Protein
View in Explore- Genbank accession
- QHR69782.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MSRIKHRIDNVFQLIDGHIQFLDRNTGLTVDPTVQHYVLNPQNVLANNRHFINWTAQEGQPNGDATTEGQSVLILGCAYAYLASGDTKYLDSAKKYWQAYIDYFFGGQPIPDPPAKYRPNWIINGKEPRLAHYPLTDDGYPTHGGFKGSLMTWTNGRTVIPHGAPHWGEYLDKAWFAFNGNLGWNSVNATVYAVNADGTTDWSKKGDQWDVDWIIDRLGRKVDWDGNILEEGFPTSQYGTVQLKNTSVNGTYKFNYATCNPVEHGGYLMERNTMWHNRPVNVPVEMGFQDNASDAETWWCDANYLMYQITGERKYWLCWQSSLLVCQDYSNIDMFDKFFRKSTYATIPFTDGISYDYSYPSTAIPKYSRDTLGYIVIRQDVAAQTTLEQQSIWFKVDQNSKLRVQFQGVDDAGHGILFRPELELSKTKDENNTVTYRCGLPLGTANMTSMDIPLSSFMRSTPPNGGTYIIADPRIIVDWGDNTVVQFKYVTGITGTNDDQIVTASMDTDGGVTVGFWLTPTSKANVKSITYRTYEDDFNMTITDAQGWRWWAMLPKTQGAWSTKTLSASDFKLSAYQPNHPETDPKPSAINLTAVDQVNLVLDTAPVNGLTGTIDFYCINDVPERYSSSSGDDYTMYFRITVQASSPHTAKLGDCTIIDYKLNSLNYTPGIIPFSNISDPNTALYDGWRGIPYPGYQYPSLYCFAGRDIDWTRLNNSINFLYDSQMWFYNTFDPVMPGPMAQAYVWDRWDARKYGEPNTFTMKHWNEKAWDGYEARAFYCACHAVYELVQRGETPPEKLVTVCKNWINYLKWFQDNNDGRTPTIFNPDGTVLAPIDDFTSHMSALFMAGCSIMGLAGYDSQIPNIGIVADRCFDLIQQNYIVLSPNHPMNGSWSVAPRPDSDNGMFFGFHAGELLRGFGLYALYRKLNPQNALPILDNSNIPTLTVLTMNDISVDVTK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 958 AA molecular weight: 108502,24410 Da isoelectric point: 5,05517 aromaticity: 0,13466 hydropathy: -0,42182
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage inny [NCBI] |
2696407 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR69782.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850601.1
[NCBI]
CDS location
range 66375 -> 69251
strand +
strand +
CDS
ATGTCAAGAATTAAGCACAGAATTGACAATGTTTTTCAACTGATCGATGGACATATTCAGTTCTTAGATCGTAATACAGGTTTAACTGTAGATCCTACAGTGCAACACTATGTATTAAACCCACAAAACGTTCTAGCTAATAACAGACACTTTATAAACTGGACTGCTCAAGAAGGGCAACCAAACGGGGATGCTACAACAGAAGGTCAATCCGTGCTTATTCTTGGTTGCGCTTATGCATACCTAGCTTCCGGCGATACAAAGTATTTAGACTCTGCTAAAAAATATTGGCAAGCCTATATAGATTACTTCTTTGGTGGTCAACCTATCCCAGATCCGCCAGCAAAGTATCGCCCTAACTGGATTATTAACGGTAAAGAACCACGTCTTGCACATTATCCTCTTACAGATGATGGCTACCCTACACACGGAGGTTTTAAGGGTAGCTTAATGACGTGGACTAACGGTAGAACAGTTATTCCTCATGGTGCTCCACATTGGGGAGAATACCTTGACAAAGCATGGTTTGCTTTTAATGGTAATCTAGGATGGAACTCTGTAAACGCTACAGTATATGCTGTTAATGCAGATGGTACAACAGATTGGTCTAAGAAGGGAGATCAATGGGATGTTGATTGGATCATTGATCGCCTAGGACGTAAAGTTGATTGGGATGGAAATATCTTAGAAGAAGGTTTTCCAACATCTCAATACGGAACAGTTCAACTAAAAAATACTTCTGTAAATGGTACATATAAATTTAACTACGCGACTTGTAACCCTGTTGAACACGGTGGTTATTTAATGGAGCGTAACACTATGTGGCATAACAGACCAGTTAACGTTCCGGTAGAAATGGGTTTTCAGGATAATGCGTCAGATGCTGAAACTTGGTGGTGTGATGCTAATTACCTGATGTACCAAATTACAGGAGAAAGAAAATATTGGCTATGCTGGCAGTCTTCACTGTTAGTGTGTCAAGATTATTCAAACATTGATATGTTTGATAAATTCTTCCGTAAGTCTACATATGCAACTATTCCGTTTACAGATGGCATCTCTTACGATTATTCGTATCCATCTACAGCAATACCTAAATATTCAAGAGATACTTTAGGTTATATTGTTATTAGACAAGATGTTGCTGCTCAAACAACATTAGAACAGCAATCCATTTGGTTTAAAGTTGATCAGAACTCTAAGTTACGAGTTCAGTTCCAAGGTGTAGATGACGCAGGACATGGTATTCTTTTCCGTCCAGAATTGGAGCTAAGTAAGACCAAAGATGAAAATAACACAGTAACTTACCGTTGTGGCTTACCATTAGGTACAGCTAATATGACAAGCATGGATATTCCATTATCCAGCTTTATGAGAAGTACCCCTCCAAATGGTGGAACATATATTATCGCAGATCCGCGAATTATTGTTGACTGGGGTGACAATACTGTGGTACAATTTAAGTATGTAACAGGTATTACTGGAACTAATGATGACCAGATTGTTACTGCATCAATGGATACGGATGGTGGTGTCACTGTTGGTTTTTGGTTAACCCCTACATCAAAAGCTAATGTTAAGTCTATCACATATAGAACATATGAAGATGACTTTAACATGACTATCACGGATGCTCAAGGTTGGAGATGGTGGGCTATGCTACCTAAAACGCAAGGAGCATGGAGTACGAAGACTTTATCAGCCTCTGATTTTAAGTTAAGTGCTTACCAGCCTAATCATCCAGAAACAGATCCTAAACCTTCAGCAATAAATCTTACTGCTGTAGATCAGGTAAATTTAGTTCTCGATACGGCTCCTGTCAATGGTTTAACAGGAACAATAGATTTCTATTGTATTAACGATGTGCCTGAAAGATATTCGTCATCTTCTGGTGATGATTATACCATGTACTTCCGTATCACTGTACAGGCTTCAAGTCCTCATACTGCTAAGTTAGGTGATTGTACTATTATTGACTATAAGTTAAATAGTCTTAATTACACACCAGGAATAATTCCATTCTCTAATATTAGTGACCCAAACACTGCATTGTATGATGGCTGGCGTGGTATTCCATACCCAGGATACCAATACCCTTCCTTATACTGTTTTGCAGGTAGAGATATTGATTGGACGCGTTTAAATAACAGTATCAATTTCTTGTATGATTCTCAAATGTGGTTTTATAACACATTCGATCCTGTGATGCCTGGGCCTATGGCACAAGCGTATGTGTGGGATCGTTGGGATGCAAGAAAATACGGTGAACCAAATACGTTCACAATGAAACACTGGAATGAAAAAGCGTGGGATGGTTATGAAGCTCGTGCATTCTACTGTGCTTGTCATGCTGTATACGAACTTGTACAAAGAGGAGAAACACCTCCTGAAAAACTAGTAACAGTTTGTAAAAATTGGATCAACTATCTTAAATGGTTCCAAGACAATAATGATGGAAGAACACCAACTATCTTTAACCCAGATGGTACAGTTCTTGCGCCTATAGATGACTTTACTAGTCATATGTCTGCACTGTTTATGGCGGGTTGTTCAATCATGGGCTTGGCAGGTTATGATTCACAAATTCCAAACATTGGTATTGTAGCAGACAGATGTTTTGATCTGATTCAGCAAAACTATATTGTGCTTTCCCCTAACCATCCGATGAATGGTTCCTGGAGTGTTGCACCACGCCCAGATTCAGATAACGGAATGTTCTTTGGTTTCCATGCTGGAGAACTATTACGTGGTTTTGGTTTATATGCCTTGTATCGTAAACTAAACCCTCAAAACGCTTTACCAATTTTGGATAATAGTAACATACCAACACTAACTGTTCTAACTATGAATGATATTAGTGTTGATGTAACCAAATAA
Tertiary structure
PDB ID
9fe476596596a189b54f881b2163c6d047a6e902aee9bdd854cd92e308088baa
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment | Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. | 2020 | — | GenBank |