Protein

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Genbank accession
WNV50212.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
Seq2Symm
C1 confidence 0,733 truncated
C1 0,733
C3 0,264
C2 0,004
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MAKKVTLPKGQTGATGTTLGQAGNILDLSDVDDIFGDTPKAKKGSPVTEFFNGIKQGLFDSVKPQQALKAFMRSAAPDGFSRMFGVYEDTMSTIRDVKDSVERTSASDLLFLTREAQDLAVKLKDKVPASVFDRLNNRLESQIENYKYAEDSNRNYKEIRRRMEAERDEDELKSAIDQVTLVQRDLAIKAEQGEVKRFAIGQAERGIRDKVSADRFDWMAKAMGQTVDNLSKLASYNEQVNYSIQKKGLEIQFRSMLHLRKIAQQTEATMELLNNGFAALVRNTGIPDHKKSSMKDLVGFNAAQRVSSSFVDNAIQTLPNFLGNFGSAVTNNATRFANENIRNFADAVRAGNMFGADAWENRYNIAGQFAGSYLGDWTRNSVIPVLGRMVRPGVERFSNNYLGGRHNQASYLLDNFPAWTQEYMNNYQNTYGARGILRDIMAPFIPQFTLQDRLKTGSYQTIGQDSGFNQLTQRTIVEAIPGYLSRLLQETRMIRTGRDDITREVFDLSTGSFMSVEDSAANTERRLVSRSTVRGVSGALTDVLEAFDPNKELSIDARKALTERLIRDANMNKRFDPEAYARAGGYDRSKVSGEAIKELTEYIKRQYNIGADGRMAGTNENFARRQEISALFLDVRNFSRDPIKEIERLTNAGKTDQLREMGIIITEQGIDRINYPRIWELMSSEVKYEGWGNDNPFDRYSDTPPSDDGGPGQLSPLGDQNNPHFIGPMYQSQTERKMRQAQEQVIRASKLAQEQANKGYDYAQQKVTLATDYVRDNVPNQFSELRRNINIPASMNFGDLRDQLYGQAGDMYSRAVNYSNQFNGYSDIVNQSIADLYTKANTFTPVIKGMDFLNGNLIDVNTGKIVEKISDITGEIKNQAGITVVTAQEVATGLYNQRGDLLTKATDIASQLRDKAAQIAGDARERLTQGLDNVSDMAKDWYIPGREEAVILGRDLLAGEYIDTATNKVITNLKDAKGTIINRAGDVVVTAQELAKGLIRSDGFNLRRNVADASNWIQRNVLGGGSTTQKIFNAMGTVANKAKDFTLGLGRDILSNRDAYLPGMLKPVLQKVKLKAGEYYTAGGNLLKSFDEINGPVLDRDGNIVVDEEQIPELINSDGSKHTAAKSKGLFRTGLGNLARGYANMSMRYWKWLGKKSVDTAKGMAGLGYKLLGSPFKKRFSAFTGKVETQIDKKALDTTTDQLLAGIWEELRNQKPDANKPRRGSWQDLTSRVSDTLNGKNTGDEEATESKGLFGKLGDTLKNIFGKKKGDEEDEGLLEDLGLGGKKGGKWAAARQILGRGALAIGGGALSTAAAYASFGGTGASTNDKLAGAAIVTSNPIMWALKDFLIKPVLGWRGSQKFKDDLISYRMMQYGATTTDQMNKVTELEQLVSSVATRGGDASFDVRALNARDIIKIFGYGTDDGPAIMRLANWIDFRFKPIFEAWLKGLSKINRSDVDISEVDSKVPNELKGQLIRSVSFPYEGNTPYLVLNNPFGEEDLSIDVASIQKKEKELLDKYSSTEKTSVEPKATSSSFKESATNVINDTITTIKSKSTDITNWFRDSAIGKAVKAVSPVESIRKMVTTVVDTLIPKANASDSLTSLQALRVHAYGMQGLDLAAVNGLLSIESLVNDKMRVANGKATYTGDMEELIKWTGQAFGMVTTSDGPDRVKVVDWLYRRFLPVFKAFIVTARSVSTSITLSQIETLTATQRVQIANAVMGATDDDGVSIWKAPSIFNIVGDMNSVEDLAKISLDEIKKEAETEVAEAPGKSKSAQIAGKNDAASGRGFASRIIDNVKSTFNSATTKVANWMENTSARVSQVIGRAREGVTDTYYTAKYKLGAGGELTPTGQTYGQLATGNGGVWENIPMPQSNKSRDAAQATFKAVSEMTGVPVELLNIFCGIESSFNYNAKAPTSSAAGWFQFIKSTWKGMLAKYGAKFGIPADDENGSLRFDPRINALMGAMFLRDNYEYLENALGRAPTDVDLYLAHFMGPAGARKFLTRDQNSIGAEIFPDQARANRSIFFKTDGSARTLGEIYQVMENKVAKFRTGGGKNANSQSLGKPKSTEELMNDAATAKQKDMATDKELIGGAADTSITDSSNNKIGLGKIMSGMASPLRTNAPSMMLPGAPSSATDVSSGQQPVVDTGAATQATVRASQIEEQRKVVTSQDKAMLDIASEQLSVLKQFHADILNYIKNKAANPSAQTGQEQANTIAPSQRPGRVVDNRPLPIRLR
Physico‐chemical
properties
protein length:2237 AA
molecular weight: 245471,73880 Da
isoelectric point:8,79937
aromaticity:0,07599
hydropathy:-0,45905

Domains

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Domain architecture
WNV50212.1
1 2237 aa
RBD 1870–1882 · STR 1883–2015 · RBD 2016–2052 ·
ATT Attachment Domain STR Structural Domain RBD Receptor-Binding Domain CBM Carbohydrate-Binding Module LEC Lectin-like Domain ENZ Enzymatic Domain CHP Intramolecular Chaperone LNK Linker/Spacer Domain TAS Tail-Associated Structural TTP Tail Tubular Protein UNK Uncharacterized Domain Unmapped
Proteins with similar domain architecture

Taxonomy

Phage
Pseudomonas phage PhiPizzaParty [NCBI] · taxon 3053654
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host
Pseudomonas aeruginosa [NCBI] · taxon 287
cellular organisms Bacteria Pseudomonadati Pseudomonadota Gammaproteobacteria Pseudomonadales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
WNV50212.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ992562.1 [NCBI]
CDS location
range 142106 -> 148819
strand +
CDS
ATGGCCAAGAAGGTAACATTGCCCAAAGGTCAAACTGGTGCAACCGGTACAACATTAGGGCAGGCTGGTAATATTCTTGACTTAAGTGATGTCGATGATATTTTTGGCGATACGCCAAAAGCTAAAAAGGGATCACCTGTCACTGAATTTTTTAATGGTATTAAACAAGGACTCTTTGACTCTGTTAAACCACAACAAGCTTTAAAAGCATTCATGCGGTCTGCGGCACCAGATGGCTTTTCACGTATGTTCGGTGTATATGAAGATACGATGTCAACTATCCGGGATGTCAAAGATTCTGTAGAACGTACGAGTGCTAGTGATTTACTCTTTTTAACAAGAGAAGCACAAGATTTAGCAGTTAAGTTAAAAGATAAAGTTCCAGCTTCTGTTTTTGACAGACTTAATAATCGATTAGAAAGTCAAATCGAAAACTATAAGTACGCTGAAGATTCAAATAGAAATTATAAAGAAATCCGTCGTCGCATGGAAGCTGAACGTGACGAGGATGAACTTAAATCTGCTATAGATCAAGTAACTCTTGTTCAACGGGATTTAGCTATAAAAGCTGAACAAGGCGAAGTTAAACGATTCGCTATTGGACAAGCTGAACGTGGAATACGTGATAAAGTATCGGCTGATAGATTTGACTGGATGGCTAAGGCTATGGGTCAAACAGTTGATAATTTATCTAAATTAGCTAGTTATAATGAACAAGTTAATTACAGTATTCAAAAGAAAGGATTAGAAATCCAATTTCGTTCTATGTTACATCTTCGGAAAATTGCACAGCAAACCGAAGCTACCATGGAATTATTAAATAATGGTTTTGCAGCACTTGTTAGAAACACAGGGATCCCCGATCATAAAAAGTCATCAATGAAGGATCTTGTTGGCTTTAATGCGGCTCAACGGGTATCGAGTAGTTTTGTTGACAACGCCATTCAAACATTACCAAATTTCTTAGGTAATTTTGGATCAGCCGTAACTAATAATGCTACTCGCTTTGCAAATGAAAATATCCGTAACTTTGCCGATGCTGTTCGCGCTGGAAACATGTTTGGTGCAGATGCATGGGAGAATAGATACAATATAGCCGGTCAATTCGCTGGCTCTTATCTTGGTGATTGGACAAGGAATTCAGTTATACCTGTATTAGGTAGAATGGTTCGTCCTGGTGTGGAACGTTTTTCAAATAACTATCTAGGTGGGCGACATAATCAAGCATCTTATTTACTTGATAACTTCCCTGCCTGGACACAAGAATACATGAATAACTACCAGAACACTTATGGTGCTCGTGGTATTCTTCGTGACATTATGGCCCCATTTATTCCACAGTTCACATTACAAGATCGATTAAAGACTGGCTCCTATCAAACAATTGGTCAGGACAGTGGCTTTAATCAACTAACACAACGTACTATAGTTGAAGCTATTCCTGGATATCTATCTAGGTTACTACAAGAAACAAGAATGATCCGGACTGGTCGCGATGATATCACACGTGAAGTGTTTGATCTCTCAACTGGCTCATTCATGTCTGTAGAGGACTCAGCTGCAAACACAGAACGTCGTCTAGTTAGTCGTTCTACTGTACGAGGTGTAAGTGGTGCTCTTACCGATGTACTTGAAGCATTTGACCCAAATAAAGAACTATCAATAGATGCTAGGAAAGCGCTAACTGAACGTTTAATTCGTGATGCCAATATGAATAAACGTTTTGACCCCGAAGCGTATGCTCGTGCTGGTGGGTATGATCGTTCTAAAGTGTCCGGCGAGGCTATTAAAGAATTAACGGAATATATTAAACGGCAATACAACATTGGTGCTGATGGTAGGATGGCAGGCACTAATGAAAACTTTGCTAGGCGTCAAGAAATATCTGCATTATTCTTAGACGTTAGAAACTTCTCACGTGATCCTATTAAAGAAATTGAGCGTTTAACCAATGCTGGTAAAACTGATCAATTACGTGAAATGGGCATTATCATAACTGAGCAGGGTATTGATCGTATTAATTACCCACGTATTTGGGAACTGATGAGTTCAGAAGTAAAATACGAAGGATGGGGTAATGATAATCCATTTGATCGTTATAGTGATACACCACCTTCTGACGATGGTGGTCCAGGGCAACTCTCCCCACTAGGTGATCAGAATAACCCGCACTTTATTGGTCCAATGTATCAGTCACAAACTGAACGAAAAATGCGGCAAGCTCAAGAGCAAGTTATTCGTGCCTCTAAGCTGGCCCAAGAGCAAGCTAATAAAGGTTATGATTATGCGCAGCAAAAAGTAACATTAGCTACGGATTATGTAAGGGATAATGTACCTAATCAATTTAGTGAATTACGCAGGAATATAAACATACCAGCGTCAATGAACTTTGGTGATTTAAGGGATCAGCTGTATGGTCAAGCCGGCGATATGTATAGTCGTGCTGTTAACTATAGTAATCAGTTCAATGGATATTCTGATATAGTCAATCAGTCAATAGCTGATCTATATACCAAAGCTAATACTTTTACACCAGTTATCAAAGGAATGGATTTTTTAAATGGAAATTTAATTGACGTTAATACTGGTAAGATAGTAGAGAAGATATCCGATATTACTGGTGAAATTAAAAACCAAGCTGGTATAACTGTAGTAACCGCTCAAGAAGTAGCTACTGGTCTCTATAATCAACGTGGTGATTTATTAACCAAGGCAACTGATATTGCTAGTCAATTACGTGATAAAGCAGCACAGATCGCTGGTGATGCCAGAGAGCGATTAACTCAAGGTTTAGATAATGTTTCTGATATGGCTAAAGATTGGTATATACCTGGCCGTGAAGAAGCCGTTATTCTTGGACGCGATCTACTAGCCGGTGAATATATCGATACAGCAACTAATAAAGTTATAACCAATTTAAAAGATGCCAAGGGCACTATTATTAATAGGGCTGGTGATGTAGTCGTAACTGCTCAAGAACTGGCTAAAGGTTTAATACGGTCAGATGGTTTCAATCTACGAAGGAATGTAGCAGATGCATCTAACTGGATACAACGAAATGTACTAGGTGGTGGATCAACTACTCAGAAAATCTTTAATGCAATGGGTACAGTTGCTAATAAAGCAAAAGACTTTACTCTTGGATTAGGTAGGGATATTCTAAGTAATAGAGACGCATATTTACCTGGTATGTTAAAACCAGTATTACAGAAAGTTAAACTAAAAGCAGGTGAGTACTATACAGCTGGTGGCAACCTATTAAAATCATTTGATGAAATTAATGGACCAGTTTTAGATAGGGATGGTAACATCGTTGTTGATGAAGAACAAATACCTGAACTTATTAACTCCGATGGATCTAAGCACACTGCTGCTAAGAGTAAGGGTTTATTCCGAACTGGCTTAGGTAATCTAGCCCGTGGTTATGCTAATATGTCAATGCGTTATTGGAAGTGGTTGGGTAAGAAATCTGTAGATACTGCTAAAGGAATGGCGGGTTTAGGATATAAATTACTTGGATCACCTTTCAAGAAACGTTTCAGTGCATTTACTGGTAAAGTAGAAACACAGATAGATAAGAAAGCTCTAGATACCACTACTGATCAATTATTAGCAGGTATATGGGAAGAACTGCGTAATCAGAAACCAGATGCTAATAAACCTCGCCGTGGTTCCTGGCAAGATCTAACATCACGTGTTAGCGATACCTTAAATGGTAAGAATACCGGTGATGAAGAAGCCACTGAATCAAAGGGCCTTTTTGGTAAACTTGGTGATACCTTAAAGAATATCTTTGGTAAGAAGAAAGGCGATGAGGAAGATGAAGGATTATTGGAAGACCTAGGTCTTGGTGGTAAGAAAGGTGGGAAATGGGCTGCTGCTCGCCAAATACTTGGTAGAGGTGCTTTAGCTATTGGTGGTGGTGCATTATCAACAGCTGCCGCATATGCTAGTTTTGGTGGCACTGGTGCATCAACAAATGATAAATTAGCTGGTGCAGCTATTGTAACTAGTAATCCGATTATGTGGGCACTTAAAGATTTCTTAATAAAACCTGTATTAGGTTGGAGAGGAAGTCAGAAATTCAAAGATGATTTAATCAGTTATCGAATGATGCAGTATGGTGCCACAACAACTGATCAGATGAACAAGGTTACTGAATTAGAACAACTTGTATCTAGTGTGGCTACACGTGGTGGGGATGCATCCTTTGATGTAAGGGCTCTTAATGCACGTGACATTATTAAGATATTTGGATATGGTACTGATGATGGCCCAGCTATCATGCGTTTAGCCAATTGGATCGACTTCAGGTTTAAACCGATCTTTGAGGCGTGGCTTAAAGGACTATCCAAAATTAATCGTAGTGATGTGGACATCAGTGAGGTTGATAGTAAAGTACCTAATGAACTAAAAGGACAGCTCATTAGATCCGTATCATTCCCATACGAAGGTAATACACCTTATCTAGTTCTTAATAACCCATTTGGTGAAGAGGACTTATCAATTGATGTGGCTTCTATTCAGAAGAAAGAAAAGGAATTATTAGATAAGTATAGTTCCACAGAGAAAACATCTGTTGAACCTAAAGCAACTTCCAGTAGTTTTAAGGAAAGTGCTACTAATGTAATAAATGATACTATTACTACGATTAAATCTAAGTCAACTGATATTACTAATTGGTTTAGGGATTCAGCTATTGGGAAAGCAGTTAAAGCTGTTAGTCCGGTTGAATCTATACGTAAAATGGTAACTACTGTAGTAGACACACTTATTCCTAAAGCAAATGCAAGTGATTCATTAACTTCGCTGCAAGCACTACGTGTTCATGCTTATGGGATGCAGGGTTTAGACTTAGCTGCTGTAAATGGGTTATTATCAATTGAAAGTCTAGTTAATGATAAAATGCGAGTAGCTAATGGAAAAGCTACTTACACAGGTGACATGGAGGAATTAATTAAGTGGACTGGCCAAGCATTTGGTATGGTTACGACTAGCGA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Genome Context

Tertiary structure

WNV50212.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 49.1
Oligomeric state monomer
Download structure

Literature

Title Authors Date PMID Source
Jumbo phages are active against extensively-drug-resistant eyedrop-associated Pseudomonas aeruginosa infections Cobian Guemes,A.G., Ghatbale,P., Blanc,A., Morgan,C., Garcia,A., Leonard,J., Huang,L., Kovalick,G., Proost,M., Chiu,M., Kuo,P., Oh,J., Karthikeyan,S., Knight,R., Pogliano,J., Schooley,R. and Pride,D. 2024-10-29 37931230 GenBank