Protein

View in Explore
Genbank accession
WGH50334.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,68
Protein sequence
MNRKLAESNDITLNNLIALSNINIKIKPLDTVVHSLIGTDTLVIPIRLEEPITQYKNQYLVVGDEIVKIFSIDNTTKDTIDGKQKDSCHINIIRQQFHTQATETLIGKHCRLVTILTYENQGSDVLSYSFTDSATNTSSDLFSVDLSNGSLVFTDNFQRWSPLSTIQEYQVHNKKTIVYFFKGQNNDMILKNLSIVEKISFATGTSSDIKRITISLKNYLYKWYNQDVSSIKVLKNMQPKEFFKTIFKLKDNEVYYVTGVDPNKAITVNRVALKSFKKVNELLKSYCKHSAIRFTFDKFERIKIFTDYFIDNLQVDDHFSTNISDIMVNDENKLIFNTVKGDIYSNLPMYNFDDLDRCYVNFKKKIPNAFMSNEMLGFSGQTYYPLEITIPNNDLFTSSTIGDYVLAKCTFAPYTEFYGRVIIKEAPNKVKLTFFAWDKDYRLLVQGKEKYINNLLNTVSKPMDLYYVRFELPDIFRFNRNIGGHSREFALDYPILPRVNGEPLYKETIDITFGSASNLKVGSYSGTVEDINKIFGVWDNQNLKYNMEYAQSHSSTTYPPIYMLSNHITEKKFEEGWVAEYTTFDNSDIQLTVEENLNSDKNIDATLILINTRNIPKNQLFVDQELDRKGNQFLRVSDISLYHIGDVLIVNKPEDNPTQQELEEYNNTLKGIRWTIKGKYSETVGRETHHYILVDSPFAKRNYGKKYKFTKFPNESVVFLQELYIKGNPIIQHKQSFVGVSSDRTKTGESSKSLYEEKDYDIGSQGLLEKTELEKLLGYILNNYNATSNETTKYKLPLKLFNALHIEPLDIITIDDPIFTNINKDTYKWIVLSVKISSDTNNVELDCLNINKKNTKPYSLDIKNVLEYKPIEIPKYSNTGTENLGNGQSDSIKDDDVGQVWVAKIDEKEFSAIVEKYNNGYIWFKGFDGTKQAEYKDKLFGKGIEFVVDINGEMILVNSDLQYRAMIRKRQMYATNYNEILAGQKVKFLAITIHTDVDGTLYGRRIHIGDNKNYFHYDMINGATFKGNFQVGEANQNSDNDLYNALQNNRVFRDSSKPINSATVRLKKGDIWYDTANGNRPYVYDGANWLSTRDGSLENNIEFSKIIYSNEPQVIGIQDNDFWVDTDDNNNIYIRKNNTWVSFYSAPTFAKTGQKVFHQTNEPVSDFNYQLKEGDIWFNADEGLIRKSFRHNRWEDVREPYVISTLNGRYIFIGANTPTVWRNKDIFINVVDKHTYINNNGNSEILGNNVLEVENNNKIHFVDSYPKGIAKTGDLWVDIDNNYIIYFYHNGNWEGKLFN
Physico‐chemical
properties
protein length:1299 AA
molecular weight: 150198,37320 Da
isoelectric point:6,00557
aromaticity:0,12317
hydropathy:-0,51147

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Fusobacterium phage vB_FnuS_FNU3
[NCBI] 		3041489 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WGH50334.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ808965 [NCBI]
CDS location
range 6405 -> 10304
strand -
CDS
TTGAATAGAAAATTAGCAGAAAGTAATGATATAACTTTAAATAATCTTATAGCATTATCTAATATAAATATTAAAATAAAGCCATTAGACACTGTTGTACACTCTTTAATAGGTACAGACACATTAGTTATACCTATTAGACTTGAAGAGCCTATAACACAGTATAAGAACCAATATTTAGTAGTTGGAGATGAAATAGTTAAAATATTTAGTATAGATAATACTACAAAAGATACAATAGATGGAAAACAAAAAGATAGTTGCCATATAAATATAATTAGACAACAGTTTCACACACAAGCAACTGAAACTTTGATAGGAAAACATTGTAGATTAGTAACAATACTTACATATGAAAATCAAGGTTCAGATGTACTCTCTTATTCATTCACTGACAGTGCTACTAATACAAGTTCAGATTTATTTTCAGTAGATTTATCTAATGGAAGTTTAGTATTTACAGATAATTTTCAAAGATGGAGTCCTTTATCTACTATACAAGAATACCAAGTGCATAATAAGAAAACTATTGTATATTTCTTTAAAGGACAAAATAATGATATGATACTAAAAAATTTAAGTATTGTAGAAAAGATTAGTTTTGCCACAGGAACATCATCAGACATTAAAAGAATTACAATATCATTAAAAAATTATTTATATAAATGGTATAATCAAGATGTATCTAGTATTAAAGTTTTAAAGAATATGCAACCAAAAGAGTTCTTTAAGACTATTTTTAAGTTAAAAGATAATGAGGTATATTATGTTACTGGTGTAGACCCTAATAAAGCTATAACAGTTAATAGAGTAGCTTTAAAGAGTTTTAAAAAGGTTAATGAGTTATTAAAATCTTACTGTAAACATAGTGCTATTAGATTTACTTTTGATAAATTTGAGAGAATAAAGATATTTACTGACTATTTTATAGATAATTTACAAGTAGATGACCATTTTAGCACAAATATAAGTGATATTATGGTAAATGATGAAAACAAACTTATATTTAATACTGTCAAAGGAGATATATATTCTAATCTACCTATGTATAATTTTGATGACTTAGATAGATGTTATGTAAATTTCAAAAAGAAAATACCTAATGCTTTTATGTCAAATGAAATGTTAGGATTTAGTGGACAAACTTATTATCCTTTGGAAATAACAATACCTAATAATGATTTATTTACAAGTAGTACAATAGGGGATTATGTACTTGCTAAATGTACTTTTGCACCTTATACAGAATTTTATGGTAGAGTTATTATTAAAGAAGCACCTAATAAAGTTAAATTAACCTTCTTTGCTTGGGATAAAGATTATAGATTATTAGTTCAAGGTAAAGAAAAATATATCAATAATTTATTAAATACAGTATCTAAACCTATGGATTTATACTATGTAAGATTTGAATTACCTGATATATTTAGATTTAATAGAAATATAGGGGGACATTCAAGAGAATTTGCATTAGATTATCCTATATTACCTAGAGTAAATGGAGAACCTTTATATAAAGAAACAATAGATATTACTTTTGGTAGTGCTAGTAATCTTAAAGTAGGTAGTTATAGTGGTACAGTAGAAGATATAAATAAAATATTTGGAGTATGGGATAATCAAAATCTTAAATATAATATGGAGTATGCACAATCACACAGTTCTACTACATATCCACCTATATATATGCTGTCTAATCATATTACAGAAAAGAAATTTGAAGAGGGTTGGGTAGCTGAATATACTACTTTTGATAATTCTGACATTCAATTAACAGTAGAAGAAAATTTAAACAGTGATAAGAATATTGATGCTACTCTTATACTAATAAATACAAGAAATATACCTAAAAATCAATTATTTGTAGACCAAGAATTAGATAGAAAAGGTAATCAATTTTTAAGAGTATCAGATATTAGTTTATATCATATTGGAGATGTATTAATAGTAAATAAACCTGAAGATAATCCTACACAACAGGAATTAGAGGAATATAATAATACTTTAAAAGGTATTAGATGGACAATTAAAGGTAAATATTCAGAAACTGTAGGTAGAGAAACACATCATTATATTCTTGTAGATAGTCCTTTTGCTAAGAGAAATTATGGTAAGAAATATAAATTTACTAAATTTCCTAATGAAAGTGTAGTATTTTTACAAGAATTATATATTAAAGGTAATCCTATTATTCAACATAAACAATCTTTTGTAGGTGTTTCTAGTGATAGAACTAAAACTGGAGAAAGTTCAAAATCTTTATATGAAGAAAAAGATTATGATATAGGTAGTCAAGGTTTATTAGAAAAGACAGAATTAGAAAAATTATTAGGATATATATTAAATAACTATAATGCAACTTCTAATGAAACTACCAAATATAAATTGCCTTTAAAACTCTTTAATGCTTTACATATAGAGCCTTTGGATATAATAACTATTGATGACCCAATATTTACTAATATAAATAAAGATACTTATAAATGGATAGTGTTATCAGTCAAAATTAGTTCAGATACAAATAATGTAGAATTAGATTGTTTAAATATAAATAAAAAGAATACTAAACCTTATTCTTTAGATATTAAGAATGTACTTGAATATAAACCTATTGAAATACCTAAATATTCAAATACAGGTACAGAAAATTTAGGTAACGGACAATCTGATTCAATAAAAGATGATGATGTAGGTCAAGTATGGGTAGCTAAAATAGATGAAAAAGAATTTTCTGCAATAGTAGAAAAATATAATAATGGTTATATTTGGTTTAAAGGTTTTGATGGTACTAAACAAGCTGAATATAAAGATAAATTGTTTGGTAAAGGTATAGAATTTGTAGTAGATATTAACGGAGAGATGATATTAGTAAATTCAGATTTACAATATCGTGCTATGATTAGAAAAAGACAAATGTATGCTACAAATTATAATGAGATATTGGCAGGACAAAAAGTAAAATTCTTAGCTATAACAATACATACAGATGTAGATGGTACTTTATATGGTAGAAGAATACATATAGGGGATAATAAAAACTATTTCCACTACGATATGATAAATGGTGCTACTTTTAAAGGTAATTTCCAAGTAGGAGAAGCTAACCAAAACAGTGATAATGACCTTTATAATGCTTTGCAAAATAATAGAGTATTTAGAGATAGTAGTAAACCTATAAATAGTGCTACTGTTAGACTTAAAAAGGGAGATATTTGGTATGACACTGCTAATGGAAATAGACCTTATGTATATGATGGTGCAAATTGGCTATCTACAAGAGATGGTAGTTTAGAAAATAATATTGAGTTCTCTAAAATAATATATTCAAATGAACCTCAAGTTATAGGTATTCAAGATAATGATTTTTGGGTAGATACAGATGATAATAATAACATATACATAAGAAAAAATAATACTTGGGTATCTTTTTATTCTGCACCTACTTTTGCTAAAACAGGACAAAAAGTATTTCATCAAACTAACGAACCTGTATCAGATTTTAATTATCAACTTAAAGAGGGAGATATTTGGTTTAATGCTGATGAAGGTTTAATTCGTAAATCTTTTAGACATAATAGATGGGAAGATGTTAGAGAACCTTATGTTATATCTACATTAAATGGTAGATATATTTTTATAGGTGCTAATACACCTACTGTATGGAGAAATAAAGATATTTTCATAAATGTAGTAGATAAACATACATATATAAATAATAATGGAAATAGTGAAATATTAGGAAACAATGTATTAGAAGTAGAGAATAATAATAAAATTCATTTTGTAGATAGTTACCCAAAAGGTATTGCAAAAACTGGGGATTTATGGGTAGATATAGACAATAATTATATTATTTATTTCTATCATAATGGAAATTGGGAAGGAAAACTGTTTAATTAA

Tertiary structure

PDB ID
3ddfaeb038f10875fbe5542c341117c1eda5460684f66f25e4d876c5abf7d938
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5472
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterisation of Fusobacterium nucleatum phages Kabwe,M. and Tucci,J. 2021 — GenBank