Protein

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Genbank accession
AIX34070.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MARTVPGSGAQIKPIFDNLFGVRAVEVINPGIGYDPTDPPRLTITGCGIPEAEAILYPIIDSDSGKIIHIRVLERGRGYDPLRMQIVPTSESLGVINSFDINKIWQNYPNSLTSGTFEVDSEGNLVDRLRIVSDNDPKPADILTERDGSGLISDRNFDQVFIYRGGKQVPFGQNRTFQKNKSLGIMANGVFLHTPEWGASAGDAPIGFELDSVLESNVKQSDVYDAVIDSNTYYYQSSRLINHFKLDHSVLDWGLHKVFTWNLKVEYGNLLVDISDLDETIGLVEVGRTIVEIGGDGEAEVVKIVRNAQNVITQLYLRDVTGTFQESSAVLGSNGFSFNISSVPLSLNLFYINFGPDAALFGSFIPDTYYLAPENIQVRKNYVIIFDQSDASNQQGIGHPIQFSTTPDGELNSGSLLYNSTGASAAVAADYENEFRSIFIMNEDETNNIYFYCKYHRHMSGYEGQEGYISLSTSQDTEVSDNDYYTTNFFKERIVITPDDLQTGYNLNLKSAGLVSNGTGAGSSGGFAIGNHYKLNGSGSQRWVRFDLDLRGVVTFDAEIIRGNDSNGGEDPDVGEELRVYFAFNTTYGSIGIANYNDSSFDSLKTVTIAVPPSSRNENQTVYLYQNGAEGSSFDHWGIRNITVGSGADDFSRHPDGHSKILGMSFDGYPIYGPYGYFGANNAVQRAADSYRLKVGAEIDGAREEVITPSSTTYAVTVSSGKFLYDGSIPNFLNLKRGNTYIFNQDDASNDGNILLLSNDSDGWHPTQDVGDVGNLSYLYQHPKITYSLDGSEVTYSQYVTGFTTSSTRQLQIVIPADVPKTLYTYSYANAQYGVRSVQDGYSMGMLVQDYIYDSTEGDLDQFNGLYVVTPEYPNGTYAYFLTESSNGTPTYPYCIGPQFFGAPLFEGDPVPALASVSPSGAEGEVVLKDDGSIDYIRMTKNGDGYFGTAEARVLGGEGSGATASPVVQTITGLTIRNEGRSFATPPTLVFEGGGGQGAQGAAEISTLGKVTSITITDDGDFYQEPPTILIDGGGGGGAKAIANIDQGKISTIELTDSGQGYVNPPRIIFTKLINLKRKTRSRQSLNSQFQYLTGLTKTTTPDATEIFVNSTNAFPGSGQFILNNEIVTYTGKATGKFTGLTRGTNFNYDQRVILDSTQDVAGVSSYNFNVGDVITRRVESSSNKLAKVYDWDPTTKELLVTFEIDELAFIDAGFAATEDAIVQFGGGLPDSSTASQLPHNTIVSIGDNITTLTVPISSIQDRTFEDDDENEDPDNAGVFLGDGIPDLINTGTDFAGQISLDGGIFDSLYGIEETQGGTNTTLFAVGDSILDATPFPQQKFATIDTAGGLSEGVEHIAQVRITVDKTVGNGVNFGVNEIVTGSVSGVTGNVVSWDNTAGVLVVTSITPFNTGNVNKGINGFLNEFSSKGTIIDVVVQEPGINYSAVPTVTIEDDGDIQATVTAVLTSAGDQIQSLTITNGGYGYNQYVETNVLHPTITFTNDSGDTTGAGAAAYAILGGENIVGNAGASYRIKSIEYQTVVQTS
Physico‐chemical
properties
protein length:1544 AA
molecular weight: 166295,12720 Da
isoelectric point:4,36259
aromaticity:0,10104
hydropathy:-0,23685

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.60.120.260
499–650
G3DSA:2.60.120.260 IPR025924
AIX34070.1
1 1544
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014b
[NCBI] 		1493508 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX34070.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019110 [NCBI]
CDS location
range 74101 -> 78735
strand +
CDS
ATGGCAAGAACAGTTCCTGGATCAGGCGCACAAATTAAGCCGATCTTTGATAATTTATTCGGTGTTCGTGCTGTAGAAGTAATCAATCCTGGTATAGGATATGATCCTACAGATCCCCCTAGATTGACTATCACGGGTTGTGGCATTCCCGAAGCAGAAGCAATATTATATCCAATTATTGATTCTGATTCTGGTAAGATTATTCATATCAGAGTCTTAGAAAGAGGACGTGGATATGATCCTTTAAGAATGCAGATTGTTCCCACATCAGAATCTCTAGGTGTTATCAATTCTTTTGATATTAATAAGATTTGGCAAAACTATCCAAACTCTCTTACTTCAGGGACTTTTGAAGTTGATTCTGAGGGAAATTTAGTAGATAGACTTAGAATTGTTAGTGATAATGATCCAAAACCAGCAGACATTCTCACAGAAAGAGATGGGTCGGGTCTAATCTCAGATAGAAATTTTGACCAAGTTTTCATCTATAGAGGTGGTAAACAGGTTCCTTTTGGACAGAATAGAACATTCCAAAAGAATAAATCACTTGGCATTATGGCAAATGGTGTGTTCTTACACACACCAGAGTGGGGAGCATCTGCTGGTGATGCCCCTATAGGATTTGAATTAGATAGTGTACTAGAGTCTAATGTAAAGCAGTCTGATGTTTATGATGCGGTTATTGACAGCAATACATATTACTATCAATCTTCAAGATTAATAAATCATTTCAAGTTAGACCATAGTGTTCTTGACTGGGGTCTCCATAAAGTATTCACTTGGAACTTGAAAGTTGAGTATGGGAATCTTTTAGTAGATATATCAGACTTGGATGAGACTATTGGTCTTGTAGAGGTAGGTAGAACTATTGTAGAGATTGGTGGTGATGGTGAGGCAGAAGTTGTAAAGATTGTAAGAAATGCTCAAAATGTAATAACGCAACTTTATTTGAGAGATGTAACAGGAACATTTCAGGAAAGTTCTGCTGTTCTTGGTTCTAATGGATTCTCTTTCAATATTAGTAGTGTTCCACTTTCATTAAATCTTTTCTATATTAATTTTGGTCCTGATGCTGCATTATTTGGTTCTTTTATTCCCGATACATATTACCTAGCACCAGAAAATATTCAGGTAAGAAAAAATTATGTAATCATCTTTGATCAATCTGATGCATCAAATCAGCAAGGTATAGGACACCCTATTCAGTTTAGTACTACTCCTGATGGAGAGTTGAATAGCGGAAGTTTATTGTACAATAGCACTGGTGCTTCTGCAGCAGTCGCTGCTGATTATGAAAATGAATTCAGAAGCATCTTTATCATGAATGAAGATGAAACTAATAATATCTATTTTTATTGTAAGTATCACAGACATATGTCTGGGTATGAAGGACAAGAAGGATATATAAGTTTAAGTACCTCCCAAGACACTGAAGTTTCAGATAATGATTATTATACTACCAATTTCTTCAAAGAAAGAATTGTTATTACACCAGATGATCTGCAAACTGGATATAATTTAAATCTTAAATCTGCAGGTCTCGTAAGCAATGGCACAGGAGCTGGTAGTAGCGGCGGATTTGCTATTGGCAATCATTACAAATTAAATGGCAGTGGGAGTCAACGGTGGGTAAGATTTGATTTAGATTTACGAGGTGTTGTTACTTTTGATGCTGAAATAATTAGAGGTAATGATAGTAATGGCGGCGAAGATCCTGATGTTGGTGAAGAACTTCGCGTATATTTTGCATTTAATACCACTTATGGTTCTATTGGGATTGCCAATTATAATGATTCCTCATTCGATTCTCTTAAAACTGTAACGATTGCAGTTCCCCCTTCCTCTAGAAATGAGAACCAAACGGTATACTTATATCAAAATGGTGCTGAGGGTTCTTCTTTTGACCACTGGGGTATTAGAAATATTACTGTTGGTTCTGGGGCGGATGATTTCTCTAGGCATCCAGACGGTCACTCCAAAATTCTTGGTATGTCCTTTGATGGATATCCTATCTACGGTCCTTATGGATATTTTGGTGCTAATAATGCTGTCCAAAGAGCAGCAGATTCTTATAGATTAAAAGTAGGAGCAGAAATTGATGGTGCCAGGGAAGAGGTAATTACTCCATCATCTACTACTTATGCGGTAACTGTTTCTAGTGGTAAATTTTTATATGATGGTTCTATCCCAAACTTCCTTAATTTAAAAAGAGGAAACACATATATTTTCAATCAAGATGATGCATCGAATGATGGAAATATTTTACTATTATCTAATGATTCTGATGGTTGGCACCCAACACAAGATGTTGGAGATGTTGGAAATCTAAGTTATCTATATCAACATCCAAAAATTACATATAGTTTAGATGGATCTGAAGTAACTTATTCTCAATATGTTACTGGATTTACTACCTCATCTACTCGACAATTGCAGATTGTAATTCCAGCTGATGTACCTAAAACTCTTTATACTTATTCGTATGCAAATGCTCAGTATGGTGTGAGGAGTGTTCAAGATGGATATTCCATGGGTATGTTAGTTCAAGATTATATCTATGATTCGACAGAGGGTGATTTAGATCAATTTAATGGTTTGTATGTAGTTACACCAGAATATCCAAATGGTACATATGCATATTTCCTGACCGAATCTTCTAATGGAACGCCCACATATCCTTACTGTATTGGACCCCAATTTTTTGGTGCTCCATTATTTGAAGGAGACCCTGTTCCAGCTCTTGCTTCTGTTTCCCCTTCTGGTGCAGAAGGAGAAGTTGTATTGAAAGATGATGGTTCGATCGATTATATTAGAATGACGAAAAATGGTGATGGTTATTTTGGAACTGCTGAAGCAAGAGTTCTTGGTGGTGAAGGTAGTGGAGCAACTGCTTCTCCTGTAGTTCAAACTATCACTGGTCTTACTATTAGAAATGAGGGTAGAAGTTTTGCTACTCCACCAACTCTTGTATTTGAAGGTGGTGGTGGACAAGGTGCTCAAGGTGCTGCTGAAATTTCTACTTTGGGTAAGGTCACATCAATTACAATCACTGATGATGGAGATTTCTATCAAGAACCTCCAACTATTTTAATTGATGGTGGTGGTGGCGGTGGAGCTAAAGCAATCGCAAATATAGATCAAGGAAAAATTAGTACTATTGAACTTACAGATTCTGGTCAAGGATATGTAAATCCCCCTAGGATTATCTTTACTAAATTAATTAATTTAAAGAGAAAAACTAGGTCTAGACAATCTCTAAATTCTCAATTCCAATATCTGACAGGGTTAACTAAAACAACTACTCCTGATGCTACTGAAATCTTCGTTAACTCTACAAATGCATTCCCTGGTTCTGGACAGTTTATTCTTAATAATGAAATTGTCACTTACACGGGTAAAGCAACAGGTAAATTTACAGGTCTTACTAGAGGAACAAATTTCAATTATGACCAAAGAGTTATATTAGATTCTACTCAAGATGTTGCTGGTGTTTCTAGTTACAATTTTAATGTTGGTGACGTTATTACTAGAAGAGTTGAAAGTTCTAGTAATAAATTGGCAAAAGTATATGATTGGGATCCTACTACTAAGGAACTTCTAGTAACTTTTGAAATTGATGAGTTAGCATTTATTGATGCTGGTTTTGCTGCTACCGAAGATGCTATTGTGCAGTTTGGAGGTGGATTGCCAGATTCTTCAACGGCATCTCAACTTCCACATAATACAATTGTTTCTATTGGTGATAATATTACAACCTTAACTGTTCCCATCTCAAGTATTCAGGATAGAACATTTGAGGATGATGATGAAAACGAAGATCCTGATAATGCTGGAGTATTTTTGGGAGATGGCATTCCCGATTTGATTAATACTGGTACTGATTTCGCTGGTCAGATTAGTCTTGATGGTGGTATTTTTGATTCCTTATATGGTATTGAAGAAACTCAAGGTGGAACAAACACTACATTATTTGCTGTTGGAGATAGTATTTTAGATGCAACACCTTTCCCACAACAAAAATTTGCTACCATTGATACGGCTGGTGGATTATCTGAAGGAGTTGAGCATATTGCTCAAGTTAGAATTACTGTAGATAAAACTGTTGGTAACGGTGTAAACTTCGGTGTTAATGAGATTGTTACAGGATCTGTTTCTGGTGTAACTGGAAATGTAGTTTCTTGGGATAACACTGCAGGAGTATTGGTGGTTACTAGTATCACTCCATTCAACACAGGTAATGTTAACAAAGGTATTAACGGATTCCTAAATGAGTTCTCTTCTAAAGGAACTATTATTGATGTAGTTGTTCAAGAACCAGGAATTAACTATTCTGCTGTTCCTACTGTAACAATTGAAGATGATGGAGATATTCAGGCAACTGTTACTGCCGTATTAACTTCTGCAGGAGATCAAATTCAATCATTAACCATTACTAATGGTGGATATGGATATAATCAATATGTCGAAACTAATGTATTACATCCTACAATTACATTCACAAATGATTCGGGGGATACTACAGGAGCAGGTGCTGCAGCATATGCTATCTTAGGTGGGGAAAACATTGTAGGTAATGCAGGTGCTTCTTATCGCATTAAGAGTATCGAATATCAGACAGTTGTACAAACCTCATAA

Tertiary structure

PDB ID
91a68ecb47fece105c6077e03128f257b7b934273a66357e7277986468a7ef66
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8196
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank