Protein

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Genbank accession
YP_010355791.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,60
Seq2Symm
C1 confidence 0,978 truncated
C1 0,978
C2 0,011
C3 0,005
Predicted homo-oligomer symmetry (Seq2Symm, per-class probabilities; C1 = monomer, C2 = dimer, C3 = trimer).
Protein sequence
MAVNEYLTRTPTNSGNRKCWTLSFWVKRNAVAANQNPENTSGSFFNFYTTQGASPYQAVASFNNDATIQIGRNEGGSDHQLNTTTKYRDVGNWMHLLIKWDVSNPVSQERLQLYVNGALESNVTGTYPSLNYNGAVNTTVQHTIATVIAGGVPYAPSGPSQQYFDWFFVDGQALTSEVFGFYKEGDGYISAGHLEATDFKPGQWSPRAPKSIKYTINRSGGFGVNGFYLPMNDSSNPGADFHCEPNSIIKLKGEDLPQPRNGAPTTSDAYVSQLRTDPYAANLVLAVPGITLENTNTELVTNGDFSNGTTGWTGLSGGSLSVEGDRLKITETTNALDAYAVNSTAITTVVGTRYTIKWTFHEGTNTTFTVRFGNSGNQSLAYLSNSDSAGQFSDPGTYSFDFEATATQLNLSFIVNQANSYGYISNVSVKEALPVRDYSADIKGSGTNKTLTAVGNAGVGYELGGYYGSAMTFDGSGDYLEVDTPVLGSGDWTIEEWFKQEPGTTMQNYWDVSLGVNGDSNIENGASIFHSTGAGGFATGEVVFISAASGGYRIYGGQDLRDGCWHHVVVEKYNNIVTLYVDGVAKTTSEDTANYNSTSNTRIGTSNLGQSNYFEGQIQDVRVYIGVAKYKGGFDVPKPYTPVGIEAFRTTDDTCKNNFATWNPLTGAGTAVDDNAAALKDGNLYFDTSNQSQVTSTIGMNSGKWYAEYHLIGSSVSGYLGVTGDGRAPINNQGTFNAFGQSLIRPGAAVDNSFTKNWTATTLTTMNPALGYSSGDVFGFALDLDSSPKTLKFYRNNTLIHTDSTIGDSGHYYFMAFRTNDGSNGVNWADVVANFGQNPSFSGTTTAGTNADDSGKGLFKYAPPTGFLALCEDNLPAPAIADPGKYFKSVLYTGSGTAGHSITGVGFKPDFVWLKGRTGSSLNHILGDIVRGPQRTLFTNNALQEYTDRGIISFDEDGFTLLSAGGDENNTNAPYVAWCWKAGGAAVSNTEGNITTQVSANPTAGFSIVKSNGPGTSGHGLNSTPKFIIQKSLTAGNWNVAHHKLYEPGGTGKILLNLTDPVVPSSTTYMHNATATTFDPLFSAEQIAYVWAEVEGFSKFGSYVGNGSTDGPFVYCGFKPAWVLVKNIDTANSHWVLWDSSRTPYNEMQNALRPNSIDPETAGFQFDFLSNGFKVRDGELSVSESGDTFIFAAFAESPFQTANAK
Physico‐chemical
properties
protein length:1205 AA
molecular weight: 129368,39160 Da
isoelectric point:4,92933
aromaticity:0,12033
hydropathy:-0,34564

Taxonomy

Phage
Synechococcus phage ACG-2014e [NCBI] · taxon 1493510
Uroviricota Caudoviricetes Pantevenvirales Chalconvirus Chalconvirus acg2014e
Host
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] · taxon 32051
Bacteria Cyanobacteria Oscillatoriophycideae Chroococcales Synechococcus

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_010355791.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_062736 [NCBI]
CDS location
range 166793 -> 170410
strand +
CDS
ATGGCTGTTAATGAATATCTAACAAGAACTCCTACAAACTCTGGCAACAGAAAATGCTGGACTTTATCTTTTTGGGTCAAGAGGAATGCTGTAGCAGCAAATCAAAATCCAGAGAATACTAGTGGATCATTTTTCAATTTTTACACAACTCAAGGTGCATCACCATATCAAGCAGTAGCAAGTTTTAATAATGATGCAACAATACAAATTGGTAGAAATGAAGGTGGTTCTGATCACCAATTAAATACTACTACCAAATATAGAGATGTTGGAAATTGGATGCATCTATTAATTAAATGGGATGTATCCAATCCTGTGTCTCAAGAGAGATTGCAATTATATGTAAATGGTGCATTAGAAAGTAATGTAACTGGTACTTATCCTAGTCTGAATTATAACGGTGCAGTAAACACAACGGTACAACATACTATTGCCACTGTTATAGCTGGTGGTGTTCCATATGCCCCATCTGGTCCATCCCAACAATATTTTGACTGGTTTTTTGTAGACGGTCAAGCACTCACATCAGAAGTGTTTGGTTTCTATAAAGAAGGAGACGGTTATATATCTGCTGGTCATTTAGAAGCAACTGATTTTAAACCAGGACAATGGAGTCCTAGAGCACCAAAGTCAATCAAGTATACGATCAATCGTAGTGGTGGATTTGGAGTCAATGGATTCTATCTTCCTATGAATGATAGTTCTAATCCTGGTGCTGACTTCCACTGTGAGCCTAATAGTATTATCAAACTGAAAGGAGAGGACTTACCACAACCACGTAATGGTGCTCCTACAACTTCTGATGCTTATGTCAGTCAGTTAAGAACAGACCCTTATGCTGCTAACTTGGTTCTTGCTGTTCCTGGTATCACATTAGAAAATACCAATACAGAATTAGTTACTAATGGTGATTTTAGTAATGGAACAACTGGATGGACTGGATTGTCGGGTGGTTCCCTGTCTGTTGAGGGTGATAGATTAAAAATTACAGAAACAACTAACGCATTAGATGCTTATGCTGTTAATAGCACAGCAATAACGACAGTAGTTGGTACAAGATATACAATCAAGTGGACTTTCCATGAAGGAACAAACACTACATTTACCGTTCGTTTTGGAAATAGTGGAAACCAGTCATTAGCATATCTCTCAAACAGTGATTCTGCTGGGCAATTTTCAGATCCAGGAACTTATAGTTTTGATTTTGAAGCAACAGCAACACAATTAAATCTATCATTTATTGTTAATCAGGCTAACTCCTATGGTTATATTTCTAATGTCTCGGTAAAAGAAGCACTGCCAGTAAGAGATTACTCTGCTGATATCAAAGGTAGTGGAACTAATAAGACACTTACAGCAGTTGGTAATGCTGGTGTGGGTTATGAACTTGGTGGATATTATGGAAGTGCTATGACCTTTGATGGTAGTGGTGATTATCTTGAAGTAGATACTCCTGTATTAGGTTCGGGTGATTGGACTATTGAAGAATGGTTCAAACAAGAACCTGGAACAACAATGCAGAATTATTGGGATGTTAGTCTTGGTGTTAATGGAGATTCTAACATTGAAAATGGTGCATCAATCTTTCATAGCACTGGAGCTGGAGGATTCGCCACTGGCGAGGTAGTATTTATTTCTGCAGCGTCGGGAGGATATAGAATTTATGGTGGTCAGGATCTCAGAGATGGTTGTTGGCATCATGTTGTTGTAGAAAAATATAACAATATAGTGACACTATATGTTGATGGAGTAGCAAAAACAACATCGGAAGATACAGCAAACTATAATTCCACATCCAATACACGTATTGGTACTAGTAATTTAGGACAAAGTAATTATTTTGAAGGTCAAATACAAGATGTTCGTGTTTACATAGGTGTAGCAAAATACAAAGGTGGTTTTGATGTTCCCAAACCTTACACACCAGTAGGTATTGAGGCATTTAGAACAACTGATGATACTTGTAAGAATAACTTTGCTACTTGGAATCCATTGACTGGTGCTGGAACTGCTGTTGATGATAATGCTGCTGCTTTGAAGGATGGAAATTTATATTTTGATACTTCAAATCAATCCCAAGTTACTTCAACAATTGGAATGAATTCTGGTAAATGGTATGCTGAATACCATTTGATAGGTTCTAGTGTATCAGGTTATCTAGGTGTTACTGGTGATGGAAGAGCACCCATAAACAATCAAGGTACTTTTAATGCTTTTGGACAGTCACTTATAAGACCTGGAGCAGCAGTAGATAATAGTTTTACAAAAAATTGGACTGCTACAACTTTAACAACTATGAATCCAGCACTTGGTTATAGTTCTGGTGATGTGTTTGGATTTGCTCTTGACCTTGATAGTTCTCCTAAAACTTTAAAGTTTTATAGAAATAACACATTAATACACACAGATTCTACAATAGGAGATAGTGGACATTACTATTTCATGGCGTTTAGAACAAATGATGGTTCAAATGGTGTGAACTGGGCTGATGTAGTAGCAAACTTCGGTCAAAACCCATCATTCTCTGGAACTACAACAGCAGGAACAAACGCAGATGATAGTGGTAAGGGACTGTTTAAGTATGCTCCTCCAACTGGTTTCTTAGCATTATGTGAGGATAACTTACCTGCTCCTGCTATTGCTGATCCTGGCAAGTACTTTAAGTCTGTGCTTTATACTGGTAGTGGAACTGCTGGTCATTCAATTACTGGTGTTGGATTCAAACCAGATTTTGTCTGGTTGAAGGGAAGAACTGGATCTAGTCTTAATCATATACTAGGTGATATTGTTCGTGGTCCTCAGAGGACACTATTTACAAATAATGCCCTCCAAGAATATACAGACAGAGGAATAATTAGTTTTGATGAAGATGGGTTTACTCTTTTATCTGCTGGTGGTGATGAAAATAATACTAATGCTCCATATGTGGCATGGTGCTGGAAGGCTGGTGGTGCCGCAGTATCAAACACTGAGGGAAATATTACAACACAGGTGAGTGCTAATCCAACTGCTGGATTTAGTATTGTAAAGTCAAATGGTCCGGGGACCTCTGGACATGGATTGAATAGCACACCAAAATTTATTATTCAAAAATCTTTGACTGCTGGAAATTGGAATGTTGCACATCATAAACTATATGAACCTGGCGGTACGGGCAAAATACTGCTTAATCTTACTGATCCTGTTGTACCATCTAGTACAACATATATGCACAATGCTACTGCTACAACATTTGATCCATTATTTTCGGCAGAACAAATTGCTTACGTGTGGGCAGAAGTAGAAGGATTTAGTAAGTTTGGAAGTTATGTTGGAAATGGAAGCACTGATGGTCCCTTTGTGTATTGTGGATTTAAACCTGCTTGGGTACTGGTAAAAAATATAGACACTGCTAACAGTCATTGGGTGTTGTGGGATTCTTCAAGAACACCTTATAATGAAATGCAAAATGCCTTACGTCCAAACAGTATCGACCCAGAAACTGCTGGTTTCCAATTTGATTTTCTTTCTAATGGATTTAAAGTAAGAGATGGTGAATTGTCTGTAAGCGAAAGCGGCGATACTTTCATCTTCGCTGCTTTTGCTGAGTCGCCATTCCAAACAGCTAACGCTAAGTAA

Genome Context

Tertiary structure

YP_010355791.1
ESMFold2 structure
Source ESMFold2
pLDDT 75.2
Oligomeric state monomer
Download structure