Protein

View in Explore
Genbank accession
CAD2272902.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,64
Protein sequence
MSDLLKQHFRATNGLDAGGNKVINVALADRNVKTDGVSVEYVIQENTIQKYDPTRGYLTDFAVTYGRRIWIANKDIPKPAGAFNQANWTSLRVDPNWIYTVRKGEFEVQSGQFINVDSNAAGNATLLLPLAPDEGDTIVVRDIGGRPGYNGILIKAQDTGASIVFGESRLREVRLTRPYSQIMLTFSNGAWRASLTDFGDTAKMVVPNGIVPTQVQAGDNVVRRYTSNSEIFITLPLFANSNDIINFTDLDGTSPINHMTVRTFDPTISIGTPGQTEVQVRTSGNGFLVYDSIDKIWRIFENDLRTRVRIITSDVTLMPNEHISVFGADNNTVKTINVTLPTDVAVGDTVTIAMNYMRKGQTVVIKASDGDTIASNLNLLQFPKRSEYPPDAAWVQSSSITFNGTTSYVPVLGLAYIEDKASGKSYWIVTESDPTVERVDAKDNTTRARLGVIALATQAQANAESNPEKELAITPETLNGRRSTETQTGIARIATSSEVNQATTASYLDNVIVTPKKLNERSATETRRGLAEIATNAKMDAGEDDFTIVTPKKLLYRTTSDSRLGVIQLVKTGGAPNTTADRSSAGTGIFDHSDYKNAVTPKTLREYKATVNQSGIVWLATDSEVRNGTPASSNIPTVVTPEALHKKVATDGAIGLIQIATQTEVNAGGVTNKAVTPKTLNDRTATNDRTGIARFATPGAQGEFEAGTSSTVMVNPKLLFDKFANTDRIQVNTSSGLTITGNLWDHYTINIQEASTSQRGTTTLATAAEVRTGTDAKKIVTAATLHAKTATEGAIGLAQYATQAQVDAGTLSDRIVPPAYLKQTIQVTESWQATDSVRGTVRLSTGDGTWKGNDTNGSTLPDNGYASKGVAVSPYELNLTLKHYLPRLGKAYDTGMLGGQTPDKYARRDIAQTISGAWTFSQDTSFSNNISVQNIIYANGGEVKISPTADTGNVHVRFQNRDGSERGIIYAEPQTASAGNLKVRVKNGTGTTAASQTYTFGGNGTLEVPNEVSTKTLRSSGNAIVGGTVMVKDVQMLAVEGLNSIFGAQSQSAFIRSRDADTQIFAQDSTGSYPILTTKNYARLADGRYVNKAGDTMTGNLNLSGSAIVITGSESWYVPTNETVIRQGSWTAEIKDATKLKGLRGYMVPIRTPIDPGNPSTLVVTGYEEKTAAGGVLTQVGVTTNNTYQLWTPYPPTTETADKRFAHTVWMRIYNPNLNKFDDWMRVFTSATPPTAADIGAPSSVSTQVKTLEVLEWIKLGPVKIWPDRPNQTLKFEWVGD
Physico‐chemical
properties
protein length:1281 AA
molecular weight: 138388,13340 Da
isoelectric point:6,63592
aromaticity:0,07182
hydropathy:-0,33365

Domains

Domains [InterPro]
IPR048391
1127–1228
IPR048391
CAD2272902.1
1 1281
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage vB_KpnM_311F
[NCBI] 		2697092 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAD2272902.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR877331 [NCBI]
CDS location
range 76657 -> 80502
strand -
CDS
ATGAGCGATTTACTGAAACAACATTTCCGTGCAACAAACGGTTTGGATGCCGGCGGAAATAAAGTTATAAATGTGGCACTTGCTGACCGCAACGTTAAAACCGACGGCGTCTCCGTCGAGTACGTTATTCAAGAAAATACTATCCAAAAATATGACCCGACGCGTGGGTATCTCACCGATTTTGCTGTGACTTATGGACGTCGTATCTGGATTGCAAATAAAGATATTCCAAAACCCGCTGGCGCTTTCAATCAAGCCAACTGGACTTCATTGCGTGTTGACCCGAACTGGATTTATACCGTCCGTAAAGGCGAGTTTGAAGTCCAATCAGGGCAATTCATCAATGTTGACTCAAACGCTGCTGGTAACGCTACATTACTGCTTCCGTTAGCACCTGATGAAGGCGATACTATCGTTGTAAGGGATATCGGTGGACGCCCTGGGTATAACGGAATCTTAATTAAAGCACAAGATACTGGTGCGTCTATCGTATTTGGTGAATCGCGCCTGCGTGAGGTAAGACTTACACGTCCGTATTCACAAATTATGCTTACGTTTAGTAATGGTGCATGGCGTGCAAGTTTAACCGATTTTGGCGATACTGCTAAAATGGTAGTTCCGAACGGGATTGTTCCGACGCAAGTTCAGGCAGGTGATAACGTAGTTCGTCGTTATACTTCCAACTCAGAGATTTTTATTACTCTGCCGTTGTTCGCTAATTCAAACGATATCATCAATTTTACTGACCTTGACGGTACATCGCCAATTAACCATATGACTGTGCGTACGTTTGACCCAACTATCTCAATTGGGACTCCTGGGCAAACAGAGGTTCAAGTACGTACTTCAGGTAATGGATTTTTGGTGTATGACTCGATTGACAAAATCTGGCGTATCTTTGAAAATGATTTACGCACCCGAGTAAGAATAATTACTTCTGATGTTACTTTAATGCCTAATGAGCATATTTCTGTATTTGGCGCAGATAACAATACCGTTAAAACAATTAACGTTACTTTGCCTACAGACGTAGCTGTTGGTGATACTGTCACAATCGCAATGAATTATATGCGTAAAGGACAGACTGTAGTAATTAAAGCTTCTGATGGTGATACCATCGCTAGCAATTTGAATTTACTGCAGTTTCCAAAACGCTCAGAGTATCCACCTGATGCAGCATGGGTGCAATCAAGCTCGATTACCTTTAATGGAACTACATCGTATGTTCCTGTTCTTGGGCTTGCATATATTGAAGATAAAGCATCCGGAAAAAGCTATTGGATTGTAACTGAATCTGACCCTACCGTAGAACGTGTTGATGCTAAAGACAACACTACCAGAGCACGATTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACACAGGCTCAAGCTAACGCGGAGTCAAATCCAGAAAAAGAATTAGCAATTACGCCAGAAACCTTAAACGGACGTCGTTCTACTGAAACTCAGACTGGTATAGCAAGAATTGCAACTTCTAGCGAAGTTAATCAGGCAACAACTGCTTCTTACTTGGATAACGTAATCGTTACTCCTAAAAAGCTTAACGAAAGGTCTGCTACTGAAACCCGTAGAGGTTTAGCAGAGATTGCAACTAATGCTAAAATGGATGCAGGTGAAGACGATTTTACAATTGTTACTCCTAAGAAGTTGCTTTATCGCACTACATCAGATTCACGATTAGGTGTTATTCAATTAGTAAAAACTGGTGGTGCTCCTAACACAACTGCTGATCGTTCTTCTGCTGGCACCGGTATATTCGATCATTCTGATTACAAAAATGCAGTTACTCCAAAAACTCTTCGTGAGTATAAAGCTACTGTAAATCAGTCAGGAATAGTTTGGTTAGCAACTGATAGCGAAGTTAGAAACGGAACTCCGGCTTCTTCAAATATTCCTACAGTCGTTACACCAGAAGCTTTGCATAAAAAAGTTGCTACTGACGGAGCAATTGGATTAATCCAAATAGCTACACAAACTGAAGTTAATGCTGGCGGCGTGACTAATAAAGCAGTTACACCTAAAACATTAAATGACCGTACAGCAACTAACGATCGTACTGGTATTGCTCGCTTCGCGACACCTGGTGCCCAGGGTGAATTTGAAGCTGGTACTTCAAGTACAGTAATGGTAAACCCTAAATTACTGTTCGATAAATTTGCTAATACTGATCGTATCCAAGTTAATACTAGTTCTGGCTTAACTATTACTGGGAACCTCTGGGACCATTATACCATCAACATACAGGAAGCAAGTACTTCTCAAAGAGGTACAACTACTCTTGCAACTGCTGCTGAGGTTAGAACCGGCACCGACGCCAAGAAAATAGTTACTGCTGCCACGCTACATGCTAAAACAGCAACTGAAGGAGCTATCGGTCTTGCTCAGTATGCTACGCAGGCACAAGTTGATGCAGGCACATTAAGTGATAGAATTGTTCCTCCTGCTTACTTGAAACAGACTATTCAGGTAACAGAGTCATGGCAAGCTACAGACAGCGTTAGAGGGACCGTCAGGCTATCCACAGGCGATGGAACGTGGAAAGGTAATGATACCAATGGCTCAACTCTTCCGGATAACGGGTATGCCTCTAAGGGCGTCGCAGTGTCTCCGTATGAATTGAACCTTACACTGAAACATTACTTGCCTCGTCTCGGTAAAGCCTATGACACAGGAATGTTAGGTGGTCAAACCCCAGACAAATATGCTCGTCGCGATATAGCGCAGACTATTTCTGGAGCTTGGACATTTAGTCAGGACACTTCATTTAGCAATAATATTTCTGTCCAGAATATTATATATGCTAATGGTGGAGAAGTAAAAATTTCTCCAACTGCTGACACTGGAAATGTGCATGTTCGTTTTCAGAATAGAGATGGAAGCGAGCGTGGTATAATTTATGCTGAGCCTCAAACAGCTTCAGCCGGAAACTTAAAAGTTCGCGTAAAAAACGGAACAGGAACTACTGCTGCAAGCCAGACCTACACATTTGGCGGTAACGGTACGTTAGAAGTTCCTAACGAAGTGTCAACTAAAACTCTGAGGTCTTCTGGAAATGCAATAGTTGGCGGAACTGTTATGGTTAAGGACGTTCAGATGCTTGCTGTCGAGGGATTGAATTCAATATTCGGTGCCCAATCACAGTCCGCATTTATTCGTTCCCGTGACGCTGATACACAAATTTTTGCACAGGATTCAACTGGATCGTATCCAATTTTAACTACCAAAAACTATGCAAGATTAGCTGACGGCCGTTATGTTAATAAAGCTGGTGATACCATGACCGGAAATCTTAACTTAAGCGGTTCTGCTATCGTTATCACAGGTTCTGAATCGTGGTATGTACCAACAAATGAAACTGTAATAAGACAAGGTTCTTGGACTGCTGAAATTAAAGACGCTACTAAATTAAAAGGTCTTCGCGGTTATATGGTTCCAATCAGAACACCGATTGACCCTGGTAACCCAAGCACTTTAGTAGTGACTGGGTATGAAGAAAAAACTGCAGCTGGTGGTGTTTTAACTCAGGTTGGTGTAACTACAAACAATACTTATCAACTTTGGACTCCTTATCCTCCAACAACCGAAACTGCCGATAAGCGTTTCGCGCATACTGTGTGGATGAGGATTTATAATCCAAACCTTAATAAGTTTGATGATTGGATGCGGGTATTTACATCTGCTACTCCTCCAACTGCAGCTGATATCGGAGCTCCAAGCTCAGTATCAACTCAGGTTAAAACCCTTGAAGTTTTGGAATGGATTAAGCTTGGTCCAGTTAAAATCTGGCCAGACCGTCCAAACCAAACTCTCAAATTTGAATGGGTAGGTGATTAA

Tertiary structure

PDB ID
f0b335da661aad6d63e57771e3c31d49564929cf9c029722a2f9110f20fb46ea
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5611
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50