Protein

View in Explore
Genbank accession
AOO17513.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGATAWNTLRYERPVESNTNTPNSLVQRDADGSFSAGTITSTLIGNASTSTRLEQTRQIQLSNDVTATGNFDGSQNLNLSTALSLINTLPHYLEGGLSTTTRTFTEVTVDQKGRVINARTPSQLNLTDYGLDGSATSDTTLAQPWNANLEAISDETGTGLYSKTAAGVVETRLITGAAGQIVITDGGGISGNPLVSLSVQANVVPGDYNTESLTSVSQAGSGGEPFGTETVNASKFSVDDKGRLTTVTNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSRVYQAITGIAAGGGAPTHTDGSDAGGWRYLAAAAVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTVENFELDQELTATTGYRGFNYLNYLKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLSQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQISASEATGKVHVEDTKFQDNYIATTNATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGNLQIDGTTTTINSTQLTVDDVTILLGGDTVPTTDDNLDRGIEFNYYDTEARLGFYGWDTNYSDLGGHAGGYRFLHAATNTNEVFTGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDSTLRVTSTSRFDDNVVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNINTDKFNVVATSGNTSIAGTLGVTNIATFSNDIDANANMTLAGNLHMESTNDITVAKNVGTGVWEIQSNDYGALRLDGGAYVAGDALIDGTLHVNGAIEVQDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYSGDTVKFSVLGATGNTDIQGTFDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGASGIVTLTNNTEQTLTGSYGADGALRLTGGAAVQRNLAVGGAARVYGNTELTGTLDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKFTVDTDNGNTDLRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTIDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKIGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDGNLRAGSLNLTGAGTALDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASAATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNALTADTLKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTTYVDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLAVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTGDLSEGSNLYFTNERVDDRVNALIVAGTGVTKAYNDSAGTYTLTVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNIFYTEARFNTSLATKDTDDVSEGSSNLYFTNTRADTRADLRVAAATGANLDLSSKSTTNLSEGTNQYYTEARVQDKLDNAFAQLSAMLNNLATATTLVLNLSGDPTPGDVTTLNNGTLSGGTLYNTGTAVATTSSGSGTGLTVDITASGGAITAVAINAAGSGYVVGETITISTGGGDATINVSAVTEMAIGDTVTGSTSGTTGVITAVGATSVTVDTVDGFFKKTETVSAGDVSTLTITSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:1907 AA
molecular weight: 196075,33840 Da
isoelectric point:4,18906
aromaticity:0,05821
hydropathy:-0,16555

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–196
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1607
AOO17513.1
1 1907
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-196 | STR 345-1578 | RBD 1643-1907
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM12
[NCBI] 		1278402 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Brizovirus > Brizovirus syn33
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO17513.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349318 [NCBI]
CDS location
range 88640 -> 94363
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATACAGTTAAGACGCGGTGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCGAATCCAACTCTTGCACAGGGTGAACTTGGAATTGAACTTGATACTGGTCGGTTCAAAATCGGTGATGGTGCAACGGCATGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTAGAGTCCAACACTAATACTCCAAACAGTCTTGTACAGAGAGACGCAGACGGAAGTTTTTCTGCGGGTACTATTACATCAACTCTTATTGGTAATGCTTCAACATCAACTAGACTTGAACAGACTAGACAGATTCAGTTATCTAATGATGTAACAGCGACTGGTAACTTTGATGGTTCCCAAAACTTAAATTTAAGTACTGCTTTATCACTGATCAATACTCTTCCTCATTACTTGGAAGGTGGTCTAAGCACTACTACTAGAACTTTTACTGAGGTTACTGTTGATCAGAAAGGTAGAGTTATAAATGCTAGAACTCCTTCTCAACTAAATCTTACTGATTATGGTCTTGATGGTTCTGCAACTAGTGACACAACTTTAGCACAACCTTGGAATGCAAACTTAGAAGCAATTTCAGACGAAACTGGTACTGGTTTATATTCAAAAACTGCAGCGGGTGTTGTTGAGACCAGACTTATTACTGGTGCTGCTGGTCAAATTGTTATCACTGACGGTGGTGGTATTAGTGGCAATCCTCTTGTCTCATTGTCGGTTCAAGCAAACGTTGTTCCTGGAGACTATAATACAGAATCTCTCACTTCAGTATCTCAAGCTGGTAGTGGTGGAGAACCTTTTGGTACAGAGACTGTTAATGCTTCTAAGTTCTCTGTTGACGATAAAGGACGTTTAACAACCGTAACGAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACATATGTTAGATATGATATCATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAAGCAATTACAGGAATTGCTGCAGGTGGTGGCGCTCCAACTCATACTGATGGTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTTGCTGCTGCAGCAGTAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTAGATAATACACAACTCCAAAACAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCGTAGAAAATTTTGAACTGGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACCGAGGATTCAATTATCTTAACTATCTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACCCTGATATTACTCTCGACGGCGCTCTTAATCAGACATTGGATAAGACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAAGTCAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAGTGCATCAGAAGCAACTGGTAAGGTCCATGTAGAGGATACAAAATTCCAAGATAATTACATCGCCACAACCAATGCGACGATGAACCTCGACCCTGGTGATGACCGTGCAGTCACTGGTTTAGTTCGTGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACAACAACTACAATTAATTCCACACAATTGACTGTAGATGATGTCACCATTCTACTTGGTGGTGATACTGTTCCTACAACTGATGATAATCTGGATCGTGGTATTGAATTCAACTATTATGACACTGAAGCACGCTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACCAATTATTCTGATTTAGGTGGTCATGCAGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCCACAAATACCAACGAAGTCTTTACGGGTACTGATTCTGGTATTATTGCAGGTAATGTAAAACTGACAACTGGTACTAACTCAACTTCTAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAATATCGGCGGTCTTCTAGATGTTGATAGTACATTGCGTGTTACTAGCACCTCTCGTTTCGACGATAATGTAGTTCTGCAGGGTGCTTCTAAGACTTTACAACTGAATAATGGTAGTGGTACAACCAAGATTGAATTCCAATCTACAACTGGTAACGGTTCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACTTCAATATTAATACTGATAAGTTTAATGTTGTTGCTACTTCTGGCAATACCTCCATTGCTGGCACATTGGGTGTTACAAACATTGCAACATTCTCTAACGACATTGATGCTAACGCCAACATGACATTGGCTGGTAACCTTCACATGGAGAGCACCAATGACATTACGGTTGCTAAGAATGTTGGCACTGGTGTTTGGGAGATTCAATCTAACGACTATGGTGCTCTCCGTCTTGATGGGGGCGCATATGTTGCTGGTGATGCACTGATTGATGGCACCCTACACGTTAACGGTGCTATTGAAGTTCAAGATAGTGCAACAGAGACTGAATCTAGACTGAACTGGTTGAGAGTTAGGTATAGAGGTCGTTTCGGTGACACTTATCAGGCAACTCCTTCCTATGCATCTCACAATACTACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTACATGTTGGTGGCACAGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGTGATACAGTTAAGTTTAGCGTTTTAGGTGCAACTGGTAATACTGACATTCAAGGCACATTCGATGTTGCTGGTAACTCCGAGTTCAATGGCACAGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTAAGAAATGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGATAATGTAACTGGCAACACCGATATCCAAGGCACTCTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGACCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGTACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTAAGAAGTGGTAGCACGGATAAGATGACCGTTGCTTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACCATCAACGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCTGATAACGGTAATACAAATATCATCGGCACACTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTCGGTGCATCTGGTATTGTCACACTTACCAATAACACTGAGCAAACTCTGACAGGTAGTTATGGTGCTGATGGTGCTCTAAGACTTACTGGTGGTGCTGCTGTCCAAAGAAACCTCGCTGTTGGTGGTGCTGCAAGAGTCTACGGCAACACTGAACTGACTGGTACTCTCGACCTTAACAATAGTGCAGACATCTCTGGTGCTTTAGTAACACATGACAATGTTACGATTACTGCAGACAATAAGACATTTGCAATTCAGAATGCATCTGCTGCTAATAAATTTACGGTAGATACTGATAATGGAAACACTGATCTTCGTGGCACCTTAGACATCGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAATCTTACTGTTACTGGAAATCTTACTATCAATGGAACGACAACTACTGTCAACTCTACGGTCACAACTATCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGATAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAGTAGACGCAACTAATTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGACGGCAATCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGTGCTGGCACTGCACTCGATGTTGATGCAAATGCAAATATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTGGTCATTCCTAACACAACCAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCCGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCTCTTACTGCAGATACACTTAAAACGGCAAGAAACATCACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACAATCACCACAACATATGTTGACGCAGACATCACTGCACTTGCTGCAATGGCAGGAACTGGTTTTGTTTCCAGAACTGCTGCCAATACATATGCTCAACGCACACTCGCTGTCACAGCATCTTCTGGTATTACACTGACAAATGCTGATGGTGTTTCTGGCAATCCAACCATTAACGTCGCTTCTACAGCAAGTAACTCAGCAAACAACCTCGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTGGGACTATTACTGCAGCATTAGTTGGTAATGTTACTGGTCAAACATCTGATATTAGTAATCACGATACTGGAGACCTTTCTGAGGGATCCAATCTATACTTTACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAGTTAATGCTCTGATTGTTGCGGGTACAGGTGTCACTAAGGCATATAACGATTCTGCAGGCACCTATACGCTTACTGTAACGCAGGCAGACATCGATACCGACAATGTAACCGAAGGTTCCACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGTACACACTTCACATATGGTACAGGTATTGAACTTAGCGGTGCAGGTGCTCTGAGTGTCACTCAGGCAGACATTGATACTGATAATGTAACTGAAGGTTCTACTAATATCTTCTACACGGAGGCACGCTTTAATACAAGTCTTGCAACTAAAGATACCGATGATGTGAGTGAAGGTTCTTCCAATCTATACTTCACTAATACTCGTGCAGATACCCGTGCTGATTTGAGAGTTGCAGCAGCAACTGGTGCAAACCTAGATCTTTCTAGTAAGTCTACCACCAATCTTTCTGAGGGTACAAATCAGTACTACACTGAAGCAAGAGTTCAAGATAAACTCGATAATGCGTTTGCTCAACTTAGTGCAATGCTCAATAATCTTGCAACCGCCACTACTTTAGTATTAAATCTATCTGGTGATCCTACACCTGGTGACGTAACTACTTTAAATAATGGCACATTATCTGGTGGTACATTGTATAACACTGGAACTGCAGTTGCTACCACCTCTAGCGGTAGTGGCACTGGATTAACAGTAGATATCACCGCATCTGGTGGTGCTATCACTGCAGTTGCTATCAACGCAGCAGGTTCTGGTTATGTAGTTGGTGAGACAATTACAATCTCTACTGGTGGTGGAGATGCCACAATAAATGTCTCTGCTGTTACTGAAATGGCAATTGGTGATACTGTCACAGGCAGTACATCAGGCACCACAGGTGTTATCACTGCTGTTGGTGCAACTTCAGTTACTGTTGACACTGTTGATGGATTCTTTAAGAAGACTGAGACAGTATCTGCTGGAGATGTTTCTACATTAACAATCACTTCATTCGCCTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
893c2b4e7be8036c1b1558d5a7bd5ac8e23ef01556de7bf83e15746d91050429
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5238
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50