Protein

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Genbank accession
WNV50212.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Protein sequence
MAKKVTLPKGQTGATGTTLGQAGNILDLSDVDDIFGDTPKAKKGSPVTEFFNGIKQGLFDSVKPQQALKAFMRSAAPDGFSRMFGVYEDTMSTIRDVKDSVERTSASDLLFLTREAQDLAVKLKDKVPASVFDRLNNRLESQIENYKYAEDSNRNYKEIRRRMEAERDEDELKSAIDQVTLVQRDLAIKAEQGEVKRFAIGQAERGIRDKVSADRFDWMAKAMGQTVDNLSKLASYNEQVNYSIQKKGLEIQFRSMLHLRKIAQQTEATMELLNNGFAALVRNTGIPDHKKSSMKDLVGFNAAQRVSSSFVDNAIQTLPNFLGNFGSAVTNNATRFANENIRNFADAVRAGNMFGADAWENRYNIAGQFAGSYLGDWTRNSVIPVLGRMVRPGVERFSNNYLGGRHNQASYLLDNFPAWTQEYMNNYQNTYGARGILRDIMAPFIPQFTLQDRLKTGSYQTIGQDSGFNQLTQRTIVEAIPGYLSRLLQETRMIRTGRDDITREVFDLSTGSFMSVEDSAANTERRLVSRSTVRGVSGALTDVLEAFDPNKELSIDARKALTERLIRDANMNKRFDPEAYARAGGYDRSKVSGEAIKELTEYIKRQYNIGADGRMAGTNENFARRQEISALFLDVRNFSRDPIKEIERLTNAGKTDQLREMGIIITEQGIDRINYPRIWELMSSEVKYEGWGNDNPFDRYSDTPPSDDGGPGQLSPLGDQNNPHFIGPMYQSQTERKMRQAQEQVIRASKLAQEQANKGYDYAQQKVTLATDYVRDNVPNQFSELRRNINIPASMNFGDLRDQLYGQAGDMYSRAVNYSNQFNGYSDIVNQSIADLYTKANTFTPVIKGMDFLNGNLIDVNTGKIVEKISDITGEIKNQAGITVVTAQEVATGLYNQRGDLLTKATDIASQLRDKAAQIAGDARERLTQGLDNVSDMAKDWYIPGREEAVILGRDLLAGEYIDTATNKVITNLKDAKGTIINRAGDVVVTAQELAKGLIRSDGFNLRRNVADASNWIQRNVLGGGSTTQKIFNAMGTVANKAKDFTLGLGRDILSNRDAYLPGMLKPVLQKVKLKAGEYYTAGGNLLKSFDEINGPVLDRDGNIVVDEEQIPELINSDGSKHTAAKSKGLFRTGLGNLARGYANMSMRYWKWLGKKSVDTAKGMAGLGYKLLGSPFKKRFSAFTGKVETQIDKKALDTTTDQLLAGIWEELRNQKPDANKPRRGSWQDLTSRVSDTLNGKNTGDEEATESKGLFGKLGDTLKNIFGKKKGDEEDEGLLEDLGLGGKKGGKWAAARQILGRGALAIGGGALSTAAAYASFGGTGASTNDKLAGAAIVTSNPIMWALKDFLIKPVLGWRGSQKFKDDLISYRMMQYGATTTDQMNKVTELEQLVSSVATRGGDASFDVRALNARDIIKIFGYGTDDGPAIMRLANWIDFRFKPIFEAWLKGLSKINRSDVDISEVDSKVPNELKGQLIRSVSFPYEGNTPYLVLNNPFGEEDLSIDVASIQKKEKELLDKYSSTEKTSVEPKATSSSFKESATNVINDTITTIKSKSTDITNWFRDSAIGKAVKAVSPVESIRKMVTTVVDTLIPKANASDSLTSLQALRVHAYGMQGLDLAAVNGLLSIESLVNDKMRVANGKATYTGDMEELIKWTGQAFGMVTTSDGPDRVKVVDWLYRRFLPVFKAFIVTARSVSTSITLSQIETLTATQRVQIANAVMGATDDDGVSIWKAPSIFNIVGDMNSVEDLAKISLDEIKKEAETEVAEAPGKSKSAQIAGKNDAASGRGFASRIIDNVKSTFNSATTKVANWMENTSARVSQVIGRAREGVTDTYYTAKYKLGAGGELTPTGQTYGQLATGNGGVWENIPMPQSNKSRDAAQATFKAVSEMTGVPVELLNIFCGIESSFNYNAKAPTSSAAGWFQFIKSTWKGMLAKYGAKFGIPADDENGSLRFDPRINALMGAMFLRDNYEYLENALGRAPTDVDLYLAHFMGPAGARKFLTRDQNSIGAEIFPDQARANRSIFFKTDGSARTLGEIYQVMENKVAKFRTGGGKNANSQSLGKPKSTEELMNDAATAKQKDMATDKELIGGAADTSITDSSNNKIGLGKIMSGMASPLRTNAPSMMLPGAPSSATDVSSGQQPVVDTGAATQATVRASQIEEQRKVVTSQDKAMLDIASEQLSVLKQFHADILNYIKNKAANPSAQTGQEQANTIAPSQRPGRVVDNRPLPIRLR
Physico‐chemical
properties
protein length:2237 AA
molecular weight: 245471,73880 Da
isoelectric point:8,79937
aromaticity:0,07599
hydropathy:-0,45905

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–899
DC_0124 G3DSA:1.10.530.10 DC_0228
Coil
Unmapped
149–173
Coil Coil DC_0124
IPR023346
STR
1883–2015
IPR023346
IPR008258
ENZ
1885–1978
IPR008258
WNV50212.1
1 2237
Architecture
STR
RBD
STR 1-2060 | RBD 2061-2237
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage PhiPizzaParty
[NCBI] 		3053654 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Pseudomonas aeruginosa
[NCBI] 		287 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNV50212.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ992562.1 [NCBI]
CDS location
range 142106 -> 148819
strand +
CDS
ATGGCCAAGAAGGTAACATTGCCCAAAGGTCAAACTGGTGCAACCGGTACAACATTAGGGCAGGCTGGTAATATTCTTGACTTAAGTGATGTCGATGATATTTTTGGCGATACGCCAAAAGCTAAAAAGGGATCACCTGTCACTGAATTTTTTAATGGTATTAAACAAGGACTCTTTGACTCTGTTAAACCACAACAAGCTTTAAAAGCATTCATGCGGTCTGCGGCACCAGATGGCTTTTCACGTATGTTCGGTGTATATGAAGATACGATGTCAACTATCCGGGATGTCAAAGATTCTGTAGAACGTACGAGTGCTAGTGATTTACTCTTTTTAACAAGAGAAGCACAAGATTTAGCAGTTAAGTTAAAAGATAAAGTTCCAGCTTCTGTTTTTGACAGACTTAATAATCGATTAGAAAGTCAAATCGAAAACTATAAGTACGCTGAAGATTCAAATAGAAATTATAAAGAAATCCGTCGTCGCATGGAAGCTGAACGTGACGAGGATGAACTTAAATCTGCTATAGATCAAGTAACTCTTGTTCAACGGGATTTAGCTATAAAAGCTGAACAAGGCGAAGTTAAACGATTCGCTATTGGACAAGCTGAACGTGGAATACGTGATAAAGTATCGGCTGATAGATTTGACTGGATGGCTAAGGCTATGGGTCAAACAGTTGATAATTTATCTAAATTAGCTAGTTATAATGAACAAGTTAATTACAGTATTCAAAAGAAAGGATTAGAAATCCAATTTCGTTCTATGTTACATCTTCGGAAAATTGCACAGCAAACCGAAGCTACCATGGAATTATTAAATAATGGTTTTGCAGCACTTGTTAGAAACACAGGGATCCCCGATCATAAAAAGTCATCAATGAAGGATCTTGTTGGCTTTAATGCGGCTCAACGGGTATCGAGTAGTTTTGTTGACAACGCCATTCAAACATTACCAAATTTCTTAGGTAATTTTGGATCAGCCGTAACTAATAATGCTACTCGCTTTGCAAATGAAAATATCCGTAACTTTGCCGATGCTGTTCGCGCTGGAAACATGTTTGGTGCAGATGCATGGGAGAATAGATACAATATAGCCGGTCAATTCGCTGGCTCTTATCTTGGTGATTGGACAAGGAATTCAGTTATACCTGTATTAGGTAGAATGGTTCGTCCTGGTGTGGAACGTTTTTCAAATAACTATCTAGGTGGGCGACATAATCAAGCATCTTATTTACTTGATAACTTCCCTGCCTGGACACAAGAATACATGAATAACTACCAGAACACTTATGGTGCTCGTGGTATTCTTCGTGACATTATGGCCCCATTTATTCCACAGTTCACATTACAAGATCGATTAAAGACTGGCTCCTATCAAACAATTGGTCAGGACAGTGGCTTTAATCAACTAACACAACGTACTATAGTTGAAGCTATTCCTGGATATCTATCTAGGTTACTACAAGAAACAAGAATGATCCGGACTGGTCGCGATGATATCACACGTGAAGTGTTTGATCTCTCAACTGGCTCATTCATGTCTGTAGAGGACTCAGCTGCAAACACAGAACGTCGTCTAGTTAGTCGTTCTACTGTACGAGGTGTAAGTGGTGCTCTTACCGATGTACTTGAAGCATTTGACCCAAATAAAGAACTATCAATAGATGCTAGGAAAGCGCTAACTGAACGTTTAATTCGTGATGCCAATATGAATAAACGTTTTGACCCCGAAGCGTATGCTCGTGCTGGTGGGTATGATCGTTCTAAAGTGTCCGGCGAGGCTATTAAAGAATTAACGGAATATATTAAACGGCAATACAACATTGGTGCTGATGGTAGGATGGCAGGCACTAATGAAAACTTTGCTAGGCGTCAAGAAATATCTGCATTATTCTTAGACGTTAGAAACTTCTCACGTGATCCTATTAAAGAAATTGAGCGTTTAACCAATGCTGGTAAAACTGATCAATTACGTGAAATGGGCATTATCATAACTGAGCAGGGTATTGATCGTATTAATTACCCACGTATTTGGGAACTGATGAGTTCAGAAGTAAAATACGAAGGATGGGGTAATGATAATCCATTTGATCGTTATAGTGATACACCACCTTCTGACGATGGTGGTCCAGGGCAACTCTCCCCACTAGGTGATCAGAATAACCCGCACTTTATTGGTCCAATGTATCAGTCACAAACTGAACGAAAAATGCGGCAAGCTCAAGAGCAAGTTATTCGTGCCTCTAAGCTGGCCCAAGAGCAAGCTAATAAAGGTTATGATTATGCGCAGCAAAAAGTAACATTAGCTACGGATTATGTAAGGGATAATGTACCTAATCAATTTAGTGAATTACGCAGGAATATAAACATACCAGCGTCAATGAACTTTGGTGATTTAAGGGATCAGCTGTATGGTCAAGCCGGCGATATGTATAGTCGTGCTGTTAACTATAGTAATCAGTTCAATGGATATTCTGATATAGTCAATCAGTCAATAGCTGATCTATATACCAAAGCTAATACTTTTACACCAGTTATCAAAGGAATGGATTTTTTAAATGGAAATTTAATTGACGTTAATACTGGTAAGATAGTAGAGAAGATATCCGATATTACTGGTGAAATTAAAAACCAAGCTGGTATAACTGTAGTAACCGCTCAAGAAGTAGCTACTGGTCTCTATAATCAACGTGGTGATTTATTAACCAAGGCAACTGATATTGCTAGTCAATTACGTGATAAAGCAGCACAGATCGCTGGTGATGCCAGAGAGCGATTAACTCAAGGTTTAGATAATGTTTCTGATATGGCTAAAGATTGGTATATACCTGGCCGTGAAGAAGCCGTTATTCTTGGACGCGATCTACTAGCCGGTGAATATATCGATACAGCAACTAATAAAGTTATAACCAATTTAAAAGATGCCAAGGGCACTATTATTAATAGGGCTGGTGATGTAGTCGTAACTGCTCAAGAACTGGCTAAAGGTTTAATACGGTCAGATGGTTTCAATCTACGAAGGAATGTAGCAGATGCATCTAACTGGATACAACGAAATGTACTAGGTGGTGGATCAACTACTCAGAAAATCTTTAATGCAATGGGTACAGTTGCTAATAAAGCAAAAGACTTTACTCTTGGATTAGGTAGGGATATTCTAAGTAATAGAGACGCATATTTACCTGGTATGTTAAAACCAGTATTACAGAAAGTTAAACTAAAAGCAGGTGAGTACTATACAGCTGGTGGCAACCTATTAAAATCATTTGATGAAATTAATGGACCAGTTTTAGATAGGGATGGTAACATCGTTGTTGATGAAGAACAAATACCTGAACTTATTAACTCCGATGGATCTAAGCACACTGCTGCTAAGAGTAAGGGTTTATTCCGAACTGGCTTAGGTAATCTAGCCCGTGGTTATGCTAATATGTCAATGCGTTATTGGAAGTGGTTGGGTAAGAAATCTGTAGATACTGCTAAAGGAATGGCGGGTTTAGGATATAAATTACTTGGATCACCTTTCAAGAAACGTTTCAGTGCATTTACTGGTAAAGTAGAAACACAGATAGATAAGAAAGCTCTAGATACCACTACTGATCAATTATTAGCAGGTATATGGGAAGAACTGCGTAATCAGAAACCAGATGCTAATAAACCTCGCCGTGGTTCCTGGCAAGATCTAACATCACGTGTTAGCGATACCTTAAATGGTAAGAATACCGGTGATGAAGAAGCCACTGAATCAAAGGGCCTTTTTGGTAAACTTGGTGATACCTTAAAGAATATCTTTGGTAAGAAGAAAGGCGATGAGGAAGATGAAGGATTATTGGAAGACCTAGGTCTTGGTGGTAAGAAAGGTGGGAAATGGGCTGCTGCTCGCCAAATACTTGGTAGAGGTGCTTTAGCTATTGGTGGTGGTGCATTATCAACAGCTGCCGCATATGCTAGTTTTGGTGGCACTGGTGCATCAACAAATGATAAATTAGCTGGTGCAGCTATTGTAACTAGTAATCCGATTATGTGGGCACTTAAAGATTTCTTAATAAAACCTGTATTAGGTTGGAGAGGAAGTCAGAAATTCAAAGATGATTTAATCAGTTATCGAATGATGCAGTATGGTGCCACAACAACTGATCAGATGAACAAGGTTACTGAATTAGAACAACTTGTATCTAGTGTGGCTACACGTGGTGGGGATGCATCCTTTGATGTAAGGGCTCTTAATGCACGTGACATTATTAAGATATTTGGATATGGTACTGATGATGGCCCAGCTATCATGCGTTTAGCCAATTGGATCGACTTCAGGTTTAAACCGATCTTTGAGGCGTGGCTTAAAGGACTATCCAAAATTAATCGTAGTGATGTGGACATCAGTGAGGTTGATAGTAAAGTACCTAATGAACTAAAAGGACAGCTCATTAGATCCGTATCATTCCCATACGAAGGTAATACACCTTATCTAGTTCTTAATAACCCATTTGGTGAAGAGGACTTATCAATTGATGTGGCTTCTATTCAGAAGAAAGAAAAGGAATTATTAGATAAGTATAGTTCCACAGAGAAAACATCTGTTGAACCTAAAGCAACTTCCAGTAGTTTTAAGGAAAGTGCTACTAATGTAATAAATGATACTATTACTACGATTAAATCTAAGTCAACTGATATTACTAATTGGTTTAGGGATTCAGCTATTGGGAAAGCAGTTAAAGCTGTTAGTCCGGTTGAATCTATACGTAAAATGGTAACTACTGTAGTAGACACACTTATTCCTAAAGCAAATGCAAGTGATTCATTAACTTCGCTGCAAGCACTACGTGTTCATGCTTATGGGATGCAGGGTTTAGACTTAGCTGCTGTAAATGGGTTATTATCAATTGAAAGTCTAGTTAATGATAAAATGCGAGTAGCTAATGGAAAAGCTACTTACACAGGTGACATGGAGGAATTAATTAAGTGGACTGGCCAAGCATTTGGTATGGTTACGACTAGCGA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
cf0cab8777632b1dd4b2baf13f3d46199200e0f01eeddefcd15fbf63633fe9b8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4944
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Jumbo phages are active against extensively-drug-resistant eyedrop-associated Pseudomonas aeruginosa infections Cobian Guemes,A.G., Ghatbale,P., Blanc,A., Morgan,C., Garcia,A., Leonard,J., Huang,L., Kovalick,G., Proost,M., Chiu,M., Kuo,P., Oh,J., Karthikeyan,S., Knight,R., Pogliano,J., Schooley,R. and Pride,D. 2024-10-29 — GenBank