Protein
View in Explore- Genbank accession
- QNR52722.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHIGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFFDGNSRERGIIYAPANDGLTTQVLNIRVQDYAAGDESTYAFSGSGLFTSPEVSAWKSISSPQILTDKVITNGKKTGDYDIYSLANNTPLAESKTAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDNDGITWYAGDGLDAYLWSFTWSGGLKAGHSISVGTPGGNKGYSELGTASISLGDNDTGFKWHQDGYFHTVNNGTRTFIYGPAETQSLRKMVMGYSPDGVLMTTPPTENYALATVVTYHDNNAYGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNASTLMFRGNTTGSSSVDNMTISVWGNTFTNPSVGNRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGDRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKDGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFVGHGAGAGGYDIQYAQAAPIFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNGKSVWSLGTEIESGTFVIHHLKEDGSQGHTSRFNMDGTVNFPDNVLVGGGEAAIARNGNIFSDIWKTFTSAGDVTNIRDAIATRVAKEGDTMTGTLWINKDAAGIVLNPPLASDSSFIRSDTAGVNNWYIGKGGADNGLGFYSYVTQGGVYITNNGEISLSPQGQGTFNFNRDRLHINGTQWTAHQAGDWANQWRQEAPVFVDFGNVGNDSYYPIIKGKSGITDEGYISGVDFGMRRITNTWAQGIIRVGNQENGSDPQAIYEFHSNGTFYAPSLLKSGRVSAGGGDPAWGGPCIVLGDNDTGLLWENDGIFNAYANGQGVFSFRPGLAQTFGDVNFHCNAGMYVRDNIDVNDVYIRSDIRCKSEIKLIKNAQEKSKLLGGYTYLVKNSVTDEVKPSAGLIAQEVQEVLPELVSEDKETGLLRLNYNGIIGLNTATINEHTDEIKELKSEIAELKALIKSLIK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1083 AA molecular weight: 116659,99800 Da isoelectric point: 5,38972 aromaticity: 0,09695 hydropathy: -0,32715
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vb_EcoM_bov9_1 [NCBI] |
2763519 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QNR52722.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT884006
[NCBI]
CDS location
range 152908 -> 156159
strand +
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATTATTGATCTGGGTTTTGCTAAAGGCGGTAGCATTGACGGGAATGTTATTCATATAGGAAACTATAATCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGCACCTTCACTCAGACAGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCCGCCGGGCAGATTATGACTGAAGGCGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCACATGTTCGTTTTTTCGATGGCAATAGTCGCGAACGTGGAATCATTTATGCCCCGGCTAATGACGGTTTAACTACACAAGTACTTAATATCAGGGTTCAAGACTACGCCGCTGGTGATGAAAGCACCTATGCATTTTCGGGCAGTGGACTATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATGGAAATCTATTTCGTCTCCGCAAATTCTGACTGATAAAGTTATTACAAATGGGAAGAAGACCGGCGATTATGATATCTATTCATTAGCAAATAACACTCCATTGGCAGAAAGCAAAACGGCTATTAACCACCTCCGTGTTATGCGAAATGCCGTAGGATCTGGTATATTCCATGAAGTTAAAGATAACGACGGGATAACCTGGTACGCCGGTGATGGGTTAGATGCCTATCTTTGGTCGTTTACCTGGTCCGGTGGATTGAAAGCAGGCCATTCTATTTCTGTTGGTACTCCTGGTGGCAATAAAGGATACTCTGAATTAGGGACTGCTTCAATTTCTCTTGGTGATAATGATACTGGATTTAAATGGCATCAGGATGGATATTTCCATACAGTAAACAACGGAACAAGAACTTTCATTTACGGTCCTGCGGAAACACAAAGCCTTAGAAAAATGGTTATGGGTTATTCTCCGGATGGTGTTCTTATGACAACGCCACCGACAGAAAACTATGCTTTGGCTACTGTTGTTACTTACCATGATAATAATGCATACGGCGATGGTCAAACACTTTTAGGATATTATCAAGGTGGTAATTACCATCATTATTTTCGCGGTAAGGGTACTACAAACATTAATACTCACGGCGGTTTGTTAGTTACTCCAGGTAATATTGATGTTATTGGCGGTTCTGTTAATATCGATGGTAGAAATAATGCTTCTACACTGATGTTTAGAGGTAACACAACTGGTAGTAGTTCAGTTGATAATATGACAATTTCCGTTTGGGGCAATACGTTTACTAATCCTAGTGTAGGTAATCGTAAAAACGTCATGGAAATTTCTGATGCAACTAGCTGGATGAGTTATATTCAAAGACTTACTACTGGCGAAGTAGAAATGAACGTTAATGGTTCATTTGAATCATCTGGTGTTACTGCTGGAGATAGAGGAGTTCACACAACAGGTGAAATTTCATCTGGAGCAGTGAATGCTCTTCGTATTTGGAACGCAGATTATGGAGCCATTTTTAGACGTTCAGAAGGAAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTATGGCGAAGGCAAAGATGGCGATATTGGTCCACTTCGCCCATTTAGTATGGCTTTAGATACTGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTCGCTGCTAACGGTTATATTAAATTTGTTGGTCATGGAGCGGGTGCCGGCGGTTATGACATTCAATATGCTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATTGATGATGATGCTGTAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAACGGTAAATCTGTTTGGTCTTTAGGTACCGAAATTGAATCAGGTACATTCGTTATTCATCATCTGAAAGAAGATGGTTCACAAGGCCATACATCAAGATTTAATATGGATGGTACAGTTAATTTCCCTGATAATGTTCTGGTCGGTGGTGGTGAAGCTGCTATTGCTCGTAATGGTAATATTTTCTCGGATATTTGGAAAACGTTTACTTCTGCAGGCGACGTAACTAATATTCGCGATGCAATAGCTACTCGTGTTGCCAAAGAAGGTGATACGATGACCGGCACTCTTTGGATTAATAAAGATGCTGCTGGAATAGTTCTTAATCCTCCTTTGGCCAGTGATTCATCATTTATTCGTTCCGATACGGCCGGGGTCAATAATTGGTATATTGGTAAAGGCGGTGCCGACAATGGTCTAGGTTTTTACAGTTATGTTACACAAGGCGGTGTATATATAACAAATAACGGAGAAATATCACTTTCTCCTCAAGGACAAGGAACATTTAATTTTAATAGAGACCGCCTCCATATAAACGGTACACAATGGACCGCACATCAAGCTGGTGACTGGGCTAACCAATGGCGTCAAGAAGCACCGGTATTTGTAGATTTTGGTAATGTCGGTAATGATAGTTATTATCCTATTATTAAAGGAAAATCCGGTATTACTGATGAAGGATACATATCTGGTGTAGATTTTGGTATGCGACGCATTACTAATACATGGGCACAAGGTATTATCCGTGTAGGTAATCAGGAAAACGGTTCCGACCCACAAGCTATCTATGAATTTCACTCTAATGGTACTTTTTATGCTCCGAGCTTACTTAAGAGCGGTAGAGTATCAGCTGGTGGTGGTGACCCTGCATGGGGCGGGCCGTGTATTGTACTTGGAGATAACGATACCGGTTTGCTTTGGGAAAACGATGGTATTTTCAACGCATATGCAAACGGCCAAGGTGTGTTTAGTTTTAGACCTGGTTTAGCTCAGACATTCGGTGATGTTAACTTCCACTGTAATGCAGGTATGTATGTTCGTGATAACATTGATGTTAACGACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTGTAAGTCGGAAATTAAGCTTATTAAGAACGCTCAAGAGAAATCTAAACTATTGGGCGGTTATACTTATCTGGTTAAAAACTCTGTTACAGACGAAGTTAAACCGTCCGCAGGTTTAATTGCTCAGGAAGTTCAAGAAGTATTACCTGAACTTGTTTCTGAAGATAAAGAGACCGGACTGCTTCGTTTGAACTATAACGGTATTATTGGTTTAAATACAGCTACAATCAACGAGCATACAGATGAAATCAAGGAATTGAAATCTGAAATTGCTGAATTGAAAGCATTAATTAAATCATTGATAAAATAA
Tertiary structure
PDB ID
40ac087d5522b83fecba0654071548ac9c1d66421f2676a595082138aa986b3d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genomes of novel bovine T4, rv5-like and Dillon viruses effective against Escherichia coli O157 | Svab,D., Falgenhauer,L., Chakraborty,T. and Toth,I. | 1975-07-29 | — | GenBank |