Protein

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Genbank accession
ALO80452.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MEYFVDGNITSSGDGLTELNAFKTIQEGIDAAYAGDTVWVKAAKYVGGENSTTRSGTSSNPIKIIGYLNTVGDIVSTQGPTYTKAMFDADSSIIDGGITVLDSSDMPLIEGIRVNEDPDDARAFTINHSFIQFENLKIQYYQMGFIAPSGNSYDGLLFKNIIMNELGNWDASNPGWDLPFSAAPPAGNLSGQGFYLIDTNNTIILNSSVYDAGAAAYFPIRADNLLIDYCEAYSTRTGNASDYLFDFVTVTNSTLSNYYAYREDLDTSKMHLSRAVMLQLQSNDNTIMNGTHVNLRTQLEVQSSRNVLKNINVIGNGQANQGNIQISGESNDNIFLDWTIDGTEGIQFLGANDTRQPGVSHVYSGNNNYFINFVITNVPVGTGNAIFSYHRLGFSDPDDGGTNYVIGLTADNCITLVNTNRTGTLHIYNSTFSNITNYDTFSTSGTATDELVNLNFYNCNFYNNGFVTPTNNVERTLVNTTALNPMFNPDYTLQEASPLRDIGMDASTINSLAATDYIGTARPQNGSYDIGAYEYSIATGIPNTDGTGSVDDTISLQAWLDSGSTTKPLGNEIYLVSGTLDIDQSGAQEVDFNGATIIVSSYADRYAIDIDKPDRSLTTLKNLTIDGKDLQRNGVRVDSPIYAENVNLLDFYSPTQSIVGWLLDINLTNYGDFTWKNCDVTKMYSEYNSIIGDGLGSARAYDIQVNAMPPDTFTVLIEDFVWDGFYGDDGGPIRVDDNTSENMSVTNNSVTLRNGSVTAFTRRGIKMAMDNITIDNVFYKSITTSNPYYQYAEPAGLIGARPLDTDPNGLLDNIVIKNCTFDGSGNYPWALIDKANTKWSNNTFINGAGIRIGNNSNSEVGDVVICGSNFGTGSKIHQQLDTVSNAPGTNIIIDSNNIADANYLEFTTLSYTVQEVLDCLGNVIIPIPLLANRNQNLIYWRI
Physico‐chemical
properties
protein length:942 AA
molecular weight: 102817,17490 Da
isoelectric point:4,20162
aromaticity:0,10191
hydropathy:-0,24862

Domains

Domains [InterPro]
IPR012334
1–294
IPR012334 IPR059226 IPR012334
IPR011050
2–294
IPR011050 IPR011050
IPR011050
281–535
IPR011050
ALO80452.1
1 942
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cellulophaga phage phi17:2_18
[NCBI] 		1747283 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ALO80452.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KT962247 [NCBI]
CDS location
range 55210 -> 58038
strand -
CDS
ATGGAATACTTTGTAGATGGAAATATTACTTCTTCTGGGGATGGTCTAACAGAACTTAACGCATTTAAAACTATCCAAGAAGGTATTGATGCTGCATATGCAGGAGATACTGTTTGGGTAAAGGCAGCTAAATATGTTGGTGGAGAAAACTCAACAACTAGGAGTGGGACATCTTCAAATCCAATTAAAATTATTGGGTATTTGAATACTGTTGGAGATATAGTAAGTACTCAAGGACCTACATATACTAAAGCTATGTTCGATGCTGATAGCTCTATAATAGATGGAGGCATAACTGTTTTAGATAGCTCAGACATGCCACTAATAGAAGGTATTAGGGTTAATGAAGATCCTGATGATGCCAGAGCTTTTACAATAAATCATAGTTTCATTCAGTTTGAGAATCTTAAAATACAATACTATCAAATGGGATTTATTGCTCCATCTGGAAATAGTTATGATGGACTATTATTCAAGAACATTATAATGAATGAACTTGGTAATTGGGATGCTAGTAATCCTGGATGGGACTTACCTTTCTCAGCAGCTCCTCCAGCAGGTAACTTATCAGGTCAAGGTTTTTATTTAATTGACACTAACAATACAATTATACTAAACTCATCTGTGTATGACGCAGGAGCAGCAGCTTATTTCCCTATAAGGGCTGATAATTTATTAATAGATTACTGTGAGGCTTATAGTACAAGAACAGGGAATGCTTCTGATTATTTATTTGATTTTGTTACAGTTACTAACTCTACATTAAGTAATTACTACGCATACAGAGAAGATTTAGATACATCTAAAATGCATTTATCTAGAGCTGTAATGTTGCAGTTGCAGTCTAACGATAACACTATAATGAACGGTACTCATGTCAATTTGAGAACTCAATTAGAAGTACAATCAAGTAGGAATGTTTTAAAGAATATAAATGTAATTGGTAACGGACAAGCTAATCAGGGCAATATACAGATCAGCGGAGAATCTAATGATAACATATTTTTAGATTGGACTATAGATGGTACAGAAGGCATACAGTTTTTAGGAGCTAATGATACTAGGCAACCAGGAGTTAGCCATGTGTATTCAGGTAATAATAACTATTTTATAAATTTTGTTATAACTAATGTACCTGTGGGTACAGGTAATGCTATATTTTCATACCATAGATTAGGGTTTTCTGATCCTGATGATGGTGGAACAAATTACGTTATAGGTTTAACGGCTGATAATTGTATTACATTAGTAAACACAAATAGAACTGGAACATTGCATATTTATAATAGTACATTTAGTAATATCACTAACTATGATACTTTTAGTACAAGTGGTACGGCAACAGATGAACTAGTTAATTTAAACTTCTATAACTGTAATTTTTACAATAATGGATTTGTAACACCTACTAATAATGTAGAAAGAACTCTAGTTAACACTACAGCTTTAAATCCTATGTTTAACCCTGACTACACTTTGCAAGAAGCTAGTCCATTAAGGGATATAGGAATGGACGCTAGTACTATAAATTCTTTAGCTGCTACTGATTATATAGGTACCGCTAGACCTCAAAATGGAAGTTATGATATAGGAGCTTACGAATACTCTATTGCCACAGGTATACCAAACACTGATGGTACTGGAAGTGTAGATGATACAATCTCACTGCAAGCATGGTTAGATAGTGGCAGCACAACTAAACCTTTAGGTAATGAGATATATTTAGTTTCAGGGACTTTAGATATAGATCAAAGTGGAGCGCAAGAAGTGGATTTTAATGGAGCCACTATAATAGTAAGTTCTTATGCAGATAGGTATGCAATTGATATAGACAAGCCAGATAGAAGTTTAACCACTCTTAAGAACTTAACAATAGATGGAAAAGATCTACAAAGAAATGGTGTTAGAGTTGATTCTCCTATTTATGCAGAAAATGTAAATTTACTAGATTTTTATTCTCCAACTCAAAGTATTGTAGGTTGGTTATTAGATATAAATCTAACTAACTATGGAGACTTTACATGGAAGAACTGTGATGTAACTAAAATGTATAGTGAGTATAATTCAATTATAGGAGACGGACTAGGATCTGCTAGAGCTTACGATATTCAAGTTAACGCCATGCCTCCAGATACTTTTACCGTATTAATAGAGGATTTTGTATGGGATGGTTTTTATGGCGATGATGGAGGACCTATTAGAGTAGACGATAATACAAGCGAGAATATGTCTGTTACAAATAACTCAGTGACATTAAGAAACGGAAGTGTAACAGCTTTTACTAGAAGAGGTATTAAAATGGCAATGGATAATATAACTATTGACAACGTTTTTTATAAATCAATTACAACATCAAATCCTTATTATCAGTATGCCGAACCAGCTGGCTTAATTGGAGCTAGGCCACTTGACACTGATCCAAATGGGCTTCTTGATAATATAGTTATTAAAAACTGTACATTTGATGGAAGCGGAAATTATCCTTGGGCTTTAATTGATAAAGCAAATACTAAATGGAGCAACAATACTTTTATAAACGGGGCAGGAATAAGGATTGGAAATAATAGCAACTCAGAAGTTGGTGATGTAGTTATTTGTGGAAGTAATTTTGGAACAGGATCTAAAATACATCAACAATTAGATACAGTTTCTAATGCTCCTGGAACTAACATAATTATAGATAGCAATAACATTGCTGATGCTAATTATTTAGAATTTACAACACTTTCTTATACAGTACAAGAAGTTTTAGATTGCTTAGGTAATGTGATTATTCCAATACCTTTATTGGCAAACAGAAATCAGAATTTAATATACTGGAGAATATAA

Tertiary structure

PDB ID
8c6b9dc24a05822cfaf67b5e02dbdc48cb59c1d809f430f7c12d57473ad020c0
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7510
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Large-scale maps of variable infection efficiencies in aquatic Bacteriodetes phage-host model systems Holmfeldt,K., Solonenko,N., Howard-Varona,C., Moreno,M., Malmstrom,R.R., Blow,M.J. and Sullivan,M.B. 2016-06-27 — GenBank