Protein
View in Explore- Genbank accession
- UGO52881.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MATRLRGTLVDGLNKPIVNATVALLAKGNSLLVLSGSEAIFKTSATGTYDITVQTGYYKVIIGPQGSEPYKAGEIAIYADSKEGTLNNYLTSWAPEELTPEVIAQVKDLVSQAETAKNASATSATKSEQERVKAETAAQNAVNTANGMKASIGLTTAPRHVADITVNPSSFLGFIRILRSSTVGYPDIASSENVLAGFVSAMDGTPGFIGVFVGDMTGTIYSYRWIKDVGVTWWKQVNYSTVNRYTQLNAETNFTNQLGNAKLLIDNNKVWGAYDNENKRFIPLAIAQGGTGALTDADARTNLRLGSNDTPQFRNLNLVTVADSAQAPSGIVSGYLNNSSGVQRCRYRIYSEIRGDNKAWLTLHLQSDTATNKYAGLSVDGNFQINGNFIGNALQLSDAPNSRINLQLDRFYQSANETVIYTPSRQAYMTISNNKTWGAYDAEAQNFIPLPINRGGTGALTISDAKTNLQIPSVGGGDWLTYNAPPGVEAGKYYPVIIDMAYSSLYASGAFIDIKTRSAAGDDPMNCCTFNGFIRCGGWSDRKDGGYGYFNNYAKNEIAMKCILSSSKDAERYVAIYVEGRGFPLQLRVPAFCEVTVPTSNFTYKNTTYAWGTANPATDSVAINTLFDFSLNRVGFYQATTEGNYYIGNGERIVLSNGMSVGEELSLTTPKVSFSGTIAAGNGVIADGTSVSNATFYSRYRVGDVIYDSEFRASENAGQIIVRDPTGGTAHQFFNFNLNGTFSAPAGLLSSTGVDWNGQINTVNKFYGIAGQVNTPENNVVYGGIHVGFSGNYAFQICGRKGKSFFRTFEAGVEGQWQQLVTKGNYGVGLIGTFKPEDGSSGFYTDSDGANTWSPANGGGFQSSYTQQRIFQFWMTSSSQGFIRFNDSGNAQASKTDKPWTTLQAAGTSDINFKRVHGVMDTDVALDNISKLEFVYFNYLSDGPEREIRRGVIAQQAQEVDPEYVHSAETSGKMTLDSNPLLLDALAAIQSLKKKDQDNKDRISKLETEVEELKTLVATLVNKEQPLP
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1028 AA molecular weight: 111412,70080 Da isoelectric point: 5,48726 aromaticity: 0,10506 hydropathy: -0,29358
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_EcoS_OddieOddie [NCBI] |
2902674 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UGO52881.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL539454.1
[NCBI]
CDS location
range 18626 -> 21712
strand +
strand +
CDS
ATGGCAACTCGTTTACGTGGTACTTTAGTTGATGGTTTAAATAAACCAATTGTCAACGCTACAGTTGCACTTTTAGCGAAAGGGAATAGCTTATTGGTATTGTCCGGTAGTGAAGCTATCTTTAAAACAAGCGCAACCGGAACATATGATATTACAGTCCAAACAGGCTATTACAAGGTTATTATCGGTCCGCAAGGTAGCGAGCCTTATAAAGCTGGTGAAATTGCTATTTACGCGGACAGTAAAGAAGGTACGCTCAATAACTATTTAACTTCCTGGGCACCGGAAGAGCTAACTCCGGAAGTCATTGCACAGGTTAAAGATTTAGTTTCACAAGCTGAGACAGCTAAGAATGCTTCTGCTACATCTGCAACTAAATCCGAGCAAGAACGCGTTAAAGCAGAGACTGCGGCTCAGAATGCTGTAAACACTGCTAACGGTATGAAAGCTTCTATTGGTTTGACTACTGCACCAAGACATGTTGCAGATATTACAGTCAACCCGTCATCATTCTTGGGTTTTATACGGATTTTACGGTCTAGTACAGTAGGTTATCCGGATATTGCGTCCTCAGAAAACGTATTAGCCGGTTTTGTTTCCGCTATGGATGGAACCCCTGGATTTATAGGTGTTTTTGTTGGAGACATGACCGGGACTATATATAGCTATAGATGGATCAAGGACGTTGGCGTTACATGGTGGAAGCAGGTTAACTATTCTACTGTCAACAGATATACCCAGCTAAACGCAGAAACTAATTTTACAAACCAATTAGGTAATGCAAAACTCCTCATAGATAATAATAAAGTTTGGGGGGCATATGACAATGAAAATAAACGCTTCATACCTCTAGCAATAGCTCAAGGTGGTACAGGGGCGCTCACAGACGCGGATGCTCGTACAAACTTAAGACTTGGTTCTAACGATACACCTCAATTCAGAAACCTTAATCTTGTTACAGTAGCAGACTCCGCACAAGCGCCTTCCGGCATTGTGAGCGGTTATTTAAATAATAGCTCTGGAGTTCAAAGATGTCGCTACCGCATATATTCTGAAATAAGAGGCGACAATAAAGCGTGGTTAACCTTACACCTTCAATCAGACACAGCAACAAATAAATATGCTGGTCTAAGCGTTGATGGTAATTTTCAAATCAATGGAAATTTTATTGGTAATGCTTTGCAGTTGTCAGACGCTCCAAATTCCAGGATTAATCTACAGTTAGATCGTTTTTATCAAAGTGCTAACGAAACGGTTATTTATACTCCGTCTCGTCAAGCATATATGACAATTTCTAATAACAAGACTTGGGGCGCTTATGACGCGGAAGCTCAAAACTTCATTCCTTTACCTATTAATAGGGGAGGGACTGGTGCCCTAACAATATCCGACGCTAAGACTAATCTTCAAATTCCGTCTGTAGGTGGGGGTGATTGGTTAACTTATAACGCTCCTCCTGGCGTGGAAGCTGGAAAGTATTATCCAGTTATCATCGATATGGCATACAGTTCTTTATATGCTTCTGGTGCTTTTATAGATATAAAGACACGTTCTGCCGCTGGTGACGACCCAATGAACTGTTGCACTTTTAACGGATTTATTAGATGTGGTGGTTGGAGCGACCGAAAAGACGGCGGTTATGGTTACTTCAACAACTATGCAAAAAATGAAATTGCTATGAAATGTATTCTTTCTTCATCTAAAGATGCGGAAAGATACGTTGCAATATATGTTGAAGGTCGTGGTTTCCCTCTTCAATTGCGTGTCCCTGCATTCTGTGAAGTAACAGTACCAACATCAAACTTTACTTATAAAAATACGACCTATGCGTGGGGTACAGCTAACCCTGCAACGGATTCTGTAGCTATAAACACCTTATTTGATTTTTCATTAAACCGCGTTGGTTTTTACCAGGCCACGACAGAAGGTAATTATTATATCGGAAATGGGGAACGTATTGTTTTATCTAACGGAATGTCTGTGGGCGAAGAGTTAAGTCTAACCACACCTAAAGTGTCTTTCAGTGGAACCATTGCTGCTGGTAACGGTGTCATTGCAGATGGAACATCTGTATCCAATGCTACTTTTTATAGTCGTTATCGTGTTGGTGACGTGATATATGACAGCGAGTTTCGCGCAAGTGAAAATGCTGGTCAAATTATAGTCCGCGATCCAACGGGTGGGACTGCGCATCAATTCTTTAACTTCAATCTCAACGGGACATTCAGCGCTCCCGCTGGTTTGCTATCTTCTACTGGAGTAGATTGGAACGGTCAGATTAATACCGTCAATAAATTCTATGGGATTGCTGGACAAGTTAACACACCAGAAAACAATGTGGTTTATGGTGGTATACATGTTGGATTCAGCGGCAACTATGCTTTCCAGATATGCGGAAGGAAAGGTAAATCCTTCTTCCGCACATTTGAAGCAGGAGTAGAAGGACAATGGCAACAATTAGTAACTAAAGGGAACTACGGAGTTGGTCTAATTGGAACTTTTAAACCGGAAGATGGTTCAAGTGGTTTTTACACTGATTCCGATGGGGCAAATACTTGGTCGCCCGCTAACGGAGGGGGTTTTCAATCTTCGTATACTCAGCAGCGAATATTCCAATTTTGGATGACATCAAGCTCGCAGGGGTTTATTCGTTTTAACGATAGCGGTAACGCTCAAGCTTCTAAGACGGATAAACCTTGGACAACACTTCAAGCAGCTGGCACATCGGATATTAATTTCAAGCGTGTTCACGGAGTGATGGATACAGATGTTGCATTGGATAACATAAGCAAGCTTGAATTTGTATACTTTAACTATCTGTCCGATGGTCCAGAGCGTGAAATCCGTAGGGGTGTCATTGCTCAACAGGCCCAGGAAGTTGATCCTGAATATGTGCATAGTGCTGAAACATCCGGGAAAATGACTTTGGATTCTAACCCATTGTTATTGGATGCATTAGCTGCAATACAATCCCTCAAGAAAAAGGATCAAGATAATAAAGACCGTATTAGTAAACTTGAAACTGAAGTTGAGGAACTTAAGACGTTAGTTGCTACGCTTGTTAATAAAGAGCAACCATTACCATAA
Tertiary structure
PDB ID
a6d6b31955aad46db8022d1d19e74d5978c11b1dcdb35ce4684144e7139656aa
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50