Protein

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Genbank accession
QPI17033.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
Protein sequence
MEDKEKNLLQINEEINSIKSKFSSLLQEQDTIKNLSEDNRNKINVLNSSIDSLDKENDNLIEQLRNIDGSHDINVDLTNYVTLDTLKTELRKYQKLSIDYIDSIVEGGWDSDIKGNLSNLNGRVSANEESLSVAMSKVNKYESSIQYLSTKVEQTAESIKSIATDYTLNEINNSITKLESFREQTARVLQDTVTRTDIDTIKNKVSEFESQVTQFADLIEQTVSKTEIDGIVIGGKNLLQNSLAISGNWILQPSTLTSTKPNALTFGQDDNGKSYFTINADGIDGQVGAQSYNSFKLEYNETYTISFDFRSDTFNRLDYCYFIDPSGNYSTPIAEKYLDIDEEWHRYSFVYKQTLTGRNSTKLLIGVDTALNGLSGTFDIARVKVERGSVSSDWTAAPEDYDNMLENYNKTINSKLTNIEKNAVGLGDVVTAAFKDGIISNAERIAIEKQKNIIDKDKTEIDKVFNTLYPNKMMTNSVKTDLKNKYDLFNEKYNILIQDITNSISDGVATQEEIAQFNTNFLRYNEAQSNIKDAIQKAIESISNGYAVTEANKITVGGMNLISNDNITALGSATLTKTNYLKYGELNVALTANSQGIKFKMDKVRSRREHILSFNLEKKTGTLTNVDISIPNSTITNVFVNSLPQGTDSRNITFDDTSSLTLVEVVFIPNDSFTTSTLINMIINKNGTFPMSVDVEGLKIEEGNKSTAWQPSINDSNARITNIESRISQTESSIDLAVTKEVYGADKTKIEQMASALSILSDGITMSSSSGNKLSTLNVDPDAIKLKSKMIDINDGDVIISNGKATIKEAAITNLMSKNIVVQTMLDAMGEVKGGITIKRPDGGYLVYNGMPRFTTSYVRSEPGVQDLMSNGTPRFKNVGNSFMFSDKTTGSSFRRAMTFYGQHETRWLHIGIWYATPQCGIDIKVDSFNEQNGVIFDKVVSIPKDTSTSVTKTKFKQIIVDLGTPEQSIASVAIRARVKPGQKGNAWFLNSYIFGRN
Physico‐chemical
properties
protein length:998 AA
molecular weight: 110963,03120 Da
isoelectric point:5,09007
aromaticity:0,07615
hydropathy:-0,42355

Domains

Domains [InterPro]
Coil
Unmapped
1–21
Coil Coil G3DSA:2.60.120.260 DC_1035
DC_0899
STR
2–319
DC_0899
IPR008979
STR
270–386
IPR008979
DC_1272
STR
271–659
DC_1272
QPI17033.1
1 998
Architecture
STR
RBD
STR 2-659 | RBD 660-988 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage vB_StaM_SA1
[NCBI] 		2785444 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus lentus
[NCBI] 		42858 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPI17033.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW218148 [NCBI]
CDS location
range 87428 -> 90424
strand -
CDS
ATGGAAGATAAAGAAAAAAATCTTCTTCAGATAAATGAAGAAATAAATTCTATTAAATCTAAATTTAGTTCTTTATTACAAGAGCAAGATACAATTAAGAATCTTTCAGAAGATAATAGAAATAAAATAAACGTATTAAATAGCAGTATAGATAGTTTAGACAAAGAAAATGATAATTTAATCGAACAGTTAAGAAATATTGATGGAAGTCATGATATTAATGTAGATTTAACAAATTATGTTACGTTAGATACATTAAAGACTGAGTTGAGAAAATATCAAAAATTAAGCATTGATTACATTGATAGTATTGTCGAAGGTGGATGGGATTCTGATATCAAAGGCAATCTATCTAATCTTAATGGTAGAGTATCTGCGAACGAAGAATCTCTTTCAGTAGCAATGTCCAAAGTTAATAAATATGAATCATCTATACAATACTTAAGTACTAAAGTAGAACAAACTGCAGAGTCAATTAAGAGTATTGCTACTGATTATACTCTAAATGAAATTAATAACAGTATTACTAAATTAGAATCATTTAGGGAACAAACTGCAAGAGTATTACAAGATACTGTTACTAGAACTGACATTGATACAATTAAGAATAAAGTATCTGAATTTGAAAGTCAAGTAACACAATTTGCAGACTTAATTGAACAAACAGTTTCTAAAACAGAAATAGATGGTATTGTTATTGGTGGTAAAAACTTATTGCAAAACTCATTAGCCATTTCTGGAAACTGGATTTTACAACCAAGTACATTAACTTCAACAAAACCAAATGCTTTGACTTTTGGTCAGGATGACAATGGTAAAAGTTACTTTACAATTAATGCTGATGGTATTGACGGTCAAGTGGGTGCACAAAGTTATAATAGTTTCAAATTGGAATATAATGAAACTTATACAATTTCATTTGATTTTAGATCAGATACATTTAATAGACTTGATTATTGTTACTTTATTGACCCTTCTGGTAATTATTCTACGCCAATCGCTGAGAAATATTTGGATATTGATGAGGAATGGCATAGATATTCATTTGTATACAAACAAACTTTAACAGGAAGAAACAGTACTAAACTTCTTATTGGTGTAGATACTGCCTTGAATGGTTTAAGTGGTACATTTGATATTGCTAGGGTTAAAGTTGAAAGAGGTAGTGTATCTTCTGACTGGACCGCAGCTCCTGAAGATTATGATAATATGTTAGAAAACTATAATAAGACTATTAATAGTAAATTAACTAATATCGAAAAGAATGCAGTAGGATTAGGTGATGTGGTTACAGCTGCTTTTAAAGACGGTATTATCTCTAATGCTGAAAGAATTGCTATTGAAAAACAGAAAAACATTATTGATAAAGATAAAACCGAGATTGATAAAGTCTTTAACACTCTTTACCCTAATAAAATGATGACTAATTCAGTTAAGACAGATCTTAAGAATAAATATGACTTATTCAATGAGAAATATAATATTCTTATACAAGATATTACTAATAGTATTAGTGATGGAGTTGCAACACAAGAAGAAATAGCTCAATTTAACACAAATTTCTTAAGATACAATGAAGCTCAATCAAATATTAAAGATGCGATACAAAAAGCTATTGAAAGTATATCTAATGGGTATGCTGTAACAGAAGCTAATAAAATCACTGTAGGTGGTATGAACTTAATCAGTAATGATAATATTACAGCATTAGGATCTGCTACATTAACTAAAACTAATTATCTAAAATATGGTGAATTGAATGTTGCTTTAACTGCTAACAGTCAAGGAATTAAATTTAAGATGGATAAAGTAAGAAGTAGAAGAGAACATATCTTAAGTTTTAACTTAGAGAAGAAAACTGGTACATTAACTAATGTTGATATTAGTATACCAAATTCAACTATAACTAATGTATTCGTGAATAGTTTACCTCAAGGTACAGACTCACGTAATATTACTTTTGATGACACTTCTTCTTTAACTTTAGTAGAAGTAGTATTTATTCCTAATGATTCATTCACTACAAGTACATTAATAAATATGATTATTAATAAGAATGGTACATTCCCAATGTCAGTTGATGTTGAAGGATTAAAAATTGAAGAGGGTAATAAATCTACTGCTTGGCAGCCTTCTATCAATGATAGTAATGCTAGAATTACTAATATTGAAAGTAGAATTAGTCAGACTGAGAGTAGTATAGACTTAGCTGTTACTAAAGAAGTTTATGGAGCTGATAAAACTAAGATTGAACAGATGGCTTCGGCATTATCTATTTTATCTGATGGTATTACTATGTCATCTTCTTCAGGTAACAAGTTATCTACTTTAAATGTTGATCCTGATGCAATTAAATTGAAATCTAAAATGATTGACATTAATGATGGTGATGTCATTATATCTAATGGTAAAGCCACTATTAAAGAGGCAGCCATTACTAATTTAATGTCTAAAAATATTGTAGTTCAAACTATGTTGGATGCTATGGGTGAAGTTAAAGGTGGTATTACTATTAAACGTCCTGATGGAGGTTATTTAGTTTATAATGGTATGCCTAGATTTACTACATCTTATGTACGTTCAGAACCAGGGGTTCAAGATTTAATGTCTAATGGTACTCCTAGATTTAAAAACGTTGGTAACTCATTCATGTTCAGTGATAAAACTACAGGAAGTTCATTTAGAAGAGCGATGACTTTCTATGGTCAACATGAAACTAGATGGCTTCATATTGGTATTTGGTATGCTACTCCACAATGTGGTATTGATATTAAAGTAGATTCATTTAACGAGCAAAATGGTGTTATATTTGATAAAGTTGTCTCTATACCTAAAGATACTTCTACTAGCGTAACTAAAACTAAATTTAAGCAAATAATTGTTGACTTGGGAACTCCTGAACAATCTATAGCTTCAGTAGCTATACGTGCTAGAGTTAAACCGGGACAAAAAGGTAATGCATGGTTCTTAAACTCTTATATATTTGGAAGAAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
672d72bc13ba76039375a64be7d9abf1499d4c22567ba2e204925b03b947acdb
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3293
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50