACGATCCTACTCTGCTCGCAAATCACGCCATAATGCAGTGCAAGTTACTTATTCGGATAAAACAAATGGCTATGAAAGTGCGATTGAATATGTCTCTGATGACGAGGAAATCAAAAAGCACGGCTTAAATTTAAGCCAAGTAACTGCCTTTGGCTGTACATCTCGTGGGCAAGCATACCGTACCGGCAAATGGATTTTAGAAACCGAAAAACGTGAAAAAGAAACCATCACTTTTACCGTGGGGCGTGAAGGCTTAATGCACTTGCCGGGCGATATTATTCGTGTGGCAGACAGCCATTATGCCGGTACGGAAATTGGCGGACGTGTACTGGCGATTAATGGGCGAAAAGTCACGTTAGATCGTGAAATTAGCATTGATAACGCCAGTTATTTTACCTATATCAACGGTGAGGCAACGCACTCTAGCATTAAAATCCAATCGGTAAACGGTAAAGAAATCACGCTAGACAGTAATCCAACAGGACTAGAAGTTTATGGGGTGTGGTCGTTATCTACCCAACAAATTACCTCAGGTTTATATCGCTCTATCTCGATTGTTGAAAATGCGGACGGTACGAATACGATTACGGCATTGCAACACGAACCGCAGAAAGAGGCGATTGTAGATAACGCTGCTCACTTTGTGGAAACGGCGAGAACGCTTTACAAAGCCCCGCAAATTAACGCAGTAGAAGTCTCGACTGGTTATGACGGCAAGCTCTATATCTCCAGTGATATTAGTTCTGGCGACGGCAAGCTGACCTATGATATTAAAATCACCAAAGATGGCAATTTGTATCAATTCAAGAAAGGATTAGCCGACCCAAATATTGAGTTGAGCGATTTACCGAATGGCGATTACAGCGTGATTATTTACGGTAAAAATGCCAAAGGGCAAATCGTCACCGAAAAAACACAAACCTTTACTATTGATCGACCTCCAGCTCCGACCGGTGTAGTAGTAACAGGTGGATTAGGGCAAATTACCCTCGAATGGGATTGGGTAAATGAGGTTACGCAAACCGAGATTTTCGCAGCGGAAACTGATAATTTCGCCCTTGCAAAAAAAATCGCAAAAGTGACCGCTAGAACCTACGCTCACACGGTAAGAGGTAATAAGGTTGTACGCTATTATTGGCTACGTCATACCAGAGGGATTAATGTCGGCCCGTTTTACCAACAACAGGGGGTAAGAGGCGAAAGTGCGGTTGATTTGGATGCTCGATTAACCGAATTAAACACTCAGCTATCACGCAATATTGTTGATGAGATTTTTGATGTTGCTGCACCGGCACGAGGTTTAGAGCTGGTCAAAACTGTGGCAAACTTGAACGATAAGCGGACGAAACTGGCGTCATCTCAAGTTTACAATCAGGCTGACGGCAAGCTCTATACTTGGAACGGTACAGCATACTCAGCTACAGTGGCTGCGGAAGATGTTACCGGCAAATTATCAAAATCTAAAATTGATACGTCCCTTATTTCGCAATTAACAGGTGCAGATAACACCGCAAATTTGGCAAGAAGATTAGCGGAAACAGCTCAAAGCAACATTAACCAAGAGATTACTAACCGACAAGATGCCGTTACTGCCGAAGCAAATAACCGTACTAAAGCCATTCAAGCTGAAAGTGCGAATTTAACGAAAAAAATTCAAGCTGAAGCAACCGCTCGTGGGGCTGCTGTTACACAGTTACAAAATGTTGATGCTCAACAATCACAACTGATTTCTGCTGTCACAGCAAAAGCTGATAATGCCTTATCCGGTTTGGAAGCAGAAAAAACAGCTCGAGCAAATGCTGATAAAGCTGAATCACAAGCCCGTGAAGCATTAACAGCAAGAATGAGTGATGCGGAAAGCAATATTGCAACTATTCAACGTACGGTAGCAACTAATGCCCAAAGCATTAGTGAAGTCAGTCAGAATTTAAATGCTAAGATTGATAATATTAATATCGGAGGTCGGAATTTATTAAGAGACAGCGAGTTCAATGCGTACAATAAATGGGGTAATCCACAGATTGATTTTACAGAAAATGCAAATCGTCGAACTATCAAAGTAACCTCAACAGGTACTAACGGTCCTGTTGGTATTGTTTCATCTAATCGCCATTCCACATCTTATTTCCAACAAGGAGAAACTTATACACTCTCATTATTTGCTCGAGGAAGTAAGGCACTAGACTATCTCTATCTAATGCGTCAAGATGGGAATAACGTTAGATTACCAGTGATTAACGTTGCCTCTGAAACTGAGTTTAATCATTACAAACTCACGTTCAAGGCTCCTTTTACCACGCAACAAGGTTATGTCTTAATCGGTTTTCGGCAAACCAGCACAGAGCAGTTTGTTGAGTTTCACAGCGTCAAACTTGAAAAAGGCAACGTAGCCACAGACTGGACGCCAGCACCTGAAGATGTGGACAGTGCGGTTAGTGCTGTTTCGGCTGATTTAACGAGTTATAAACAAACTCAAGCGGCTACCGATTCAGCACAAGCACAGCAACTTAATCAGTTATCTGTGAACTTGACCAAAGCAGAGACTAATTTCAACGCCAAAATCACGGAAGAAAAAAAAGCTCGTGTTGATGCAGATAAAGCGAATGCAGAGAGGCTCACAGACATAACAAGCCGTGTTGCAAATGCGGAATCAACTATTACCAATTTCCAATCAACCAAAGCGAATAAAAGTGAGGTTGCGAGCCTTGCACAAAGTTCGTTGCAGGCAGTTTGGAAGGCAGATACACAATCAGCGATTGGCGAGTTGGCTGTCGGTGGAAGAAATTTATTATTAAAATCCAACGCAACAAACTTAATCAATTTTGTCAGATCATCTCAAGATGTATTAGATAACACTGATTTCAAAACTCCAGTAGTACGAATCAACTGTATACAAGATAGTTGGTTTGGTCGAAAAACAGCGATTACATCGGGAAAATTGCTTGCTGGTAAATACACTCTATCGTTTAAGTATCGCACCAACGCTACAATTAATAATACTTTTATTGGTTATGGAGGCAATCAGCGCAGACGGCTTATCACATCAAATGTTGTCGGTAATGAGACATGGCAAACTTGCAAGCTCACATTTGAGACAACCGAGGATTACCCTGATATATTTATCATTATTGGTGGTTATGGTAAGGCGGATGTAAGTTATATTGAATTTGCCGAGCTGAAACTAGAGAAAGGCGCTATCGCTACAGATTGGACACCAGCACCGGAAGATGTGGAAAGTTCTGTAAGTGCAGTATCTGCAAAAGTAGATTCGGTTCAACAAACGCTGGCAAATGCAGATTCAGCACTAAGCTCTCGCATTGATACGGTCAATGCCTCAGTCGGATCAAACTCATCTAAAATTACCCAAGTCAGCAATGCGGTAGCAAGTGTGGACGGCAAATTATCTGCTACCCATACCATCAAAACCGAAACCATTGCCGGTGGACGCAAAGCGATTGCCGGTATTGCATTTGGTGCAACGGCAGATAACCGTAATGCGGAATCTTCTGTGATTGTGATGGCAGATAAATTTGAGGTCGTGAAAAACGCCCAAGACGGCACGCCAGTAAGACTATTTGGCGTGGTAGAAAATAAAGTAGCGATTAATGGGAATTTAATCGCAACAGGCTCGATTTCAGGAGACCACATCAATGCAAATTCCGTCAGAACTGCTGTATTGACTGCAGGAGCGATTAAAACGGAGCATTTGGCAGCAGGGCAAATATCGGCGGATAAGTTAGCGATTGGGCTAGGTGGGAATTTGCTGGTTAATCCTATTTTTGCAACACCCGATTTGTCAATAGCTCCGTTTGGCTGGAACTACTGGCGAGGAGAAGTTGGTGATCGGCTAAATATTGACACCCGTAATATTTTCAA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a5341096834c0984d0378ed86b66d1419cf3baa300bca29f9c68041814df8be5
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7399
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Comparative analysis of multiple inducible phages from Mannheimia haemolytica Niu,Y.D., Cook,S.R., Wang,J., Klima,C.L., Hsu,Y.H., Kropinski,A.M., Turner,D. and McAllister,T.A. 2015 26318735 GenBank