Protein

View in Explore
Genbank accession
XBS49399.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MYSIKTDLDITGGATVGKDLLVKGDAVFNKNLTVNGTVTFADAVFTAIEAGTVDISSTLDVAGKASLNGGIEVHGNSVIGNLPVGSDTATINSNAQFQSPVSMAGNLTQTAGTAVLKDTQVASMDVLGTSSFKGNITAETGTTAAFDKITATDATFTNTATTDITSTGTANFKDVNISGTLGGTFSLSDVNATTLTVSGLTSLQGGVTLGSNITGVNSSANFRDIKIGSNAANTNYRLSFNYSAPSLRPTVILQNEIQSELMSPATLSVLKTASFGDSSLSTFGITGNGLNKLDYLTVSGNSVQDPTTPLLQVTSGKTKVHDFEVTGTATIPNIESTGTANFNNINVSGTLGGTFSLDDIEANTLTVSGLTSLVGGVTLGADISGANSTANFKAVSLGQNAADANVKYGFAYSAPGARPTVILQNEIQSELVSPAVLNVQKTATFGDASLATYGITGNGLNKLDYLSITGNGTQSPATPQLQVAGKSVLNDVEFTGTVTGLTVDVSGQDLTPKSVDAAEAIKGQTLESVGQTTVGTNLQVGGTANVVGALTGTAATFTGDVSAAKGTFSGDVSVTGQTVTVRDLVVTGTTTGVTAQADVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGDTTLAGLTASSVTSTGDITGASVSGNTVTAAGALSGGSLAVTGAGSMASLTVPSITGDTTFANNVTITGTLTPSSIDLSTTDVSAASLTTTGNVTVGGSLAVTGAIDLSAADVVTKSVSATNPSTFGVINASSVAATGDVSGGTLTTTGAAKVGTLTSTGVVSGSRLSSGTATITTSVTVPTLQAEAAGAGTLNLASNVVAAKDLTVTGVFKPEGGLDLTTVDITANSLTTTADVNVGGNLVVDGTFDLSAADVSVKSLASAETITSAGVITVTDSTNTSSLPKITSTDATLFTVNAGTINATGNSVLQSVSATQVTATSAEFSGGGIGLQVDNDANVGGALSVGGIATVGSLTTTAASLNIAKNTAITGDLAVSGTLTAGSIDLSNTDVTVKSLDSLGNAHIAGNLTVDGAFDLSATNLVAASLASTGSTTVGTDLVLTTGVVTGSPAISGNTTIGGTLGVTGAVNLTDIVNIGKKVTVSTGGIQVVDGGINTNTINVSGASTLAGTSITGTLGVTGASTLAGVSATSLTVSGDSTVQKLTVQGELIPQGGLDLSGADITANSLTTATTINATGLSTLSGGVSTSTVTASGLATVGSLTSTANASVGGNLGVTGTLDVTGATTVSSLTATGAVKTGTTLTVGTPVGEQPETVQIIPDTYIAGKLRVIGGINAEIDVSGQTLEPYAIEAAATLSAVGNITSGATIVSKAATIGDVGSQNNNLTVNGNVVTNGDFTVTGVLNAQLNQADSDVAVKSLTATNNVAAGTSITAGTSITASGLLKGNSLEVTTTGSFGGAVTMSSGANITGTVGITAGDLTVGGNISATGTAGFGATTVSTITTSGLATLASASVTGALTVGGTLTANGNTVIGDAAADTLTVNATSTFKENATFDKNLTVTGSINTTTANFTTNNMVTKKYSVIPASVTASTAAVGGTWTPDGTTNVYRLTLDQSVTMDSIAGLIGSGQACSVYIYVTPSVADTTFTFGGAYSVVSGTVSAVVGQTSIIQVIYDGFSTVFDTFVAQRV
Physico‐chemical
properties
protein length:1644 AA
molecular weight: 160703,71570 Da
isoelectric point:4,14086
aromaticity:0,03467
hydropathy:0,28942

Domains

Domains [InterPro]
IPR058970
1555–1632
IPR058970
XBS49399.1
1 1644
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage fEgEco12
[NCBI] 		3158837 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XBS49399.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP777464 [NCBI]
CDS location
range 153032 -> 157966
strand -
CDS
ATGTACTCGATTAAAACAGATCTCGATATAACTGGTGGTGCAACGGTTGGTAAAGATCTTCTTGTGAAAGGCGATGCAGTATTCAATAAAAATCTAACAGTTAATGGAACTGTAACTTTTGCTGACGCTGTATTCACTGCAATTGAAGCAGGAACTGTAGACATTTCATCTACACTAGATGTTGCTGGTAAAGCATCATTGAATGGTGGAATTGAAGTTCATGGTAATTCCGTAATTGGTAATTTGCCTGTTGGTTCTGATACTGCAACAATTAATTCTAATGCACAATTCCAAAGCCCAGTATCAATGGCAGGTAACCTAACACAAACCGCTGGCACTGCTGTACTAAAAGATACCCAAGTGGCATCAATGGATGTTCTTGGAACTTCTTCATTTAAAGGTAATATTACTGCTGAAACTGGCACTACCGCAGCATTTGACAAAATAACTGCAACTGATGCAACATTCACAAACACTGCAACTACTGATATCACATCAACTGGAACTGCAAACTTTAAAGATGTGAATATTTCCGGTACACTAGGTGGAACATTTAGTCTATCTGATGTTAATGCAACAACTCTAACTGTTTCTGGTTTAACCAGTCTACAAGGTGGTGTTACATTAGGTTCCAACATTACTGGTGTGAATAGTAGTGCAAACTTCCGTGATATTAAAATTGGTTCCAATGCTGCAAACACTAACTACCGTTTGAGCTTTAACTATTCTGCTCCAAGTCTTCGTCCAACTGTAATTCTACAGAACGAAATCCAATCAGAATTGATGTCTCCAGCTACCCTAAGTGTATTGAAAACTGCATCTTTTGGTGATTCGTCATTATCCACTTTTGGTATTACTGGTAATGGTCTAAACAAACTAGATTACCTAACAGTATCTGGTAACTCTGTTCAAGATCCAACAACTCCACTATTACAAGTAACTTCAGGTAAAACTAAAGTTCATGATTTCGAAGTAACAGGAACTGCAACTATTCCTAACATTGAAAGTACTGGTACTGCTAATTTTAATAACATCAACGTATCTGGTACACTCGGTGGTACTTTCAGTCTTGATGATATTGAAGCAAACACACTAACTGTATCCGGTTTAACTAGCCTTGTTGGTGGTGTAACTTTAGGTGCTGATATTTCCGGTGCTAATAGTACTGCTAATTTTAAAGCAGTAAGTTTAGGACAAAACGCCGCCGATGCTAACGTTAAGTATGGTTTTGCTTATTCTGCCCCTGGTGCTCGTCCAACTGTAATTCTACAAAATGAAATTCAGTCTGAGCTAGTATCTCCAGCAGTACTTAATGTACAAAAAACTGCAACCTTTGGTGATGCATCTCTTGCAACCTATGGTATCACAGGTAACGGTCTAAACAAACTAGATTATCTATCTATTACTGGTAATGGTACACAAAGTCCAGCTACCCCACAACTACAAGTTGCTGGTAAATCAGTACTAAATGATGTTGAATTCACTGGTACTGTAACTGGTCTAACTGTTGATGTGAGTGGACAAGATCTAACTCCTAAATCAGTAGATGCTGCTGAAGCAATCAAAGGTCAAACCCTTGAATCAGTTGGTCAAACCACCGTAGGAACTAACCTACAAGTTGGTGGTACTGCTAATGTTGTTGGTGCACTAACTGGTACTGCTGCTACCTTCACTGGTGATGTAAGTGCTGCTAAAGGTACTTTCAGTGGTGATGTTAGCGTTACTGGTCAAACTGTAACTGTACGTGATTTAGTAGTAACTGGTACAACTACTGGTGTAACTGCCCAAGCTGATGTTGATGGTCTTGATATCGCCCCAAATAAAGTTGATGTTACAACAACACTATCTGTTGCTGGGGACACTACTTTAGCTGGCCTAACTGCTAGTTCAGTAACCAGTACTGGTGATATTACTGGTGCGTCTGTATCTGGTAATACAGTAACTGCGGCTGGTGCACTATCTGGTGGTTCTCTTGCAGTAACTGGTGCTGGTTCTATGGCTTCACTAACTGTTCCAAGTATTACTGGTGACACTACTTTTGCTAATAACGTAACTATTACTGGAACACTAACTCCGAGTAGTATAGATTTAAGCACTACTGATGTAAGTGCTGCTTCTTTAACAACTACTGGTAACGTAACTGTTGGTGGTTCTCTTGCAGTAACTGGTGCTATTGATTTGTCTGCTGCTGATGTAGTAACAAAATCAGTTAGTGCAACTAACCCAAGTACATTTGGTGTAATTAATGCATCTTCTGTTGCCGCAACTGGTGACGTTTCAGGTGGCACACTAACTACTACTGGTGCAGCGAAAGTAGGAACACTAACTAGTACTGGTGTAGTATCTGGTTCGCGTTTGTCTTCTGGTACTGCAACAATCACAACTTCTGTAACAGTTCCAACTTTACAAGCTGAAGCTGCTGGTGCTGGTACACTAAATCTAGCAAGTAATGTTGTCGCGGCAAAAGATCTAACTGTCACTGGTGTATTCAAACCTGAAGGTGGTCTTGATCTAACAACTGTTGATATTACTGCAAACTCACTAACTACTACTGCTGATGTTAATGTTGGTGGAAACTTAGTAGTTGATGGTACTTTTGACCTAAGTGCTGCTGATGTGTCTGTGAAATCTCTTGCAAGTGCAGAGACAATTACAAGTGCTGGTGTTATTACCGTTACCGATTCAACCAATACTAGTTCGTTACCTAAAATTACTTCAACTGATGCAACACTCTTTACAGTAAATGCAGGTACTATTAATGCAACTGGCAACAGTGTACTACAAAGTGTATCAGCTACTCAAGTAACTGCTACTAGTGCTGAATTTTCTGGTGGTGGCATTGGTCTTCAAGTTGATAATGATGCAAACGTTGGTGGTGCATTATCTGTTGGTGGCATTGCAACTGTTGGTTCTTTAACAACAACTGCTGCTTCTCTTAATATTGCAAAAAATACTGCAATCACTGGTGATTTAGCTGTATCTGGTACACTAACTGCTGGTTCAATCGACCTAAGCAATACTGATGTAACCGTTAAATCTCTTGATTCACTAGGTAACGCACACATTGCTGGTAACCTAACTGTTGATGGTGCATTCGACTTAAGTGCAACTAACCTTGTAGCTGCAAGTCTAGCAAGTACTGGTTCTACTACTGTTGGAACTGATCTAGTACTAACAACTGGTGTTGTGACTGGTAGCCCAGCTATCTCTGGTAATACAACAATCGGTGGAACTCTTGGTGTAACTGGTGCTGTTAACCTAACTGATATTGTTAATATCGGTAAGAAAGTAACAGTGAGTACTGGTGGTATTCAGGTAGTTGATGGTGGTATCAATACTAACACAATTAACGTTTCTGGTGCTTCTACTCTAGCAGGAACTTCCATTACTGGAACTTTAGGTGTAACTGGTGCTTCTACTCTAGCAGGTGTATCTGCGACATCACTAACAGTTTCTGGTGACAGTACTGTTCAGAAACTAACTGTCCAAGGTGAATTAATCCCACAAGGTGGTCTTGACCTAAGCGGTGCAGACATTACTGCTAATAGTCTAACTACTGCAACAACTATCAATGCAACTGGCCTAAGTACTCTAAGTGGTGGTGTTAGTACTTCTACTGTGACTGCATCTGGTCTAGCAACTGTTGGAAGTTTAACTTCTACTGCAAACGCATCAGTTGGTGGCAATTTGGGTGTAACTGGAACTCTAGATGTTACTGGTGCTACTACTGTATCTTCACTAACAGCTACTGGTGCAGTGAAAACTGGTACAACCCTAACTGTTGGTACTCCAGTTGGTGAACAACCTGAAACTGTACAGATCATTCCAGATACTTATATTGCTGGTAAATTGCGTGTAATCGGCGGTATTAACGCTGAAATCGACGTAAGTGGTCAAACACTAGAACCATATGCAATTGAAGCTGCTGCAACACTATCTGCTGTTGGTAACATTACTTCTGGTGCAACCATCGTTTCTAAAGCTGCAACAATTGGTGATGTTGGTTCACAAAACAACAACCTAACTGTTAATGGTAACGTAGTAACTAATGGTGACTTCACCGTTACTGGTGTACTAAATGCACAATTGAACCAAGCAGATTCCGATGTAGCTGTTAAGTCTTTGACTGCAACTAACAACGTTGCGGCTGGTACTTCAATCACTGCTGGAACATCCATCACTGCATCAGGCTTACTAAAAGGTAATTCGTTAGAAGTCACCACTACTGGTTCATTTGGTGGTGCAGTAACTATGTCAAGTGGTGCAAACATCACTGGTACTGTTGGTATCACTGCTGGTGACCTAACAGTAGGTGGTAATATCTCTGCAACTGGTACTGCTGGATTCGGTGCAACAACCGTTTCTACAATTACAACATCAGGTTTAGCTACCCTTGCAAGTGCATCTGTAACTGGTGCTCTAACTGTAGGTGGTACATTAACTGCAAATGGTAACACTGTGATTGGTGATGCTGCTGCTGATACTTTAACTGTAAATGCAACATCTACATTTAAAGAGAACGCAACATTTGATAAGAACCTAACAGTGACTGGTTCTATTAACACAACCACTGCAAACTTCACTACAAACAACATGGTAACTAAGAAATATTCTGTTATCCCTGCTAGTGTTACTGCTTCTACTGCTGCTGTAGGTGGTACTTGGACACCAGATGGTACTACTAACGTATATCGCTTAACTCTTGACCAAAGTGTTACAATGGATTCCATCGCGGGTCTAATTGGTAGTGGTCAAGCATGTTCAGTGTATATCTATGTAACTCCATCTGTTGCTGATACTACTTTCACCTTCGGTGGTGCATACTCTGTAGTTTCTGGTACAGTAAGTGCTGTAGTTGGTCAAACAAGTATTATCCAAGTAATCTATGATGGTTTCAGTACTGTGTTTGATACCTTCGTTGCACAACGTGTATAA

Tertiary structure

PDB ID
75a73a6b0f3dcfe2546c3bab4845f150a46021028a828d8ca20ab8f040ff0ee9
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5304
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50