Protein
- Genbank accession
- QBX24832.1 [GenBank]
- Protein name
- capsid and scaffold protein
- RBP type
-
TF
- Seq2Symm
-
C1 confidence 0,601
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).C1 0,601 C3 0,505 O 0,001 - Protein sequence
-
MATATFSGSYGHNMTLELQATQTSQNIAGNYSTVKVVGRLHTNGYASMWGVSSDVTIHINGGGAIEHPVINIGTNSTQEIFNHTYNVGHDSEGKKTVGVQLSVGLNTGGYGSSMVAFDLPLTQIKRASTGKVTATELGKVATITIDRKNSSFKHTLRYNWDGKTGTIATNVDTSCNWTLPMDFANTVPNADYHWGTVYIDTYNGSTKIGTKEATFNANIPASVKPTLGSITLTDGNTTVSNLLGKANTFAEIVSDIKVGFTNAKGSYSSTIKEYRAEIVGKNQSISENNGNFGIMNWNGEAQVKAWVVDSRGRSSNVVTADITVLEYFLPTLTFTAVRGDTNQSSDKIVVTRTAKIAPLKIGDTQKNSFKLTFKTAPFGTETFTVDTNAGVNDKVTHELINSQATLSGTFDVGKSYEVYGVLEDALTSSGIVKAPPVSPEKMVMGMAETAVSFGKFPENTNAVDSDWAYYYKNQRIEFVKGLNTSADPNTLLTSGAYKPTTTTNLPSGVGQHGQLLVVKSEGDTISQMYMPYNESSVFVRNANGIGGSSPNWKGWKKLANTDEVNAIKNSSNMTNTGWQSAGFTGSYYKRSGDMLAIRFNFTGNGKTFVIAEVPPSVWSAPQEMMFDIAQWSVSGSDNTHVQVNKNTGQFNILNSRNGQPYRGQILVMV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 669 AA molecular weight: 72153,68350 Da isoelectric point: 8,20342 aromaticity: 0,09118 hydropathy: -0,32526
Taxonomy
Phage
Streptococcus phage Javan210
[NCBI]
· taxon 2548048
Host
No host information
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX24832.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK448875
[NCBI]
CDS location
range 33597 -> 35606
strand +
strand +
CDS
ATGGCAACAGCTACATTTAGCGGTTCTTACGGTCACAATATGACATTAGAGTTGCAAGCGACACAGACGAGTCAAAATATAGCTGGAAATTACAGTACTGTTAAAGTAGTAGGTCGTTTACACACTAATGGTTACGCCTCTATGTGGGGTGTGAGTAGTGATGTGACAATCCATATTAATGGCGGTGGTGCAATTGAGCACCCCGTGATTAATATTGGGACGAATTCAACACAGGAAATCTTTAATCACACTTACAATGTTGGGCACGACTCAGAAGGTAAGAAGACAGTCGGAGTTCAATTAAGTGTCGGGTTGAACACGGGTGGGTATGGTTCATCTATGGTTGCTTTTGATTTACCGTTGACACAAATCAAAAGAGCAAGTACTGGTAAAGTGACGGCTACAGAGCTTGGCAAAGTTGCAACTATCACAATTGACCGCAAAAACAGTTCGTTCAAACACACTCTTAGGTACAATTGGGATGGCAAAACAGGAACAATTGCGACAAACGTCGATACGTCTTGTAATTGGACTTTGCCGATGGATTTTGCTAACACAGTGCCTAATGCTGACTATCATTGGGGAACGGTCTATATTGATACTTACAACGGTAGTACGAAAATTGGTACAAAAGAGGCTACATTTAACGCAAACATTCCTGCAAGTGTCAAACCAACGCTAGGCAGTATTACTTTGACAGATGGAAATACCACGGTTTCAAATCTCTTGGGTAAAGCTAATACATTTGCTGAGATTGTGTCAGACATCAAAGTAGGTTTTACCAATGCTAAGGGTTCGTACAGTTCTACAATCAAAGAATACAGAGCTGAAATTGTAGGTAAGAACCAGAGCATTAGTGAGAATAACGGAAATTTTGGGATTATGAATTGGAACGGTGAAGCTCAGGTTAAGGCTTGGGTAGTAGATAGCCGTGGGCGTAGCAGTAATGTGGTTACTGCAGATATTACGGTTCTTGAGTATTTTCTACCAACGCTGACCTTTACGGCTGTTCGTGGTGATACCAATCAAAGTTCAGACAAGATTGTCGTCACTCGAACCGCTAAGATAGCACCTTTAAAAATTGGTGATACACAAAAGAATAGCTTCAAGCTTACTTTTAAAACAGCACCGTTTGGCACGGAGACTTTTACTGTTGATACTAATGCAGGTGTTAATGATAAGGTCACACATGAACTTATCAATTCTCAAGCAACACTTAGTGGAACTTTTGACGTTGGTAAGTCTTACGAAGTTTATGGTGTCCTAGAAGATGCGTTAACAAGTTCAGGTATTGTTAAAGCCCCTCCCGTATCTCCCGAAAAAATGGTTATGGGGATGGCTGAGACAGCTGTAAGTTTTGGTAAATTCCCAGAAAATACGAATGCTGTAGATAGTGATTGGGCTTATTATTACAAAAATCAACGTATTGAATTCGTTAAAGGCTTGAATACTTCGGCTGACCCAAACACACTTTTAACGAGTGGTGCTTACAAGCCAACAACTACAACCAACCTACCTAGCGGGGTAGGTCAGCACGGACAGTTACTAGTCGTTAAAAGTGAAGGTGACACAATTAGTCAAATGTATATGCCTTACAACGAATCAAGTGTATTTGTCCGCAATGCAAACGGAATCGGTGGTAGTTCGCCAAACTGGAAGGGTTGGAAGAAACTTGCAAACACTGACGAAGTTAATGCAATCAAAAACAGTAGCAACATGACTAACACAGGTTGGCAATCAGCAGGTTTCACGGGTTCGTATTACAAGCGCAGCGGTGACATGCTGGCAATTCGCTTTAATTTCACAGGCAACGGAAAGACGTTTGTAATCGCAGAAGTGCCACCAAGTGTGTGGTCAGCGCCGCAAGAGATGATGTTTGACATTGCTCAGTGGTCTGTAAGTGGAAGTGATAACACGCATGTCCAAGTCAATAAGAATACAGGTCAGTTTAATATTTTAAATTCTCGCAACGGGCAGCCGTATCGAGGTCAAATATTAGTAATGGTTTAG
Genome Context
Tertiary structure
QBX24832.1
ESMFold2 structure
Source
ESMFold2
pLDDT
81.4
Oligomeric state
monomer