Protein

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Genbank accession
AIX30166.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,99
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,60
Protein sequence
MANQNFRVKKGIEVGLGATFLYADDSGVGINSASPRSNLDVRGRSQTEELLVDNYAEVQGPSTFVGLGTFGGDLYVGNDLYVKGNLSFTSFESETGNVTGVLTTRDFNVTGLSTFAGDATFQSDVNISGASSITGNLVVSGASTLTGIVTTGDDLYVGGSLYVFNDIFYDEITGRNLSISGIATLRQLEIQQDLEVAGLSTFVGLVSFRDAVGTNLTVYNLSANTGNFVEINVDGGGGGGGGTGIDSTSVNTEFLNVTGVATFNNGIATNFSAEFIDAGVTTTTDLHFTNGYGVNLNMSGITTVGILTVYENIYDSRNQVGYGDSLLVTQGGKLVWTRPDIAGIATSFQPGSTFYVSENGSNTNDGRSPEKAWSSIAYAVSQIGDTSHDILEVTAGEYTETFPITVPKGLTISGAGQRATIVRPSQATETNDGFLLNDRSTIHNITVTGFYKPQGSINYAFKFSVGAAITSRSPYVDKVTVINKGTQTSASDPYGYGSADSYPTTAPGGAGVLVDGSVVATNSLEAAILLNEVTLFTAGNQGIKITNGGRVEWLNGFIYFASEALVGLSDKTTGLAGAGKARLTLENASGGLVGGNTVQYYDSDGTTVLASGTIDNVSGSYVTLTNAGVGTFTTPRNRTAKKVDFVNGAQLSTAQARFGTSSLDVTGAGTDNITVDSTSDFGFGTGDFTVEFWIYRTGNINGKVICDFRDTAATDQAITIQGDGGNETDVYIGTTSVVTGTVPTTLNAWNHIAVCRVGSTITQYIDGAVSGSGTAATDLGVARQLTFGDRYDNSNNGPTAYLDELRVTKGAAKYTGAFTSPSVALTGDKDTSILLHFDGINGATSTTDDIIVLQDIRITGGNTADKVTLADYSQFGADLRSIACAIEYGNQGMIGDGDGVTLRAISINFNHVGALGDITNDPNLAIQSNEVIELNGGQVSYVSIDQKGDFRVGESFYVNQETGDVSFNNTTTDLTSLSSLTITDGTNNSLITPTSGRFGNVQISGQQVASVSGDLDLVTAGGGEVNIYGNTNVVGILTAQVVEINAIQKGDTSIALDDTGTDGTIRFNTDGSEAGRFTKDNDLAVTHNFRVGGIGTIPNLVSTTATITTLNVENLVSSGSTSGGGGTGIGSTAINSPNLNISGQANFNNVNVSGVATVPDLTVTNSFTNTGYSTITGDAEVGGNLWLKGDLNVIGSQNVSEFFATNMEISGIATFGTVKVNSNVHCDDTVFVGGAVTITGPITAVDIFATGIGTIPVADVGHADVDSINVTGISTISQVDIGKITVGDFTVTGFATVTDGLEVIGPVSFGGSITQLPLPTGQGGVWFDNSVVGVGTLLATNASISGLLGVGNSLGVAGDAYIDGNIIGSGGTISNYNEIITPLLTATDIDAATLDVSGNVTIDGNVDLGDTSADFVRINGRVSTSFIPSTDSATDLGSNGLRWKELFVDKLTLTDDAAIGGDLSVGGSVSADYVDTTELNVSGVATFAQISIGGGGGGISTNGVIINNVTVTDQSTLNNLIVSGVSTFVGVSTFKGDVYIDGNLIIDGDNSQDLISGTNLLVSGIATIGTLGVTTNLTVGGDVLVSGAMTAGSYNGDGSQLDNLPAASITTSITPTTRVNGDTLQTGDLWYDSSELRQYTYYDDGGSVQWVPSAPEPTIPDFTYAGNTGIGTLSLGDDTFSVVGDGTNVVTTASGVTTTVTISLSDSVAIAGSMTAGSFLGENLNVSGVSTFVGVTTFRGDVFIEGNLIIDGDESQDLVSGTNLIITGIATIGTLGVTTTTTNTLTVLDTFTLDNPVNSIGISSDLGGAGAAHTALASQLAIKQYIDANNSDQNLNFTGDTGSGSIGLGTEFLEVRGTAQQVTTIGVGNSVVIGLPNTVRVPQRLYVGGGAFTQVMDANSASGVVFANKIVTINKGLTLSSSDLTGVRNLVQTGIATLGTVNFSGVTTTVGNAFVGNDLSVLGTVNANDFNSTSDATRKEDVVEIEDALAKVLDLRGVTFNWKNGEGSSAGVLAQEVQMVLPEIVKGDVGNMSVQYNGIIALLVQAVKELSSEVEELKRTKSDKRRKKS
Physico‐chemical
properties
protein length:2069 AA
molecular weight: 212621,55030 Da
isoelectric point:4,14216
aromaticity:0,06863
hydropathy:0,06506

Domains

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Domain architecture
AIX30166.1
1 2069 aa
STR 347–811 · CHP 1974–2061 ·
ATT Attachment Domain STR Structural Domain RBD Receptor-Binding Domain CBM Carbohydrate-Binding Module LEC Lectin-like Domain ENZ Enzymatic Domain CHP Intramolecular Chaperone LNK Linker/Spacer Domain TAS Tail-Associated Structural TTP Tail Tubular Protein UNK Uncharacterized Domain Unmapped
Proteins with similar domain architecture

Tail Spike Domain Segmentation

Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.

Domain layout
AIX30166.1
1 2069 aa
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 406 406 0,8836
Central domain 407 648 243 0,9886
C-terminal 649 2069 1420 0,0841
N-terminal Central domain C-terminal

View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.

Taxonomy

Phage
Synechococcus phage ACG-2014f [NCBI] · taxon 1493511
Uroviricota Caudoviricetes Pantevenvirales Atlauavirus Atlauavirus tusconc8
Host
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] · taxon 32051
Bacteria Cyanobacteria Oscillatoriophycideae Chroococcales Synechococcus

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AIX30166.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019095 [NCBI]
CDS location
range 204123 -> 210332
strand +
CDS
GTGGCGAATCAGAATTTTCGTGTCAAAAAAGGTATAGAAGTTGGCTTAGGTGCCACTTTTCTATACGCAGACGACAGTGGAGTTGGCATTAATAGTGCTAGCCCACGATCAAACCTAGACGTTCGAGGTAGATCCCAAACAGAGGAACTACTGGTAGACAACTATGCAGAGGTGCAAGGACCCTCTACATTCGTTGGACTAGGTACCTTTGGGGGTGATCTATATGTTGGGAATGATCTATATGTAAAGGGCAACCTATCATTCACCAGTTTTGAATCTGAGACTGGTAATGTAACAGGTGTTCTTACCACAAGAGACTTTAATGTAACCGGATTATCTACGTTTGCGGGAGACGCCACCTTCCAAAGTGACGTAAATATCTCTGGTGCTTCTTCAATTACTGGAAACTTAGTAGTTTCTGGTGCCTCTACGCTCACAGGTATCGTCACAACTGGCGATGACCTCTATGTGGGTGGTAGTTTATATGTATTCAATGATATCTTCTATGATGAGATTACTGGTAGAAACCTCAGTATCTCTGGTATTGCCACACTCAGACAGTTAGAAATCCAACAGGACCTAGAAGTTGCAGGTCTCTCCACATTTGTTGGTTTAGTATCGTTCAGAGATGCAGTAGGTACAAACCTCACAGTTTATAATCTTTCCGCCAATACTGGTAACTTCGTAGAGATTAACGTCGATGGTGGAGGAGGCGGCGGTGGCGGTACTGGTATCGATAGTACCTCCGTCAATACCGAGTTCTTAAACGTCACTGGTGTTGCAACATTTAACAATGGTATTGCCACCAACTTCAGCGCAGAGTTTATTGACGCTGGTGTAACCACAACTACCGACCTCCACTTCACTAATGGTTACGGTGTCAATCTCAATATGAGTGGCATCACAACTGTTGGTATTCTAACAGTCTATGAGAATATCTATGACTCTAGAAACCAAGTTGGTTATGGTGACTCACTACTAGTCACACAGGGTGGGAAACTAGTATGGACTAGACCTGATATTGCAGGTATTGCCACTTCATTCCAACCAGGTTCTACCTTCTATGTAAGTGAGAATGGTAGTAATACCAATGATGGTAGAAGTCCAGAGAAAGCATGGAGTTCTATTGCATATGCCGTATCACAGATTGGAGATACTTCTCACGATATTCTAGAGGTTACTGCTGGTGAATACACAGAAACCTTCCCTATCACAGTCCCTAAAGGTTTAACCATTTCTGGTGCTGGACAAAGGGCAACCATTGTTAGACCGTCACAGGCAACAGAAACCAATGATGGTTTCCTACTAAACGATAGATCCACTATCCATAACATCACAGTTACTGGATTCTACAAACCACAAGGTTCTATCAACTACGCCTTCAAGTTTAGTGTTGGAGCAGCAATCACCAGTAGAAGTCCTTATGTTGATAAGGTCACGGTCATCAACAAAGGTACTCAGACAAGTGCCAGTGACCCATATGGTTATGGTTCAGCTGACTCCTACCCAACCACAGCACCTGGTGGTGCTGGTGTTTTAGTTGATGGTAGTGTAGTTGCAACCAACTCACTAGAAGCAGCAATTCTCCTCAATGAGGTTACACTATTCACTGCTGGCAACCAAGGTATTAAGATTACCAATGGTGGTAGAGTAGAGTGGTTGAATGGTTTCATCTACTTCGCTTCTGAAGCACTTGTAGGTCTTAGTGATAAGACTACTGGTTTAGCGGGTGCTGGTAAGGCAAGACTAACCCTAGAGAACGCCTCTGGTGGATTGGTTGGTGGTAATACCGTTCAATACTATGATAGTGATGGAACCACAGTTCTTGCTTCTGGTACCATTGATAATGTATCTGGTAGTTATGTAACACTAACCAACGCTGGTGTTGGTACATTCACAACTCCTAGAAATAGAACAGCCAAGAAGGTTGACTTTGTTAATGGAGCACAACTATCCACAGCACAGGCAAGGTTCGGTACATCCTCACTAGATGTAACTGGTGCCGGAACTGATAACATCACAGTTGATTCCACTTCAGACTTTGGGTTTGGAACTGGAGACTTCACCGTTGAATTCTGGATATACAGAACTGGTAATATTAATGGTAAGGTAATCTGTGACTTCAGAGATACCGCCGCTACAGATCAAGCAATTACTATCCAAGGTGATGGTGGTAATGAGACTGATGTTTATATTGGTACTACATCCGTTGTCACTGGTACAGTTCCTACCACACTGAATGCTTGGAACCATATCGCTGTTTGTAGAGTTGGTTCTACCATCACTCAGTATATTGATGGTGCTGTTTCTGGTAGTGGAACTGCTGCTACTGATCTAGGTGTTGCTAGACAACTAACCTTTGGTGATAGGTACGACAATAGTAACAACGGTCCTACAGCATACCTAGATGAACTTCGTGTCACTAAGGGGGCAGCAAAATACACAGGAGCATTCACTTCACCTTCAGTAGCACTCACAGGTGATAAGGATACTTCTATCCTACTACACTTTGATGGTATCAATGGAGCAACCTCCACTACAGATGATATCATTGTCCTCCAGGATATTCGTATCACTGGTGGTAACACAGCAGATAAAGTTACCCTAGCAGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGACCTCAGGTCTATCGCTTGTGCCATTGAATATGGTAACCAGGGTATGATTGGTGATGGTGATGGAGTAACTCTCCGTGCTATCTCTATCAACTTCAACCATGTAGGTGCTCTTGGTGATATCACTAACGATCCTAACCTAGCGATTCAATCGAACGAGGTTATCGAACTCAATGGTGGTCAAGTATCCTATGTAAGTATTGACCAGAAGGGTGACTTCCGTGTTGGTGAATCCTTCTATGTTAACCAGGAAACTGGTGATGTATCATTCAACAACACAACAACTGATCTAACCTCACTATCTAGTCTAACCATCACTGATGGTACTAACAACTCACTTATCACTCCTACCTCTGGTAGATTTGGTAATGTTCAGATCTCTGGACAGCAAGTTGCTTCTGTATCTGGTGACCTAGACCTAGTAACCGCTGGTGGTGGTGAAGTTAACATCTACGGTAATACTAACGTTGTTGGTATTCTAACCGCACAGGTTGTTGAGATCAACGCTATCCAGAAGGGTGATACTTCTATCGCTCTAGATGATACCGGTACTGATGGTACTATCCGGTTTAACACCGATGGTTCTGAGGCAGGTAGATTCACTAAGGATAACGACCTTGCAGTAACACACAACTTCCGCGTTGGTGGAATTGGTACTATTCCAAACTTGGTAAGTACTACTGCAACCATCACAACTCTAAATGTTGAGAACCTTGTCAGTAGTGGTAGCACTAGTGGCGGTGGCGGAACTGGTATCGGTTCTACCGCTATCAATTCACCTAACCTTAATATTTCTGGTCAGGCAAACTTCAACAACGTCAACGTTTCTGGTGTTGCCACGGTTCCTGATCTAACTGTAACCAACTCCTTTACTAATACTGGTTATTCAACCATCACTGGTGACGCCGAAGTTGGTGGAAATCTATGGTTGAAGGGTGACCTCAATGTTATCGGTTCCCAGAATGTTAGCGAGTTCTTCGCTACCAATATGGAGATCTCTGGTATCGCTACCTTCGGTACCGTAAAGGTCAACAGTAATGTCCATTGTGACGATACTGTATTTGTTGGCGGTGCTGTAACAATCACTGGTCCAATCACAGCAGTGGATATCTTTGCCACTGGTATTGGAACCATTCCTGTAGCAGATGTTGGACATGCCGATGTTGATTCTATCAATGTCACTGGTATCTCTACTATCTCTCAGGTTGATATCGGTAAGATTACCGTAGGTGACTTCACTGTAACTGGATTTGCAACTGTCACTGACGGACTTGAAGTTATCGGTCCTGTCTCATTTGGTGGTTCTATCACACAACTACCTCTACCAACTGGTCAAGGTGGTGTTTGGTTTGACAACTCTGTTGTGGGTGTCGGCACACTACTCGCCACTAATGCATCAATTAGCGGACTCCTCGGAGTTGGTAATTCATTGGGTGTTGCTGGTGATGCCTACATCGATGGAAACATCATTGGTTCTGGTGGTACTATCTCTAATTACAACGAGATTATTACACCTCTCCTAACCGCAACTGATATCGATGCAGCTACACTCGATGTTAGTGGTAACGTAACCATTGATGGAAACGTAGACCTTGGTGACACATCTGCCGACTTCGTTAGAATCAACGGTAGAGTAAGTACTTCCTTTATTCCTTCTACTGATAGTGCAACTGACTTAGGTAGCAATGGTCTCAGGTGGAAAGAACTCTTCGTTGATAAACTCACCCTCACAGATGATGCTGCTATTGGTGGTGATCTATCTGTTGGTGGTAGTGTATCTGCCGATTATGTAGATACTACTGAACTCAATGTCAGTGGTGTTGCAACCTTCGCTCAGATTTCAATTGGTGGTGGCGGCGGTGGTATTAGTACCAACGGCGTTATTATTAACAATGTTACTGTTACTGACCAGAGTACTCTTAACAACCTCATTGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGTGTTTCTACCTTCAAGGGTGATGTCTATATCGATGGTAACCTAATCATTGATGGTGATAACAGTCAGGATCTAATCAGTGGTACTAACCTACTCGTCAGTGGTATTGCTACCATCGGCACACTAGGTGTAACTACAAACTTAACTGTTGGTGGTGATGTACTTGTCAGTGGTGCTATGACCGCTGGTTCATACAATGGTGATGGTTCTCAGTTAGATAATCTACCTGCAGCATCAATCACAACCTCCATAACACCTACAACTAGGGTGAATGGTGATACACTACAGACTGGTGATCTATGGTATGACTCTTCTGAGTTACGCCAGTATACTTACTATGATGATGGTGGATCCGTTCAGTGGGTACCTTCAGCCCCAGAACCTACTATTCCTGATTTTACCTACGCAGGTAA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Genome Context

Tertiary structure

AIX30166.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 63.1
Oligomeric state monomer
Download structure

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank