Protein
- Genbank accession
- YP_010657045.1 [GenBank]
- Protein name
- receptor binding protein
- RBP type
-
TFTF
- Seq2Symm
-
C1 confidence 0,891 truncated
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C1 0,891 C3 0,474 I 0,000 - Protein sequence
-
MVKQVIASAQITLTDLGDAIISGTKPTNPKLDQLWIERLTGKPDKLWRWNGTSWIEQTLDLGSLDPDADGKIENHETTIGNMVNDAKIDITERQEVKNKLTPILGLAVTDSQTDLPYALDLRNSGVGELAAVSKAAVNVGIKTDDTLYVDLGVKYNNLRAYLVAMTPKPWDASVANKDNAITVVPTDWRTKWLDYYKAVQALTVAVQTKLQGNIDNVSISGRNLLNGTATSTSAVGENRTNQTWTPYLFANGSSKAINDADSFCMSFDWVIEGTPAGTLYVQGNNPYPAIASTITFSATNNKGRYSGTGKIPSGTATFTGVNFRLDNFPLGSKITISNVKIETGNKPTGWTPSPEDVAKAIEDADKKAQLVTESVNDMSLDSKLTPVEKIQLKTDYDSITAEFTTTLNSADAFNLTSSSERAAYNTAYSALKTFVDPLLVKMNETSGVDRAAFRQRFKDYYDTKAKLLKKISDTSKGLIDDSAKQTPNIILNSGFLQGTKFWDNFPTGVSLDTSIDLGGIPVIKVIQSGNQDNIYRGANTQLYPAPFDSNITFSIYSFAPNLANIDSGLVVEIKTYDKDKNRILPSTWALECTPSKSGVWERFSRTISISGNKDIKYINFFFYVRKNGTAYFAKPMLQIGNALGDWSPNPADVFADTIDTKAEESKNAISDMSSDNKLTPLEKVQLKKEWGTIAAEKPQFEALGKSYANAATELNAYINAYNALNNTLNGTTGYLKNMASTDTINGATFRSQFDTYYAKQAELIKKVNNLIQGNIDGIQGVKNLLLASKRAISVNDYLLNDFTLTEDFIAGQDYTFVVRGTVPSGQSFGIWQNGGSTNVGYATTEFIKGVYYVTFKAVATTAGNQRSLRLYNVPQNTTNATVEWVALYKGTKPFDWTAAPEDADVGKTNLIIDSEFKYLASWIRANPNNTVIESGIMPNGIKNIRTTIATTGYYDFTQYIEVEPNTEYTFSCNAGGAFQIFLWEKKADKTATNVYKDNAKTFNFPYDMSSPRSTFTYTIKTQPDAKYIQFIFRVNGGGSGTTGARIALPQLERGTTASEWKANPFDTSNGEIFIQGSGADQTDKSRKLIVNGNTIYNETSGRGLRLITLRRDNLDVLESYYYDVYGSDADKNNLATKLNSYGDDVIITLASYDAIAWNTNLLNAMMAIGGSGVNATYRTPFAFIGMKGLGRYNGLEQFTGTGTVFSPATISTKIVNGALQGVNNNTGASDTTMRQDLRITAPLPTSIDLDANGITAKTTTAGKYARLDYRGLYIAGGAIQIDGGLSEGQLAQGVTRKMSYLDSNGLYTGQVNIGGSGQNGILSIKNSSNNEIVRGDTSGLTINNGAITIKRPDGANLIINGMAAYNFAVTTHNPPFRGDNIDTRSWYYHTTKGIPFSRDLQVCDYVATQHTGRYMKMDVDFYTSPGNSGALVVIQAGKYNSGGQEVIVSQIEITNTTPQPSYTISIDCGVPNYQRIGFYFCLASWSAGDVYARLVRAWMEG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1501 AA molecular weight: 163947,63720 Da isoelectric point: 5,81539 aromaticity: 0,09993 hydropathy: -0,33111
Domains
Domain architecture
YP_010657045.1
1
1501 aa
STR 484–636 · LEC 1063–1101 · STR 1102–1188 · LEC 1189–1232 ·
ATT Attachment Domain
STR Structural Domain
RBD Receptor-Binding Domain
CBM Carbohydrate-Binding Module
LEC Lectin-like Domain
ENZ Enzymatic Domain
CHP Intramolecular Chaperone
LNK Linker/Spacer Domain
TAS Tail-Associated Structural
TTP Tail Tubular Protein
UNK Uncharacterized Domain
Unmapped
Proteins with similar domain architecture
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010657045.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_070843
[NCBI]
CDS location
range 23135 -> 27640
strand +
strand +
CDS
ATGGTAAAACAGGTTATCGCTTCAGCACAAATAACATTAACAGACTTAGGCGATGCAATAATTTCAGGTACAAAGCCTACTAATCCTAAACTGGATCAGTTATGGATTGAACGTTTAACTGGTAAACCTGATAAGTTATGGCGATGGAATGGTACGAGTTGGATTGAACAAACATTAGATTTAGGATCACTAGACCCTGATGCTGATGGCAAAATAGAAAACCATGAAACTACTATCGGTAATATGGTTAATGATGCGAAAATTGATATTACAGAACGTCAAGAAGTTAAGAATAAGTTAACTCCAATTTTAGGTTTAGCTGTAACGGATTCACAAACTGATTTACCTTACGCTTTGGATTTAAGGAATTCAGGCGTAGGCGAATTGGCTGCTGTAAGTAAAGCTGCCGTAAACGTAGGTATTAAAACTGACGATACACTGTATGTCGATTTAGGGGTTAAGTACAATAATCTTAGAGCTTATTTAGTAGCTATGACACCTAAACCGTGGGATGCTTCTGTTGCAAATAAAGACAATGCTATCACTGTAGTCCCTACTGATTGGAGAACTAAATGGTTAGATTATTATAAAGCTGTACAAGCATTGACTGTAGCTGTTCAAACTAAGTTACAAGGGAATATTGATAATGTTAGTATTAGTGGTCGTAACTTATTAAATGGAACAGCGACTTCTACAAGTGCAGTAGGTGAAAATAGAACTAACCAAACGTGGACACCTTATTTATTTGCTAACGGAAGTTCTAAGGCTATAAATGATGCTGATTCATTTTGTATGTCGTTTGATTGGGTTATAGAAGGAACACCTGCTGGAACGTTGTATGTTCAAGGTAATAATCCATATCCAGCTATAGCTAGTACGATTACTTTTTCAGCTACAAATAACAAAGGTCGTTATTCAGGAACAGGAAAAATACCGAGTGGTACAGCAACGTTTACAGGAGTTAATTTCCGTCTAGATAATTTTCCTTTAGGTTCTAAAATAACTATTTCGAATGTTAAAATTGAAACCGGAAATAAACCTACTGGCTGGACTCCATCACCTGAAGATGTGGCGAAAGCTATTGAAGATGCAGATAAGAAAGCTCAATTAGTTACTGAATCAGTAAATGATATGTCTTTAGATAGTAAATTAACACCAGTTGAGAAAATCCAATTAAAAACTGATTATGATTCAATTACTGCTGAGTTCACTACTACTCTAAATAGTGCTGATGCTTTTAATTTGACTTCATCATCGGAAAGGGCTGCATACAATACAGCTTATAGCGCGTTAAAAACTTTCGTTGATCCATTGTTAGTTAAAATGAACGAGACTTCAGGTGTAGACCGCGCTGCATTTAGACAAAGATTCAAAGATTACTATGATACTAAAGCTAAGTTGTTGAAAAAGATTTCTGATACTTCAAAAGGATTGATTGATGATTCAGCAAAACAAACACCAAACATTATACTCAATAGTGGATTTTTGCAGGGTACAAAGTTTTGGGATAACTTTCCTACAGGTGTATCACTAGATACAAGTATTGATTTAGGTGGAATACCTGTAATAAAAGTTATTCAATCAGGAAACCAAGATAACATTTATAGAGGTGCTAACACTCAATTATACCCAGCTCCATTTGATTCTAATATTACATTCAGTATTTATTCTTTCGCCCCTAACTTAGCTAATATTGATTCAGGACTTGTGGTTGAAATAAAAACTTACGACAAAGATAAGAACAGAATACTTCCTTCTACATGGGCTTTAGAATGTACACCTAGTAAAAGTGGAGTTTGGGAAAGATTCAGCAGAACTATTTCTATAAGCGGAAATAAAGATATAAAATATATCAATTTCTTTTTCTATGTAAGAAAGAATGGTACAGCTTATTTTGCTAAACCGATGTTGCAAATAGGTAATGCATTAGGAGATTGGAGTCCTAATCCGGCTGATGTTTTCGCTGATACAATAGATACAAAAGCTGAAGAAAGCAAAAATGCTATTTCAGATATGTCTAGCGACAATAAATTAACTCCTTTAGAAAAGGTTCAGTTAAAGAAAGAATGGGGTACAATAGCCGCTGAGAAACCTCAATTTGAAGCTTTAGGTAAAAGTTATGCTAATGCTGCTACAGAGCTTAATGCATATATAAACGCATATAACGCATTGAATAATACGTTAAATGGAACTACTGGTTATCTAAAGAACATGGCTTCTACAGATACAATCAACGGCGCTACATTCCGCTCTCAATTCGATACGTATTACGCGAAACAAGCTGAGTTGATAAAGAAAGTTAACAACTTAATCCAAGGTAATATTGATGGTATTCAAGGGGTTAAGAATTTGCTGTTAGCTTCCAAAAGAGCTATAAGTGTAAATGACTATTTGTTGAATGACTTTACTCTCACTGAAGATTTTATCGCTGGTCAAGATTATACATTCGTTGTTAGAGGGACTGTTCCATCCGGTCAAAGTTTTGGTATTTGGCAAAATGGAGGTTCTACTAATGTAGGTTACGCAACAACCGAATTTATAAAAGGTGTTTATTATGTGACATTTAAAGCGGTAGCTACTACAGCTGGCAACCAACGTTCTTTACGATTGTACAACGTTCCGCAAAACACAACTAACGCTACAGTTGAATGGGTTGCATTGTACAAAGGAACTAAACCTTTTGATTGGACGGCTGCTCCTGAAGATGCTGATGTAGGTAAAACTAACTTGATTATTGATTCTGAATTTAAATATTTAGCAAGTTGGATAAGAGCTAATCCTAATAATACAGTTATCGAAAGTGGAATAATGCCTAATGGCATCAAAAACATTAGAACTACAATTGCAACTACTGGTTATTATGATTTCACCCAATATATAGAGGTAGAACCAAACACTGAATACACTTTTTCATGCAACGCAGGTGGAGCTTTCCAAATATTTTTATGGGAAAAGAAAGCTGACAAAACAGCAACTAACGTATATAAAGATAATGCCAAAACTTTCAACTTCCCTTACGATATGTCTTCACCAAGATCGACATTCACTTATACAATTAAAACTCAACCTGACGCTAAATACATTCAGTTTATCTTTAGGGTTAATGGTGGTGGAAGTGGAACTACAGGCGCACGTATCGCGCTACCTCAATTAGAAAGAGGTACTACAGCTAGTGAATGGAAAGCTAATCCTTTTGACACTTCTAATGGTGAAATATTCATTCAAGGTTCAGGGGCGGATCAGACTGATAAATCAAGAAAATTAATCGTTAATGGAAATACAATTTATAATGAAACTTCAGGACGTGGATTGAGACTAATCACTTTAAGAAGAGATAATTTAGATGTTTTAGAATCATATTATTACGATGTGTACGGTTCTGATGCTGATAAGAACAATTTAGCTACGAAACTTAATTCTTATGGTGATGATGTAATTATAACTTTAGCTTCTTATGATGCGATCGCATGGAATACAAACCTTCTCAATGCTATGATGGCTATTGGTGGTTCAGGAGTTAACGCAACTTATCGTACGCCTTTCGCTTTCATTGGCATGAAGGGATTAGGCCGCTACAATGGATTAGAACAATTTACTGGTACTGGTACTGTATTCTCACCTGCTACTATTTCAACTAAAATTGTAAATGGAGCATTACAAGGAGTCAACAATAATACTGGTGCTTCTGATACAACAATGAGACAAGACTTACGCATAACAGCGCCCTTACCAACGAGTATCGACTTAGATGCGAATGGTATAACAGCAAAGACAACTACAGCTGGTAAGTACGCGCGTTTAGATTATCGTGGCCTTTACATCGCTGGTGGAGCTATTCAAATCGATGGTGGTCTTTCTGAAGGACAACTTGCTCAAGGTGTTACGAGAAAAATGTCGTATCTAGATAGTAATGGTTTATACACTGGACAGGTAAACATTGGTGGTTCTGGTCAAAATGGTATATTATCCATTAAGAATTCTTCCAATAATGAAATTGTCCGTGGTGATACAAGCGGATTAACTATCAATAACGGCGCTATAACAATTAAACGTCCTGATGGAGCTAACTTGATTATAAATGGTATGGCTGCTTATAACTTCGCTGTAACAACGCATAATCCACCTTTCCGTGGTGATAACATTGATACAAGATCATGGTATTATCACACAACGAAAGGAATTCCGTTCAGTCGTGACTTACAAGTTTGTGATTATGTAGCAACTCAACATACAGGAAGATATATGAAAATGGATGTTGATTTTTATACTTCACCTGGCAATTCAGGAGCTTTAGTAGTCATACAGGCTGGTAAATACAATTCAGGCGGTCAGGAAGTTATTGTTTCTCAAATAGAGATAACTAATACAACTCCACAACCATCTTATACAATTAGTATAGATTGTGGAGTTCCGAATTATCAAAGAATTGGTTTCTATTTCTGTTTAGCTTCTTGGAGTGCTGGTGATGTATACGCACGTTTAGTTAGGGCTTGGATGGAAGGTTAA
Genome Context
Tertiary structure
YP_010657045.1
ColabFold structure
Source
ColabFold
pLDDT
81.6
Oligomeric state
monomer