Protein

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Genbank accession
XTJ55674.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,53
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,63
Protein sequence
MSDLLKQHFRATNGLDAGGNKVINVALADRNVKTDGVSVEYVIQENTIQKYDPTRGYLTDFAVTYGRRIWIANKDIPKPAGDFNQANWTSLRVDPNWIYTVRKGEFEIQSGQFINVDSNAAGNATLLLPLAPDEGDTIVVRDIGGRPGYNGILIKAQDTGASIVFGESRLREVRLTRPYSQIMLTFSNGAWRASLTDFGDTAKMVVPNGIVPTQVQAGDNVVRRYTSNSEIFITLPLFANSNDIINFTDLDGTSPINHMTVRTFDPTISIGTPGQTEVQVRTSGTGFLVYDSIDKIWRIFENDLRTRVRIITSDVTLMPNEHISVFGTDNNTVKTINVTLPTDVAVGDTVTIAMNYMRKGQTVVIKASGGDTIASNLNLLQFPKRSEYPPDAAWVQSSSITFNGTTSYVPVLGLAYIEDKASGKSYWIVTESDPTVERVDAKDNTTRARLGVIALATQAQANAESNPEKELAITPETLNGRRSTETQTGIARIATSSEVNQSTTASYLDNVIVTPKKLNERAATETRRGLAEIATNAKMDAGTDDFTIVTPKKLLYRTTSDSRLGVIQLVKTGGAPNTTADRSSAGTGIFDHSDYKNAVTPKTLREYKATVNQSGIVWLATDSEVRNGTPASSNIPTVVTPESLHKKVATDGAIGLIQIATQTEVNAGGVTNKAVTPKTLNDRTATNNRTGIARFATPGAQGEFEAGTSSTVMVNPKLLFDKFANTDRIQVNTSSGLTITGNLWDHYTINIQEASTSQRGTTTLATAAEVRTGTDAKKIVTAAALHAKTATEGAIGLAQYATQAQVDAGTLSDRIVPPAYLKQTIQVTESWQATDSVRGTVRLSTGDGTWKGNDTNGSTLPDNGYASKGVAVSPYELNLTLKHYLPRLGKAYDTGMLGGQTPDKYARRDIAQTISGAWTFSQDTSFSNNISVKNVIYANGGEVKISPTADTGIVHVRFQNRDGSERGIIYAEPQTASAGNLKVRVKNGTGTTAASQTYTFGGNGTLEVPNEVSTKTLRSSGNAIVGGTVMVKDVQMLAVEGLNSIFGAQSQSAFIRSRDADTQIFAQDSTGSYPILTTKNYARLADGRYVKKAGDTMTGNLNINSSAIVITGSESWYVPTNETVIRQGSWTAEIKDATKLKGLRGYMVPIRTPIDPGNPSTLVVTGYEEKTAAGGVLTQVGVTTNNTYQLWTPYPPTTETADKRFAHTVWMRIYNPNLNKFDDWMRVFTSATPPTAADIGAPSSVSTQVKTLEVLEWIKLGPVKIWPDRPNQTLKFEWVGD
Physico‐chemical
properties
protein length:1281 AA
molecular weight: 138418,33170 Da
isoelectric point:8,07694
aromaticity:0,07182
hydropathy:-0,32927

Domains

Domains [InterPro]
IPR048391
1127–1228
IPR048391
XTJ55674.1
1 1281
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage 15882-3-1
[NCBI] 		3373938 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XTJ55674.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ537370 [NCBI]
CDS location
range 51773 -> 55618
strand +
CDS
ATGAGCGATTTACTGAAACAACATTTCCGTGCAACGAACGGCTTGGACGCAGGCGGAAATAAAGTTATAAATGTGGCACTTGCTGACCGCAACGTTAAAACCGACGGCGTCTCCGTCGAGTACGTTATTCAAGAAAACACTATCCAAAAATATGACCCGACACGTGGGTATCTCACTGATTTTGCTGTGACTTATGGACGTCGTATCTGGATTGCAAATAAAGATATTCCAAAGCCTGCTGGAGATTTTAACCAGGCGAATTGGACTTCTTTACGTGTTGACCCGAACTGGATTTATACCGTCCGTAAAGGAGAGTTTGAAATTCAATCTGGTCAGTTCATCAACGTTGACTCTAACGCTGCAGGTAATGCTACATTACTGCTTCCGTTAGCACCGGATGAAGGCGATACCATCGTAGTTCGTGATATTGGCGGGCGTCCTGGCTATAACGGAATCTTAATTAAAGCACAAGATACTGGTGCGTCTATCGTATTTGGTGAATCGCGTCTGCGTGAGGTAAGACTTACACGTCCGTATTCACAAATTATGCTTACGTTTAGTAATGGTGCATGGCGTGCGAGTTTAACAGATTTTGGCGATACTGCCAAGATGGTAGTTCCGAACGGGATTGTTCCGACGCAAGTTCAGGCAGGTGATAACGTAGTTCGTCGTTATACTTCCAACTCAGAGATTTTTATTACTCTGCCGTTGTTCGCTAATTCAAACGATATCATCAATTTTACTGACCTTGACGGTACATCGCCAATTAACCATATGACTGTGCGTACGTTTGACCCAACTATCTCAATTGGGACTCCTGGGCAAACAGAGGTTCAAGTACGTACTTCAGGCACCGGATTTTTGGTATATGACTCGATTGACAAAATCTGGCGTATTTTTGAAAATGATTTACGCACCAGAGTAAGAATAATTACTTCTGATGTTACTTTAATGCCTAATGAGCATATTTCTGTATTTGGCACAGATAACAATACCGTTAAAACAATTAACGTTACTTTGCCTACAGACGTAGCTGTTGGGGATACTGTCACAATCGCAATGAATTATATGCGCAAAGGACAGACTGTAGTAATTAAAGCTTCTGGTGGTGATACTATCGCTAGCAATTTGAATTTACTGCAATTTCCAAAACGTTCAGAGTATCCACCTGATGCAGCATGGGTGCAATCAAGCTCAATTACCTTTAACGGAACTACATCGTATGTTCCTGTTCTTGGGCTTGCATATATTGAAGATAAAGCATCCGGAAAAAGCTATTGGATTGTAACTGAATCTGACCCTACCGTAGAACGAGTTGATGCTAAAGACAATACAACTAGAGCCCGATTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACGCAGGCTCAAGCTAATGCGGAGTCAAACCCAGAAAAAGAATTAGCAATTACGCCAGAAACCTTAAATGGACGTCGTTCTACTGAAACCCAAACTGGTATAGCAAGAATTGCAACTTCCAGCGAAGTTAATCAGTCAACAACTGCTTCTTACTTGGATAATGTAATCGTTACTCCTAAAAAGCTTAACGAAAGAGCTGCTACTGAAACTCGTAGAGGTTTAGCAGAGATTGCGACTAATGCTAAAATGGATGCAGGAACAGACGATTTTACAATTGTTACTCCTAAGAAGCTGCTTTATCGTACTACGTCGGATTCACGGTTAGGTGTTATTCAATTAGTAAAAACTGGTGGTGCTCCTAACACAACTGCTGATCGTTCTTCTGCTGGCACCGGTATATTCGATCATTCTGATTACAAAAATGCAGTTACTCCAAAAACTCTTCGTGAGTATAAAGCTACTGTAAACCAATCAGGAATAGTCTGGTTAGCAACTGATAGCGAAGTTAGAAACGGAACTCCTGCTTCTTCAAATATTCCTACGGTTGTTACACCAGAATCTTTGCATAAAAAAGTTGCTACTGATGGAGCAATTGGTTTAATCCAAATAGCTACACAAACTGAAGTTAATGCTGGCGGCGTGACTAATAAAGCAGTTACACCTAAAACATTAAATGACCGTACAGCAACTAACAATCGTACTGGTATTGCTCGCTTCGCGACACCTGGTGCCCAGGGTGAATTTGAAGCTGGTACTTCAAGTACAGTAATGGTAAACCCTAAATTACTGTTCGATAAATTTGCTAATACCGATCGTATCCAAGTTAATACTAGTTCTGGCTTAACTATTACTGGGAACCTCTGGGACCATTATACCATCAACATACAGGAAGCAAGTACTTCTCAAAGAGGTACAACCACTCTTGCTACTGCTGCTGAGGTTAGAACTGGAACCGACGCTAAGAAAATAGTTACTGCTGCCGCGTTACATGCTAAAACAGCAACCGAAGGAGCTATCGGTCTTGCTCAGTATGCTACACAGGCACAAGTTGATGCAGGCACATTAAGTGATAGAATTGTTCCTCCTGCTTACTTGAAACAGACTATTCAGGTAACAGAGTCATGGCAAGCTACAGACAGCGTTAGAGGGACCGTGAGGCTATCTACAGGCGATGGAACGTGGAAAGGTAATGATACCAATGGCTCAACTCTTCCGGATAACGGGTATGCCTCTAAGGGCGTCGCAGTGTCTCCGTATGAATTGAACCTTACACTGAAACATTACTTGCCTCGTCTCGGTAAAGCCTATGACACAGGAATGTTAGGTGGTCAAACACCAGACAAATATGCTCGTCGCGATATAGCGCAGACTATTTCTGGAGCTTGGACATTTAGTCAGGACACTTCATTTAGCAATAATATTTCTGTCAAGAATGTTATATATGCTAATGGTGGTGAAGTTAAAATTTCTCCAACTGCTGACACTGGAATTGTGCATGTTCGTTTTCAAAATAGAGACGGAAGCGAGCGTGGTATAATTTATGCTGAGCCTCAAACAGCTTCAGCCGGAAACTTAAAAGTTCGCGTAAAAAACGGAACAGGAACTACTGCTGCAAGCCAGACCTACACATTTGGCGGTAACGGTACGTTAGAAGTTCCTAACGAAGTGTCAACTAAAACTCTGAGGTCTTCTGGAAATGCAATAGTTGGCGGAACTGTTATGGTTAAGGACGTTCAGATGCTTGCTGTCGAGGGATTGAATTCAATATTCGGTGCCCAATCACAGTCCGCATTTATTCGTTCCCGTGACGCTGATACACAAATTTTTGCACAGGATTCAACTGGATCGTATCCAATTTTAACTACCAAAAACTACGCAAGATTAGCTGATGGCCGTTATGTCAAGAAAGCTGGTGATACCATGACCGGCAATCTTAACATAAATAGTTCTGCTATCGTCATTACGGGTTCTGAATCCTGGTATGTGCCAACGAATGAAACTGTAATAAGACAAGGTTCTTGGACTGCTGAAATCAAAGACGCTACTAAATTGAAAGGTCTTCGTGGTTATATGGTTCCAATCAGAACACCGATTGACCCTGGTAACCCAAGCACTTTAGTAGTGACTGGGTATGAAGAAAAAACTGCAGCTGGTGGTGTTTTAACTCAGGTTGGTGTAACTACAAACAATACTTATCAGCTTTGGACGCCTTATCCTCCGACAACCGAAACTGCTGATAAGCGTTTCGCGCATACTGTGTGGATGAGGATTTATAATCCAAACCTTAATAAGTTTGATGATTGGATGCGAGTATTTACATCTGCTACTCCTCCAACTGCAGCTGATATCGGAGCTCCGAGCTCAGTATCAACTCAGGTTAAAACCCTTGAAGTTTTGGAATGGATTAAGCTTGGTCCAGTTAAAATCTGGCCAGACCGTCCAAATCAAACTCTCAAATTTGAATGGGTAGGTGATTAA

Tertiary structure

PDB ID
4031ac6cb4a7d528e91a3d785d367bdc9eb583f08dedf2dc67fd3452803a0425
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2298
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Phage training: Klebsiella pneumoniae Burke,K.A., Filippov,A.A., Nikolich,M.P. and Peters,T.L. 1997-09 — GenBank