Protein

View in Explore
Genbank accession
AOO17513.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Seq2Symm
C3 confidence 0,998 truncated
C3 0,998
C1 0,010
D3 0,002
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGATAWNTLRYERPVESNTNTPNSLVQRDADGSFSAGTITSTLIGNASTSTRLEQTRQIQLSNDVTATGNFDGSQNLNLSTALSLINTLPHYLEGGLSTTTRTFTEVTVDQKGRVINARTPSQLNLTDYGLDGSATSDTTLAQPWNANLEAISDETGTGLYSKTAAGVVETRLITGAAGQIVITDGGGISGNPLVSLSVQANVVPGDYNTESLTSVSQAGSGGEPFGTETVNASKFSVDDKGRLTTVTNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSRVYQAITGIAAGGGAPTHTDGSDAGGWRYLAAAAVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTVENFELDQELTATTGYRGFNYLNYLKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLSQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQISASEATGKVHVEDTKFQDNYIATTNATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGNLQIDGTTTTINSTQLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNLDRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTNYSDLGGHAGGYRFLHAATNTNEVFTGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDSTLRVTSTSRFDDNVVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNINTDKFNVVATSGNTSIAGTLGVTNIATFSNDIDANANMTLAGNLHMESTNDITVAKNVGTGVWEIQSNDYGALRLDGGAYVAGDALIDGTLHVNGAIEVQDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGATGNTDIQGTFDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGASGIVTLTNNTEQTLTGSYGADGALRLTGGAAVQRNLAVGGAARVYGNTELTGTLDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKFTVDTDNGNTDLRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTIDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKIGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDGNLRAGSLNLTGAGTALDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNALTADTLKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTTYVDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLAVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTGDLSEGSNLYFTNERVDDRVNALIVAGTGVTKAYNDSAGTYTLTVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNIFYTEARFNTSLATKDTDDVSEGSSNLYFTNTRADTRADLRVAAATGANLDLSSKSTTNLSEGTNQYYTEARVQDKLDNAFAQLSAMLNNLATATTLVLNLSGDPTPGDVTTLNNGTLSGGTLYNTGTAVATTSSGSGTGLTVDITASGGAITAVAINAAGSGYVVGETITISTGGGDATINVSAVTEMAIGDTVTGSTSGTTGVITAVGATSVTVDTVDGFFKKTETVSAGDVSTLTITSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:1907 AA
molecular weight: 196075,33840 Da
isoelectric point:4,18906
aromaticity:0,05821
hydropathy:-0,16555

Taxonomy

Phage
Cyanophage S-RIM12 [NCBI] · taxon 1278402
Uroviricota Caudoviricetes Pantevenvirales Brizovirus Brizovirus syn33
Host
Synechococcus [NCBI] · taxon 1129
cellular organisms Bacteria Bacillati Cyanobacteriota/Melainabacteria group Cyanobacteriota Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AOO17513.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349318 [NCBI]
CDS location
range 88640 -> 94363
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATACAGTTAAGACGCGGTGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCGAATCCAACTCTTGCACAGGGTGAACTTGGAATTGAACTTGATACTGGTCGGTTCAAAATCGGTGATGGTGCAACGGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTAGAGTCCAACACTAATACTCCAAACAGTCTTGTACAGAGAGACGCAGACGGAAGTTTTTCTGCGGGTACTATTACATCAACTCTTATTGGTAATGCTTCAACATCAACTAGACTTGAACAGACTAGACAGATTCAGTTATCTAATGATGTAACAGCGACTGGTAACTTTGATGGTTCCCAAAACTTAAATTTAAGTACTGCTTTATCACTGATCAATACTCTTCCTCATTACTTGGAAGGTGGTCTAAGCACTACTACTAGAACTTTTACTGAGGTTACTGTTGATCAGAAAGGTAGAGTTATAAATGCTAGAACTCCTTCTCAACTAAATCTTACTGATTATGGTCTTGATGGTTCTGCAACTAGTGACACAACTTTAGCACAACCTTGGAATGCAAACTTAGAAGCAATTTCAGACGAAACTGGTACTGGTTTATATTCAAAAACTGCAGCGGGTGTTGTTGAGACCAGACTTATTACTGGTGCTGCTGGTCAAATTGTTATCACTGACGGTGGTGGTATTAGTGGCAATCCTCTTGTCTCATTGTCGGTTCAAGCAAACGTTGTTCCTGGAGACTATAATACAGAATCTCTCACTTCAGTATCTCAAGCTGGTAGTGGTGGAGAACCTTTTGGTACAGAGACTGTTAATGCTTCTAAGTTCTCTGTTGACGATAAAGGACGTTTAACAACCGTAACGAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACATATGTTAGATATGATATCATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAAGCAATTACAGGAATTGCTGCAGGTGGTGGCGCTCCAACTCATACTGATGGTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTTGCTGCTGCAGCAGTAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTAGATAATACACAACTCCAAAACAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCGTAGAAAATTTTGAACTGGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACCGAGGATTCAATTATCTTAACTATCTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACCCTGATATTACTCTCGACGGCGCTCTTAATCAGACATTGGATAAGACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAAGTCAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAGTGCATCAGAAGCAACTGGTAAGGTCCATGTAGAGGATACAAAATTCCAAGATAATTACATCGCCACAACCAATGCGACGATGAACCTCGACCCTGGTGATGACCGTGCAGTCACTGGTTTAGTTCGTGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACAACAACTACAATTAATTCCACACAATTGACTGTAGATGATGTCACCATTCTACTTGGTGGTGATACTGTTCCTACAACTGATGATAATCTGGATCGTGGTATTGAATTCAACTATTATGACACTGAAGCACGCTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACCAATTATTCTGATTTAGGTGGTCATGCAGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCCACAAATACCAACGAAGTCTTTACGGGTACTGATTCTGGTATTATTGCAGGTAATGTAAAACTGACAACTGGTACTAACTCAACTTCTAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAATATCGGCGGTCTTCTAGATGTTGATAGTACATTGCGTGTTACTAGCACCTCTCGTTTCGACGATAATGTAGTTCTGCAGGGTGCTTCTAAGACTTTACAACTGAATAATGGTAGTGGTACAACCAAGATTGAATTCCAATCTACAACTGGTAACGGTTCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACTTCAATATTAATACTGATAAGTTTAATGTTGTTGCTACTTCTGGCAATACCTCCATTGCTGGCACATTGGGTGTTACAAACATTGCAACATTCTCTAACGACATTGATGCTAACGCCAACATGACATTGGCTGGTAACCTTCACATGGAGAGCACCAATGACATTACGGTTGCTAAGAATGTTGGCACTGGTGTTTGGGAGATTCAATCTAACGACTATGGTGCTCTCCGTCTTGATGGGGGCGCATATGTTGCTGGTGATGCACTGATTGATGGCACCCTACACGTTAACGGTGCTATTGAAGTTCAAGATAGTGCAACAGAGACTGAATCTAGACTGAACTGGTTGAGAGTTAGGTATAGAGGTCGTTTCGGTGACACTTATCAGGCAACTCCTTCCTATGCATCTCACAATACTACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTACATGTTGGTGGCACAGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGTGATACAGTTAAGTTTAGCGTTTTAGGTGCAACTGGTAATACTGACATTCAAGGCACATTCGATGTTGCTGGTAACTCCGAGTTCAATGGCACAGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTAAGAAATGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGATAATGTAACTGGCAACACCGATATCCAAGGCACTCTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGACCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGTACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTAAGAAGTGGTAGCACGGATAAGATGACCGTTGCTTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACCATCAACGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCTGATAACGGTAATACAAATATCATCGGCACACTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTCGGTGCATCTGGTATTGTCACACTTACCAATAACACTGAGCAAACTCTGACAGGTAGTTATGGTGCTGATGGTGCTCTAAGACTTACTGGTGGTGCTGCTGTCCAAAGAAACCTCGCTGTTGGTGGTGCTGCAAGAGTCTACGGCAACACTGAACTGACTGGTACTCTCGACCTTAACAATAGTGCAGACATCTCTGGTGCTTTAGTAACACATGACAATGTTACGATTACTGCAGACAATAAGACATTTGCAATTCAGAATGCATCTGCTGCTAATAAATTTACGGTAGATACTGATAATGGAAACACTGATCTTCGTGGCACCTTAGACATCGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAATCTTACTGTTACTGGAAATCTTACTATCAATGGAACGACAACTACTGTCAACTCTACGGTCACAACTATCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGATAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAGTAGACGCAACTAATTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGACGGCAATCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGTGCTGGCACTGCACTCGATGTTGATGCAAATGCAAATATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTGGTCATTCCTAACACAACCAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCCGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCTCTTACTGCAGATACACTTAAAACGGCAAGAAACATCACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACAATCACCACAACATATGTTGACGCAGACATCACTGCACTTGCTGCAATGGCAGGAACTGGTTTTGTTTCCAGAACTGCTGCCAATACATATGCTCAACGCACACTCGCTGTCACAGCATCTTCTGGTATTACACTGACAAATGCTGATGGTGTTTCTGGCAATCCAACCATTAACGTCGCTTCTACAGCAAGTAACTCAGCAAACAACCTCGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTGGGACTATTACTGCAGCATTAGTTGGTAATGTTACTGGTCAAACATCTGATATTAGTAATCACGATACTGGAGACCTTTCTGAGGGATCCAATCTATACTTTACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAGTTAATGCTCTGATTGTTGCGGGTACAGGTGTCACTAAGGCATATAACGATTCTGCAGGCACCTATACGCTTACTGTAACGCAGGCAGACATCGATACCGACAATGTAACCGAAGGTTCCACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGTACACACTTCACATATGGTACAGGTATTGAACTTAGCGGTGCAGGTGCTCTGAGTGTCACTCAGGCAGACATTGATACTGATAATGTAACTGAAGGTTCTACTAATATCTTCTACACGGAGGCACGCTTTAATACAAGTCTTGCAACTAAAGATACCGATGATGTGAGTGAAGGTTCTTCCAATCTATACTTCACTAATACTCGTGCAGATACCCGTGCTGATTTGAGAGTTGCAGCAGCAACTGGTGCAAACCTAGATCTTTCTAGTAAGTCTACCACCAATCTTTCTGAGGGTACAAATCAGTACTACACTGAAGCAAGAGTTCAAGATAAACTCGATAATGCGTTTGCTCAACTTAGTGCAATGCTCAATAATCTTGCAACCGCCACTACTTTAGTATTAAATCTATCTGGTGATCCTACACCTGGTGACGTAACTACTTTAAATAATGGCACATTATCTGGTGGTACATTGTATAACACTGGAACTGCAGTTGCTACCACCTCTAGCGGTAGTGGCACTGGATTAACAGTAGATATCACCGCATCTGGTGGTGCTATCACTGCAGTTGCTATCAACGCAGCAGGTTCTGGTTATGTAGTTGGTGAGACAATTACAATCTCTACTGGTGGTGGAGATGCCACAATAAATGTCTCTGCTGTTACTGAAATGGCAATTGGTGATACTGTCACAGGCAGTACATCAGGCACCACAGGTGTTATCACTGCTGTTGGTGCAACTTCAGTTACTGTTGACACTGTTGATGGATTCTTTAAGAAGACTGAGACAGTATCTGCTGGAGATGTTTCTACATTAACAATCACTTCATTCGCCTGA

Genome Context

Tertiary structure

AOO17513.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 54.7
Oligomeric state monomer
Download structure