Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_010657045.1 [GenBank]
Protein name
receptor binding protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,66
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,88
Protein sequence
MVKQVIASAQITLTDLGDAIISGTKPTNPKLDQLWIERLTGKPDKLWRWNGTSWIEQTLDLGSLDPDADGKIENHETTIGNMVNDAKIDITERQEVKNKLTPILGLAVTDSQTDLPYALDLRNSGVGELAAVSKAAVNVGIKTDDTLYVDLGVKYNNLRAYLVAMTPKPWDASVANKDNAITVVPTDWRTKWLDYYKAVQALTVAVQTKLQGNIDNVSISGRNLLNGTATSTSAVGENRTNQTWTPYLFANGSSKAINDADSFCMSFDWVIEGTPAGTLYVQGNNPYPAIASTITFSATNNKGRYSGTGKIPSGTATFTGVNFRLDNFPLGSKITISNVKIETGNKPTGWTPSPEDVAKAIEDADKKAQLVTESVNDMSLDSKLTPVEKIQLKTDYDSITAEFTTTLNSADAFNLTSSSERAAYNTAYSALKTFVDPLLVKMNETSGVDRAAFRQRFKDYYDTKAKLLKKISDTSKGLIDDSAKQTPNIILNSGFLQGTKFWDNFPTGVSLDTSIDLGGIPVIKVIQSGNQDNIYRGANTQLYPAPFDSNITFSIYSFAPNLANIDSGLVVEIKTYDKDKNRILPSTWALECTPSKSGVWERFSRTISISGNKDIKYINFFFYVRKNGTAYFAKPMLQIGNALGDWSPNPADVFADTIDTKAEESKNAISDMSSDNKLTPLEKVQLKKEWGTIAAEKPQFEALGKSYANAATELNAYINAYNALNNTLNGTTGYLKNMASTDTINGATFRSQFDTYYAKQAELIKKVNNLIQGNIDGIQGVKNLLLASKRAISVNDYLLNDFTLTEDFIAGQDYTFVVRGTVPSGQSFGIWQNGGSTNVGYATTEFIKGVYYVTFKAVATTAGNQRSLRLYNVPQNTTNATVEWVALYKGTKPFDWTAAPEDADVGKTNLIIDSEFKYLASWIRANPNNTVIESGIMPNGIKNIRTTIATTGYYDFTQYIEVEPNTEYTFSCNAGGAFQIFLWEKKADKTATNVYKDNAKTFNFPYDMSSPRSTFTYTIKTQPDAKYIQFIFRVNGGGSGTTGARIALPQLERGTTASEWKANPFDTSNGEIFIQGSGADQTDKSRKLIVNGNTIYNETSGRGLRLITLRRDNLDVLESYYYDVYGSDADKNNLATKLNSYGDDVIITLASYDAIAWNTNLLNAMMAIGGSGVNATYRTPFAFIGMKGLGRYNGLEQFTGTGTVFSPATISTKIVNGALQGVNNNTGASDTTMRQDLRITAPLPTSIDLDANGITAKTTTAGKYARLDYRGLYIAGGAIQIDGGLSEGQLAQGVTRKMSYLDSNGLYTGQVNIGGSGQNGILSIKNSSNNEIVRGDTSGLTINNGAITIKRPDGANLIINGMAAYNFAVTTHNPPFRGDNIDTRSWYYHTTKGIPFSRDLQVCDYVATQHTGRYMKMDVDFYTSPGNSGALVVIQAGKYNSGGQEVIVSQIEITNTTPQPSYTISIDCGVPNYQRIGFYFCLASWSAGDVYARLVRAWMEG
Physico‐chemical
properties
protein length:1501 AA
molecular weight: 163947,63720 Da
isoelectric point:5,81539
aromaticity:0,09993
hydropathy:-0,33111

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.60.120.260
484–636
G3DSA:2.60.120.260 PS52031
IPR039477
1102–1188
IPR039477
YP_010657045.1
1 1501
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacillus phage PBC4
[NCBI] 		1675028 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010657045.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_070843 [NCBI]
CDS location
range 23135 -> 27640
strand +
CDS
ATGGTAAAACAGGTTATCGCTTCAGCACAAATAACATTAACAGACTTAGGCGATGCAATAATTTCAGGTACAAAGCCTACTAATCCTAAACTGGATCAGTTATGGATTGAACGTTTAACTGGTAAACCTGATAAGTTATGGCGATGGAATGGTACGAGTTGGATTGAACAAACATTAGATTTAGGATCACTAGACCCTGATGCTGATGGCAAAATAGAAAACCATGAAACTACTATCGGTAATATGGTTAATGATGCGAAAATTGATATTACAGAACGTCAAGAAGTTAAGAATAAGTTAACTCCAATTTTAGGTTTAGCTGTAACGGATTCACAAACTGATTTACCTTACGCTTTGGATTTAAGGAATTCAGGCGTAGGCGAATTGGCTGCTGTAAGTAAAGCTGCCGTAAACGTAGGTATTAAAACTGACGATACACTGTATGTCGATTTAGGGGTTAAGTACAATAATCTTAGAGCTTATTTAGTAGCTATGACACCTAAACCGTGGGATGCTTCTGTTGCAAATAAAGACAATGCTATCACTGTAGTCCCTACTGATTGGAGAACTAAATGGTTAGATTATTATAAAGCTGTACAAGCATTGACTGTAGCTGTTCAAACTAAGTTACAAGGGAATATTGATAATGTTAGTATTAGTGGTCGTAACTTATTAAATGGAACAGCGACTTCTACAAGTGCAGTAGGTGAAAATAGAACTAACCAAACGTGGACACCTTATTTATTTGCTAACGGAAGTTCTAAGGCTATAAATGATGCTGATTCATTTTGTATGTCGTTTGATTGGGTTATAGAAGGAACACCTGCTGGAACGTTGTATGTTCAAGGTAATAATCCATATCCAGCTATAGCTAGTACGATTACTTTTTCAGCTACAAATAACAAAGGTCGTTATTCAGGAACAGGAAAAATACCGAGTGGTACAGCAACGTTTACAGGAGTTAATTTCCGTCTAGATAATTTTCCTTTAGGTTCTAAAATAACTATTTCGAATGTTAAAATTGAAACCGGAAATAAACCTACTGGCTGGACTCCATCACCTGAAGATGTGGCGAAAGCTATTGAAGATGCAGATAAGAAAGCTCAATTAGTTACTGAATCAGTAAATGATATGTCTTTAGATAGTAAATTAACACCAGTTGAGAAAATCCAATTAAAAACTGATTATGATTCAATTACTGCTGAGTTCACTACTACTCTAAATAGTGCTGATGCTTTTAATTTGACTTCATCATCGGAAAGGGCTGCATACAATACAGCTTATAGCGCGTTAAAAACTTTCGTTGATCCATTGTTAGTTAAAATGAACGAGACTTCAGGTGTAGACCGCGCTGCATTTAGACAAAGATTCAAAGATTACTATGATACTAAAGCTAAGTTGTTGAAAAAGATTTCTGATACTTCAAAAGGATTGATTGATGATTCAGCAAAACAAACACCAAACATTATACTCAATAGTGGATTTTTGCAGGGTACAAAGTTTTGGGATAACTTTCCTACAGGTGTATCACTAGATACAAGTATTGATTTAGGTGGAATACCTGTAATAAAAGTTATTCAATCAGGAAACCAAGATAACATTTATAGAGGTGCTAACACTCAATTATACCCAGCTCCATTTGATTCTAATATTACATTCAGTATTTATTCTTTCGCCCCTAACTTAGCTAATATTGATTCAGGACTTGTGGTTGAAATAAAAACTTACGACAAAGATAAGAACAGAATACTTCCTTCTACATGGGCTTTAGAATGTACACCTAGTAAAAGTGGAGTTTGGGAAAGATTCAGCAGAACTATTTCTATAAGCGGAAATAAAGATATAAAATATATCAATTTCTTTTTCTATGTAAGAAAGAATGGTACAGCTTATTTTGCTAAACCGATGTTGCAAATAGGTAATGCATTAGGAGATTGGAGTCCTAATCCGGCTGATGTTTTCGCTGATACAATAGATACAAAAGCTGAAGAAAGCAAAAATGCTATTTCAGATATGTCTAGCGACAATAAATTAACTCCTTTAGAAAAGGTTCAGTTAAAGAAAGAATGGGGTACAATAGCCGCTGAGAAACCTCAATTTGAAGCTTTAGGTAAAAGTTATGCTAATGCTGCTACAGAGCTTAATGCATATATAAACGCATATAACGCATTGAATAATACGTTAAATGGAACTACTGGTTATCTAAAGAACATGGCTTCTACAGATACAATCAACGGCGCTACATTCCGCTCTCAATTCGATACGTATTACGCGAAACAAGCTGAGTTGATAAAGAAAGTTAACAACTTAATCCAAGGTAATATTGATGGTATTCAAGGGGTTAAGAATTTGCTGTTAGCTTCCAAAAGAGCTATAAGTGTAAATGACTATTTGTTGAATGACTTTACTCTCACTGAAGATTTTATCGCTGGTCAAGATTATACATTCGTTGTTAGAGGGACTGTTCCATCCGGTCAAAGTTTTGGTATTTGGCAAAATGGAGGTTCTACTAATGTAGGTTACGCAACAACCGAATTTATAAAAGGTGTTTATTATGTGACATTTAAAGCGGTAGCTACTACAGCTGGCAACCAACGTTCTTTACGATTGTACAACGTTCCGCAAAACACAACTAACGCTACAGTTGAATGGGTTGCATTGTACAAAGGAACTAAACCTTTTGATTGGACGGCTGCTCCTGAAGATGCTGATGTAGGTAAAACTAACTTGATTATTGATTCTGAATTTAAATATTTAGCAAGTTGGATAAGAGCTAATCCTAATAATACAGTTATCGAAAGTGGAATAATGCCTAATGGCATCAAAAACATTAGAACTACAATTGCAACTACTGGTTATTATGATTTCACCCAATATATAGAGGTAGAACCAAACACTGAATACACTTTTTCATGCAACGCAGGTGGAGCTTTCCAAATATTTTTATGGGAAAAGAAAGCTGACAAAACAGCAACTAACGTATATAAAGATAATGCCAAAACTTTCAACTTCCCTTACGATATGTCTTCACCAAGATCGACATTCACTTATACAATTAAAACTCAACCTGACGCTAAATACATTCAGTTTATCTTTAGGGTTAATGGTGGTGGAAGTGGAACTACAGGCGCACGTATCGCGCTACCTCAATTAGAAAGAGGTACTACAGCTAGTGAATGGAAAGCTAATCCTTTTGACACTTCTAATGGTGAAATATTCATTCAAGGTTCAGGGGCGGATCAGACTGATAAATCAAGAAAATTAATCGTTAATGGAAATACAATTTATAATGAAACTTCAGGACGTGGATTGAGACTAATCACTTTAAGAAGAGATAATTTAGATGTTTTAGAATCATATTATTACGATGTGTACGGTTCTGATGCTGATAAGAACAATTTAGCTACGAAACTTAATTCTTATGGTGATGATGTAATTATAACTTTAGCTTCTTATGATGCGATCGCATGGAATACAAACCTTCTCAATGCTATGATGGCTATTGGTGGTTCAGGAGTTAACGCAACTTATCGTACGCCTTTCGCTTTCATTGGCATGAAGGGATTAGGCCGCTACAATGGATTAGAACAATTTACTGGTACTGGTACTGTATTCTCACCTGCTACTATTTCAACTAAAATTGTAAATGGAGCATTACAAGGAGTCAACAATAATACTGGTGCTTCTGATACAACAATGAGACAAGACTTACGCATAACAGCGCCCTTACCAACGAGTATCGACTTAGATGCGAATGGTATAACAGCAAAGACAACTACAGCTGGTAAGTACGCGCGTTTAGATTATCGTGGCCTTTACATCGCTGGTGGAGCTATTCAAATCGATGGTGGTCTTTCTGAAGGACAACTTGCTCAAGGTGTTACGAGAAAAATGTCGTATCTAGATAGTAATGGTTTATACACTGGACAGGTAAACATTGGTGGTTCTGGTCAAAATGGTATATTATCCATTAAGAATTCTTCCAATAATGAAATTGTCCGTGGTGATACAAGCGGATTAACTATCAATAACGGCGCTATAACAATTAAACGTCCTGATGGAGCTAACTTGATTATAAATGGTATGGCTGCTTATAACTTCGCTGTAACAACGCATAATCCACCTTTCCGTGGTGATAACATTGATACAAGATCATGGTATTATCACACAACGAAAGGAATTCCGTTCAGTCGTGACTTACAAGTTTGTGATTATGTAGCAACTCAACATACAGGAAGATATATGAAAATGGATGTTGATTTTTATACTTCACCTGGCAATTCAGGAGCTTTAGTAGTCATACAGGCTGGTAAATACAATTCAGGCGGTCAGGAAGTTATTGTTTCTCAAATAGAGATAACTAATACAACTCCACAACCATCTTATACAATTAGTATAGATTGTGGAGTTCCGAATTATCAAAGAATTGGTTTCTATTTCTGTTTAGCTTCTTGGAGTGCTGGTGATGTATACGCACGTTTAGTTAGGGCTTGGATGGAAGGTTAA

Tertiary structure

PDB ID
019b38615a5a3ec819ba3d4300d2fd94c2f11852e387e42a38abfc0a4df94459
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8162
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50